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Method Article
Ein Verfahren, durch welches die Genexpression in der Neuralrohr sein herunterreguliert kann in einem Zelltyp-spezifische, nachvollziehbar beschrieben. Wir zeigen, wie In ovo Elektroporation von microRNA-basierte Plasmide, raumzeitlich kontrollierten RNA-Interferenz auslösen kann verwendet werden, um commissural Axon Führung in der Entwicklung von Neuralrohrdefekten zu untersuchen.
Kommissuralen dI1 Neuronen wurden ausführlich untersucht, um die zugrunde liegenden Mechanismen Axon Führung während der Entwicklung 1,2 aufzuklären. Diese Neuronen sind im dorsalen Rückenmark und schicken ihre Axone entlang stereotype Bahnen. Kommissuralen Axone zunächst ventral projizieren Richtung und dann über der Bodenplatte. Nach dem Überqueren der Mittellinie, machen diese Axone eine scharfe rostral Turn und Projekt längs zum Gehirn. Jeder dieser Schritte wird durch die koordinierte Tätigkeit der anziehenden und abstoßenden Signalmoleküle reguliert. Die richtige Interpretation dieser Signale ist entscheidend für die Führung von Axonen entlang ihrer abgegrenzten Weg. Somit wird die physiologische Beitrag eines bestimmten Moleküls zu kommissuralen Axon Führung idealerweise im Rahmen des lebenden Embryo untersucht. Dementsprechend müssen Gen knockdown in vivo exakt gesteuert werden, um sorgfältig zu unterscheiden Axon Führung Aktivitäten von Genen, die spielen möglicherweise mehrereRollen während der Entwicklung.
Hier beschreiben wir ein Verfahren zur Knockdown Genexpression im Huhn Neuralrohr in einem Zelltyp-spezifische, nachvollziehbar. Wir verwenden neuartige Plasmidvektoren 3 beherbergen zelltypspezifischen Promotoren / Enhancer, die die Expression eines Fluoreszenzprotein-Marker anzutreiben, direkt gefolgt von einer miR30-RNAi-Transkript 4 (die sich in dem 3'-UTR von der cDNA, die das fluoreszierende Protein) ( Abbildung 1). Wenn in den Entwicklungsbehälter Neuralrohr elektroporiert, hervorzurufen diese Vektoren effiziente Herunterregulation der Genexpression und exprimieren hell fluoreszierenden Marker Proteine ermöglichen die direkte Verfolgung der Zellen erleben Knockdown 3. Mischen verschiedener RNAi-Vektoren vor der Elektroporation erlaubt die gleichzeitige Knockdown von zwei oder mehreren Genen in unabhängigen Bereichen des Rückenmarks. Dies erlaubt komplexen zellulären und molekularen Wechselwirkungen während der Entwicklung untersucht werden, in einer Weise, die schnell, sUmsetzung, präzise und kostengünstig. In Kombination mit DiI Tracing von commissural Axon Trajektorien in Open-book-Präparate 5, ist diese Methode ein nützliches Werkzeug für die in-vivo-Studien der zellulären und molekularen Mechanismen der commissural Axonwachstum und Führung. Im Prinzip könnte jede Promotor / Enhancer verwendet werden, möglicherweise macht die Technik breiter anwendbar für in vivo Studien der Genfunktion während der Entwicklung 6.
Dieses Video zeigt, wie zu handhaben und Fenster Eier, die Injektion von DNA-Plasmiden in das Neuralrohr und die Elektroporation Verfahren. Um commissural Axon Führung zu untersuchen, wird das Rückenmark aus dem Embryo als Open-book-Präparation entfernt, fixiert und injiziert mit DiI zu ermöglichen Axon Wege zu verfolgen. Das Rückenmark wird zwischen Deckgläsern montiert und visualisiert mit Hilfe der konfokalen Mikroskopie.
Ein. Vorbereitung der RNAi Plasmid-DNA für Zelltyp-spezifische Gene Silencing
Plasmide (Abbildung 1) synthetisiert werden unter Verwendung von Standard molekulare Klonierungstechniken, wie zuvor im Detail beschrieben 3,4.
1,1 Klonierung in den Vektoren: oligonucelotide Design
Ein Beispiel für Silencing GFP ist unten gezeigt.
Zielsequenz (22nt): 5'-GGCACAAGCTGGAGTACAACTA
GFP Vorwärts HP1 = 59mer
GFP umgekehrt HP1 = 58mer
Es gibt eine gemeinsame Sequenzen in diesen Oligos dass ein Teil der miRNA flankierenden Sequenzen (Huhn-spezifisch) und gemeinsamen Schleife / Stammsequenzen (aus menschlichen miRNA30) zu bilden. Die genspezifischen Zielsequenzen sind unterstrichen. Beachten Sie, dass es amIsMatch am 5'Basis des Vorlauftrum (fettgedruckt dargestellt; G → A in diesem Beispiel), um die natürliche Fehlpaarung in miRNA30 an dieser Position zu imitieren.
Ein Beispiel für Silencing LacZ ist unten gezeigt.
Zielsequenz (22nt): 5'-CGCGCTGTATCGCTGGATCAAA
LacZ Vorwärts HP2:
LacZ umgekehrt HP2:
Beachten Sie, dass wiederum der 5'-Base der Zielsequenz in der Vorlauftrum geändert wurde (fettgedruckt, C → A in diesem Beispiel), so dass es die Antisense-Sequenz Fehlpaarungen, imitiert miRNA30.
1,2 PCR Reaktion und Subklonierung
Klonierung in ersten Haarnadelkurve Website: 1 ul - 10 ng GFP Vorwärtsprimer HP1 1 ul - 100 ng 5 'Primer HP1 1 ul - 100 ng 3 'Primer HP1 1 ul dNTPs (10 mM) 5 ul 10x Pfu Reaktionspuffer 1 ul Pfu DNA-Polymerase (Promega) 39 ul PCR-Grade Wasser | OR | Klonierung in zweiter hairpin Website: 1 ul - 10 ng LacZ Vorwärtsprimer HP2 1 ul - 100 ng 5 'Primer HP2 1 ul - 100 ng 3 'Primer HP2 1 ul dNTPs (10 mM) 5 ul 10x Pfu Reaktionspuffer 1 ul Pfu DNA-Polymerase (Promega) 39 ul PCR-Grade Wasser |
Zyklen:
94 ° C | 94 ° C | 55 ° C | 72 ° C | 72 ° C | 4 ° C |
1 min | 30 sec | 30 sec | 1 min | 9 min | halten |
30 Zyklen |
1,3 Sequencing miRNA-Plasmiden
Unter normalen Bedingungen die Sequenzierungsreaktion scheitert oft an starken sekundären Struktur der Haarnadeln. Um diese 7 zu verbessern:
2. Elektroporation
2,1 Egg Handling
2.2 Herstellung von Reagenzien und Ausrüstung
2,3 Windowing
2,4 Elektroporation
RNAi-Plasmid-DNA (in H 2 0) | X ul |
20x PBS | 1 ul |
0,4% Trypanblau | 2 ul |
sterile ddH 2 0, bis zu einem Endvolumen von | 20 ul |
Verwenden Sie sanfte Saugwirkung, um die DNA-Mischung in das Glas auf den Schlauch befestigt Mikrokapillare laden.
3. Spinal Cord Vorbereitungen
3,1 Dissection von Embryonen
3,2 Isolierung von Rückenmark von Embryonen
3,3 Fixation von Open-Bücher
3.5 Montage für die Bildgebung
4. Repräsentative Ergebnisse
Elektroporation und Expression von Plasmiden
Unter demvorstehend beschriebenen Bedingungen sollte fluoreszierendes Protein eindeutig nachweisbare im entsprechenden Zelltyp ohne die Notwendigkeit für eine zusätzliche Verstärkung des Signals durch Antikörpermarkierung. Das fluoreszierende Protein sollte nur in der gewünschten Zelltyp / s nachweisbar. Repräsentative Beispiele für Open-book Zubereitungen und Querschnitte von Embryonen mit den verschiedenen Plasmiden elektroporiert werden in Abbildung 2 dargestellt.
Effizienz der künstlichen miRNAs
Künstliche miRNAs gegen ein neues Gen von Interesse muss zunächst für die Effizienz und Spezifität ihrer knockdown Effekte untersucht werden. Wir finden, dass β-Aktin-Promotor-driven Konstrukte, bei 0,25 ug / ul elektroporiert, geeignet für diese 3 sind. Knockdown in vivo kann durch Immunhistochemie oder in situ Hybridisierung getestet werden.
DiI Kennzeichnung
Entsprechend gezielte DiI Injektionen in Wildtyp Embryonensollte mehr als 80% der Injektionsstelle bei ideal, archetypische Bahnen 3 ergibt, wie in Abbildung 3 dargestellt. Tier zu Tier Variabilität sollte niedrig sein.
Abbildung 1. Generalized schematische der miRNA-exprimierenden Plasmidvektoren. Die Verwendung von verschiedenen RNA-Polymerase II-Promotoren / Enhancern ermöglicht Zelltyp-spezifische Expression. Die transfizierten Zellen können durch den Ausdruck eines fluoreszierenden Reporter, der direkt verbunden ist (innerhalb eines einzigen Transkript), ein oder zwei künstliche miRNAs, die niederzuschlagen Genexpression. Fett gedruckten Text gibt den Sense-Strang eines künstlichen miRNA gegen LacZ, wie im Text beschrieben.
Abbildung 2. Repräsentative Beispiele of fluoreszierendes Protein Expressionsmuster erhalten nach der Elektroporation der angegebenen Plasmidvektoren. Querschnitte und offene Bücher sind von HH25-26 Hühnerembryonen, die bei HH18 elektroporiert wurden. β-Aktin-Promotor die ubiquitäre Expression treibt Math1 Enhancer die Expression in Neuronen und dI1 HOXA1 Enhancer antreibt Expression spezifisch in der Bodenplatte. CN, commissural Neurons; FP, Bodenplatte.
Abbildung 3. Anwendung und Analyse der DiI Injektionsstellen in offenes Buch Vorbereitungen. DiI sollte in einem punktförmigen Muster injiziert werden kann, nahe dem seitlichen Rand des offenen Buches auf dem elektroporierten Seite (identifiziert durch fluoreszierendes Protein Expression). Nach 3 Tagen der Diffusion, sollte kommissuralen Axon Trajektorien sein zu können unter Fluoreszenzmikroskopie sichtbar gemacht. Normale Axon Bahnen wird auf den Boden p wachsenEnde, überqueren Sie die Bodenplatte und dann wachsen und rostral. Abnormal Phänotypen aus Gen-knock down kann auf diese archetypischen Trajektorie verglichen werden. In dem Beispiel, machen einige Axone Stall in der Bodenplatte oder fehlerhafte Drehen Entscheidungen auf der Gegenseite.
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Diese einfache, vektorbasierten künstlichen miRNA Expressionsstrategie kann Knockdown endogenen Genexpression in dem Neuralrohr Huhn verwendet werden. Diese funktionale Tools bieten mehrere Gen-Silencing, zeitliche Steuerung und Zelltyp-Spezifität, die Aufklärung komplexer Entwicklungsverläufe zu erleichtern. Insbesondere haben wir die Brauchbarkeit dieser Plasmide in kommissuralen Axon Führung gezeigt, da die Plasmide können zur Knockdown verschiedenen Genen in kommissuralen Neuronen oder in ihren Zwischenziel, d...
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Keine Interessenskonflikte erklärt.
Arbeit im Labor von ES wird durch die Swiss National Science Foundation unterstützt. Wir danken Herrn Dr. Beat Kunz für die Unterstützung bei Dreharbeiten zu danken.
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Name | Company | Catalog Number | Comments |
Namen Reagenz | Firma | Katalog-Nummer | |
0,5 mm Glaskapillaren | World Precision Instruments | 1B120F-4 | |
Glasnadel puller | Narishige | PC-10 | |
Electroporator | BTX | ECM 830 | |
Sylgard Silikonelastomer | World Precision Instruments | SYLG184 | |
Wolframdraht, 0,075 mm | World Precision Instruments | TGW0325 | |
Insect Pins, 0,20 mm | Fine Science Tools | 26002-20 | |
Insect Pins, 0,10 mm | Fine Science Tools | 26002-10 | |
Frühling Schere | Fine Science Umols | 15003-08 | |
Dumont Nr. 5 Zangen | Fine Science Tools | 11252-20 | |
Dumont Nr. 55 Pinzette | Fine Science Tools | 11255-20 | |
Schnelle DiI | Molecular Probes | D-7756 | |
Fluoreszenzmikroskopen | Olymp | SZX12, BX51 |
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