Whole Mount RNA Fluorescent <em>in situ</em> Hybridization of <em>Drosophila</em> Embryos

Assessing  the expression pattern of a gene, as well as the subcellular localization  properties of its transcribed RNA, are key features for ...

Institut de Recherches Cliniques de Montréal (IRCM)

&#x5375;&#x5DE2;&#x4E0A;&#x76AE;&#x764C; (EOC) &#x7EC6;&#x80DE;&#x682A;&#x8868;&#x8FBE;&#x57FA;&#x56E0;&#x82AF;&#x7247;&#x5206;&#x6790;&#x53EF;&#x80FD;&#x4F1A;&#x88AB;&#x5229;&#x7528;&#xFF0C;&#x9610;&#x660E;&#x91CD;&#x8981;&#x8FD9;&#x4E00;&#x75BE;&#x75C5;&#x7684;&#x9057;&#x4F20;&#x548C;&#x540E;&#x5929;&#x4E8B;&#x4EF6;&#x3002;&#x4E00;&#x4E2A;&#x53EF;&#x80FD;&#x7684;&#x53D8;&#x91CF;&#x662F;&#x96EA;&#x4EAE;&#x7684;&#x5019;&#x9009;&#x4EBA;&#x5BF9;&#x751F;&#x957F;&#x6761;&#x4EF6;&#x7684;&#x5F71;&#x54CD;&#x3002;&#x76EE;&#x524D;&#x5DF2;&#x7814;&#x7A76;&#x4E86;&#x81F4;&#x7624;&#x6027;&#x5E73;&#x7EC6;&#x80DE;&#x682A;&#xFF0C;OV-90&#x3001; &#x7EEA;&#x8BED;&#x4FDA;&#x8BED;-21 G &#x548C;&#x7EEA;&#x8BED;&#x4FDA;&#x8BED; 112D 3 &#x53F7;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x5BF9;&#x751F;&#x957F;&#x6761;&#x4EF6;&#x7684;&#x5F71;&#x54CD;&#x4F7F;&#x7528;&#x597D;&#x5F97;&#x591A; GeneChip(R) HG-U133A &#x8868;&#x8FBE;&#x57FA;&#x56E0;&#x82AF;&#x7247;&#x5206;&#x6790;&#x3002;

&#x81F4;&#x7624;&#x6027;&#x4E0A;&#x76AE;&#x6027;&#x5375;&#x5DE2;&#x764C;&#x7EC6;&#x80DE;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53; 3 &#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x5BF9;&#x5355;&#x5C42;&#x3001; &#x7403;&#x4F53;&#x548C;&#x80BF;&#x7624;&#x751F;&#x957F;&#x6761;&#x4EF6;&#x7684;&#x5F71;&#x54CD;&#x3002;

Expression microarray analyses of epithelial ovarian cancer (EOC) cell lines may be exploited to elucidate genetic and epigenetic events important in this disease. A possible variable is the influence of growth conditions on discerning candidates. The present study examined the influence of growth conditions on the expression of chromosome 3 genes in the tumorigenic EOC cell lines, OV-90, TOV-21G and TOV-112D using Affymetrix GeneChip(R) HG-U133A expression microarray analysis.

Influence of monolayer, spheroid, and tumor growth conditions on chromosome 3 gene expression in tumorigenic epithelial ovarian cancer cell lines.

Analyses de microarray expression de lign&eacute;es cellulaires de cancer ovarien &eacute;pith&eacute;lial (cou) peuvent &ecirc;tre exploit&eacute;es afin d&#39;&eacute;lucider les &eacute;v&eacute;nements g&eacute;n&eacute;tiques et &eacute;pig&eacute;n&eacute;tiques importants dans cette maladie. Une variable possible est l&#39;influence des conditions de croissance sur les candidats les hautes exigences. La pr&eacute;sente &eacute;tude a examin&eacute; l&#39;influence des conditions de croissance sur l&#39;expression des g&egrave;nes du chromosome 3 dans les lign&eacute;es cellulaires EOC tumorig&egrave;nes, OV-90, TOV - 21 G et TOV-112D utilisant Affymetrix GeneChip(R) HG-U133A expression microarray analysis.

Influence des conditions de croissance monocouche, sph&eacute;ro&iuml;de et tumeur sur le chromosome 3 gene expression in lign&eacute;es cellulaires de cancer ovarien &eacute;pith&eacute;lial tumorig&egrave;ne.

Ausdruck Microarray Analysen der epithelialen Ovarialkarzinom (EOC) Zelllinien k&ouml;nnen ausgenutzt werden, um genetische und epigenetische Ereignisse wichtig, diese Krankheit zu erhellen. Eine m&ouml;gliche Variable ist der Einfluss der Wachstumsbedingungen zu erkennenden Kandidaten. Die vorliegende Studie untersucht den Einfluss der Wachstumsbedingungen auf die Expression von Genen von Chromosom 3 in den tumorigenic EOC-Zelllinien, OV-90, TOV - 21G und TOV-85C mit Affymetrix GeneChip(R) HG-U133A-Ausdruck-Microarray-Analyse.

Einfluss der Monolage Sph&auml;roid und Tumor Wachstumsbedingungen auf Chromosom 3 Genexpression in tumorigenic Epithel ovarian Krebs-Zelllinien.

Analisi microarray espressione di linee di cellule di cancro ovarico epiteliale (EOC) possono essere sfruttate per delucidare genetici ed epigenetici eventi importanti in questa malattia. Una variabile possibile &egrave; l&#39;influenza delle condizioni di crescita su candidati pi&ugrave; esigenti. Il presente studio ha esaminato l&#39;influenza delle condizioni di crescita sull&#39;espressione dei geni del cromosoma 3 in linee di cellule dell&#39;EdC tumorigeno, OV-90, TOV - 21 G e TOV-112D usando l&#39;analisi di microarray Affymetrix GeneChip(R) HG-U133A espressione.

Influenza delle condizioni di crescita monostrato, sferoide e tumore sul cromosoma 3 gene expression in linee cellulari di cancro ovarico epiteliale tumorigeno.

&#x4E0A;&#x76AE;&#x6027;&#x5375;&#x5DE3;&#x764C; (EOC) &#x7D30;&#x80DE;&#x682A;&#x5F0F;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; &#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x89E3;&#x6790;&#x306F;&#x907A;&#x4F1D;&#x7684;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30A8;&#x30D4;&#x30B8;&#x30A7;&#x30CD;&#x30C6;&#x30A3;&#x30C3;&#x30AF;&#x306A;&#x30A4;&#x30D9;&#x30F3;&#x30C8;&#x3053;&#x306E;&#x75C5;&#x6C17;&#x306E;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x3092;&#x89E3;&#x660E;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x60AA;&#x7528;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x53EF;&#x80FD;&#x306A;&#x5909;&#x6570;&#x306F;&#x3001;&#x6210;&#x9577;&#x6761;&#x4EF6;&#x306E;&#x5F71;&#x97FF;&#x306B;&#x76EE;&#x306E;&#x80A5;&#x3048;&#x305F;&#x5019;&#x88DC;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x6210;&#x9577;&#x6761;&#x4EF6;&#x304C;&#x3001;&#x767A;&#x764C;&#x6027; EOC &#x7D30;&#x80DE;&#x30E9;&#x30A4;&#x30F3;&#x3001;OV 90&#x3001;TOV 21 G&#x3001;TOV 112D &#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53; 3 &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x306B;&#x53CA;&#x307C;&#x3059;&#x5F71;&#x97FF;&#x306B;&#x3064;&#x3044;&#x3066;&#x691C;&#x8A0E;&#x30A2;&#x30D5;&#x30A3;&#x30E1;&#x30C8;&#x30EA;&#x30AF;&#x30B9; GeneChip(R) HG U133A &#x5F0F;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; &#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x89E3;&#x6790;&#x3092;&#x7528;&#x3044;&#x305F;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x767A;&#x764C;&#x6027;&#x4E0A;&#x76AE;&#x6027;&#x5375;&#x5DE3;&#x764C;&#x7D30;&#x80DE;&#x682A;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53; 3 &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x5358;&#x5206;&#x5B50;&#x819C;&#x3001;&#x56DE;&#x8EE2;&#x6955;&#x5186;&#x4F53;&#x3001;&#x816B;&#x760D;&#x306E;&#x6210;&#x9577;&#x6761;&#x4EF6;&#x306E;&#x5F71;&#x97FF;

&#xC0C1;&#xD53C; &#xB09C;&#xC18C; &#xC554; (EOC) &#xC140; &#xB77C;&#xC778;&#xC758; &#xD45C;&#xD604; microarray &#xBD84;&#xC11D;&#xC774;&#xC774; &#xC9C8;&#xBCD1;&#xC5D0; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xC720;&#xC804;&#xACFC; &#xD6C4; &#xC131;&#xC801;&#xC778; &#xC774;&#xBCA4;&#xD2B8; &#xD558; &#xC545;&#xC6A9; &#xB420; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xAC00;&#xB2A5;&#xD55C; &#xBCC0;&#xC218; &#xC548;&#xBAA9; &#xD6C4;&#xBCF4;&#xC5D0; &#xC131;&#xC7A5; &#xC870;&#xAC74;&#xC758; &#xC601;&#xD5A5; &#xC774;&#xB2E4;. &#xD604;&#xC7AC;&#xC758; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xC870;&#xC0AC; tumorigenic EOC &#xC140; &#xB77C;&#xC778;, OV-90, &#xBE44; &#xB124;-21 G&#xACFC; &#xBE44; &#xB124;-112D &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; 3 &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xD45C;&#xD604;&#xC5D0; &#xC131;&#xC7A5; &#xC870;&#xAC74;&#xC758; &#xC601;&#xD5A5; Affymetrix GeneChip(R) HG U133A &#xC2DD; microarray &#xBD84;&#xC11D;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC;.

Tumorigenic &#xC0C1;&#xD53C; &#xB09C;&#xC18C; &#xC554; &#xC138;&#xD3EC; &#xB77C;&#xC778;&#xC5D0; &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; 3 &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604;&#xC5D0; &#xB2E8;&#xCE35;, &#xD33D;&#xCC3D;&#xC774;, &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xC885;&#xC591; &#xC131;&#xC7A5; &#xC870;&#xAC74;&#xC758; &#xC601;&#xD5A5;.

An&aacute;lisis de microarrays de expresi&oacute;n de l&iacute;neas celulares de c&aacute;ncer de ovario epitelial (EOC) pueden explotarse para dilucidar los eventos gen&eacute;ticos y epigen&eacute;ticos importantes en esta enfermedad. Una variable posible es la influencia de las condiciones de crecimiento a los candidatos que discierne. El presente estudio examin&oacute; la influencia de las condiciones de crecimiento en la expresi&oacute;n de genes del cromosoma 3 en las l&iacute;neas de celulares de EdC tumor&iacute;geno, OV-90, TOV - 21 G y TOV-112D usando an&aacute;lisis de microarrays de expresi&oacute;n Affymetrix GeneChip(R) HG-U133A.

Influencia de las condiciones de crecimiento de monocapa, esferoide y tumor en la expresi&oacute;n del gen 3 de cromosoma en l&iacute;neas celulares de c&aacute;ncer de ovario epitelial tumor&iacute;geno.

&#x751F;&#x6210;&#x7684;&#x81F4;&#x7624;&#x6027; OV-90 &#x5375;&#x5DE2;&#x764C;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7CFB; 3 &#x53F7;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x7247;&#x6BB5;&#x8F6C;&#x5165;&#x6B63;&#x5E38;&#x8F90;&#x5C04;&#x6742;&#x79CD;&#x7684;&#x9057;&#x4F20;&#x5206;&#x6790;&#x786E;&#x5B9A;&#x4E3A;&#x5019;&#x9009;&#x80BF;&#x7624;&#x6291;&#x5236;&#x57FA;&#x56E0; (TSG) &#x8F68;&#x8FF9; 3p12.3 pcen &#x533A;&#x57DF;&#x3002;&#x5728;&#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x591A;&#x6001;&#x6027;&#x5FAE;&#x536B;&#x661F;&#x91CD;&#x590D;&#x6742;&#x4EA4;&#x5206;&#x6790;&#x8FDB;&#x4E00;&#x6B65;&#x5B9A;&#x4E49; 3p12.3 pcen &#x95F4;&#x9694;&#x5230;&#x5305;&#x542B; 12 &#x4E2A;&#x5DF2;&#x77E5;&#x7684;&#x6216;&#x5047;&#x8BBE;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0; 16.1 Mb &#x5171;&#x540C;&#x533A;&#x57DF;&#xFF1A; 3ptel-ROBO2-ROBO1-GBE1-CADM2-VGLL3-CHMP2B-POU1F1-HTR1F-CGGBP1-ZNF654-C3orf38-EPHA3-3pcen&#x3002;&#x4E03;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x57FA;&#x56E0; ROBO1&#x3001; GBE1&#x3001; VGLL3&#x3001; CHMP2B&#x3001; CGGBP1&#x3001; ZNF654 &#x548C; C3orf38&#xFF0C;&#x5C55;&#x51FA;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x6DF7;&#x5408;&#x52A8;&#x529B;&#x8F66;&#xFF0C;&#x628A;&#x5B83;&#x4EEC;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x9876;&#x7EA7; TSG &#x5019;&#x9009;&#x4EBA;&#x4F5C;&#x8FDB;&#x4E00;&#x6B65;&#x7684;&#x5206;&#x6790;&#x3002;&#x7236;&#x6BCD; OV-90 &#x7684;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x884C;&#x4E5F;&#x68C0;&#x6D4B;&#x5230;&#x7684;&#x53EA;&#x6709;&#x4E00;&#x4E2A; &#xFF08;VGLL3&#xFF09; &#x8FD9;&#x4E9B;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x3002;&#x4E0D;&#x5728;&#x9884;&#x6D4B;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x7F16;&#x7801;&#x533A;&#x7684;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x5019;&#x9009;&#x4EBA;&#x5728; OV-90 &#x548C;&#x6350;&#x52A9;&#x8005;&#x7684;&#x6B63;&#x5E38;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53; 3 contig &#x6BD4;&#x8F83;&#x5E8F;&#x5217;&#x5206;&#x6790;&#x786E;&#x5B9A;&#x4E86;&#x57FA;&#x56E0;&#x7A81;&#x53D8;&#x3002;&#x7136;&#x800C;&#xFF0C;nondeleterious &#x5E8F;&#x5217;&#x53D8;&#x5F02;&#x786E;&#x5B9A;&#x539F;&#x4EA7;&#x5730;&#x7B49;&#x4F4D;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x8F6C;&#x5F55;&#x7684;&#x533A;&#x57DF;&#x6770;&#x51FA;&#x7236; ROBO1&#x3001; VGLL3&#x3001; CHMP2B&#x3001; &#x548C;&#x6742;&#x79CD; CGGBP1 &#x548C;&#x57FA;&#x56E0;&#x6D4B;&#x5E8F;&#x63ED;&#x793A; biallelic &#x8FD9;&#x4E9B;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x3002;&#x6709;&#x8DA3;&#x7684;&#x662F;&#xFF0C;&#x4E0E;&#x539F;&#x4EE3;&#x57F9;&#x517B;&#x6B63;&#x5E38;&#x5375;&#x5DE2;&#x8868;&#x9762;&#x4E0A;&#x76AE;&#x7EC6;&#x80DE;&#x6216;&#x5375;&#x5DE2;&#x826F;&#x6027;&#x80BF;&#x7624;&#x6076;&#x6027;&#x5375;&#x5DE2;&#x80BF;&#x7624;&#x6837;&#x672C;&#x4E2D;&#x89C2;&#x5BDF;&#x5230;&#x7684; VGLL3 &#x548C; ZNF654 underexpression &#x548C;&#x53D1;&#x751F;&#x8FD9;&#x79CD;&#x7B49;&#x4F4D;&#x57FA;&#x56E0; 3p12.3 pcen &#x542B;&#x91CF;&#x65E0;&#x5173;&#x3002;&#x4E24;&#x8005;&#x5408;&#x8BA1;&#x7ED3;&#x679C;&#x8868;&#x660E;&#x8BE5;&#x65F6;&#x5F02;&#x5E38;&#x7684; VGLL3 &#x548C; &#xFF08;&#x6216;&#xFF09; ZNF654 &#x8868;&#x8FBE;&#x5F0F;&#x53EF;&#x80FD;&#x5F71;&#x54CD;&#x800C;&#x88AB;&#x62B5;&#x9500;&#x7684; OV-90&#xFF0C;3 p &#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x884C; hemizygous &#x4E2D;&#x7684; 3 &#x53F7;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x7247;&#x6BB5;&#x8F6C;&#x79FB;&#x5375;&#x5DE2;&#x80BF;&#x7624;&#x53D1;&#x751F;&#x7684;&#x91CD;&#x8981;&#x9014;&#x5F84;&#x3002;

3P12.3 pcen &#x5730;&#x533A;&#x7684;&#x8868;&#x5F81;&#x4E0E;&#x80BF;&#x7624;&#x6291;&#x5236;&#x57FA;&#x56E0;&#x4FEE;&#x9970;&#x7684;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53; 3 &#x7247;&#x6BB5;&#x8F6C;&#x79FB;&#x65B0;&#x578B;&#x5375;&#x5DE2;&#x764C;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x884C;&#x6A21;&#x578B;&#x4E2D;&#x76F8;&#x5173;&#x8054;&#x3002;

The genetic analysis of nontumorigenic radiation hybrids generated by transfer of chromosome 3 fragments into the tumorigenic OV-90 ovarian cancer cell line identified the 3p12.3-pcen region as a candidate tumor suppressor gene (TSG) locus. In the present study, polymorphic microsatellite repeat analysis of the hybrids further defined the 3p12.3-pcen interval to a 16.1 Mb common region containing 12 known or hypothetical genes: 3ptel-ROBO2-ROBO1-GBE1-CADM2-VGLL3-CHMP2B-POU1F1-HTR1F-CGGBP1-ZNF654-C3orf38-EPHA3-3pcen. Seven of these genes, ROBO1, GBE1, VGLL3, CHMP2B, CGGBP1, ZNF654, and C3orf38, exhibited gene expression in the hybrids, placing them as top TSG candidates for further analysis. The expression of all but one (VGLL3) of these genes was also detected in the parental OV-90 cell line. Mutations were not identified in a comparative sequence analysis of the predicted protein coding regions of these candidates in OV-90 and donor normal chromosome 3 contig. However, the nondeleterious sequence variants identified in the transcribed regions distinguished parent of origin alleles for ROBO1, VGLL3, CHMP2B, and CGGBP1 and cDNA sequencing of the hybrids revealed biallelic expression of these genes. Interestingly, underexpression of VGLL3 and ZNF654 were observed in malignant ovarian tumor samples as compared with primary cultures of normal ovarian surface epithelial cells or benign ovarian tumors, and this occurred regardless of allelic content of 3p12.3-pcen. The results taken together suggest that dysregulation of VGLL3 and/or ZNF654 expression may have affected pathways important in ovarian tumorigenesis which was offset by the transfer of chromosome 3 fragments in OV-90, a cell line hemizygous for 3p.

Characterization of the 3p12.3-pcen region associated with tumor suppression in a novel ovarian cancer cell line model genetically modified by chromosome 3 fragment transfer.

L&#39;analyse g&eacute;n&eacute;tique des hybrides de rayonnement tumorig&eacute;niques g&eacute;n&eacute;r&eacute;s par le transfert de fragments du chromosome 3 dans la lign&eacute;e de cellules de cancer de l&#39;ovaire OV-90 tumorig&egrave;ne identifi&eacute; la r&eacute;gion 3p12.3-pcen comme un locus de g&egrave;ne (TSG) de suppresseur de tumeur candidat. Dans la pr&eacute;sente &eacute;tude, microsatellites polymorphiques R&eacute;p&eacute;tez l&#39;analyse des hybrides plus d&eacute;fini l&#39;intervalle 3p12.3-pcen &agrave; une r&eacute;gion commune 16,1 Mo contenant 12 g&egrave;nes connus ou hypoth&eacute;tiques : 3ptel-ROBO2-ROBO1-GBE1-CADM2-VGLL3-CHMP2B-POU1F1-HTR1F-CGGBP1-ZNF654-C3orf38-EPHA3-3pcen. Sept de ces g&egrave;nes, ROBO1 GBE1, VGLL3, CHMP2B, CGGBP1, ZNF654 et C3orf38, expos&eacute; &agrave; l&#39;expression des g&egrave;nes chez les hybrides, en les pla&ccedil;ant comme meilleurs candidats STG pour une analyse ult&eacute;rieure. L&#39;expression de tous, sauf un (VGLL3) de ces g&egrave;nes a &eacute;t&eacute; &eacute;galement d&eacute;tect&eacute;e chez la lign&eacute;e parentale OV-90. Mutations ont &eacute;t&eacute; identifi&eacute;es pas dans une analyse comparative de s&eacute;quence de la prot&eacute;ine codant des r&eacute;gions de ces candidats de contig de chromosome normal 3 OV-90 et donateurs. Cependant, les variantes de la s&eacute;quence pour identifi&eacute;s chez le parent unique r&eacute;gions transcrites d&#39;all&egrave;les d&#39;origine ROBO1, VGLL3, CHMP2B et CGGBP1 et ARNC le s&eacute;quen&ccedil;age des hybrides a r&eacute;v&eacute;l&eacute; biall&eacute;liques expression de ces g&egrave;nes. Fait int&eacute;ressant, les underexpression de VGLL3 et ZNF654 ont &eacute;t&eacute; observ&eacute;s dans des &eacute;chantillons de tumeur ovarienne maligne par rapport aux cultures primaires de cellules &eacute;pith&eacute;liales surfaces ovariennes normales et ou des tumeurs ovariennes b&eacute;nignes, et cela s&#39;est produit sans &eacute;gard au contenu all&eacute;lique de 3p12.3-pcen. Les r&eacute;sultats pris ensemble sugg&egrave;rent que le d&eacute;r&egrave;glement des VGLL3 et/ou ZNF654 expression peut avoir affect&eacute; des voies importantes dans la tumorigen&egrave;se ovarienne, qui a &eacute;t&eacute; compens&eacute;e par le transfert de fragments du chromosome 3 dans OV-90, un h&eacute;mizygotes de ligne de cellules pour 3P.

Caract&eacute;risation de la r&eacute;gion de 3p12.3-pcen associ&eacute;e &agrave; la suppression tumorale dans un mod&egrave;le de ligne de cellules de cancer de l&#39;ovaire roman g&eacute;n&eacute;tiquement modifi&eacute; par le transfert de 3 fragment de chromosome.

Die genetische Analyse von nontumorigenic Strahlung-Hybriden, die durch &Uuml;bertragung von Chromosom 3 Fragmente in die tumorigenic OV-90-Eierstockkrebs-Zelllinie generiert identifiziert die 3p12.3-Pcen-Region als ein Kandidat Tumorsuppressor Gen (TSG) Locus. In der vorliegenden Studie, polymorphe Microsatellite wiederholen Analyse der Hybriden weiter definiert das 3p12.3-Pcen-Intervall zu einer gemeinsamen 16.1 Mb-Region, 12 bekannte oder hypothetische Gene enthalten: 3ptel-ROBO2-ROBO1-GBE1-CADM2-VGLL3-CHMP2B-POU1F1-HTR1F-CGGBP1-ZNF654-C3orf38-EPHA3-3pcen. Sieben dieser Gene, ROBO1, GBE1, VGLL3, CHMP2B, CGGBP1, ZNF654 und C3orf38, stellte die Genexpression in der Hybriden, platzieren sie als Spitzenkandidaten der TSG zur weiteren Analyse. In die elterliche OV-90-Zelllinie wurde auch der Ausdruck alle au&szlig;er einem (VGLL3) dieser Gene entdeckt. Mutationen wurden nicht in eine vergleichende Sequenzanalyse der vorhergesagten Proteine codieren Regionen dieser Kandidaten in OV-90 und Spender normalen Chromosom 3 Contig. Jedoch die nondeleterious Sequenz-Varianten in der transkribierten Regionen definierten &uuml;bergeordneten Herkunft Allele f&uuml;r ROBO1, VGLL3, CHMP2B, und CGGBP1 und DNA-Sequenzierung der Hybriden offenbart Biallelic Ausdruck dieser Gene. Interessant ist, Underexpression VGLL3 und ZNF654 in b&ouml;sartiger Tumor der Eierst&ouml;cke Proben gegen&uuml;ber Prim&auml;rkulturen von normalen ovariellen Oberfl&auml;che Epithelzellen oder gutartige Eierstockkrebs beobachtet wurden, und dies geschah unabh&auml;ngig allelische Inhalt der 3p12.3-Pcen. Die Ergebnisse, die zusammengenommen legen nahe, dass Dysregulation von VGLL3 und/oder ZNF654 Auspr&auml;gung kann haben Faktoren Wege wichtig im Eierstock Tumorentstehung, die durch die &Uuml;bertragung von Chromosom 3 Fragmente in OV-90, eine Zelle Zeile Hemizygous f&uuml;r 3P ausgeglichen wurde.

Charakterisierung der 3p12.3-Pcen Region zugeordneten Tumor Unterdr&uuml;ckung in einem neuartigen Eierstockkrebs Zelle Linie Modell von Chromosom 3 Fragment &Uuml;bertragung genetisch ver&auml;ndert.

L&#39;analisi genetica degli ibridi di radiazione nontumorigenic generato dal trasferimento di frammenti di cromosoma 3 nella linea cellulare di cancro ovarico OV-90 tumorigeno identificato la regione 3p12.3-pcen come un locus candidato tumore soppressore gene (STG). Nel presente studio, polimorfico microsatellite ripetere analisi degli ibridi ulteriormente definito l&#39;intervallo 3p12.3-pcen a un&#39;area comune 16,1 Mb contenente 12 geni conosciuti o ipotetici: 3ptel-ROBO2-ROBO1-GBE1-CADM2-VGLL3-CHMP2B-POU1F1-HTR1F-CGGBP1-ZNF654-C3orf38-EPHA3-3pcen. Sette di questi geni, ROBO1, GBE1, VGLL3, CHMP2B, CGGBP1, ZNF654 e C3orf38, esposto di espressione genica in ibridi, posizionandole come candidati migliori STG per ulteriori analisi. L&#39;espressione di tutti, ma uno (VGLL3) di questi geni &egrave; stato rilevato anche nella linea parentale di cella OV-90. Non sono state identificate mutazioni in un&#39;analisi comparativa sequenza della proteina predetta coding regioni di questi candidati in OV-90 e donatore contig normale cromosoma 3. Tuttavia, le varianti di sequenza nondeleterious identificato nel padre di alleli di origine distinto regioni trascritte per ROBO1, VGLL3, CHMP2B e CGGBP1 e cDNA sequenziamento degli ibridi ha rivelato biallelica espressione di questi geni. &Egrave; interessante notare che, underexpression di VGLL3 e ZNF654 sono stati osservati in campioni di tumore ovarico maligno rispetto alle colture primarie di cellule epiteliali superficiali dell&#39;ovaio normale o tumori ovarici benigni, e ci&ograve; &egrave; avvenuto indipendentemente dal contenuto allelica del 3p12.3-pcen. I risultati presi insieme suggeriscono che disregolazione del VGLL3 e/o ZNF654 espressione possa aver influito percorsi importanti nella tumorigenesi ovarico che &egrave; stata compensata dal trasferimento di frammenti di cromosoma 3 OV-90, una cella linea emizigote per 3 p.

Caratterizzazione della regione 3p12.3-pcen associati con soppressione del tumore in un romanzo ovarian cancer cell linea modello geneticamente modificato dal trasferimento di 3 frammento di cromosoma.

&#x767A;&#x764C;&#x6027; OV 90 &#x5375;&#x5DE3;&#x304C;&#x3093;&#x7D30;&#x80DE;&#x30E9;&#x30A4;&#x30F3;&#x3078;&#x306E;&#x7B2C; 3 &#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x65AD;&#x7247;&#x306E;&#x8EE2;&#x9001;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x751F;&#x6210;&#x3055;&#x308C;&#x308B; nontumorigenic &#x653E;&#x5C04;&#x7DDA;&#x96D1;&#x7A2E;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x7684;&#x89E3;&#x6790; 3p12.3 pcen &#x5730;&#x57DF;&#x5019;&#x88DC;&#x816B;&#x760D;&#x30B5;&#x30D7;&#x30EC;&#x30C3;&#x30B5;&#x30FC;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50; (TSG) &#x8ECC;&#x8DE1;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x8B58;&#x5225;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x30DD;&#x30EA;&#x30E2;&#x30FC;&#x30D5;&#x30A3;&#x30C3;&#x30AF; &#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; &#x30B5;&#x30C6;&#x30E9;&#x30A4;&#x30C8;&#x7E70;&#x308A;&#x8FD4;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x96D1;&#x7A2E;&#x306E;&#x89E3;&#x6790;&#x306F;&#x3055;&#x3089;&#x306B; 12 &#x306E;&#x65E2;&#x77E5;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x4EEE;&#x60F3;&#x7684;&#x306A;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3092;&#x542B;&#x3080; 16.1 Mb &#x306E;&#x5171;&#x901A;&#x9818;&#x57DF;&#x306B; 3p12.3 pcen &#x306E;&#x9593;&#x9694;&#x3092;&#x5B9A;&#x7FA9;: 3ptel-ROBO2-ROBO1-GBE1-CADM2-VGLL3-CHMP2B-POU1F1-HTR1F-CGGBP1-ZNF654-C3orf38-EPHA3-3pcen&#x3002;7 &#x3064;&#x306E;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306F;&#x3001;ROBO1&#x3001;GBE1&#x3001;VGLL3&#x3001;CHMP2B&#x3001;CGGBP1&#x3001;ZNF654&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073; C3orf38&#x3001;&#x3055;&#x3089;&#x306A;&#x308B;&#x5206;&#x6790;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30C8;&#x30C3;&#x30D7;&#x306E; TSG &#x5019;&#x88DC;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x305D;&#x308C;&#x3089;&#x3092;&#x914D;&#x7F6E;&#x3059;&#x308B;&#x96D1;&#x7A2E;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x3092;&#x51FA;&#x5C55;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x304C; 1 &#x3064; (VGLL3) &#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x3082;&#x30DA;&#x30A2;&#x30EC;&#x30F3;&#x30BF;&#x30EB; OV 90 &#x30BB;&#x30EB;&#x30E9;&#x30A4;&#x30F3;&#x3067;&#x691C;&#x51FA;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x7A81;&#x7136;&#x5909;&#x7570;&#x306F; OV 90 &#x3068;&#x30C9;&#x30CA;&#x30FC;&#x306E;&#x6B63;&#x5E38;&#x306A;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53; 3 contig &#x3067;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x5019;&#x88DC;&#x8005;&#x306E;&#x5730;&#x57DF;&#x306E;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C7;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;&#x4E88;&#x6E2C;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306E;&#x6BD4;&#x8F03;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x89E3;&#x6790;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x540C;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x306A;&#x304B;&#x3063;&#x305F;.&#x305F;&#x3060;&#x3057;&#x3001;nondeleterious &#x5869;&#x57FA;&#x914D;&#x5217;&#x5909;&#x7570;&#x306E;&#x8D77;&#x6E90;&#x306E;&#x5BFE;&#x7ACB;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x8EE2;&#x5199;&#x9818;&#x57DF;&#x8B58;&#x5225;&#x306E;&#x89AA;&#x8B58;&#x5225; ROBO1&#x3001;VGLL3&#x3001;CHMP2B &#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x3001;&#x30B7;&#x30E5;&#x30DF;&#x30EC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x5F0F;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x96D1;&#x7A2E;&#x306E; CGGBP1 &#x3068; cDNA &#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x8208;&#x5473;&#x6DF1;&#x3044;&#x3053;&#x3068;&#x306B;&#x3001;underexpression VGLL3 &#x3068; ZNF654 &#x306E;&#x4E00;&#x6B21;&#x6587;&#x5316;&#x306E;&#x6B63;&#x5E38;&#x5375;&#x5DE3;&#x8868;&#x9762;&#x4E0A;&#x76AE;&#x7D30;&#x80DE;&#x3084;&#x826F;&#x6027;&#x5375;&#x5DE3;&#x816B;&#x760D;&#x3068;&#x6BD4;&#x8F03;&#x3057;&#x3066;&#x60AA;&#x6027;&#x5375;&#x5DE3;&#x816B;&#x760D;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EB;&#x3092;&#x89B3;&#x5BDF;&#x3057;&#x305F;&#x3057;&#x3001;3p12.3 pcen &#x306E;&#x5BFE;&#x7ACB;&#x306E;&#x5185;&#x5BB9;&#x306B;&#x95A2;&#x4FC2;&#x306A;&#x304F;&#x767A;&#x751F;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x305D;&#x306E;&#x5236;&#x5FA1;&#x7834;&#x7DBB;&#x4E00;&#x7DD2;&#x306B;&#x53D6;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x793A;&#x5506; VGLL3 &#x304A;&#x3088;&#x3073;/&#x307E;&#x305F;&#x306F; ZNF654 &#x306E;&#x5F0F;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x7D30;&#x80DE;&#x30E9;&#x30A4;&#x30F3; hemizygous 3 p OV 90 &#x7B2C; 3 &#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x30D5;&#x30E9;&#x30B0;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C8;&#x306E;&#x8EE2;&#x9001;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x76F8;&#x6BBA;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x5375;&#x5DE3;&#x306E;&#x816B;&#x760D;&#x5F62;&#x6210;&#x306B;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x5F71;&#x97FF;&#x3092;&#x4E0E;&#x3048;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

3P12.3 pcen &#x5730;&#x57DF;&#x306E;&#x30AD;&#x30E3;&#x30E9;&#x30AF;&#x30BF;&#x30EA;&#x30BC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x816B;&#x760D;&#x6291;&#x5236;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x7D44;&#x63DB;&#x3048;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53; 3 &#x30D5;&#x30E9;&#x30B0;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C8;&#x8EE2;&#x9001;&#x5C0F;&#x8AAC;&#x3001;&#x5375;&#x5DE3;&#x304C;&#x3093;&#x7D30;&#x80DE;&#x30E9;&#x30A4;&#x30F3; &#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

Nontumorigenic &#xBC29;&#xC0AC;&#xC120; &#xD558;&#xC774;&#xBE0C;&#xB9AC;&#xB4DC; tumorigenic OV 90 &#xB09C;&#xC18C; &#xC554; &#xC138;&#xD3EC; &#xB77C;&#xC778;&#xC5D0; &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; 3 &#xC870;&#xAC01;&#xC758; &#xC804;&#xC1A1;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC0DD;&#xC131; &#xB41C; &#xC720;&#xC804; &#xBD84;&#xC11D; &#xD6C4;&#xBCF4; &#xC885;&#xC591; &#xC5B5;&#xC81C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; (TSG) &#xB85C;&#xCEE4; &#xC2A4; 3p12.3 pcen &#xC9C0;&#xC5ED;&#xC744; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD604;&#xC7AC;&#xC758; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB2E4;&#xD615; microsatellite &#xBC18;&#xBCF5; &#xD558;&#xC774;&#xBE0C;&#xB9AC;&#xB4DC; &#xBD84;&#xC11D; &#xCD94;&#xAC00; 12 &#xC54C;&#xB824;&#xC9C4; &#xB610;&#xB294; &#xAC00;&#xC0C1; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558;&#xB294; 16.1 m b &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC778; &#xC9C0;&#xC5ED; 3p12.3 pcen &#xAC04;&#xACA9; &#xC815;&#xC758;: 3ptel-ROBO2-ROBO1-GBE1-CADM2-VGLL3-CHMP2B-POU1F1-HTR1F-CGGBP1-ZNF654-C3orf38-EPHA3-3pcen. 7 ROBO1, GBE1, VGLL3, CHMP2B, CGGBP1, ZNF654, &#xBC0F; C3orf38,&#xC774; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604; &#xCD94;&#xAC00; &#xBD84;&#xC11D;&#xC744; &#xC704;&#xD574; &#xCD5C;&#xACE0; TSG &#xD6C4;&#xBCF4;&#xB85C; &#xBC30;&#xCE58; &#xD558;&#xC774;&#xBE0C;&#xB9AC;&#xB4DC;&#xC5D0; &#xC804;&#xC2DC;. &#xBAA8;&#xB4E0; &#xD558;&#xB098; (VGLL3)&#xC774;&#xC774; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xD45C;&#xD604; &#xB610;&#xD55C; &#xBD80;&#xBAA8;&#xC758; OV 90 &#xC140; &#xB77C;&#xC778;&#xC5D0;&#xC11C; &#xAC80;&#xC0C9; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774; &#xB418;&#xC9C0; OV 90 &#xBC0F; &#xAE30;&#xC99D;&#xC790; &#xC815;&#xC0C1; &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; 3 contig&#xC5D0; &#xD6C4;&#xBCF4;&#xC758; &#xC9C0;&#xC5ED; &#xCF54;&#xB529; &#xC608;&#xCE21;&#xB41C; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xBE44;&#xAD50; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xBD84;&#xC11D;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD655;&#xC778; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098;, nondeleterious &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xBCC0;&#xC885; ROBO1, VGLL3, CHMP2B, &#xC6D0;&#xC0B0;&#xC9C0; &#xB300;&#xB9BD; &#xBCA0;&#xB080;&#xB41C; &#xC9C0;&#xC5ED; &#xACE0;&#xC720; &#xBD80;&#xBAA8;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xB418;&#xBA70; &#xD558;&#xC774;&#xBE0C;&#xB9AC;&#xB4DC; CGGBP1 &#xBC0F; cDNA &#xC2DC;&#xD000;&#xC2F1; &#xBC1D;&#xD600; biallelic &#xC2DD;&#xC774;&#xC774; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758;. &#xD765;&#xBBF8;&#xB86D;&#xAC8C;&#xB3C4;, VGLL3 &#xBC0F; znf654&#xC758; underexpression &#xC815;&#xC0C1; &#xB09C;&#xC18C; &#xD45C;&#xBA74; &#xC0C1;&#xD53C; &#xC138;&#xD3EC; &#xB610;&#xB294; &#xC591;&#xC131; &#xB09C;&#xC18C; &#xC885;&#xC591;&#xC758; &#xAE30;&#xBCF8; &#xBB38;&#xD654;&#xC5D0; &#xBE44;&#xD574; &#xC545;&#xC131; &#xB09C;&#xC18C; &#xC885;&#xC591; &#xC0D8;&#xD50C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xAD00;&#xCC30; &#xB410;&#xB2E4; &#xACE0;&#xC774; 3p12.3-pcen&#xC758; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xB0B4;&#xC6A9;&#xC5D0; &#xAD00;&#xACC4; &#xC5C6;&#xC774; &#xBC1C;&#xC0DD;. &#xD568;&#xAED8; &#xCC0D;&#xC740; &#xACB0;&#xACFC; &#xC81C;&#xC548; &#xADF8; dysregulation VGLL3 znf654&#xC758; &#xC2DD; &#xC218; &#xC601;&#xD5A5; OV-90, 3p&#xC758; &#xC140; &#xB77C;&#xC778; hemizygous&#xC5D0;&#xC11C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; 3 &#xC870;&#xAC01;&#xC758; &#xC804;&#xC1A1;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC0C1;&#xC1C4; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4; &#xB09C;&#xC18C; tumorigenesis&#xC5D0;&#xC11C; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xACBD;&#xB85C;.

3P12.3 pcen &#xC9C0;&#xC5ED; &#xBD84;&#xD3EC;&#xC758; &#xC885;&#xC591; &#xC5B5;&#xC81C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; 3 &#xC870;&#xAC01; &#xC804;&#xC1A1; &#xD558; &#xC5EC; &#xBCC0;&#xD615; &#xC18C;&#xC124; &#xB09C;&#xC18C; &#xC554; &#xC138;&#xD3EC; &#xB77C;&#xC778; &#xBAA8;&#xB378;&#xC5D0; &#xC5F0;&#xAD00; &#xB41C;.

El an&aacute;lisis gen&eacute;tico de los h&iacute;bridos de la radiaci&oacute;n nontumorigenic generados por la transferencia de fragmentos de cromosoma 3 en la l&iacute;nea de c&eacute;lulas de c&aacute;ncer de ovario OV-90 tumor&iacute;gena identificado la regi&oacute;n 3p12.3-pcen como locus candidato tumor supresor gene (TSG). En el presente estudio, polim&oacute;rficos del microsatellite repetir el an&aacute;lisis de los h&iacute;bridos m&aacute;s definici&oacute;n el intervalo de 3p12.3-pcen a una regi&oacute;n com&uacute;n de 16,1 Mb que contiene 12 genes conocidos o hipot&eacute;ticos: 3ptel-ROBO2-ROBO1-GBE1-CADM2-VGLL3-CHMP2B-POU1F1-HTR1F-CGGBP1-ZNF654-C3orf38-EPHA3-3pcen. Siete de estos genes, ROBO1, GBE1, VGLL3, CHMP2B, CGGBP1, ZNF654 y C3orf38, exhibi&oacute; la expresi&oacute;n g&eacute;nica en los h&iacute;bridos, coloc&aacute;ndolos como primeros candidatos TSG para su posterior an&aacute;lisis. Tambi&eacute;n se detect&oacute; la expresi&oacute;n de todos menos uno (VGLL3) de estos genes en la l&iacute;nea de c&eacute;lula parental de OV-90. No se identificaron mutaciones en un an&aacute;lisis comparativo de la secuencia de la prote&iacute;na predijo codificaci&oacute;n regiones de estos candidatos en OV-90 y donantes contig cromosoma normal 3. Sin embargo, las variantes de la secuencia nondeleterious identificaron en el padre distinguido regiones transcrito de alelos de origen para ROBO1, VGLL3, CHMP2B, y CGGBP1 y del cDNA de la secuencia de los h&iacute;bridos revel&oacute; biallelic expresi&oacute;n de estos genes. Curiosamente, subexpresi&oacute;n de VGLL3 y ZNF654 fueron observadas en muestras de tumor maligno de ovario en comparaci&oacute;n con cultivos primarios de c&eacute;lulas epiteliales superficiales ov&aacute;ricas normales o tumores ov&aacute;ricos benignos, y esto ocurri&oacute; sin importar contenido al&eacute;lica de 3p12.3-pcen. Los resultados combinados sugieren que dysregulation de VGLL3 y/o ZNF654 expresi&oacute;n puede haber afectado v&iacute;as importantes en tumorigenesis ov&aacute;rico que se compens&oacute; con la transferencia de fragmentos de cromosoma 3 en OV-90, un hemizygous de l&iacute;nea celular para 3P.

Caracterizaci&oacute;n de la regi&oacute;n de 3p12.3-pcen asociados con la supresi&oacute;n tumoral en un modelo de l&iacute;neas de celular nuevo c&aacute;ncer ov&aacute;rico gen&eacute;ticamente modificado por transferencia 3 fragmento de cromosoma.

RNA &#x7ED3;&#x5408;&#x86CB;&#x767D; muscleblind &#x6837; (Mbnl) &#x5BB6;&#x5EAD;&#x626E;&#x6F14;&#x91CD;&#x8981;&#x89D2;&#x8272;&#x5728;&#x808C;&#x8089;&#x548C;&#x773C;&#x90E8;&#x53D1;&#x80B2;&#x548C;&#x5F3A;&#x76F4;&#x6027;&#x808C;&#x8425;&#x517B;&#x4E0D;&#x826F; (DM)&#xFF0C;&#x5728;&#x5176;&#x4E2D;&#x5C55;&#x5F00;&#x7684; CUG &#x6216; CCUG &#x91CD;&#x590D;&#x529F;&#x80FD;&#x4E0A;&#x8017;&#x8D39; Mbnl &#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x901A;&#x8FC7;&#x4F7F;&#x7528; RNA seq &#x6807;&#x8BC6; Mbnl &#x86CB;&#x767D;&#x5728;&#x8111;&#x3001; &#x5FC3;&#x810F;&#x3001; &#x808C;&#x8089;&#x548C;&#x6210;&#x808C;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4E2D;&#x7684;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x5168;&#x529F;&#x80FD;&#x548C;&#x751F;&#x7269;&#x7269;&#x7406;&#x6307;&#x6807;&#x548C;&#x526A;&#x8F91; seq &#x529E;&#x6CD5;&#x3002;&#x6B64;&#x5206;&#x6790;&#x786E;&#x5B9A;&#x5176;&#x8C03;&#x63A7;&#x53D6;&#x51B3;&#x4E8E; Mbnl &#x51FD;&#x6570;&#x6307;&#x793A; Mbnl1 &#x548C; Mbnl2 &#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x529F;&#x80FD;&#x4E92;&#x6362;&#x6A21;&#x5F0F;&#x4E2D;&#x7684;&#x51E0;&#x4E2A;&#x51E0;&#x767E;&#x62FC;&#x63A5;&#x4E8B;&#x4EF6;&#x3002;&#x6838;&#x82F7;&#x9178;&#x51B3;&#x8BAE; RNA &#x6620;&#x5C04;&#x5173;&#x8054;&#x7684;&#x9547;&#x538B;&#x6216;&#x5916;&#x663E;&#x5B50;&#x62FC;&#x63A5;&#x4E0E;&#x9644;&#x8FD1;&#x6216;&#x8005; 3&#39; Mbnl &#x7ED1;&#x5B9A;&#x6FC0;&#x6D3B;&#x63A5;&#x5408;&#x7AD9;&#x70B9;&#x6216;&#x9644;&#x8FD1; 5 &#x4E0B;&#x6E38; &#39; &#x62FC;&#x63A5;&#x7F51;&#x7AD9;&#xFF0C;&#x5206;&#x522B;&#x3002;&#x53D1;&#x73B0;&#x8F66;&#x53A2;&#x5185;&#x4E9A;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5BBF;&#x4E3B;&#x5206;&#x6790;&#x5168;&#x7403;&#x4F5C;&#x7528;&#x8C03;&#x8282;&#x5B9A;&#x4F4D;&#x5728;&#x5C0F;&#x9F20;&#x548C;&#x679C;&#x8747;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5206;&#x6CCC;&#x7684; Mbnls &#x548C; Mbnl &#x4F9D;&#x8D56;&#x4E8E;&#x7FFB;&#x8BD1;&#x548C;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x5206;&#x6CCC;&#x8DCC;&#x5E45; mRNAs &#x4E0E; Mbnl &#x4F9D;&#x8D56;&#x672C;&#x5730;&#x5316;&#x7684;&#x4E00;&#x4E2A;&#x5B50;&#x96C6;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x8C03;&#x67E5;&#x7ED3;&#x679C;&#x6301;&#x6709;&#x51E0;&#x4E2A;&#x65B0;&#x5F71;&#x54CD; DM &#x53D1;&#x75C5;&#x4E2D;&#x7684;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;

Pre mRNA &#x526A;&#x63A5;&#x548C; mRNA &#x672C;&#x5730;&#x5316;&#x7684; muscleblind &#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x5168;&#x8C03;&#x8282;&#x3002;

The muscleblind-like (Mbnl) family of RNA-binding proteins plays important roles in muscle and eye development and in myotonic dystrophy (DM), in which expanded CUG or CCUG repeats functionally deplete Mbnl proteins. We identified transcriptome-wide functional and biophysical targets of Mbnl proteins in brain, heart, muscle, and myoblasts by using RNA-seq and CLIP-seq approaches. This analysis identified several hundred splicing events whose regulation depended on Mbnl function in a pattern indicating functional interchangeability between Mbnl1 and Mbnl2. A nucleotide resolution RNA map associated repression or activation of exon splicing with Mbnl binding near either 3' splice site or near the downstream 5' splice site, respectively. Transcriptomic analysis of subcellular compartments uncovered a global role for Mbnls in regulating localization of mRNAs in both mouse and Drosophila cells, and Mbnl-dependent translation and protein secretion were observed for a subset of mRNAs with Mbnl-dependent localization. These findings hold several new implications for DM pathogenesis.

Transcriptome-wide regulation of pre-mRNA splicing and mRNA localization by muscleblind proteins.

La famille (Mbnl) de muscleblind-comme des prot&eacute;ines de liaison &agrave; l&#39;ARN joue importante r&ocirc;le dans le d&eacute;veloppement musculaire et des yeux et dans la dystrophie myotonique (DM), dans lequel CUG &eacute;largi ou CCUG r&eacute;p&egrave;te fonctionnellement appauvrissent les prot&eacute;ines Mbnl. Nous avons identifi&eacute; transcriptome &eacute;chelle fonctionnelles et biophysiques cibles de Mbnl des prot&eacute;ines dans le cerveau, le coeur, muscle et myoblastes en utilisant RNA-seq et CLIP-seq s&#39;approche. Cette analyse a identifi&eacute; plusieurs &eacute;v&eacute;nements d&#39;&eacute;pissage centaines dont r&egrave;glement d&eacute;pend de la fonction Mbnl dans un mod&egrave;le indiquant l&#39;interchangeabilit&eacute; fonctionnelle entre Mbnl1 et Mbnl2. Un nucl&eacute;otide r&eacute;solution RNA carte associ&eacute;e li&eacute;e la r&eacute;pression ou activation de l&#39;exon &eacute;pissage avec liaison Mbnl pr&egrave;s soit 3&#39; site d&#39;&eacute;pissure ou pr&egrave;s de l&#39;aval 5&#39; splice site, respectivement. Analyse transcriptomique des compartiments subcellulaires d&eacute;couvert un r&ocirc;le mondial pour Mbnls dans la r&eacute;gulation de la localisation des ARNm dans les souris et les cellules de la drosophile et s&eacute;cr&eacute;tion de traduction et de la prot&eacute;ine Mbnl-d&eacute;pendantes ont &eacute;t&eacute; observ&eacute;es pour un sous-ensemble de l&#39;ARNm avec localisation Mbnl-d&eacute;pendante. Ces r&eacute;sultats tiennent plusieurs nouvelles implications pour la pathog&eacute;nie de la DM.

R&eacute;glementation &agrave; l&#39;&eacute;chelle du transcriptome de la localisation de l&#39;ARNm et l&#39;&eacute;pissage pr&eacute;-ARNm par des prot&eacute;ines de muscleblind.

Die Muscleblind-artigen (Mbnl) Familie von RNA-bindende Proteine spielt wichtige Rollen in Muskeln und Auge Entwicklung und Myotone Dystrophie (DM), in dem erweiterten CUG oder CCUG funktional wiederholt Mbnl Proteine zum Abbau. Wir entdeckten Transkriptom-weite funktionale und biophysikalische Mbnl Proteine im Gehirn, Herz und Muskel Myoblasts mit RNA-Seq und CLIP-Seq Ans&auml;tze. Diese Analyse identifiziert mehrere hundert Splei&szlig;en Ereignisse Mbnl-Funktion in einem Muster angibt, funktionale Austauschbarkeit zwischen Mbnl1 und Mbnl2 deren Verordnung abh&auml;ngig. Ein Nukleotid-Aufl&ouml;sung-RNA Karte zugeordneten Repression oder Aktivierung des Exon Splei&szlig;en mit Mbnl Bindung nahe entweder 3&#39; in der N&auml;he der nachgeschaltete 5&#39; Splei&szlig;stelle Website, bzw. oder Splei&szlig;en Website. Transcriptomic Analyse der subzellul&auml;ren F&auml;cher deckte eine globale Rolle f&uuml;r Mbnls bei der Regulierung der Lokalisierung von mRNAs sowohl Maus als auch Drosophila-Zellen, und Mbnl-abh&auml;ngige &Uuml;bersetzung und Protein Sekretion beobachtet f&uuml;r eine Teilmenge der mRNAs mit Mbnl abh&auml;ngigen Lokalisierung. Diese Erkenntnisse haben verschiedene neue Auswirkungen auf DM Pathogenese.

Transkriptom-weite Regulierung der Pre-mRNA-Splei&szlig;en und mRNA Lokalisierung durch Muscleblind Proteine.

Famiglia muscleblind-like (Mbnl) di RNA-binding proteins svolge importante ruoli nello sviluppo muscolare e occhio e nella distrofia miotonica (DM), in cui CUG espanso o CCUG ripete funzionalmente riducono le proteine Mbnl. Abbiamo identificato transcriptome-wide obiettivi funzionali e biofisici di Mbnl proteine nel cervello, cuore, muscolo e mioblasti utilizzando RNA-seq e CLIP-seq si avvicina. Questa analisi identificati diversi eventi di splicing cento cui regolamento dipendeva dalla funzione di Mbnl in un modello che indica l&#39;intercambiabilit&agrave; funzionale tra Mbnl1 e Mbnl2. Un nucleotide risoluzione RNA mappa repressione associato o attivazione di exon splicing con associazione di Mbnl vicino o 3&#39; splice sito o vicino a valle 5&#39; splice sito, rispettivamente. Analisi trascrittomica di compartimenti subcellulari scoperto un ruolo globale per Mbnls nella regolazione della localizzazione dei mRNAs in mouse e cellule di Drosophila, e la secrezione della proteina e traduzione Mbnl-dipendenti sono stati osservati per un sottoinsieme dei mRNAs con localizzazione Mbnl-dipendente. Questi risultati sostengono diverse nuove implicazioni per la patogenesi del DM.

Regolamento a livello transcriptome di localizzazione di mRNA e di splicing pre-mRNA di proteine muscleblind.

Muscleblind &#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306A; &#xFF08;Mbnl&#xFF09; &#x5BB6;&#x65CF;&#x306E; RNA &#x7D50;&#x5408;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306E; Mbnl &#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306E;&#x5F79;&#x5272;&#x7B4B;&#x8089;&#x3084;&#x76EE;&#x306E;&#x958B;&#x767A;&#x3068;&#x7B4B;&#x5F37;&#x76F4;&#x6027;&#x30B8;&#x30B9;&#x30C8;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A3;&#x30FC;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x7684;&#x62E1;&#x5F35; CUG &#x307E;&#x305F;&#x306F; CCUG &#x3092;&#x7E70;&#x308A;&#x8FD4;&#x3057;&#x307E;&#x3059; (DM) &#x3092;&#x4F7F;&#x3044;&#x679C;&#x305F;&#x3059;&#x91CD;&#x8981;&#x679C;&#x305F;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6211;&#x3005; Mbnl &#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306E;&#x8133;&#x3001;&#x5FC3;&#x81D3;&#x3001;&#x7B4B;&#x8089;&#x3001;&#x7B4B;&#x82BD;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x30FC;&#x30E0;&#x6A5F;&#x80FD;&#x7684;&#x3067;&#x5E74;&#x4F1A;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8; RNA seq &#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x8B58;&#x5225;&#x3001;&#x30AF;&#x30EA;&#x30C3;&#x30D7; seq &#x306B;&#x8FD1;&#x3065;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x5206;&#x6790;&#x306F;&#x3001;&#x898F;&#x5247;&#x304C; Mbnl &#x95A2;&#x6570;&#x3067; Mbnl1 &#x3068; Mbnl2 &#x9593;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x7684;&#x306A;&#x4E92;&#x63DB;&#x6027;&#x3092;&#x793A;&#x3059;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x306B;&#x4F9D;&#x5B58;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x767E;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0; &#x30A4;&#x30D9;&#x30F3;&#x30C8;&#x8B58;&#x5225;&#x3002;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30AA;&#x30C1;&#x30C9;&#x5206;&#x89E3;&#x80FD; RNA &#x30DE;&#x30C3;&#x30D7;&#x95A2;&#x9023;&#x6291;&#x5727;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x30A8;&#x30AF;&#x30BD;&#x30F3; Mbnl &#x30D0;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C9;&#x3068;&#x8FD1;&#x304F;&#x3044;&#x305A;&#x308C;&#x304B; 3&#39; &#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B9;&#x306E;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B9; &#x30B5;&#x30A4;&#x30C8;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x4E0B;&#x6D41;&#x306E; 5&#39; &#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x8FD1;&#x304F;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B9; &#x30B5;&#x30A4;&#x30C8;&#x3001;&#x305D;&#x308C;&#x305E;&#x308C;&#x3002;&#x7D30;&#x80DE;&#x5185;&#x30B3;&#x30F3;&#x30D1;&#x30FC;&#x30C8;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C8;&#x306E;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x30FC;&#x30E0;&#x89E3;&#x6790;&#x30B0;&#x30ED;&#x30FC;&#x30D0;&#x30EB; &#x30ED;&#x30FC;&#x30EB; Mbnls &#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30DE;&#x30A6;&#x30B9;&#x3084;&#x30B7;&#x30E7;&#x30A6;&#x30B8;&#x30E7;&#x30A6;&#x30D0;&#x30A8;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B; Mrna &#x306E;&#x5C40;&#x5728;&#x3092;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3059;&#x308B;&#x306B;&#x6458;&#x767A;&#x3057;&#x3066;&#x3001;Mbnl &#x306B;&#x4F9D;&#x5B58;&#x3059;&#x308B;&#x7FFB;&#x8A33;&#x3001;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306E;&#x5206;&#x6CCC; Mbnl &#x306B;&#x4F9D;&#x5B58;&#x3057;&#x305F;&#x5C40;&#x5728;&#x3068; Mrna &#x306E;&#x30B5;&#x30D6;&#x30BB;&#x30C3;&#x30C8;&#x306B;&#x89B3;&#x5BDF;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x77E5;&#x898B;&#x306F; DM &#x75C5;&#x56E0;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x610F;&#x5473;&#x3092;&#x4FDD;&#x6301;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

Muscleblind &#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306B;&#x3088;&#x308B; mRNA &#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x3068; mRNA &#x5C40;&#x5728;&#x306E;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x30FC;&#x30E0;&#x898F;&#x5236;&#x3002;

RNA &#xC758;&#xBB34;&#xC801;&#xC778; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; muscleblind &#xAC19;&#xC740; (Mbnl) &#xAC00;&#xC871; &#xC7AC;&#xC0DD; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xADFC;&#xC721;&#xACFC; &#xB208; &#xAC1C;&#xBC1C; &#xBC0F; myotonic &#xC601;&#xC591; &#xC7A5;&#xC560; (DM)&#xB294; &#xD655;&#xC7A5; &#xB41C; CUG &#xB610;&#xB294; CCUG &#xBC18;&#xBCF5; &#xAE30;&#xB2A5; Mbnl &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC744; &#xACE0;&#xAC08;. RNA-seq &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xB1CC;, &#xC2EC;&#xC7A5;, &#xADFC;&#xC721;, &#xBC0F; myoblasts Mbnl &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; transcriptome &#xC218;&#xC900; &#xAE30;&#xB2A5; &#xBC0F; &#xC0DD;&#xBB3C; &#xB9AC; &#xBAA9;&#xD45C; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xBC0F; &#xD074;&#xB9BD; seq &#xC811;&#xADFC;. &#xC774; &#xBD84;&#xC11D; &#xD655;&#xC778; &#xBA87; &#xBC31; &#xC811;&#xD569; &#xC774;&#xBCA4;&#xD2B8; &#xC778; &#xB808; &#xADE4; &#xB808;&#xC774; &#xC158; Mbnl &#xD568;&#xC218; mbnl1&#xC640; Mbnl2 &#xC0AC;&#xC774;&#xC758; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC801; &#xD638;&#xD658;&#xC131;&#xC744; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0B4;&#xB294; &#xD328;&#xD134;&#xC5D0; &#xC758;&#xC874; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB274;&#xD074;&#xB808;&#xC624;&#xD2F0;&#xB4DC; &#xD574;&#xC0C1;&#xB3C4; RNA &#xAD00;&#xB828; &#xB41C; &#xC5B5;&#xC555; &#xB9E4;&#xD551;&#xD558;&#xAC70;&#xB098; exon &#xADFC;&#xCC98; &#xC5B4;&#xB290; 3&#39; Mbnl &#xBC14;&#xC778;&#xB529;&#xC73C;&#xB85C; &#xC811;&#xD569;&#xC758; &#xD65C;&#xC131;&#xD654; &#xACB0;&#xD569; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8; &#xB610;&#xB294; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8;&#xC5D0; &#xAC01;&#xAC01; &#xACB0;&#xD569; &#xD558; &#xADFC;&#xCC98;&#xB97C; &#xB2E4;&#xC6B4;&#xC2A4;&#xD2B8;&#xB9BC; 5&#39;. Transcriptomic &#xBD84;&#xC11D; subcellular &#xAD6C;&#xD68D;&#xC758; &#xB9C8;&#xC6B0;&#xC2A4;&#xC640; &#xCD08;&#xD30C;&#xB9AC; &#xC140; Mrnas&#xC758; &#xC9C0;&#xC5ED;&#xD654; &#xC870;&#xC808;&#xC5D0; Mbnls&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xAE00;&#xB85C;&#xBC8C; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xBC1C;&#xACAC; &#xD558; &#xACE0; Mbnl &#xC885;&#xC18D; &#xBC88;&#xC5ED; &#xBC0F; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xBD84; &#xBE44; Mbnl &#xC885;&#xC18D; &#xC9C0;&#xC5ED;&#xD654; Mrnas&#xC758; &#xD558;&#xC704; &#xC9D1;&#xD569;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xAD00;&#xCC30; &#xB418;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC558;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xACB0;&#xACFC; DM &#xBCD1; &#xC778;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xBA87; &#xAC00;&#xC9C0; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xC758;&#xBBF8;&#xB97C; &#xAC1C;&#xCD5C;.

Muscleblind &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC0AC;&#xC804; mRNA &#xC811;&#xD569; &#xBC0F; mRNA &#xC9C0;&#xC5ED;&#xD654; Transcriptome &#xC218;&#xC900; &#xADDC;&#xC81C;.

El muscleblind-como (Mbnl) la familia de prote&iacute;nas de uni&oacute;n de ARN desempe&ntilde;a importante papel en el desarrollo muscular y el ojo y en la distrofia miot&oacute;nica (DM), en el que repite CUG ampliado o CCUG funcionalmente agota Mbnl prote&iacute;nas. Identificamos todo el transcriptoma objetivos funcionales y biof&iacute;sicas de Mbnl prote&iacute;nas en el cerebro, coraz&oacute;n, m&uacute;sculo y mioblastos usando RNA-seq y CLIP-seq se acerca. Este an&aacute;lisis identific&oacute; varios eventos que empalma cientos cuya regulaci&oacute;n depende de la funci&oacute;n Mbnl en un patr&oacute;n que indica la intercambiabilidad funcional entre Mbnl1 y Mbnl2. Mapa de un nucle&oacute;tido resoluci&oacute;n RNA asociada de la represi&oacute;n o activaci&oacute;n del ex&oacute;n que empalma con el atascamiento Mbnl cerca o 3&#39; sitio del empalme o cerca de las aguas abajo 5&#39; empalme el sitio, respectivamente. An&aacute;lisis transcript&oacute;mico de compartimentos subcelulares descubrieron un rol global para Mbnls en la regulaci&oacute;n de la localizaci&oacute;n de mRNAs en rat&oacute;n y c&eacute;lulas de Drosophila, y secreci&oacute;n de prote&iacute;nas y traducci&oacute;n Mbnl dependientes fueron observados para un subconjunto de mRNAs con localizaci&oacute;n Mbnl-dependiente. Estos resultados tienen varias nuevas implicaciones para la patogenesia de DM.

Neal Cody

Institut de Recherches Cliniques de Montréal (IRCM)

Whole Mount RNA Fluorescent in situ Hybridization of Drosophila Embryos