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Die Tau-Aggregation-Assay beschrieben in dieser Handschrift imitiert die erwarteten Features der in Vivo Tau Fehlfaltung und Aggregation.
Aggregation von Tau-Protein und Bildung von gekoppelten spiralförmigen Fäden ist ein Kennzeichen der Alzheimer-Krankheit und andere Tauopathies. Im Vergleich zu anderen Proteinen assoziiert mit neurodegenerativen Erkrankungen, die gemeldeten in-vitro- Aggregation-Kinetik für Tau-Protein sind weniger konsistent präsentieren eine relativ hohe Variabilität. Hier beschreiben wir die Entwicklung einer in-vitro- Aggregation Assays, die die erwarteten Schritte verbunden mit Tau Fehlfaltung und Aggregation in Vivoimitiert. Der Test verwendet die längste Tau-Isoform (huTau441) die N-terminale sauren Beilagen sowie vier Mikrotubuli binden Domänen (MBD) enthält. Die Aggregation in Vitro ausgelöst durch Zugabe von Heparin und kontinuierlich von Thioflavin T Fluoreszenz in einem 96 gut Mikrotestplatte Format gefolgt. Die Tau-Aggregation-Assay ist hoch reproduzierbare zwischen verschiedenen Brunnen, Durchläufe und Chargen des Proteins. Die Aggregation führt zu Tau PHF-ähnliche Morphologie ist sehr effizient bei der Aussaat der Bildung von de Novo fibrillären Strukturen. Neben seiner Anwendung bei der Untersuchung des Mechanismus der Tau Fehlfaltung und Aggregation ist der aktuelle Test ein robustes Werkzeug für das screening von Drogen, die die Pathogenese der Tau stören könnten.
Alzheimer-Krankheit ist eine verheerende Neurodegenerative Erkrankung, die durch die Anhäufung von extrazellulären senilen Plaques der aggregierten Amyloid Beta1 histopathologisch definiert ist und intrazelluläre neurofibrillären Verschlingungen mit aggregiert hyperphosphoryliertem Tau Protein2. Physiologische Tau ist Monomere und präsentiert als sechs einzigartige Isoformen mit 0-2 N-terminal-Einsätze und 3 oder 4 Mikrotubuli binden Domänen3,4 durch Alternatives Spleißen und durchschnittlich 2-3 Phosphorylations entstehen. Es wird vermutet, dass Hyperphosphorylierung, Fehlfaltung und selbständige Aggregation in fibrillary Strukturen die Schlüsselelemente in Tau-Pathogenese als krankhaft veranlagten dementen Personen5,6 bilden.
Die aggregierten neurofibrillären Tau Verwicklungen sind ein Markenzeichen für Anzeige, sondern auch für andere Tauopathies, einschließlich Frontotemporal lobar Degeneration (FTLD), Pick Krankheit, progressive Supranuclear Lähmung (PSP), Fronto-temporalen Demenz (FTD) und PV altersbedingte Tauopathie (Teil)2. Aus Sicht der biochemischen Verständnis des Mechanismus der Tau Fehlfaltung und Aggregation könnte Aufschluss über den pathologischen Prozessen zugeordnet AD und andere Tauopathies. Neben dem wissenschaftlichen Aspekt sind robuste in-vitro- Aggregation-Assays wertvolle Werkzeuge für das Screening der Droge Kandidaten7,8,9,10. Es wird vermutet, dass die Aggregation von Tau eine Keimbildung abhängigen Polymerisation Prozess (NDP)11,12,13,14folgt. Die NDP-Kinetik ist sigmoidale und beginnt mit einer energetisch ungünstigen Keimbildung Schritt folgte eine schnelle energetisch downhill-Aggregation-Prozess.
Im Gegensatz zu anderen Amyloidogenic Proteinen, einschließlich des Prion-Proteins, Amyloid Beta und α-Synuclein Tau aggregiert nicht spontan unter physiologischen Bedingungen und auch extreme pHs oder hohen Temperaturen sind nicht förderlich für die Aggregation15. Dies ist wahrscheinlich auf die Hydrophylic Interaktionen in der Tau-Aggregation-Schnittstelle vorhanden. Jedoch aggregiert Tau effizient bei physiologischen Konzentrationen, wenn Induktoren wie Heparin16 oder anderen Polyanions17,18 verwendet werden.
Frühere Bemühungen, in-vitro- Tau-Aggregation-Assays eingerichtet haben etwas Licht auf die Details der Tau Fehlfaltung und Aggregation, aber sie kamen hinter dem imitiert, was geglaubt wird, um die in-Vivo -Tau-Aggregation-Kinetik werden. In den meisten Fällen fehlte die Tau-Aggregation-Kinetik die anfängliche Verzögerung Phase mit Tau Keimbildung verbunden. Dies könnte die Folge der Verwendung von sehr hohen Tau Proteinkonzentrationen, Präsenz von Aggregaten in den Start Tau Protein Vorbereitungen und/oder Nutzung von Tau Fragmente mit viel höhere Aggregation Neigung als physiologischer voller Länge Tau gewesen sein Eiweiß19,20,21,22,23. Des weiteren frühere Studien nicht die Reproduzierbarkeit und Robustheit Aspekt der Tau Aggregation Kinetik eingegangen.
Hier beschreiben wir eine robuste in-vitro- Tau Aggregation Probe, die die wichtigsten Merkmale der eine Keimbildung abhängigen Polymerisation mit einer anfängliche Verzögerung Phase entspricht der Tau Nukleation, gefolgt von einer exponentiellen Wachstumsphase imitiert. Darüber hinaus die generierte rekombinante Tau-Aggregate sind fibrillären in der Natur und haben einen extrem hohen Ausgangswerten Potenz. Der Test ist sehr reproduzierbar auch zwischen Tau Chargen und stellt ein wertvolles Werkzeug für Aggregation-Hemmer auf den Bildschirm.
(1) Reagenz Vorbereitung
(2) Dauerbetrieb ThT Aggregation Assay ein Multimode Mikrotestplatte Leser
Hinweis: Die Reaktion auf huTau441-Aggregation-Kinetik in einem kontinuierlichen Modus (automatische Messungen) zu überwachen ist ThT Farbstoff hinzugefügt. Obwohl die Reaktion von einem regelmäßigen Fluorometer verfolgt werden kann mit einem konventionellen Küvette, die manuelle Art der Operation schränkt die Häufigkeit der Messungen und beeinträchtigt die Genauigkeit der kinetischen aufgezeichneten Kurven. Aus diesem Grund wird ein automatische Multimode Mikrotestplatte Leser verwendet.
Rekombinante huTau441 mit den C291A und C322A Mutationen und N-terminale seine C-terminalen C-Tags zum Ausdruck gebracht und gereinigt wie zuvor beschrieben24. Die huTau441 Chargen sind hochreine als visualisierte auf SDS-PAGE und nahezu 100 % Monomeren wie S-MALS (Abbildung 1) bewertet. Die Reaktion erfolgte kontinuierlich durch ThT Fluoreszenz mit einem multimode Mikrotestplatte Reader, die Aggregation von 15 µM huTau441 wurde durch die Zugabe von 8 µM HMW Heparin induzierte. Die Erregung Wellenlänge war 440 nm (Bandbreite 20 nm) während Emission bei 485 gemessen wurde nm (Bandbreite 20 nm). Der Test ist sehr reproduzierbar, mit Ergebnissen aus 10 einzelnen Brunnen wird praktisch nicht zu unterscheiden (Abbildung 2A). Die Morphologien der ThT positive huTau441 Aggregate wurden nach 50 h von AFM bewertet. Aggregierte hutau441 ist eine homogene Mischung aus fibrillären Strukturen ähnlich gemeldeten ex Vivo Morphologien (Abbildung 2 b) unterschiedlicher Länge. Darüber hinaus enthält die endgültige Reaktionsmischung nicht Monomer, schlägt eine vollständige Umwandlung zu Aggregaten, dargestellt durch S-MALS Messungen (Abbildung 2). Die Kinetik der huTau441 Aggregation im unabhängigen Durchläufe sind sehr ähnlich wie ähnliche sigmoidale Kurven und nisht zu unterscheidend Lag und Wachstum Phasen (Abbildung 3) betont. Die hohe Reproduzierbarkeit wird beibehalten, wenn verschiedene Chargen des Proteins verwendet werden (Abbildung 4). Darüber hinaus sind vorgeformte huTau441 Aggregate sehr effizient bei der Rekrutierung von Tau Monomer und Induktion der Bildung von de-Novo -Tau-Aggregaten. Beträge, die der vorgeformten Tau Aggregate so niedrig wie 0,0025 % (V/V) sind in der Lage, Keimbildung und Trigger Generation von de Novo Fibrillen (Abbildung 5) zu umgehen.
Abbildung 1: rekombinante huTau441 ist Monomere und hochreinen. (A) Reinheit Bewertung unter denaturierenden Bedingungen auf einem 4-12 % SDS-PAGE Gel einschließlich Molekulargewicht standard Protein Ladder (kDA) (Spur 1); Durchströmung von der letzte C-Tag Affinität Reinigung Schritt (Bahn 2); Spalte Waschen Bruchteil (Spur 3), huTau441 Protein Peak vor (Bahn 4) eluiert und nach Puffer tauschen (Bahn 5), beziehungsweise). (B) S-MALS Analyse der huTau441. Protein zeigt > 99,9 % Monomere mit einer molaren Masse von 51 kDa und enthält keine Aggregate oder Fragmente. Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.
Abbildung 2: Aggregation von rekombinanten huTau441 ist sehr reproduzierbar und quantitativ führt zu fibrillären Strukturen. (A) Kinetik der Heparin induzierte huTau441 Aggregation in 96 gut Mikrotestplatte Format von ThT Fluoreszenz kontinuierlich überwacht. Konzentrationen von huTau441 und Heparin sind 15 µM und 8 µM. Die 10 Einzelkurven zur Umwandlung des gleichen Protein Batch in zehn Vertiefungen der gleichen Mikrotestplatte entsprechen und zeichnen sich durch eine durchschnittlich (mit SD) Lag-Phase von 14,2 ± 0,38 h und t50 von 18,8 ± 0,40 h. kinetische Daten war ausgerüstet mit einer 5-Parameter Logis- C-Kurve mit einer linearen Abnahme der obere Asymptote. Lag-Phase und t-50 wurden durch Interpolation zwischen den Sollwerten durch lineare Regression berechnet. Lag-Phase errechnet sich die 3 % Erhöhung des ThT-Fluoreszenz-Signals. Kurve passende und zusammenfassende Statistiken stammen mit IBM SPSS Statistics Version 20.0.0.2. (B). Tau Aggregate PHF-ähnlichen Morphologien zu zeigen, wie durch AFM Bildgebung bei 50 h; (C). S-MALS Analyse der Monomere huTau441 (t = 0 h) und der Überstand des Reaktionsgemisches nach Abschluss der Reaktion (t = 50 h). Zum Zeitpunkt von 50 h war das Reaktionsgemisch für 1 h bei 20.000 X g und 4 ° c und der führte Überstand auf S-MALS injiziert zentrifugiert. Das Verschwinden des Monomer Peak bestätigt die vollständige Zusammenfassung der Tau. Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.
Abbildung 3: der Tau-Aggregation-Test zeigt hohen Reproduzierbarkeit zwischen unabhängigen Durchläufe. Die beiden Platten Anzeigen von vier einzelnen Kinetik Spuren für spontane huTau441 Aggregation gesammelt in zwei unabhängigen Experimenten mit der gleichen Charge von huTau441 Protein. Konzentrationen von huTau441 und Heparin sind 15 µM und 8 µM. Kinetik zeichnen sich durch eine (mit SD) durchschnittliche Verzögerung von 12,2 ± 0,18 h und t50 von 17,8 ± 0,8 h (Ausführung 1) und 11,6 ± 0,52 h und t50 von 17,8 ± 0,23 h (Run 2), beziehungsweise. Kinetische Daten wurde mit einem 5-Parameter logistische Kurve mit einer linearen Abnahme der obere Asymptote ausgestattet. T-50 wurden durch Interpolation zwischen den Sollwerten durch lineare Regression berechnet. Lag-Phase errechnet sich die 3 % Erhöhung des ThT-Fluoreszenz-Signals. Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.
Abbildung 4: der Tau-Aggregation-Test zeigt hohen Reproduzierbarkeit zwischen verschiedenen Chargen des huTau441 Proteins. Jedes Panel zeigt vier repliziert entspricht einer bestimmten huTau441 Charge. Die Aggregation von jeder Charge folgte im unabhängigen Experimenten. Konzentrationen von huTau441 und Heparin sind 15 µM und 8 µM. Aggregation Kinetik entspricht den vier einzelnen Tau Chargen sind gekennzeichnet durch eine durchschnittlich (mit SD) Lag-Phase von 15,3 ± 0,38 h und t50 von 21,1 ± 0,46 h (Batch 1); Lag-Phase von 12,5 ± 0,07 h und t50 von 19,8 ± 0,34 h (Batch 2); Phase von 15,1 ± 0,34 h und t50 von 21,9 ± 0,86 h (Batch 3) hinken und lag Phase von 11,5 ± 0,29 h und t50 von 17,8 ± 0,29 h (Batch-4), beziehungsweise. Kinetische Daten wurde mit einem 5-Parameter logistische Kurve mit einer linearen Abnahme der obere Asymptote ausgestattet. Lag-Phase und t-50 wurden durch Interpolation zwischen den Sollwerten durch lineare Regression berechnet. Lag-Phase errechnet sich die 3 % Erhöhung des ThT-Fluoreszenz-Signals. Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.
Abbildung 5: vorgeformten hutau441 Aggregate haben hohe Aktivität Aussaat. Zur Einleitung des Aussaat wurden beschallten Tau Aggregate Monomer hutau441 hinzugefügt. Von Rot nach blau, jede Farbe der unterschiedlichen kinetischen Kurven repräsentiert die unterschiedliche Höhe der zusätzlichen Samen: 1,25 %, 0,63 %, 0,31 %, 0,16 %, 0,08 %, 0,04 %, 0,02 %, 0,01 %, 0,005 % und 0,0025 % (V/V), beziehungsweise. Spontane Umwandlung von hutau441 wird in schwarz dargestellt. In vervierfacht wurden alle Bedingungen getestet. Die vier kinetische repliziert, verbunden mit einer bestimmten Konzentration von Samen sind sehr reproduzierbar und in den meisten Fällen nicht zu unterscheiden. Konzentrationen von hutau441 und Heparin sind 15 µM und 8 µM. Die Zugabe von geringen Mengen von vorgeformten beschallten fibrillären Strukturen beseitigt die anfängliche Verzögerung Phase bei der spontanen Umwandlung beobachtet und die Wirkung ist proportional mit der Menge an Samen. Von Rot nach blau ist der Unterschied in t50 beobachtet (t50 spont.conv-t50 Aussaat) bzw. 18,9, 18.40, 17,8, 17.3, 16,6, 16.1, 15,4, 14.7, 14,2 und 13,7 Stunden. Spontane Umwandlung von hutau441 zeichnet sich durch eine durchschnittliche t-50 (mit SD) von 19.85 ± 0,54 h. kinetische Daten wurde mit einem 5-Parameter logistische Kurve mit einer linearen Abnahme der obere Asymptote ausgestattet. t-50 wurden durch Interpolation zwischen den Sollwerten durch lineare Regression berechnet. Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.
Trotz zahlreicher Versuche berichtet die Tau-Aggregation-Kinetik in der Literatur, Datum fehlt das gewünschte Maß an Reproduzierbarkeit und/oder einige der Features einer Keimbildung abhängigen Polymerisation19,20,21 , 22 , 23 , 25. Dies wird oft durch das Fehlen eines Lag-Phase, ineffiziente Aussaat und nicht-fibrillären Natur Tau Aggregate unterstrichen. Der Grund für diese Mängel kann variieren und suboptimale Tau Protein-Qualität (Fragmentierung, Aggregate, geringe Reinheit, etc.), Wahl des Proteins und induzieren und Reagenzien oder experimentellen Bedingungen enthält. Ein weiterer erschwerender Faktor sind die zwei Cystein-Rückstände befindet sich in der Tau-Aggregation-Benutzeroberfläche, die bilden Intra- oder inter - molekulare Disulfid überbrückt, abhängig von der Redox-Umwelt und beeinflussen die Effizienz der Tau-Aggregation. In den meisten Ansätzen, die Verringerung der Reagenzien wie DVB-t oder DÄMMUND wurden verwendet, um die Cystein-Rückstände in reduzierten Formen zu pflegen und somit erhöhen Reproduzierbarkeit25. Darüber hinaus ist die vom Aussterben bedroht-Koeffizient von Tau sehr gering, das führt zu Schwierigkeiten bei der Messgenauigkeit der Proteinkonzentration.
Wir standen vor allem ein paar Parameter und Qualitätsmerkmale, die wir entscheidend für eine stabile, reproduzierbare und repräsentative Aggregation Profil von Tau-Protein als: Beseitigung der Möglichkeit der Intra- und inter-molekulare Disulfid Anordnung, Generieren einer hochreinen Tau-Monomer und Erhöhung der Genauigkeit der Konzentrationsbestimmung. Diese Reagenz bezogene Fragen mögliche Aufmerksamkeit Punkte sind, die wir für optimale Assay-Entwicklung kritisch betrachtet. Um diese Probleme zu beheben, wurde in voller Länge huTau441 mit zwei Mutationen, C291A und C322A, und mit N - und C-terminalen Tags ausgedrückt. Mutation der Cystein-Reste hat minimale Auswirkungen auf das Tau-Protein und ersparen sich die sonst sehr schwer zu steuern Disulfid überbrückt. Mit dem Ausdruck des Proteins mit relativ kurzen N und C-terminalen Tags erlaubt uns, eine zweistufige Affinität Reinigung Protokoll führte zu sehr hohen Reinheit, Integrität und Monomer Inhalte zu verfolgen. Darüber hinaus haben wir eine F8W-Mutation, die vom Aussterben bedroht-Koeffizient des Proteins erhöht und erlaubt sehr viel genauer Konzentration Messungen24eingeführt.
Neben der Verwendung von qualitativ hochwertigen Protein Reagenzien, wurden auch andere Test-Parameter optimiert. Die optimale Tau: Heparin-Verhältnis wurde identifiziert, um rund 0,5 (M/M) werden die bisher veröffentlichten Studien26entspricht. Mechanische und optische instrumental Einstellungen sind entscheidend, um sicherzustellen, dass die Reproduzierbarkeit und die optimalen Parameter zu einem gewissen Grad je nach Hersteller abweichen können.
Die Aggregation der Tau in diesem Assay beschrieben zeigt Merkmale, die in AD Tau Pathogenese zugeordnet sind und im Zusammenhang mit Tauopathies. Der Prozess beginnt mit einer anfängliche Verzögerung entspricht die Bildung von energiereichen Kerne und ist gefolgt von einer rasanten Wachstumsphase, die entspricht Fibrille Wachstum. Die Verzögerungszeit ist lang genug, um in einem breiten Fenster um die Aussaat Prozess mit einem breiten Spektrum an Samen Konzentrationen (Abbildung 5) zwar noch nicht allzu langer Zeit so Proteinabbau und/oder unspezifische Aggregation vermieden werden (Abbildung im Detail zu studieren 2). diese sekundären Ereignisse könnte vor allem passieren, wenn eine intrinsisch ungeordnete Protein wie huTau441 für längere Zeit zu physiologischen Bedingungen ausgesetzt ist. Die erhaltenen Tau Aggregate Anzeige die Morphologie der PHFs von Gehirnen von Alzheimer-Patienten isoliert und sind sehr effizient bei der Rekrutierung von Monomeren Tau und konvertieren es in de Novo generiert Aggregate, einen Prozess als seeding bezeichnet. Der Assay ist hoch reproduzierbare, die kinetischen Kurven wird praktisch nicht zu unterscheiden zwischen Brunnen, Durchläufe und Eiweiß Chargen. Obwohl der aktuelle Test konzentriert sich nur auf die längste Tau Isoform, huTau441, kann die Anwendung angepasst werden, um die Umwandlung von anderen Formen der Tau (Ameijde Et Al., Acta Neuropathologica Kommunikation, im Druck) zu studieren ermöglicht es zudem mechanistische Studien konzentriert sich auf das Zusammenspiel von Tau Isoformen und möglicherweise Aufschluss über die Unterschiede zwischen Tau Pathogenese n. wo 3R und 4R Isoformen sind in PHFs und PICK Krankheit oder frontotemporale Demenz wo enthält hauptsächlich Tau Pathologie 3R und 4R Tau Isoformen, bzw.27.
Die sehr hohe Reproduzierbarkeit des Assays sollte Leser es mit relativer Leichtigkeit in ihren spezifischen Labor Einstellungen implementieren lassen. Der Assay imitiert, was geglaubt wird, um die in Vivo Fehlfaltung und Aggregation von Tau zu werden, stellt ein wertvolles Werkzeug für das screening von Wirkstoffkandidaten und bewerten deren Einmischung mechanistische Studien, die Aufschluss über Tau Pathogenese und es wird mit den verschiedenen Schritten des Prozesses Pathogenese.
Die Autoren haben nichts preisgeben.
Die Autoren möchten Hector Quirante Danke für den Ausdruck und die Reinigung des huTau441, Hanna Inganäs und Margot van Winsen für hervorragende technische Unterstützung und Martin Koldijk für die Datenanalyse.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Thioflavin T | Sigma-Aldrich | T3516-5G | dry powder (Mw = 318.86 g/mol) |
Heparin | Sigma-Aldrich | H3393-50KU | dry powder (Mw = 17-19 kDa) |
TCEP | Sigma-Aldrich | 75259-1G | dry powder (MW= 286.65 g/mol) |
PBS | Gibco-Life Technologies | 10010-015 | Sterile, pH 7.4 (1X) |
0.22 μm sterile filter | Corning | 431160 | PES membrane |
0.20 μm sterile serynge filter | Corning | 431229 | PES membrane |
96-well microplates | Thermo Scientific | 9502867 | Black, flat botton |
Microplate sealers | R&D Systems | DY992 | Adhesive strips |
Synergy Neo2 Multi-Mode Microplate Reader | Biotek | Synergy Neo2 | Hybrid Technology, Gen5 Software |
Eppendorf Tubes | Eppendorf | 0030 120.086 | 1,5 ml tubes |
Ultrasonics-Branson SFX250 | Branson | 101-063-966R | 1/2" Solid Horn and 1/8" microtip |
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