Integration des molekularen Netzwerkbetriebs in die 2D-HPLC-MS zur Analyse von Aconitum-Pendelproben

Um mit der Datenaufbereitung zu beginnen, exportieren Sie 2D-HPLC-MS-Rohdaten aus dem Massenspektralbereich. Geben Sie neben der Verbindung mit dem GNPS-FTP-Server in der WINSCP-Schnittstelle auf der Seite Sitzungskonfiguration die Verbindungsinformationen ein. Nachdem Sie die Informationen eingegeben haben, klicken Sie auf die Schaltfläche Start, um eine Verbindung zum GNPS-FTP-Server herzustellen.

Erstellen Sie molekulare Netzwerke, indem Sie einen Webbrowser öffnen und die GNPS-Website besuchen. Neue Benutzer müssen sich für ein Konto anmelden und sich dann anmelden. Klicken Sie auf der Hauptoberfläche der GNPS-Website unter Datenanalyse auf Molekulares Netzwerk erstellen.

Klicken Sie auf der Seite Aufgabenerstellung auf die Schaltfläche Eingabedateien auswählen, wählen Sie dann die Datendatei aus und laden Sie sie hoch. Legen Sie auf den Registerkarten "Workflow-Optionen" die verschiedenen Parameter fest, die das molekulare Netzwerk oder MN erzeugen. Zu diesen Parametern gehören der Peak-Extraktionsalgorithmus, der Peak-over-Travel-Wert, die Ähnlichkeitsberechnungsmethode usw. Nachdem Sie die entsprechenden Parametereinstellungen vorgenommen haben, klicken Sie unten auf der Seite auf die Schaltfläche Senden, um die Aufgabe auszuführen.

Nachdem die Aufgabe ausgeführt wurde, suchen Sie die erstellten Aufgaben auf der Registerkarte Aufträge, und klicken Sie auf den Namen des Workflows, um die Analyseergebnisse anzuzeigen. Die Website bietet MN-Diagramme, Substitute, symbiotische Netzwerke und andere verwandte Informationen. Vier der Alkaloidkomponenten in den APB-Proben, die von der MN identifiziert wurden, waren Aconitin, 14-Benzoylaconin, 14-O-Acetylneolin und Hypaconitin.

Die vier Verbindungen hatten den gleichen Elternkern. Aconitin, 14-Benzylaconin, 14-Benzoylaconin und Hypaconitin waren ähnlich, und nur die Substituenten waren unterschiedlich.