Method Article
Wir beschreiben optimierte Werkzeuge zur Untersuchung des Zebrafischherzens in vivo mit Lichtblattfluoreszenzmikroskopie. Insbesondere schlagen wir helle kardiale transgene Linien vor und präsentieren neue sanfte Einbettungs- und Immobilisierungstechniken, die Entwicklungs- und Herzfehler vermeiden. Eine mögliche Datenerfassungs- und Analysepipeline, die an die kardiale Bildgebung angepasst ist, ist ebenfalls vorhanden.
Die embryonale Herzforschung hat stark von den Fortschritten in der schnellen In-vivo-Lichtblattfluoreszenzmikroskopie (LSFM) profitiert. In Kombination mit der schnellen äußeren Entwicklung, der handhabbaren Genetik und der Transluzenz des Zebrafisches Danio rerio hat LSFM Einblicke in die Form und Funktion des Herzens mit hoher räumlicher und zeitlicher Auflösung ohne signifikante Phototoxizität oder Photobleichen geliefert. Die Bildgebung von schlagenden Herzen stellt bestehende Probenvorbereitungs- und Mikroskopietechniken in Frage. Man muss eine gesunde Probe in einem verengten Sichtfeld halten und ultraschnelle Bilder aufnehmen, um den Herzschlag aufzulösen. Hier beschreiben wir optimierte Werkzeuge und Lösungen, um das Zebrafischherz in vivo zu untersuchen. Wir demonstrieren die Anwendungen heller transgener Linien zur Markierung der Herzbestandteile und stellen neuartige sanfte Einbettungs- und Immobilisierungstechniken vor, die Entwicklungsdefekte und Veränderungen der Herzfrequenz vermeiden. Wir schlagen auch eine Datenerfassungs- und Analysepipeline vor, die an die kardiale Bildgebung angepasst ist. Der gesamte hier vorgestellte Workflow konzentriert sich auf die Bildgebung des embryonalen Herzens von Zebrafischen, kann aber auch auf verschiedene andere Proben und Experimente angewendet werden.
Um die komplexen Ereignisse und Wechselwirkungen im früh schlagenden Herzen aufzudecken, ist eine In-vivo-Bildgebung des gesamten Organs erforderlich. Mit ihrer minimalen Phototoxizität1,2,3, ihrer geringen Photobleichung4 und ihrer hohen Geschwindigkeit hat sich die Lichtblattmikroskopie zum primären Bildgebungsinstrument für die embryonale und kardiale Entwicklung entwickelt5,6. Es hat Einblicke in die Form und Funktion des Herzens mit einer hohen räumlichen und zeitlichen Auflösung geliefert7,8,9 und es den Forschern ermöglicht, fluoreszierend markierte Teile des Herzens mit hoher Geschwindigkeit abzubilden und zu verfolgen, hämodynamische Kräfte zu untersuchen und die Herzentwicklung direkt im Körper der sich entwickelnden Embryonen zu verfolgen6,10,11,12.
Um Zebrafische im Sichtfeld präzise und reproduzierbar einzuschränken, gibt es eine Vielzahl von Einbettungsprotokollen für Lichtbleche, kurz- und langfristig, sowie Einzel- oder Mehrfachproben13,14,15,16,17,18,19. Das gebräuchlichste Protokoll beinhaltet die Tricain-Ruhigstellung und die Agarosemontage in einem Glas- oder Kunststoffrohr. Da sich die Herzfrequenz jedoch aufgrund der verwendeten Temperatur, Anästhetika und des verwendeten Einbettungsmaterials ändern kann20,21,22 erfordert die Bildgebung des Zebrafisch-Herzs spezifische, schonende Protokolle, um die Gesundheit der Proben zu gewährleisten6,8,11,12,20,21,22,23 . Für die Kurzzeitbildgebung (bis zu einer Stunde) kann man den Fisch in 130 mg/L Tricain betäuben und in fluoriertes Ethylenpropylen (FEP) Röhrchen mit 0,1% iger Agaroselösung und einem Pfropfen einbetten, wie in Weber et al. 201416 beschrieben. Da Tricain jedoch zu Entwicklungsdefekten führen kann20,22 müssen für die Langzeitbildgebung unterschiedliche Protokolle verwendet werden.
Hier beschreiben wir eine neue Strategie für die langfristige kardiale Bildgebung. Während es viele Lichtblattimplementierungen gibt24, empfehlen wir die Verwendung einer hängenden Probe in einem T-SPIM-Mikroskop (eine Detektions- und zwei Beleuchtungslinsen in einer horizontalen Ebene, wobei die Probe vertikal im gemeinsamen Fokus hängt). Dies gibt die notwendige Bewegungs- und Rotationsfreiheit für die präzise Probenpositionierung. Die Fische werden immobilisiert, indem 30 pg α-Bungarotoxin-mRNA im ein- oder zweizelligen Stadium injiziert werden. α-Bungarotoxin ist ein Schlangengift, das die Muskeln lähmt, ohne die kardiovaskuläre Entwicklung oder Physiologie zu beeinträchtigen22. Für eine präzise, verzerrungsfreie Bildgebung empfehlen wir, Fische in Röhrchen aus FEP zu montieren, einem Polymer mit einem Brechungsindex, der fast identisch mit Wasser ist. Wir besprechen, wie die FEP-Röhrchen am besten vorbereitet werden können, indem sie vor der Bildgebung begradigt und gereinigt werden. Die Fische werden dann in diesen Röhren mit dem Kopf nach unten in Medien montiert, und der Boden des Rohres wird mit einem 2% igen Agarosepfropfen versiegelt, auf dem fischige Köpfe ruhen. Das Schneiden von Löchern in das FEP-Rohr erleichtert den Gasaustausch und sorgt für das Fischwachstum. Die eingebetteten Fische können in Medien aufbewahrt werden, bis sie direkt vor der Bildgebung auf einem Probenhalter montiert werden. Wir schlagen auch eine Datenerfassungs- und Analysepipeline für reproduzierbare Hochgeschwindigkeitsbildgebung vor. Darüber hinaus diskutieren wir die Verwendung von zytoplasmatischen versus Membranmarker-transgenen Linien für eine robuste Herzzellmarkierung sowie verschiedene Optionen, um das Herz zu stoppen. Diese Montagetechniken gewährleisten die Probengesundheit und ermöglichen es, das Herz präzise und reproduzierbar im Sichtfeld einzuschränken.
Alle Erwachsenen und Embryonen von Zebrafischen (Danio rerio) wurden gemäß den vom UW-Madison Institutional Animal Care and Use Committee (IACUC) genehmigten Protokollen behandelt.
1. Zubereitung von Zebrafischen
2. Vorbereitung von FEP-Röhrchen
Abbildung 1: FEP-Rohrreinigung und -begradigung. (a) FEP-Rohre auf einer Kabeltrommel. b) FEP-Rohre vor dem Richten. c) FEP-Rohre aus autoklavsicheren Schläuchen aus Glas und Stahl. d) Spülen der FEP-Rohre nach dem Richten und Abkühlen. e) FEP-Rohr, das zur Beschallung auf die Größe eines Zentrifugenrohrs zugeschnitten ist. f) Spülen der FEP-Röhren nach der Beschallung. g) Lagerung der gereinigten und begradigten FEP-Röhrchen in einem Zentrifugenröhrchen. (h) Schneiden des FEP-Röhrchens vor der Bildgebung. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
3. Zubereitung von 2% Agarosegericht
4. Vorbereitung von Einbettungsmedien
5. Probenmontage
Abbildung 2: Embryonenmontage im FEP-Röhrchen. (a) Anästhesiepräsenter pigmentfreier Fisch in Befestigungsmedien. b) Eine Spritze mit stumpfer Endnadel und FEP-Schlauch. c) Sobald Medien und Fische im FEP-Röhrchen aufgenommen wurden, schneiden Sie das Röhrchen am Rand der Nadel auf. d) Eintauchen des geschnittenen Rohrs in eine mit 2 % Agarose beschichtete Schale, um das Ende zu verstopfen. e) Ein Zebrafisch in einem verstopften FEP-Röhrchen. f) Schneiden Sie das FEP-Rohr vorsichtig um 30°, um Gasaustauschlöcher zu erzeugen. g) FEP-Rohr mit vier Löchern über einem eingebetteten Zebrafisch. h) Schema eines Zebrafisches, der in eine FEP-Röhre eingebettet ist. Löcher und Agarstopfen sind angegeben. (i) Mehrere eingebettete Zebrafische, die für die Bildgebung bereit sind. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
6. Probenpositionierung
Abbildung 3: Probenkammer. (a) FEP-Röhrchen, das auf einem Probenhalter montiert ist. b) Die Stichprobenkammer mit Stufen und Zielen. (c) Draufsicht auf die mit Medien gefüllte Probenkammer mit Beleuchtung und Detektionsobjektiv in einer T-SPIM-Konfiguration. d) Am Mikroskop montierter Probenhalter mit der Probe in der Kammer. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
Abbildung 4: Embryonenpositionierung für die Herzbildgebung. (a) 24 hpf Tg(kdrl:Hsa.HRAS-mCherry) Zebrafisch mit falsch ausgerichteten Augen. a') Derselbe Fisch, mit ausgerichteten Augen. (b) Derselbe Fisch gedreht -100 ° und (b') -50 ° für eine optimale Herzbildgebung. c) 48 hpf Zebrafisch mit falsch ausgerichteten Augen. c') Derselbe Fisch, mit ausgerichteten Augen. (d) Derselbe Fisch wurde für eine optimale Herzbildgebung um 30° gedreht. Schwarze Pfeile zeigen auf das Herz. Maßstabsleiste 100 μm. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
7. Bilderfassung
8. Bildverarbeitung
Abbildung 5: Das 48 hpf Zebrafischherz. (a) Standbild eines Z-Frames, anterior-ventrale Ansicht von 48 hpf Tg(kdrl:Hsa.HRAS-mCherry; myl7:lck-EGFP) Zebrafisch, abgebildet mit LSFM, (b) 3D-Rekonstruktion von Filmstapeln, Schnittansicht durch das Atrium. (c) Montage von vier Frames über einen vollen Herzschlag auf einer Z-Ebene. Kreisdiagramme zeigen die Zeit während des Herzschlags an. Maßstabsleiste 50 μm. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
Wir haben das 48 hpf schlagende Herz von Tg(kdrl:Hsa.HRAS-mCherry; myl7:lck-EGFP) Zebrafisch gemäß dem oben beschriebenen Protokoll aufgezeichnet (Abbildung 5). Eine 488 nm und eine 561 nm Laserlichtplatte beleuchteten die Probe gleichzeitig. Die emittierte Fluoreszenz wurde senkrecht mit einer 16x/0,8 W Objektivlinse und einer wissenschaftlichen Metalloxid-Halbleiterkamera (sCMOS) detektiert.
Bei 48 hpf hat das Herz gerade eine Schleife durchlaufen und hat zwei Kammern, den Ventrikel und den Vorhof, muss aber noch Klappen entwickeln. In unseren Filmen sind die verschiedenen Herzstrukturen wie Zuflusstrakt, Ventrikel, atrioventrikulärer Kanal (AVC), Atrium und Abflussspur leicht unterscheidbar (Abbildung 5a,b). Diese Daten zeigen das genaue Schlagen und zeigen komplexe Wechselwirkungen zwischen den beiden Zellschichten des Herzens: dem Myokard, einer einzelligen Muskelschicht, die sich zusammenzieht und Kraft erzeugt (Abbildung 5c, rot), und dem Endokard, einer einzelnen Zellschicht, die das Herz mit dem Gefäßsystem verbindet (Abbildung 5c, Cyan).
Die Herzschlagrekonstruktion in x,y,z (3D) + Zeit (4D) + Farbe (5D) wurde nach Mickoleit et al.6 durchgeführt. Die Rekonstruktion basiert auf zwei Hypothesen: Die Bewegung des Herzens wiederholt sich, und die Daten sollten mit einem kleinen z-Schritt erfasst werden. Die Ausgabe ist ein rekonstruierter Einzeltakt in 5D, der 30 GB bis 80 GB pro Heartbeat misst. Zum Rendern der Daten haben wir das kostenlose Open-Source-Tool FluoRender für das Tiefenrendering31 verwendet, da es für die Verarbeitung mehrdimensionaler Datensätze und das einfache Rendern von 5D-Filmen sowohl von Zellebenen als auch von einzelnen Schichten entwickelt wurde (Abbildung 5b).
Transgene Linien zur Abbildung des Herzens
Abbildung 6: Vergleich von zytoplasmatischen und Membranmarker-Zebrafisch-transgenen Linien. Anterior-ventrale Ansicht von 48 hpf Zebrafischherzen, aufgenommen mit LSFM. Weiße Pfeile zeigen Strukturen an, die nur mit einer transgenen Membranmarkerlinie sichtbar sind. (a) Tg(kdrl:EGFP)32 Signal in Cyan im Herzen und (a') im Ventrikel. (b) Tg(kdrl:Hsa.HRAS-mCherry; myl7:dsRed)33 Signal in rot im Herzen und (b') im Ventrikel. ( c,c') Verschmelzung von Tg(kdrl:Hsa.HRAS-mCherry; myl7:dsRed) und Tg(kdrl:EGFP) Signal. Maßstabsleiste 50 μm. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
Die Abbildung des Zebrafischherzens erfordert eine präzise Herzzellmarkierung. Während die Myokarddicke in den Zellen relativ konstant ist, sind Endokardzellen dick um den Kern herum, haben aber dünne Membranvorsprünge, in einigen Regionen dünner als 2 μm. Zytoplasmatische transgene Linien wie Tg(kdrl:EGFP)32 markieren effektiv die Regionen um Endokardkerne, aber weiter entfernt emittiert das dünne Zytoplasma möglicherweise nicht genügend Photonen, um mit so kurzen Expositionszeiten nachgewiesen zu werden, was zu künstlichen Löchern in den Daten führt (Abbildung 6a). Im Gegensatz dazu können transgene Membranmarkerlinien wie Tg(kdrl:Hsa.HRAS-mCherry)33 das Endokard effektiv markieren und mehr Details offenbaren (Abbildung 6b,c). Wählen Sie für jedes Experiment sorgfältig die am besten geeignete transgene Linie aus.
Immobilisierung von Zebrafischen
Die Wahl der Immobilisierungstechnik hängt von der Länge des Experiments und dem Alter des Fisches ab. Tricain wurde häufig für die Immobilisierung von Zebrafischen verwendet, hauptsächlich aufgrund seiner Benutzerfreundlichkeit. In der Tat führt die einfache Zugabe von 130 mg / L Tricain zu den Fischmedien zu ihrer Betäubung in 10 Minuten. Da es zu Entwicklungsstörungen führen und die Herzphysiologie beeinflussen kann20,22 empfehlen wir, Tricain nur für kurze Experimente (weniger als 30 min) zu verwenden. Bei längerer Bildgebung lähmen α-Bungarotoxin-mRNA-Injektionen im ein- oder zweizelligen Stadium fische bis zu 3 Tage nach der Befruchtung (dpf), ohne die kardiovaskuläre Entwicklung oder Physiologie zu beeinträchtigen22.
Auswahl der richtigen FEP-Röhren
FEP-Rohre sind in verschiedenen Durchmessern und Stärken erhältlich. Um 0-5 dpf Fische abzubilden, sind 0,8 mm ein guter Innendurchmesser; Wählen Sie entweder dickwandige 0,8 x 1,6 mm Rohre oder dünnwandige 0,8 x 1,2 mm Rohre. Wir empfehlen dünnwandige Rohre; Dickere Wände bieten jedoch eine erhöhte Stabilität und Steifigkeit, was wichtig sein kann, wenn die Probenkammer über fließende Medien verfügt, die ein dünnes Rohr stören und bewegen könnten. Für größere Proben können 1,6 x 2,4 mm und 2 x 3 mm verwendet werden.
Temperatur- und Gasaustausch
Ein wesentlicher Aspekt des Wohlbefindens des Zebrafisch-Embryos ist die Temperatur. Idealerweise halten Sie den Fisch während der Bildgebung bei 28,5 ° C, da die Umgebungstemperatur die Entwicklung und die Herzfrequenz beeinflusst34.
Nach unserer Erfahrung hält der Sauerstoffaustausch durch den 2% igen Agarosepfropfen nur eine stabile Herzfrequenz bis 3-4 dpf aufrecht. Daher sorgt das Schneiden von Löchern in der Röhre für sauerstoffdiffusion. Es kann auch für die Arzneimittelabgabe an die Probe erforderlich sein, falls gewünscht.
Aussetzung des Herzschlags.
Die schnellen Erfassungsgeschwindigkeiten entsprechend ausgestatteter Lichtblattmikroskope ermöglichen die Aufnahme des schlagenden Herzens in vivo. Um jedoch einen ungestörten Z-Stack zu erwerben, kann man das Herz verlangsamen oder stoppen. Das Anhalten des Herzens führt jedoch zu einer Entspannung des Herzmuskels und kann zum Zusammenbruch des Herzens führen6. Die Herzschlagsuspension kann unter Verwendung von Morpholinos, niedrigen Temperaturen, einem Inhibitor der Muskelkontraktion oder Optogenetik erfolgen. Diese Methoden haben jeweils ihre Nachteile und müssen für jedes Experiment sorgfältig evaluiert werden.
Die Injektion von 4 ng Silent Heart (sih) Morpholino im Einzelzellstadium kann den Herzschlag stoppen, indem sie auf das Gen tnnt2a abzielt, das für die Sarkomerbildung entscheidend ist35. sih Zebrafische haben keinen Herzschlag und überleben nur bis 7 dpf, wenn die Embryonen beginnen, sich auf zirkulierendes Blut für die Sauerstoffversorgung zu verlassen. Da die Herzmorphogenese sowohl von genetischen als auch von biomechanischen Kräften angetrieben wird36, weisen diese Fische Herzfehlbildungen um 3 dpf auf.
Da der Fluss von Ca2+ temperaturempfindlich ist, beeinflusst die Temperatur die Herzfrequenz bei embryonalen Zebrafischen21. Folglich verlangsamt das Absenken der Temperatur in der Bildgebungskammer den Herzschlag. Um den Herzschlag zu stoppen, sind Temperaturen unter 15 °C erforderlich. Da Zebrafische in der Regel bei 28,5 °C gehalten werden, können solche niedrigen Temperaturen nur für kurze Zeiträume (weniger als 10 min) gehalten werden.
Medikamente wie chemische Inhibitoren von Muskelkontraktionen, 2,3-Bu-Tanedion-2-Monoxim (BDM), können dem Zebrafischmedium (50 nM37,38) zugesetzt werden, um den Herzschlag vorübergehend auszusetzen. BDM ist bequem zu verwenden, da es die Herzkontraktion in weniger als 15 Minuten stoppt und weggewaschen werden kann, um die Herzfunktion wiederherzustellen. Da BDM jedoch das Herzaktionspotential verändert, muss es mit Vorsicht angewendet werden37.
Schließlich kann das Herz transgener Zebrafische, die lichtgesteuerte Ionenkanäle oder Pumpen wie Channelrhodopsin oder Halorhodopsin in ihrem Myokard exprimieren, manipuliert und gestoppt werden, indem der Schrittmacher am Zuflusstrakt mit Licht beleuchtet wird39,7,40,41,9.
Aussicht
Die vorgestellten optimierten Werkzeuge und Lösungen zur Untersuchung des Zebrafischherzens in vivo ermöglichen eine langfristige, schonende Bildgebung der ultraschnellen Herzdynamik. Die Probeneinbettung kann an verschiedene Bildgebungsmodalitäten wie konfokale Mikroskopie, Zwei-Photonen-Mikroskopie oder optische Projektionstomographie (OPT) angepasst werden. Die Lichtblattmikroskopie ist jedoch wahrscheinlich die bevorzugte Technik, die eine optische Schnittgeschwindigkeit mit einer Geschwindigkeit bietet, die ausreicht, um die Dynamik des Herzens zu erfassen. Während sich dieses Protokoll auf die Bildgebung des embryonalen Herzens von Zebrafischen konzentriert, glauben wir, dass es auch auf verschiedene andere Proben und Experimente angewendet werden könnte. Es wird interessant sein, in Zukunft zu sehen, ob ähnliche Einbettungs- und Bildgebungsverfahren auch in späteren Stadien während der Entwicklung eingesetzt werden können, wenn das Herz verborgener und die Larve weniger durchscheinend ist.
Die Autoren haben nichts preiszugeben.
Wir danken Madelyn Neufeld für die Illustration in Abbildung 2h. Diese Arbeit wurde von der Max-Planck-Gesellschaft, dem Morgridge Institute for Research, der Chan Zuckerberg Initiative und dem Human Frontier Science Program (HFSP) unterstützt.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
1.5mL Eppendorf | Eppendorf | 22364111 | To carry embedded samples |
15mL Falcon tubes | Falcon | 352095 | To carry embedded samples |
50mL centrifuge tubes | Falcon | 352070 | 50ml tubes for sonication step, and storing cleaned, straightened FEP tubes |
50mL syringe | BD | 309654 | 50ml syringe for FEP cleaning |
Agarose, low gelling temperature | Sigma Aldrich | 39346-81-1 | To make plug |
Blunt Tip Needles, 21 gauge | VWR | 89500-304 | Blunt end needle for 0.8 inner diameter FEP tube |
Borosilicate glass tube | McMaster-Carr | 8729K33 | Tubing for FEP tube straightening 9.5mm outer diameter, 5.6 inner diameter, 30cm long, other sizes available |
Borosilicate glass tube | McMaster-Carr | 8729K31 | Tubing for FEP tube straightening 6.35mm outer diameter, 4mm inner diameter, 30cm long, other sizes available |
Conventional needles, 21 Gauge | BD | 305165 | Conventional needle for 0.8 inner diameter FEP tube |
Disposable glass pipette | Grainger | 52NK56 | To transfer fish, use with pipette pump |
E3 medium for zebrafish embryos | |||
Ethanol | Sigma Aldrich | 64-17-5 | Ethanol for FEP cleaning |
FEP tube, 0.8 / 1.2 mm | ProLiquid | 2001048 | FEP tube with thin wall, other sizes available |
FEP tube, 0.8 / 1.6 mm | Bola | S1815-04 | FEP tube with thick wall, other sizes available |
FEP tube, 2/3mm | BGB | 211581 | Large FEP tube with thick wall, other sizes available |
Hot Hand Rubber Mitt | Cole-Parmer | 691000 | To carry hot equipment after autoclaving |
Omnifix 1mL Syringes | B Braun | 9161406V | 1ml syringe for embedding |
Petri dish, small | Dot Scientific | PD-94050 | To make agarose plug |
Pipette pumps | Argos Technologies | 04395-05 | To transfer fish, use with disposable glass pipette |
PTU | Sigma Aldrich | 103-85-5 | Also known as: N-Phenylthiourea, 1-Phenyl-2-thiourea, Phenylthiocarbamide |
Razor blades | Azpack | 11904325 | To cut FEP tubes |
Sodium Hydroxide | Dot Scientific | DSS24000 | NaOH for FEP cleaning |
Tricaine | Sigma Aldrich | E10521 | Also known as: MS-222, Ethyl 3-aminobenzoate methanesulfonate, Tricaine |
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