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Method Article
Ein grundlegendes Problem in unserem Verständnis der kortikalen Schaltung ist, wie Netzwerke in verschiedenen kortikalen Schichten kodieren sensorische Informationen. Hier beschreiben wir elektrophysiologische Techniken unter Verwendung von Multi-Contact-laminar Elektroden an Single-Einheiten und lokale Feld Potenziale und vorliegenden Analysen Datensatz kortikalen Schichten zu identifizieren.
Kortikalen Schichten sind allgegenwärtig Strukturen im gesamten Neokortex 1-4, dass der hochgradig rezidivierendem lokalen Netzwerken bestehen. In den letzten Jahren wurden erhebliche Fortschritte in unserem Verständnis der Unterschiede wurden in Reaktion Eigenschaften von Neuronen in verschiedenen kortikalen Schichten 5-8 gemacht, aber es gibt noch viel zu links, ob und wie neuronale Populationen kodieren Informationen in einer Laminar-spezifischen lernen Art und Weise.
Bestehende Multi-Elektroden-Array-Techniken, obwohl informative zur Messung Antworten auf viele Millimeter der kortikalen Raum entlang der kortikalen Oberfläche, sind ungeeignet, um das Problem der laminaren kortikalen Schaltkreisen Ansatz. Hier präsentieren wir unsere Methode für den Aufbau und die Aufnahme einzelner Neurone und lokale Feld-Potentiale (LFPs) über kortikale Schichten der primären Sehrinde (V1) unter Verwendung von Multi-Contact-laminar Elektroden (Abbildung 1; Plextrode U-Probe, Plexon Inc).
Die Methoden enthalten sind Aufnahmegerät Konstruktion, die Identifizierung von kortikalen Schichten und die Identifizierung der rezeptiven Felder von einzelnen Neuronen. Zur Identifizierung kortikalen Schichten, messen wir die evozierte Potentiale (EKP) des LFP Zeitreihen mit Full-Field geflasht Reize. Wir führen Sie dann Strom-Quelle Dichte (CSD) Analyse auf die Umpolung von der sink-source-Konfiguration an der Basis der Schicht 4 (die Spüle ist in Schicht 4, nachfolgend als Körnerschicht 9-12 bezeichnet) ermittelt werden können. Current-Source-Dichte ist nützlich, weil es ein Indiz für die Lage, Richtung und Dichte der transmembrane Stromfluss sorgt, so dass wir genau zu positionieren Elektroden aus allen Schichten in einem einzigen Eindringen 6, 11, 12 aufzunehmen.
1. NAN Microdrive Bau
Wir nutzen die U-Probe in Kombination mit dem NAN-Elektrode Antriebssystem. Der Aufbau dieses Systems erfordert 2-3 Stunden, aber einmal gebaut ist es sehr einfach zu modifizieren. Wir beginnen mit der Montage der NAN Turm, der ein 4-Kanal-Base (Abbildung 2a) umfasst, die NAN Kammer (Abb. 2b), das Gitter mit 1 mm Abstand (Abbildung 2c), 1-4 Schraube Microdrives (Abbildung 2d), 1 -4 Führungsrohre (Abbildung 2e, 500 Mikrometer Durchmesser und geschnitten, um ca. 5-7 cm) und 1-4 Microdrive Türme (Abbildung 2f). Der Einfachheit halber werden wir beschreiben, das Verfahren für den Bau des NAN-System mit einem Turm und einem U-Probe. Nach einigem Training, dieses Verfahren dauert in der Regel 2-3 Stunden, wenn alle Materialien vorhanden sind.
2. U-Probe Sterilisation
Die laminare Elektrode oder Plextrode U-Probe wird aus Plexon Inc. erworben und ist zu einem Preis von etwa $ 2000 zur Verfügung - 4000 $. Der Preis richtet sich im Wesentlichen auf drei Aspekte: die Zahl der Kontaktstellen, die Konfiguration von Websites und der Durchmesser der einzelnen Websites. Wir sind derzeit mit dem 16-Kanal-Version mit einer linearen Anordnung und ein Kontakt-Durchmesser von 25 um. Wichtig ist, dass die Dicke der U-Probe direkt in den Kontakt Durchmesser zusammen. In unseren Experimenten haben wir immer 25 Mikrometer Durchmesser Kontakte, die gleich ein 360 mu m Dicke verwendet wird. Die gegenwärtigen Kosten für unsere Version Modell ist ungefähr $ 3500 Dollar. Die U-Probe kommt verpackt in einer Elektrode Fall mit Jumper und Erdungskabel und die Vorlaufzeit vom Einkauf bis zur Auslieferung beträgt ca. 4-6 Wochen.
3. Advancing the U-Probe für die Aufzeichnung
Da die Festigkeit und Dicke der Dura sehr variabel zwischen Subjekten ist, haben wir ein allgemeines Verfahren für die Förderung des U-Pro implementiertwerden mit dem NAN Microdrive-System. Wichtig ist, kommt jeder U-Probe mit einer detaillierten Analyse der einzelnen Kontakte Impedanz und die gesamte Ranger für die U-Probe. Wir verwendeten Elektroden, deren Kontakte Impedanzen reichten von 0,3 bis 0,5 MOhm. Derzeit gibt es eine Impedanz-Tester für den Kauf von Plexon aber leider zur Zeit unserer Aufnahmen dieses Gerät nicht verfügbar war. Als Ergebnis haben wir nicht in der Lage, eine detaillierte Analyse der Impedanz führen.
4. Identifikation und Verifikation der kortikalen Schichten
Wir haben ein Verfahren zur Identifizierung kortikalen Schichten mit einem evozierte Potential (ERP)-Paradigma und Strom-Source-Dichte (CSD) Analyse durchgeführt. Wir verließen uns auf die CSD, weil es ein Indiz für die Lage, Richtung und Dichte der transmembrane Stromfluss sorgt, so dass wir genau zu positionieren Elektroden aus allen Schichten in einem einzigen Eindringen aufzunehmen. In der Tat haben Charles Schroeder und seine Kollegen zuvor laminaren Aufnahme microlesion und histologischen Rekonstruktion, um die Wirksamkeit der ERP / CSD-Methode in die funktionale Identifizierung der kortikalen Schichten in V1 9-12 Validierung kombiniert. Andere Methoden mit den spontan erzeugten Schwingungen wurden verwendet, um kortikale Tiefe wie kortikale Spindeln und up / down Staaten 13-15 identifizieren.
Für diese Analyse nutzen wir die ICSD Toolbox für MATLAB, die den CSD berechnet nach der 2. räumlichen Ableitung der LFP Zeitreihen über die gleichmäßig verteilten Kontakte der U-Probe ( http://software.incf.org/ Software / csdplotter / home ) 9,10,16,17.
5. Identifizierung von einzelnen Neuronen und rezeptiven Feld-Mapping
Wir hatten großen Erfolg mit Isolierung und Aufnahme mehrerer Einzelgeräte aus dem U-Probe. Auf einem in der Regel der Aufnahme können wir erwarten, zu 6-10 gut isolierte Einheiten und 14-16 lokale Feld potenzieller Signale haben. Finding einzelnen Einheiten ist auch zuverlässiger mit der U-Probe im Vergleich zu Single-Elektroden. Selbst wenn man all die notwendige Hardware zu verwenden, um genau vorher 16 Elektroden wurden, würden sie nicht in der Lage sein Netzwerk Populationen in Abhängigkeit von der kortikalen Schichten so präzise wie mit der U-Probe zu erkunden. Schließlich haben wir in der Regel mit den gleichen U-Probe für 30-40 Durchdringungen aufzunehmen.
6. Repräsentative Ergebnisse: Aufnahmen der einzelnen Einheiten und LFPs über kortikale Schichten aus primären visuellen Kortex
Einer der wichtigsten Schritte in der Analyse mit dem laminaren Elektroden ist, um zuverlässig zu identifizieren kortikalen Schichten und überprüfen Sie diese Identifikation über viele Stunden und Sitzungen. So haben wir den evozierte Potentiale (EKP) des LFPs über laminar Kontakte in Reaktion auf einen Full-Field geflasht Reiz (Abbildung 3a). Abb. 3b zeigt ein Beispiel für die Art der Informationen, die man braucht, um zu erhalten, um den aktuellen Source-Dichte (CSD), die kortikalen Schichten identifizieren zu berechnen. Wir haben dann die CSD Analyse der LFP Zeitreihen eingesetzt, um die Umpolung von der sink-source-Konfiguration an der Basis der Schicht 4 ermittelt werden können. Abbildung 4a zeigt die CSD-Analyse bei der Lokalisierung von kortikalen Schichten über kortikale Tiefe als Funktion der Zeit - die Position der supragranular (SG), blieb granulare (G) und infragranular (IG)-Schichten auch vier Stunden nach der Aufnahme-Session begann stabil. Abbildung 4b enthält CSD Spuren, dass die durchschnittliche dieser Kontakte, die einem bestimmten Layer darstellen - in diesem Beispiel erfährt der Körnerschicht eine deutliche Abnahme der CSD Amplitude bei ~ 50 ms. Diese Analyse diente als Referenz an die Elektrode Kontakte oberhalb und unterhalb der Körnerschicht zuweisen supragranular und infragranular Schichten (bzw. den Kontakt mit dem größten Spülcenter-of-Masse als die Körnerschicht Referenz bei 0 um served).
Ein weiterer kritischer Analyse mit dem laminaren Elektrode genau zu identifizieren und zu lokalisieren die Neuronen 'rezeptiven Feld. Dieses Verfahren ist von entscheidender Bedeutung für die Positionierung der Anreiz für die robusteste Reaktion der Neurone zu generieren. 5a ist ein Beispiel für zwei rezeptiven Feld Grundstücke von Neuronen im primären visuellen cortex (V1). Der Ursprung dieser Grundstücke ist der Fixationspunkt, der einen kleinen weißen Kreis zentral auf einem schwarzen Bildschirm angezeigt wird. Die Farbe in diesen Parzellen stellt die Feuerrate von jedem Neuron in Reaktion auf eine dynamische umgekehrter Korrelation Reiz. Wir verwenden diese Informationen, um die Anreize für ein bestimmtes Experiment (z. B. eine Sinus-Gitter) Position. Stimuli, die präsentiert werden sind größer als die durchschnittliche rezeptiven Feld Größe, um rezeptiven Feld Standorte aller gleichzeitig aufgenommen Neuronen umfassen.
Nachdem wir kortikalen Schichten zu identifizieren und die Position der Reiz in der optimalen rezeptiven Feld Ort können wir auf die experimentelle Protokoll, in dem wir derzeit verschiedene visuelle Reize vor, während das Tier führt über Fixierung oder Diskriminierung Aufgaben. Nach dem Experiment, führen wir unsere spike-Wellenform-Analyse, um die Single-Einheiten konnten wir den gleichen Kanal aufzeichnen zu isolieren. Dieser Vorgang dauert oft einige Zeit zu beherrschen und wird ständig verbessert, als neue Analyse-Software und-techniken zur Verfügung gestellt werden. Abbildung 5b ist ein Beispiel für die Art der Ausgabe der Reihe nach mit Plexon Offline Sorter erwarten. Mit dieser Software Einheit Isolation wird durch visuelle Inspektion durchgeführt. Ausgeprägte Cluster sind bezogen auf das Gewicht der ersten und zweiten Hauptkomponenten, spike Breite, das Tal und Gipfel Eigenschaften identifiziert.
Abbildung 1. Multi-Contact-Laminar-Elektroden mit Multi-Contact-laminar Elektroden verzeichneten wir gleichzeitig spiking Aktivität von isolierten einzelnen Neuronen und LFP-Einheiten über kortikale Schichten von V1. Jedes U-Probe besteht aus 16 gleichen Abstand (100 um) Elektrode Kontakte überspannt mit einer Gesamtlänge von 1,6 mm. Jede Elektrode Kontakt ist 25 mu m im Durchmesser und besteht aus Platin-Iridium besteht.
Abbildung 2. NAN Gitterkonstruktion Die NAN Microdrive-System sorgt für zusätzliche Stabilität und Präzision über die klassische Schraube angetrieben Microdrive. Jede Gruppe von Elektroden ist unabhängig in der XY-Ebenen manipuliert, in einem benutzerdefinierten Arbeitsbereich. Jede Gruppe von Elektroden ist unabhängig in Z-Richtung innerhalb einer benutzerdefinierten Arbeitstiefe (bis zu 100 mm) und variablen Drehzahlbereich von 0.001 mm / sec bis 0,5 mm / sec und einer hohen Auflösung von 1 Mikrometer manipuliert (a) 4. - Rinnensohle, (b) die NAN Kammer, (c) das Raster mit 1 mm Abstand (d) 1-4 Schrauben Microdrives, (e) 1-4 Führungsrohre (500 Mikrometer Durchmesser und geschnitten, um ca. 5-7 cm) , (f) 1-4 Microdrive Türme und (g) das ausgefüllte NAN und Zylinderfuß.
Abbildung 3. Evozierte Reaktion Potenzial Paradigma und LFP Zeitreihen (a) Um kortikalen Schichten zu identifizieren, messen wir die evozierte Potential (ERP) während einer passiven Fixierung Aufgabe, während Affen zu einem Full-Field-schwarzen Bildschirm, der weiß (~ 1 Hz) für 100 geflasht ausgesetzt waren ms, und dann zu schwarzen Zahlen zurückgekehrt. (b) Die LFP Antworten mit den laminaren U-Probe aufgezeichnet verarbeitet wurden, um ERP Spuren für jeden Kontakt zu erhalten. Das körnige Schicht wurde in allen Sitzungen der Suche nach einem Waschbecken-driven Inversion in der Amplitude der Reaktion in das ERP-Spuren, und durch die Anwesenheit der Umpolung von der sink-source-Konfiguration an der Basis der Schicht 4 begleitet bestimmt. Die gepunktete Box zeigt das Timing der Zeit, wenn die Inversion eingetreten ist.
Abbildung 4. Layer-Identification mit Strom-Source-Dichte-Analyse (a) Strom-Source-Dichte-Analyse (basierend auf den 2 nd räumliche Ableitung der LFP Zeitreihen) wurde verwendet, um die Umpolung von der sink-source-Konfiguration auf der Basis der Begleitung zu identifizieren Körnerschicht. Wir untersuchten, wie stabil die Identifizierung von kortikalen Schichten im Laufe der Zeit beibehalten wird (von links nach rechts). In diesen Beispielen ist die Stromsenke (blau) der Körnerschicht und erstreckt sich über ~ 400 um. (B) Der CSD Spuren unterhalb jeder Parzelle stellen die durchschnittlichen CSD dieser Kontakte, die einem bestimmten Schicht. Dies erlaubte uns, den genauen Zeitpunkt der ersten Senke (in diesen Beispielen ~ 50-60 ms. CSD Spur Umschläge repräsentieren die Standardabweichung und schwarzen Balken zeigen die Dauer der geflasht Reiz (100 ms). Ermitteln
Abbildung 5. Spike Sortier-und rezeptiven Feld-Mapping (a) Zunächst wird eine halbe visuelle Grad berechnet und verdoppelt. Dann werden umgekehrter Korrelation Reize in Flecken auf einem CRT-Monitor c präsentiertonsisting orientierter Gitter bei 0, 45, 90 und 135 Grad. Firing Tarife für jedes Neuron unabhängig voneinander bei 5 ms Intervalle zwischen 40 bis 120 ms berechnet nach Anregungen für jede räumliche Lage werden vorgestellt. Die maximale Brenntemperatur Preise sind berechnet und dann den Schwerpunkt für jede Zeitverzögerung. Dann, auf jede Verzögerung der Abstand zwischen dem Schwerpunkt und der angrenzenden Feuerrate Standorten berechnet. Die zeitliche Verzögerung mit dem minimalen Abstand als das rezeptive Feld gewählt. (B) Spike Wellenform Eigenschaften wie Peakhöhe, Taltiefe, peak to valley, Zeit der Gipfel oder Tal, etc. analysiert werden mit einer Offline-Sortierung Software-Programms ( Plexon). Spikes sind auf ähnliche Eigenschaften sortiert, bis Wellenformen von einem Neuron ohne Überlappung von einem anderen konzentriert sind.
Abbildung 6. Shuffled CSD-Profil. Same Konvention wie in Abb. 3a, aber wir führten eine schlurfenden Verfahren, das zufällig aus einer neuen CSD-Matrix mit den Kontaktstellen gemischt. Diese Analyse wird verwendet, um eine bessere Validierung des körnigen sinken durch das Mischen der Elektrodenpositionen Verlassen des zeitlichen Bereich unverändert. Aus diesen Beispielen im Laufe der Zeit angezeigt, das Mischen der Elektrode Kontakte als Funktion der kortikalen Tiefe zerstören alle laminar Spezifität.
Multi-unit-Aufnahmen sind zum Standard geworden für die Analyse, wie neuronale Netzwerke im Kortex Stimulus Informationen zu kodieren. Angesichts der jüngsten Fortschritte in der Elektroden-Technologie, ermöglicht die Implementierung von laminar Elektroden eine beispiellose Charakterisierung von lokalen kortikalen Schaltkreisen. Obwohl Multi-Elektroden-Aufnahmen nützliche Informationen über neuronale Populationsdynamik bieten, können mehrere Laminar Elektroden eine höhere Auflösung und mehr Informationen über d...
Keine Interessenskonflikte erklärt.
Wir danken Ye Wang für Diskussionen und Sorin Pojoga für Verhaltenstraining. Unterstützt durch die NIH EUREKA-Programm, das National Eye Institute, die Pew Scholars Program, die James S. McDonnell Foundation (VD), und ein NIH Vision Training Grant (BJH).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Name der Ausrüstung | Firma | Katalog-Nummer | Kommentare |
Nan Microdrive-System | Nan Instruments | NAN-S4 | Abbildung 2. Benutzerdefinierte Klammern sind notwendig, um die U-Probe verwenden. Alles mit Ausnahme der U-Probe erwähnt wird durch NAN Instrumente zur Verfügung gestellt. |
Screw Microdrives | MIT-Maschine-Shop | Alles, was in der Lage, ein Führungsrohr der NAN Netz sicher ist angemessen sein. | |
Stainless Steel Führungsrohre | Kleinteile | B00137QHNS (1) oder B00137QHO2 (5) | Dies sind 60 in langen und Zuschnitte in das Labor mit einem Dremel Bohrmaschine |
Plexon U-Probe | Plexon, Inc | PLX-UP-16-25ED-100-SE-360-25T-500 | Siehe U-Probe Spezifikationen finden Sie unter www.plexon.com siehe auch Abbildung 1. |
Tabelle 1. Hardware.
Name der Software | Firma | Webseite | Kommentare |
NAN-Software | NAN | http://www.naninstruments.com/DesignConcept.htm | Computer-Schnittstelle erfordert eine zusätzliche serielle Schnittstelle zur Plexon und die NAN Hardware unterbringen |
Offline-Sorter, FPAlign, PlexUtil, MATLAB-Programmen | Plexon | http://www.plexon.com/downloads.html # Software | Unter "Installation Packages" |
NeuroExplorer | NeuroExplorer | http://www.neuroexplorer.com/ | Unter "Ressourcen" |
CSDplotter Version 0.1.1 | Klas H. Petterson | http://arken.umb.no/ ~ klaspe / user_guide.pdf |
Tabelle 2. Software.
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