首先，向流通池的通道 3 中加入 500 μL 无蛋白图像缓冲液。将两纳摩尔的酿酒酵母 NAP1 和 2 至 5 纳摩尔的 LD655 标记的 H4 组蛋白八聚体与 500 微升 1X HR 缓冲液混合。将此混合物添加到流通池的通道 4 中。
以 1.0 bar 的压力对所有通道进行 30 秒的流动，以冲洗样品。将流速设置为 0.2 bar，并将光阱移动到通道 1 以捕获一对合适的链霉亲和素包被的微珠。接下来，将光阱移动到通道 3。
关闭流路，并对胶条对进行强制校准。打开红色共聚焦激光器，并校准成像区域。将流速设置为 0.2 bar 后，将光阱移至通道 2 以捕获生物素化 DNA。
然后将光阱移动到通道 3，并停止流路。增加光阱之间的距离以拉伸 DNA，并监测相关的强制距离曲线以确认存在单个 DNA 系绳。调整光阱之间的距离，使 DNA 张力读取大约 1 皮顿。
打开线扫描，在打开红色激光的情况下开始收集运动量计。然后将光阱移动到通道 4，让流出，沿着 DNA 系绳形成核小体。要解开核小体，请将光阱移动到通道 3。
将力读数设置为 0 并将速度设置为每秒 0.1 微米，将光阱 1 从光阱 2 上移开。将 10 纳摩尔的 Cy3 标记的连接组蛋白 H1.4 混合到 500 微升图像缓冲液中，并添加到通道 5 中。形成含有核小体的 DNA 系绳后，除了红色激光外，还打开绿色激光，并将光阱移动到通道 5，以实时成像 H1 与染色质的结合。
沿 DNA 系绳的核小体形成在 2D 扫描和 kymograph 上可视化为静止的红色荧光病灶。光漂白分析显示一步或两步光漂白事件，表明存在单核小体。在没有 NAP1 的情况下，组蛋白八聚体结合 DNA，但大部分保持未包裹，由恒定张力指示。
使用 Cy3 标记的 H2A，获得了与 LD655 标记的 H4 相似的核小体组装结果。核小体解缠随着时间的推移增加了系绳距离，在运动记录仪上可见，并产生了带有特征性裂缝的强制距离曲线，表示单个核小体的解缠。连接组蛋白 H1 与染色质的结合由绿色荧光病灶表示，双色稳定轨迹代表 H1 与核小体的结合，绿色锯齿状轨迹代表扩散的 H1 轨迹。
