Um eine alkalische Phosphatase-Färbung durchzuführen, spülen Sie zunächst die geernteten Zebrafischschuppen fünf Minuten lang in ALP-Färbelösung. Als nächstes legen Sie die Schuppen für 15 Minuten in eine funktionierende ALP-Färbelösung. Entfernen Sie dann die ALP-Lösung und spülen Sie die Schuppen in deionisiertem Wasser ab, um die Reaktion zu stoppen.
Um die Schuppen mit der Von-Kossa-Färbemethode zu färben, beginnen Sie damit, die Schuppen 40 Minuten lang unter starkem Licht in 5%iger Silbernitratlösung zu inkubieren. Entfernen Sie anschließend die Silbernitratlösung und waschen Sie die Schuppen zweimal fünf Minuten lang in entionisiertem Wasser. Inkubieren Sie die Schuppen fünf Minuten lang in 5%igem Natriumthiosulfat und waschen Sie sie dann erneut mit entionisiertem Wasser.
Montieren Sie die Waage mit einem Montagemedium auf der Schiene. Decken Sie sie mit einem Deckglas ab und betrachten Sie sie unter dem Mikroskop. Neben der hier demonstrierten ALP- und Von-Kossa-Methode gibt es verschiedene andere Färbemethoden, mit denen verschiedene Aspekte der Zell- oder Matrixbiologie auf den Skalen visualisiert werden können, wie z. B. TRAP, Kalziumfluoreszenz, Alizarinrot und immunhistochemische Färbung.