Um mit der Zusammenführung krankheitsassoziierter Gene zu beginnen, platzieren Sie die zuvor gespeicherten TXT-Dateien aus fünf Datenbanken, die den Kräuternamen, die Inhaltsstoff-ID, die Gen-ID und das Skript Krankheit enthalten. R im selben Ordner. Öffnen Sie den R-Code.
Kopieren Sie den Pfad, in dem die TXT-Datei gespeichert ist, und fügen Sie ihn in die Zeile ein, in der sich setwd im R-Code befindet. Öffnen Sie die R-Software. Führen Sie den geänderten R-Code aus, und klicken Sie auf Speichern.
Legen Sie das Gen fest und benennen Sie die Datei Disease.txt. Öffnen Sie die Venn-Diagramm-Website. Kopieren Sie im Abschnitt Eingabe den bereits gespeicherten Textinhalt und fügen Sie ihn in die Liste ein.
Benennen Sie den Inhalt mit der jeweiligen Datenbank. und klicken Sie auf Senden. Klicken Sie unter dem Bild auf Bild als PNG speichern und speichern Sie das Textergebnis im selben Ordner.
Platzieren Sie das Symbol alltargets.. txt-Datei und die Krankheit. txt-Datei im selben Ordner.
Öffnen Sie den R-Code. Kopieren Sie den Pfad, in dem die txt-Datei gespeichert ist, und fügen Sie ihn in die Zeile ein, in der sich setwd im R-Code befindet. Öffnen Sie die R-Software.
Führen Sie den geänderten R-Code aus, und klicken Sie auf Speichern. Legen Sie das Gen fest und benennen Sie die Datei Drug_Disease.txt. Öffnen Sie die Venn-Diagramm-Website.
Kopieren Sie im Abschnitt Eingabe das Symbol alltargets.symbol, und fügen Sie es ein. txt und Krankheit. txt in die Liste ein und benennen Sie die Dateien.
Klicken Sie unter dem Bild auf Bild als PNG speichern und speichern Sie die Textergebnisse im selben Ordner. Öffnen Sie die String-Website, und klicken Sie auf Mehrere Proteine. Klicken Sie auf Durchsuchen und laden Sie die DrugDisease hoch.
txt-Datei. und wählen Sie dann Homo sapiens in Organismen aus. Klicken Sie auf SUCHEN und dann auf WEITER.
Klicken Sie nun auf Einstellungen, und legen Sie die minimal erforderliche Interaktionsbewertung auf die höchste Zuverlässigkeit fest. Aktivieren Sie in der Option Netzwerkanzeige die Option Getrennte Knoten im Netzwerk ausblenden, und klicken Sie dann auf AKTUALISIEREN>Knoten im Netzwerkschema so anpassen, dass es keine Überlappung oder Okklusion gibt. Klicken Sie auf Exporte, gefolgt von Als hochauflösende Bitmap herunterladen, um die Protein Interworking Network Map im PNG-Format zu erhalten, und laden Sie die TSV-Datei als kurze tabellarische Textausgabe herunter.
Speichern Sie PNG- und TSV-Dateien in einem einheitlichen Ordner.
