在内分泌干扰物计算水生毒理学的Silico建模方法:使用QSAR工具箱的基于软件的方法

我们的协议使用高度可访问和开放的软件程序，能够快速计算内分泌干扰化学品的短期不利影响。这个经合组织QSAR工具箱可用于预测化学物质的毒性，并为以用户友好的方式评估内分泌干扰物的急性生态毒性提供了一种有效的方法。启动 QSAR 工具箱后，用户默认从输入工具箱阶段开始，工具箱会自动创建名为"文档 1"的工作文件。

单击化学摘要服务编号后，在可用文本字段中输入目标物质的化学抽象服务编号，然后单击"搜索"。通过"结构"按钮，还可以通过简化的分子输入线输入系统代码来搜索该物质。要对多个目标物质执行硅化检测，请将简单的物质列表写在文本编辑器中，其中每个化学抽象服务编号都列在一行中，并保存具有适当名称的文本文件。

接下来，单击"数据"并确认已检查生态毒理学信息下列出的数据库。单击"输入"，选择"查询"，然后单击对话框窗口中的"是"以接受所选设置。在"化学抽象服务"选项卡下，选择"加载列表"以上载保存为文本文件的物质列表。

单击弹出式菜单底部的"添加"，然后单击"执行"。QSAR 工具箱将显示一条消息，指示已检索到用于搜索的物质数量。要分析，请单击"分析工具箱"阶段按钮，然后导航到阶段选项面板中的"分析方法"。

单击"分析方法"窗口中的"全部"，并确认在"端点特定"下"预定义"和"与水生毒性相关的探查器"下列出的所有探查器，然后单击"应用"，右键单击"参数"以根据需要运行集成的 2D 和 3D QSAR 模型。对于数据收集，单击"数据工具箱"阶段按钮，然后单击"收集操作"工具栏。选择"所有终结点"以收集所有实验数据，或选择"选择"收集终结点特定的实验数据。

右键单击感兴趣的终结点，然后使用可用术语和箭头以首选方式组织终结点树，然后单击"确定"。然后右键单击感兴趣的终结点，然后选择导出数据矩阵将收集的数据导出到电子表格中。将出现矩阵导出向导，允许将其他终结点添加到导出列表中。

完成选择并单击"导出"以保存文件。要填充数据间隙，请单击"数据间隙填充工具箱"阶段按钮，然后单击"自动"。选择生态毒理学信息和鱼，致命浓度在50%在96小时，然后单击确定。

将显示工作流控制器窗口。如果运行批处理模式，请指定要执行工作流的物质范围。如果成功执行预测，请单击"报表工具箱"阶段按钮，左键单击生成的预测值，单击"预测"，并在弹出式向导中自定义报表内容和外观。

单击"下一步"后，单击"创建报表"，然后将预测和类别报告另存为 PDF 文件和数据矩阵作为电子表格文件。在该定量分析中，对选定的内分泌干扰物的预测急性毒性分析，当预测的数据点与实验数据点绘制为日志尺度时，发现所有分析的鱼类和我们代表性物种的两个参数之间有正相关关系。为了对最高可靠性进行安全评估，通过绘制 50% 致命浓度的 95% 置信区间与实验推导值的预测下限，执行了进一步的计算分析。

在安全阈值较高的评估中，与实验推导值相比，92%的经测试的内分泌干扰化合物属于保护范围。在这里，雌激素受体粘结剂预测致命浓度在50%值的平均值高于非粘结剂的均值。相比之下，对于50%值的实验致命浓度，非和弱粘结剂的三个级别高于更强雌激素受体粘结剂的三个级别。

此过程只能应用于具有唯一标识符的化学物质，在这种情况下，该标识符是 SMILES 代码。OECD QSAR 工具箱中集成了另一个自动化工作流，该工作流可以同样应用，用于皮肤敏感。