Nachdem Sie alle Runden durchgeführt und Fluoreszenzbilder der Arabidopsis-Keimlinge aufgenommen haben, öffnen Sie die experimentellen Daten in der Analysesoftware. Um eine Fachmaske zu generieren, klicken Sie auf die Option Neuen Fachtyp erstellen. Wählen Sie dann eine Bildnummer in Runde und klicken Sie im oberen Teil des Bildschirms auf Bild laden.
Klicken Sie als nächstes, um in den neuen Formmodus zu wechseln, auf eine der Schaltflächen, die verschiedene Zeichenwerkzeuge für Formen darstellen. Zeichnen Sie die interessierenden Bereiche auf dem Plattenbild. Wählen Sie die verschiedenen Genotypen auf dem Teller aus und geben Sie ihnen entsprechende Namen.
Klicken Sie auf Esc, um den Formmodus zu verlassen. Klicken Sie dann auf Fachtyp speichern, um die generierte Fachmaske zu speichern. Gehen Sie nun zur Option Nach Fachtyp ändern und wählen Sie die generierte Maske aus.
Um eine Pflanzenmaske mit hoher Genauigkeit zu erstellen, verwenden Sie das Bild, das nach 180 Minuten Messung aufgenommen wurde. Um den minimalen Schwellenwert für die Intensität des Fluoreszenzsignals festzulegen, entfernen Sie das Häkchen aus dem automatischen Schwellenwert. Legen Sie einen manuellen Schwellenwert auf Null fest und klicken Sie auf Vorschau. Wählen Sie als Nächstes Runde 91.
Klicken Sie auf Vorschau aktualisieren und prüfen Sie, ob die Array-Maske alle Genotypen auf dem Plattenbild abdeckt. Passen Sie den Hintergrund des Bildes an und verwenden Sie die Farboptionen, um die Tablettmaske auf dem Plattenbild hervorzuheben. Klicken Sie auf Ausführen, markieren Sie nur Runde 91 und starten Sie die Analyse.
Sobald das Fertigstellungsmenü auf dem Bildschirm angezeigt wird, wählen Sie die ausgeführte Runde aus und klicken Sie auf Switch Analyzer, um Daten zu analysieren und Daten für diesen bestimmten Zeitpunkt zu exportieren. Klicken Sie dann auf das Symbol Exportteil öffnen, um die Dateien aus dem exportierten Archiv zu extrahieren. Klicken Sie im Einstellungsmodus für die lokale Analyse auf Neuen Tray-Typ erstellen, um das Menü des Masken-Builders aufzurufen.
Klicken Sie dann auf Bild laden, und wählen Sie Runde vier. Klicken Sie in der oberen rechten Ecke des Bildschirms auf Aus Datei laden und laden Sie die XSEL-Datei. Das Bild der Platte wird mit angewendeter Fachmaske angezeigt.
Geben Sie einen Namen für die Pflanzenmaske ein und klicken Sie auf Ablagetyp. Wenden Sie die Pflanzenmaske an, indem Sie ihren Namen in der Option Nach Tray-Typ ändern auswählen. Deaktivieren Sie dann den automatischen Schwellenwert, um eine manuelle Schwellenwertmanipulation zu ermöglichen.
Ändern Sie im Vorschaumenü den Wert des Schwellenwerts von niedrig auf hoch, bis die generierte Pflanzenmaske perfekt zu der Region passt, die in jedem der Genotypen von Interesse ist. Wählen Sie dann die letzte Runde, um zu prüfen, ob die Maske für alle Runden der Messungen passt. Um die Analyse für alle Messrunden durchzuführen, klicken Sie auf Ausführen und anschließend auf Analyse starten.
Im Vergleich zu den Kontrollbedingungen in Gegenwart von 6-Benzylaminopurin wurden bemerkenswerte Unterschiede während der exponentiellen Phase der Chlorophyllsynthese in Wildtyp-Arabidopsis-Sämlingen beobachtet.
