Genome-wide Purification of Extrachromosomal Circular DNA from Eukaryotic Cells

Extrachromosomal circular DNAs (eccDNAs) are common genetic elements in Saccharomyces cerevisiae and are reported in other eukaryotes as well. EccDNAs ...

Technical University of Denmark

&#x53EF;&#x4EE5;&#x5B9A;&#x4E49;&#x4E3A;&#x591A;&#x7EC6;&#x80DE;&#x805A;&#x5408;&#x79C9;&#x627F;&#x8868;&#x9762;&#x548C;&#x5D4C;&#x5165;&#x5728;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5916;&#x57FA;&#x8D28;&#x4E2D;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x7684;&#x751F;&#x7269;&#x819C;&#x3002;&#x975E;&#x81F4;&#x75C5;&#x6027;&#x9175;&#x6BCD;&#x3001; &#x917F;&#x9152;&#x9175;&#x6BCD;&#xFF0C;&#x9075;&#x5FAA;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x751F;&#x7269;&#x819C;&#x4E0E;&#x7EC6;&#x80DE;&#x548C;&#x7EC6;&#x80DE;&#x8868;&#x9762;&#x7C98;&#x9644;&#x7684;&#x5171;&#x540C;&#x7279;&#x70B9;&#x3002;&#x917F;&#x9152;&#x9175;&#x6BCD;&#x663E;&#x793A;&#x4EE5;&#x4EA7;&#x751F;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5916;&#x57FA;&#x8D28;&#x3001; &#x54CD;&#x5E94;&#x611F;&#x5E94;&#x548C;&#x591A;&#x7EC6;&#x80DE;&#x805A;&#x5408;&#x5DF2;&#x964D;&#x4F4E;&#x5230;&#x6297;&#x771F;&#x83CC;&#x836F;&#x7684;&#x654F;&#x611F;&#x6027;&#x3002;&#x7C98;&#x9644;&#x88AB;&#x4ECB;&#x5BFC;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x8868;&#x9762;&#x86CB;&#x767D;&#x7684; Flo11 &#x5DF2;&#x88AB;&#x8BC1;&#x660E;&#x662F;&#x751F;&#x7269;&#x819C;&#x53D1;&#x5C55;&#x4E0D;&#x53EF;&#x7F3A;&#x5C11;&#x7684;&#x4E00;&#x4E2A;&#x5BB6;&#x5EAD;&#x3002;FLO11 &#x8868;&#x8FBE;&#x5F0F;&#x662F;&#x901A;&#x8FC7;&#x5305;&#x62EC;&#x86CB;&#x767D;&#x6FC0;&#x9176; A &#x548C; mapk &#x4FE1;&#x53F7;&#x8F6C;&#x5BFC;&#x901A;&#x8DEF;&#x8C03;&#x63A7;&#x7684;&#x82E5;&#x5E72;&#x89C4;&#x7BA1;&#x3002;&#x917F;&#x9152;&#x9175;&#x6BCD;&#x751F;&#x7269;&#x819C;&#x6210;&#x5F62;&#x5E94;&#x53D8;&#x80CC;&#x666F;&#x53CA;&#x7EFF;&#x8272;&#x8367;&#x5149;&#x86CB;&#x767D;&#x878D;&#x5408;&#x86CB;&#x767D;&#x96C6;&#x5408;&#x4E2D;&#x5305;&#x62EC;&#x5220;&#x9664;&#x7A81;&#x53D8;&#x83CC;&#x682A;&#x96C6;&#x5408;&#x4E3A;&#x5236;&#x5B9A;&#x4E86;&#x5148;&#x8FDB;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x5DE5;&#x5177;&#x548C;&#x8D44;&#x6E90;&#x3002;&#x6B64;&#x5916;&#xFF0C;S.&#x9175;&#x6BCD;&#x751F;&#x7269;&#x819C;&#x4E5F;&#x88AB;&#x7533;&#x8BF7;&#x5171;&#x7126;&#x6FC0;&#x5149;&#x626B;&#x63CF;&#x663E;&#x5FAE;&#x955C;&#x548C;&#x8367;&#x5149;&#x6807;&#x8BB0;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x3001; DNA &#x548C; RNA&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x6280;&#x672F;&#x53EF;&#x4EE5;&#x7528;&#x4E8E;&#x63ED;&#x793A;&#x751F;&#x7269;&#x819C;&#x8010;&#x836F;&#x53D1;&#x5C55;&#x548C;&#x7814;&#x7A76;&#x7684;&#x5206;&#x5B50;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3001; &#x7EC6;&#x80DE;&#x54CD;&#x5E94;&#x73AF;&#x5883;&#x7EBF;&#x7D22;&#x3001; &#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x53D8;&#x5316;&#x53CA; S.&#x9175;&#x6BCD;&#x751F;&#x7269;&#x819C;&#x4E2D;&#x7684;&#x58C1;&#x9F9B;&#x7684;&#x5206;&#x5B50;&#x673A;&#x5236;&#x3002;&#x917F;&#x9152;&#x9175;&#x6BCD;&#x5BF9;&#x5FF5;&#x73E0;&#x83CC;&#x5C5E;&#x6D3B;&#x52A8;&#x5BC6;&#x5207;&#x76F8;&#x5173;&#xFF0C;&#x662F;&#x8C03;&#x67E5;&#x7684;&#x81F4;&#x75C5;&#x9175;&#x6BCD;&#x751F;&#x7269;&#x819C;&#x6A21;&#x5F0F;&#x3002;&copy; 2012&#x5E74;&#x6B27;&#x6D32;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x4F1A;&#x8054;&#x5408;&#x4F1A;&#x8054;&#x5408;&#x4F1A;&#x3002;&#x7531;&#x5E03;&#x83B1;&#x514B;&#x97E6;&#x5C14;&#x51FA;&#x7248;&#x6709;&#x9650;&#x516C;&#x53F8;&#x51FA;&#x7248;&#x4FDD;&#x7559;&#x6240;&#x6709;&#x7684;&#x6743;&#x5229;&#x3002;

&#x917F;&#x9152;&#x9175;&#x6BCD;-&#x6A21;&#x578B;&#x53D1;&#x73B0;&#x9175;&#x6BCD;&#x751F;&#x7269;&#x819C;&#x751F;&#x7269;&#x7684;&#x5206;&#x5B50;&#x673A;&#x5236;&#x3002;

Microbial biofilms can be defined as multi-cellular aggregates adhering to a surface and embedded in an extracellular matrix. The non-pathogenic yeast, S. cerevisiae, follows the common traits of microbial biofilms with cell-cell and cells-surface adhesion. S. cerevisiae is shown to produce an extracellular matrix, respond to quorum sensing and multi-cellular aggregates have lowered susceptibility to antifungals. Adhesion is mediated by a family of cell surface proteins of which Flo11 has been shown to be essential for biofilm development. FLO11 expression is regulated via a number of regulatory pathways including the protein kinase A and a MAPK pathway. Advanced genetic tools and resources have been developed for S. cerevisiae including a deletion mutant-strain collection in a biofilm forming strain background and GFP-fusion protein collections. Furthermore, S. cerevisiae biofilm is well applied for confocal laser scanning microscopy and fluorophore tagging of proteins, DNA and RNA. These techniques can be used to uncover the molecular mechanisms for biofilm development, drug resistance and for the study of molecular interactions, cell-response to environmental cues, cell to cell variation and niches in S. cerevisiae biofilm. Being closely related to Candida species, S. cerevisiae is a model to investigate biofilms of pathogenic yeast. Â© 2012 Federation of European Microbiological Societies. Published by Blackwell Publishing Ltd. All rights reserved.

Saccharomyces cerevisiae - a model to uncover molecular mechanisms for yeast biofilm biology.

Biofilms microbiens peut &#xEA;tre d&#xE9;finie comme agr&#xE9;gats multicellulaires adh&#xE9;rer &#xE0; une surface et noy&#xE9;e dans une matrice extracellulaire. La levure non pathog&#xE8;ne, S. cerevisiae, suit les traits communs de biofilms microbiens avec cellule-cellule et les cellules de la surface d&#x26;#39;adh&#xE9;rence. S. cerevisiae est montr&#xE9; pour produire une matrice extracellulaire, de r&#xE9;pondre &#xE0; la d&#xE9;tection de quorum et multi-cellulaires ont permis de r&#xE9;duire la sensibilit&#xE9; des agr&#xE9;gats aux antifongiques. L&#x26;#39;adh&#xE9;sion est m&#xE9;di&#xE9;e par une famille de prot&#xE9;ines de surface cellulaire qui Flo11 a &#xE9;t&#xE9; r&#xE9;v&#xE9;l&#xE9;e essentielle pour le d&#xE9;veloppement du biofilm. FLO11 l&#x26;#39;expression est r&#xE9;gul&#xE9;e par l&#x26;#39;interm&#xE9;diaire d&#x26;#39;un certain nombre de voies de r&#xE9;gulation, y compris la prot&#xE9;ine kinase A et une voie MAPK. Outils avanc&#xE9;s g&#xE9;n&#xE9;tiques et les ressources ont &#xE9;t&#xE9; d&#xE9;velopp&#xE9;es pour S. cerevisiae, y compris un mutant de d&#xE9;l&#xE9;tion-souche de collection dans un biofilm formant fond souche et les collections de prot&#xE9;ines de fusion GFP-. En outre, le biofilm de S. cerevisiae est bien appliqu&#xE9; pour la microscopie confocale &#xE0; balayage laser et le marquage des prot&#xE9;ines fluorophore, l&#x26;#39;ADN et l&#x26;#39;ARN. Ces techniques peuvent &#xEA;tre utilis&#xE9;es pour d&#xE9;couvrir les m&#xE9;canismes mol&#xE9;culaires pour le d&#xE9;veloppement du biofilm r&#xE9;sistance aux m&#xE9;dicaments, et pour l&#x26;#39;&#xE9;tude des interactions mol&#xE9;culaires, cellulaires de r&#xE9;ponse &#xE0; des stimuli environnementaux, la cellule &#xE0; la variation de la cellule et les niches dans un biofilm de S. cerevisiae. &#xC9;tant &#xE9;troitement li&#xE9;e aux esp&#xE8;ces de Candida, S. cerevisiae est un mod&#xE8;le pour &#xE9;tudier les biofilms de levure pathog&#xE8;ne. &#xA9; 2012 F&#xE9;d&#xE9;ration Europ&#xE9;enne des Soci&#xE9;t&#xE9;s de Microbiologie. Publi&#xE9; par Blackwell Publishing Ltd Tous droits r&#xE9;serv&#xE9;s.

Saccharomyces cerevisiae - un mod&#xE8;le pour d&#xE9;couvrir les m&#xE9;canismes mol&#xE9;culaires de biologie biofilm levure

Mikrobielle Biofilmen k&ouml;nnen als mehrzellige Aggregate Festhalten an einer Fl&auml;che definiert und in einer extrazellul&auml;ren Matrix eingebettet werden. Die nicht-pathogene Hefe S. Cerevisiae, folgt die gemeinsamen Merkmale der mikrobiellen Biofilmen mit Zell-Zell und Zellen-Oberfl&auml;che Haftung. S. Cerevisiae wird angezeigt, um eine extrazellul&auml;re Matrix zu produzieren, reagieren auf Quorum sensing und mehrzelligen Aggregate haben Anf&auml;lligkeit f&uuml;r Antimykotika gesenkt. Adh&auml;sion ist von einer Familie der Zelle Oberfl&auml;che Proteine vermittelt, von denen Flo11 erwiesen hat, f&uuml;r Biofilm-Entwicklung. FLO11 Ausdruck ist &uuml;ber eine Reihe von Regulationsmechanismen einschlie&szlig;lich der Proteinkinase A und eine MAPK-Signalweg reguliert. Genetische Sonderwerkzeuge und Ressourcen wurden f&uuml;r S. Cerevisiae einschlie&szlig;lich eine L&ouml;schung-Mutant-Dehnungs-Auflistung in einem Biofilm bilden Stamm Hintergrund und GFP-Fusion-Protein-Sammlungen entwickelt. S. Cerevisiae Biofilm ist zudem gut f&uuml;r konfokale Laser-scanning-Mikroskopie und Fluorophor tagging Proteine, DNA und RNA angewendet. Diese Techniken k&ouml;nnen verwendet werden, um die molekularen Mechanismen f&uuml;r Biofilm Entwicklung, Resistenzen und f&uuml;r das Studium der molekularen Interaktionen, Zelle-Reaktion auf &ouml;kologische Hinweise, Variation von Zelle zu Zelle und Nischen in S. Cerevisiae Biofilm aufzudecken. Dass Sie eng mit Candida-Spezies, ist S. Cerevisiae ein Modell, Biofilme pathogene Hefe zu untersuchen. &copy; 2012 F&ouml;deration der Europ&auml;ischen mikrobiologischer Gesellschaften. Ver&ouml;ffentlicht von Blackwell Publishing Ltd. Alle Rechte vorbehalten.

Saccharomyces Cerevisiae - ein Modell, molekulare Mechanismen f&uuml;r die Hefe Biofilm Biologie aufzudecken.

I biofilm microbici possono essere definiti come aggregati pluricellulari aderente a una superficie e incorporati in una matrice extracellulare. Il lievito non patogeno, S. cerevisiae, segue i tratti comuni di biofilm microbici con adesione cellula-cellula e cellule della superficie. S. cerevisiae &egrave; indicato per produrre una matrice extracellulare, rispondere al quorum sensing e aggregati pluricellulari hanno abbassato la suscettibilit&agrave; di antimicotici. Adesione &egrave; mediata da una famiglia di proteine della superficie cellulare di cui Flo11 ha dimostrato di essere essenziale per lo sviluppo di biofilm. FLO11 espressione &egrave; regolata tramite un certo numero di vie regolarici compresa la chinasi di proteina A e un percorso MAPK. Risorse e strumenti genetici avanzati sono state sviluppate per S. cerevisiae, tra cui una collezione di ceppo mutante di delezione in un biofilm formando ceppo sfondo e collezioni della proteina GFP-fusione. Inoltre, S. cerevisiae biofilm &egrave; ben applicato per laser confocale scansione microscopia e fluoroforo tagging delle proteine, DNA e RNA. Queste tecniche possono essere utilizzate per scoprire i meccanismi molecolari per lo sviluppo di biofilm, resistenza ai farmaci e per lo studio delle interazioni molecolari, cellulari-risposta a stimoli ambientali, cellula per cellula variazione e nicchie in S. cerevisiae biofilm. Essendo strettamente correlati alla specie Candida, S. cerevisiae &egrave; un modello per studiare i biofilm di lieviti patogeni. &copy; 2012 Federation of European Microbiological Societies. Pubblicato da Blackwell Publishing Ltd. Tutti i diritti riservati.

Saccharomyces cerevisiae - un modello per scoprire i meccanismi molecolari di biologia di biofilm di lievito.

&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x306E;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA;&#x30D5;&#x30A3;&#x30EB;&#x30E0;&#x306F;&#x3001;&#x8868;&#x9762;&#x306B;&#x4ED8;&#x7740;&#x3057;&#x305F;&#x591A;&#x7D30;&#x80DE;&#x51DD;&#x96C6;&#x4F53;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x5B9A;&#x7FA9;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x304A;&#x308A;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x5916;&#x30DE;&#x30C8;&#x30EA;&#x30C3;&#x30AF;&#x30B9;&#x306B;&#x7D44;&#x307F;&#x8FBC;&#x3080;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x975E;&#x75C5;&#x539F;&#x6027;&#x9175;&#x6BCD;&#x3001;S.&#x30BB;&#x30EC;&#x30D3;&#x30B7;&#x30A8;&#x306F;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE; - &#x7D30;&#x80DE;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x8868;&#x9762;&#x306E;&#x63A5;&#x7740;&#x6027;&#x3092;&#x6709;&#x3059;&#x308B;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x306E;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA;&#x30D5;&#x30A3;&#x30EB;&#x30E0;&#x306E;&#x4E00;&#x822C;&#x7684;&#x306A;&#x7279;&#x6027;&#x306B;&#x5F93;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002; S. cerevisiae&#x306E;&#x306F;&#x3001;&#x6297;&#x771F;&#x83CC;&#x85AC;&#x306B;&#x5BFE;&#x3059;&#x308B;&#x611F;&#x53D7;&#x6027;&#x304C;&#x4F4E;&#x4E0B;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x30AF;&#x30A9;&#x30FC;&#x30E9;&#x30E0;&#x30BB;&#x30F3;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x3068;&#x591A;&#x7D30;&#x80DE;&#x51DD;&#x96C6;&#x4F53;&#x306B;&#x5FDC;&#x7B54;&#x3057;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x5916;&#x30DE;&#x30C8;&#x30EA;&#x30C3;&#x30AF;&#x30B9;&#x3092;&#x751F;&#x6210;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x793A;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x63A5;&#x7740;&#x306F;Flo11&#x304C;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA;&#x30D5;&#x30A3;&#x30EB;&#x30E0;&#x306E;&#x958B;&#x767A;&#x306B;&#x4E0D;&#x53EF;&#x6B20;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x793A;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x8868;&#x9762;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306E;&#x30D5;&#x30A1;&#x30DF;&#x30EA;&#x30FC;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x5A92;&#x4ECB;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x3002; FLO11&#x5F0F;&#x306F;&#x3001;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30A4;&#x30F3;&#x30AD;&#x30CA;&#x30FC;&#x30BC;&#x304A;&#x3088;&#x3073;MAPK&#x7D4C;&#x8DEF;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x306E;&#x6570;&#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x3066;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x9AD8;&#x5EA6;&#x306A;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B66;&#x7684;&#x30C4;&#x30FC;&#x30EB;&#x3068;&#x30EA;&#x30BD;&#x30FC;&#x30B9;&#x306F;&#x3001;&#x6B6A;&#x307F;&#x306E;&#x80CC;&#x666F;&#x3068;GFP-&#x878D;&#x5408;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306E;&#x30B3;&#x30EC;&#x30AF;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x3092;&#x5F62;&#x6210;&#x3059;&#x308B;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA;&#x30D5;&#x30A3;&#x30EB;&#x30E0;&#x306E;&#x6B20;&#x5931;&#x5909;&#x7570;&#x682A;&#x306E;&#x30B3;&#x30EC;&#x30AF;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x3001;S.&#x30BB;&#x30EC;&#x30D3;&#x30B7;&#x30A8;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x958B;&#x767A;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x307E;&#x305F;&#x3001;S. cerevisiae&#x306E;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA;&#x30D5;&#x30A3;&#x30EB;&#x30E0;&#x304C;&#x3088;&#x304F;&#x3001;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3001;DNA&#x3068;RNA&#x306E;&#x5171;&#x7126;&#x70B9;&#x30EC;&#x30FC;&#x30B6;&#x30FC;&#x8D70;&#x67FB;&#x9855;&#x5FAE;&#x93E1;&#x3001;&#x86CD;&#x5149;&#x30BF;&#x30AE;&#x30F3;&#x30B0;&#x200B;&#x200B;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x9069;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x6280;&#x8853;&#x306F;&#x3001;S. cerevisiae&#x306E;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA;&#x30D5;&#x30A3;&#x30EB;&#x30E0;&#x4E2D;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x5909;&#x52D5;&#x3068;&#x30CB;&#x30C3;&#x30C1;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x306F;&#x3001;&#x74B0;&#x5883;&#x624B;&#x304C;&#x304B;&#x308A;&#x306B;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x5FDC;&#x7B54;&#x3001;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA;&#x30D5;&#x30A3;&#x30EB;&#x30E0;&#x306E;&#x958B;&#x767A;&#x3001;&#x85AC;&#x5264;&#x8010;&#x6027;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x5206;&#x5B50;&#x9593;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x5206;&#x5B50;&#x6A5F;&#x69CB;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30AB;&#x30F3;&#x30B8;&#x30C0;&#x7A2E;&#x306B;&#x5BC6;&#x63A5;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3001;S.&#x30BB;&#x30EC;&#x30D3;&#x30B7;&#x30A8;&#x306F;&#x3001;&#x75C5;&#x539F;&#x6027;&#x9175;&#x6BCD;&#x306E;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA;&#x30D5;&#x30A3;&#x30EB;&#x30E0;&#x3092;&#x8ABF;&#x67FB;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x30E8;&#x30FC;&#x30ED;&#x30C3;&#x30D1;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x4F1A;&#xA9;2012&#x9023;&#x76DF;&#x3002;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E;&#x8457;&#x4F5C;&#x6A29;&#x306F;&#x30D6;&#x30E9;&#x30C3;&#x30AF;&#x30A6;&#x30A7;&#x30EB;&#x30D1;&#x30D6;&#x30EA;&#x30C3;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x682A;&#x5F0F;&#x4F1A;&#x793E;&#x304C;&#x767A;&#x8868;&#x3057;&#x305F;&#x3002;

&#x30B5;&#x30C3;&#x30AB;&#x30ED;&#x30DF;&#x30BB;&#x30B9;&#xB7;&#x30BB;&#x30EC;&#x30D3;&#x30B7;&#x30A8;&#xFF08;Saccharomyces cerevisiae&#xFF09; - &#x9175;&#x6BCD;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA;&#x30ED;&#x30B8;&#x30FC;&#x306E;&#x5206;&#x5B50;&#x6A5F;&#x69CB;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3059;&#x308B;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;

&#xBBF8;&#xC0DD;&#xBB3C; biofilms &#xD45C;&#xBA74; &#xC900;&#xC218; &#xBA40;&#xD2F0; &#xC140;&#xB8F0;&#xB7EC; &#xC9D1;&#xACC4;&#xB85C; &#xC815;&#xC758; &#xD558; &#xACE0; &#xC138;&#xD3EC; &#xC678; &#xB9E4;&#xD2B8;&#xB9AD;&#xC2A4;&#xC5D0; &#xD3EC;&#xD568; &#xB41C; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xBE44; &#xBCD1;&#xC6D0; &#xC131; &#xD6A8; &#xBAA8; S. cerevisiae &#xC140; &#xBC0F; &#xC140; &#xD45C;&#xBA74; &#xC811;&#xCC29; &#xB825; &#xAC00;&#xC9C4; &#xBBF8;&#xC0DD;&#xBB3C; biofilms&#xC758; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC778; &#xD2B9;&#xC131;&#xC744; &#xB2E4;&#xC74C;&#xACFC; &#xAC19;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. S. cerevisiae&#xB294; &#xC138;&#xD3EC; &#xC678; &#xAE30;&#xC9C8;&#xC744; &#xC0DD;&#xC131;, &#xCFFC;&#xB7FC; &#xC13C; &#xC2F1;&#xC5D0; &#xC751;&#xB2F5;&#xC744; &#xD45C;&#xC2DC; &#xD558; &#xACE0; &#xBA40;&#xD2F0; &#xC140;&#xB8F0;&#xB7EC; &#xC9D1;&#xACC4;&#xB294; antifungals&#xC5D0; &#xB0B4;&#xB838;&#xB2E4;. &#xC811;&#xCC29; biofilm &#xAC1C;&#xBC1C;&#xC744; &#xC704;&#xD574; &#xD544;&#xC218;&#xC801;&#xC778; &#xAC83;&#xC73C;&#xB85C; &#xD45C;&#xC2DC; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; flo11&#xB294; &#xC138;&#xD3EC; &#xD45C;&#xBA74; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xAC00;&#xC871;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC911;&#xC7AC;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. FLO11 &#xC2DD; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xD0A4; &#xB2C8; &#xC544; &#xC81C; A&#xC640; MAPK &#xACBD;&#xB85C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558; &#xC5EC; &#xADDC;&#xC815; &#xACBD;&#xB85C; &#xD1B5;&#xD574; &#xD1B5;&#xC81C; &#xB41C;&#xB2E4;. &#xACE0;&#xAE09; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xB3C4;&#xAD6C; &#xBC0F; &#xB9AC;&#xC18C;&#xC2A4; biofilm &#xD615;&#xC131; &#xC2A4;&#xD2B8;&#xB808;&#xC778; &#xBC30;&#xACBD;&#xACFC; GFP &#xC735;&#xD574; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xCEEC;&#xB809;&#xC158;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC0AD;&#xC81C; &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774; &#xC2A4;&#xD2B8;&#xB808;&#xC778; &#xCEEC;&#xB809;&#xC158;&#xC744; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558;&#xB294; S. cerevisiae&#xC5D0; &#xAC1C;&#xBC1C; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB610;&#xD55C;, S. cerevisiae biofilm confocal &#xB808;&#xC774;&#xC800; &#xC2A4;&#xCE90;&#xB2DD; &#xD604;&#xBBF8;&#xACBD; &#xAC80;&#xC0AC; &#xBC95; &#xBC0F; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;, DNA &#xBC0F; RNA&#xC758; fluorophore &#xD0DC;&#xADF8;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC801;&#xC6A9; &#xC798; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xBD84;&#xC790; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;, &#xC138;&#xD3EC; &#xBC18;&#xC751; &#xD658;&#xACBD; &#xB2E8;&#xC11C;, &#xC140;&#xC744; &#xBCC0;&#xD615; &#xBC0F; S. cerevisiae biofilm&#xC5D0; &#xD2C8;&#xC0C8; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xB97C; &#xC704;&#xD55C; biofilm &#xAC1C;&#xBC1C;, &#xC57D;&#xBB3C; &#xC800;&#xD56D;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xBD84;&#xC790; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC744; &#xBC1D;&#xD788;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xAE30;&#xC220;&#xC740; &#xC0AC;&#xC6A9;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. Candida &#xC885; &#xBC00;&#xC811; &#xD558; &#xAC8C; &#xAD00;&#xB828; &#xB418; &#xACE0;, S. cerevisiae &#xBCD1;&#xC6D0; &#xC131; &#xD6A8; &#xBAA8; biofilms &#xC870;&#xC0AC; &#xBAA8;&#xB378;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &copy; 2012 &#xC5F0;&#xBC29; &#xC720;&#xB7FD; &#xBBF8;&#xC0DD;&#xBB3C; &#xD559;&#xD68C;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xBE14;&#xB799; &#xC6F0; &#xCD9C;&#xD310;&#xC0AC; &#xD68C;&#xC0AC;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xAC8C;&#xC2DC; &#xBAA8;&#xB4E0; &#xAD8C;&#xB9AC; &#xBCF4;&#xC720;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Saccharomyces cerevisiae-&#xD6A8; &#xBAA8; biofilm &#xC0DD;&#xBB3C;&#xD559; &#xBD84;&#xC790; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC744; &#xBC1D;&#xD788;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xBAA8;&#xB378;.

Biopel&#xED;culas microbianas se puede definir como multicelulares agregados adherirse a una superficie y embebidos en una matriz extracelular. La levadura no pat&#xF3;gena, S. cerevisiae, se ajusta a las caracter&#xED;sticas comunes de las biopel&#xED;culas microbianas con la adhesi&#xF3;n c&#xE9;lula-c&#xE9;lula y las c&#xE9;lulas de la superficie. S. cerevisiae se muestra para producir una matriz extracelular, respuesta a la detecci&#xF3;n de qu&#xF3;rum y agregados multicelulares han disminuido la susceptibilidad a los antif&#xFA;ngicos. Adhesi&#xF3;n est&#xE1; mediada por una familia de prote&#xED;nas de la superficie celular de los cuales Flo11 ha demostrado ser esencial para el desarrollo del biofilm. FLO11 expresi&#xF3;n est&#xE1; regulada a trav&#xE9;s de una serie de v&#xED;as reguladoras incluyendo la prote&#xED;na quinasa A y una v&#xED;a MAPK. Las herramientas avanzadas de recursos gen&#xE9;ticos y se han desarrollado para S. cerevisiae como un mutante de deleci&#xF3;n-cepa de colecci&#xF3;n en una formaci&#xF3;n de biofilm cepa de antecedentes y de fusi&#xF3;n GFP-colecciones de prote&#xED;nas. Adem&#xE1;s, la biopel&#xED;cula de S. cerevisiae es bien aplicado por microscop&#xED;a confocal de barrido l&#xE1;ser y etiquetado fluor&#xF3;foro de prote&#xED;nas, ADN y ARN. Estas t&#xE9;cnicas se pueden utilizar para descubrir los mecanismos moleculares de resistencia a la biopel&#xED;cula de desarrollo de f&#xE1;rmacos, y para el estudio de las interacciones moleculares, la respuesta celular a las se&#xF1;ales ambientales, de c&#xE9;lulas a la variaci&#xF3;n de c&#xE9;lulas y nichos en el biofilm de S. cerevisiae. Est&#xE1; estrechamente relacionada con las especies de Candida, S. cerevisiae es un modelo para investigar las biopel&#xED;culas de hongos pat&#xF3;genos. &#xA9; 2012 Federaci&#xF3;n Europea de Sociedades de Microbiolog&#xED;a. Publicado por Blackwell Publishing Ltd. Todos los derechos reservados.

Rasmus K. Bojsen

National Veterinary Institute

Technical University of Denmark

Genome-wide Purification of Extrachromosomal Circular DNA from Eukaryotic Cells

Rasmus K. Bojsen

.css-o250i3{font-size:18px;font-family:Open Sans,sans-serif;line-height:21.6px;}National Veterinary Institute

Technical University of Denmark

Genome-wide Purification of Extrachromosomal Circular DNA from Eukaryotic Cells

National Veterinary Institute