Method Article
El objetivo de este proyecto es desarrollar un oleoducto de modelado interactivo, específico para cada paciente para simular los efectos de la estimulación cerebral profunda en casi en tiempo real y proveer retroalimentación significativa en cuanto a cómo estos dispositivos influyen en la actividad neuronal en el cerebro.
Estimulación cerebral profunda (DBS), que implica la inserción de un electrodo para entregar estimulación a una región localizada del cerebro, es una terapia establecida para trastornos del movimiento y se aplica a un número creciente de trastornos. Modelado computacional se ha utilizado con éxito para predecir los efectos clínicos de la DBS; sin embargo, hay una necesidad de técnicas de modelado de nuevo mantener el ritmo con la creciente complejidad de los dispositivos DBS. Estos modelos también necesitan generar predicciones con rapidez y precisión. El objetivo de este proyecto es desarrollar una canalización de procesamiento de imagen para incorporar la proyección de imagen de resonancia magnética estructural (MRI) y las imágenes de difusión ponderada (DWI) en un modelo interactivo, paciente específico para simular los efectos de DBS. Un plomo DBS virtual puede colocarse dentro del modelo de paciente, junto con contactos activos y configuraciones de estimulación, donde cambios en la posición o la orientación generan una nueva malla de elementos finitos y la solución del problema del campo bioelectric en cerca en tiempo real, un intervalo de tiempo de aproximadamente 10 segundos. Este sistema también permite la simulación de múltiples contactos en proximidad cercana a permitir dirección actual por diferentes ánodos y cátodos en diferentes cables. Las técnicas presentadas en este trabajo reducen la carga de generación y uso de modelos computacionales ofreciendo retroalimentación significativa sobre los efectos de la colocación de los electrodos, electrodo de diseño y configuraciones de estimulación a los investigadores o clínicos que no sean expertos en modelado.
Estimulación cerebral profunda (DBS) es una terapia establecida para trastornos del movimiento como el temblor esencial1 y2de la enfermedad de Parkinson. Esta terapia también está siendo investigada como un tratamiento potencial para un número creciente de desórdenes incluyendo lesión de cerebro traumática3, síndrome de Tourette4y depresión5. Los sistemas de DBS requieren implante quirúrgico de una plomo del electrodo para proporcionar la estimulación en una región localizada del cerebro para modular la actividad neuronal continua6. La ubicación de los electrodos y los parámetros de estimulación tiene un efecto sobre la modulación de los circuitos neuronales que proporcionan beneficios terapéuticos. Pequeñas variaciones en la localización pueden afectar a la ventana terapéutica, posiblemente aumentando la probabilidad de efectos secundarios adversos antes de beneficio terapéutico alcanzado7,8,9. En la práctica, a menudo es difícil predecir que la estimulación de efectos tendrá en la actividad de los nervios; por lo tanto, esta ventana de beneficio terapéutico se identifica de forma paciente por paciente, como el dispositivo de estimulación está programado por el médico8,9. Este proceso es cada vez más complejo a medida que nuevas generaciones de dispositivos DBS disponibles. Por ejemplo, plomo nuevos diseños se están introduciendo con más contactos10,11,12, y en algunos casos múltiples contactos están siendo implantados en proximidad cercana a otros13. Por lo tanto, es necesario ser capaces de explorar y predecir los efectos de DBS en un espacio grande y creciente del parámetro.
Análisis y Modelado computacional pueden utilizarse para predecir los efectos fisiológicos y clínicos de DBS con carácter específico para cada paciente. Estos modelos utilizan elementos finitos (FEM) de modelado para construir tres representaciones dimensionales de los tejidos del cerebro y las características biofísicas del electrodo implantado. Modelos de campo bioelectric de FEM se han utilizado con éxito para predecir los efectos de DBS14, pero hasta ahora han sido lentas y costosas computacionalmente para generar. Hay una necesidad de técnicas de modelado de nuevo mantener el ritmo con la creciente complejidad de los dispositivos DBS. Estos modelos específicos del paciente deben proporcionar cerca de información visual en tiempo real sobre los efectos de DBS como plomo o se cambian los parámetros de estimulación. Al usuario obtener información sobre una ubicación de plomo y ajuste de estimulación en unos pocos segundos, lo que permite continuado refinamiento de la colocación de plomo a lo largo de varios minutos. Paciente-especificidad se logra por la incorporación de la anatomía del paciente, forma de su cerebro y tamaño, cuando la FEM y la aplicación de las propiedades biofísicas de su cerebro, tal como conductividad anisotrópica del tejido. Anisotropic conductividad describe cómo la corriente se extenderá a través de regiones diferentes del cerebro y puede medirse de forma no invasiva de todo el cerebro similar a una imagen típica de resonancia magnética (MRI).
DBS modelado métodos que no utilizan información específica del paciente puede proporcionar predicciones rápidas, pero menos precisas de los efectos de estimulación, debido a geometrías generalizadas y valores de la conductividad para el tejido cerebral. En este enfoque, una FEM solo se utiliza para todos los pacientes y la actividad prevista de los nervios puede ser computada por adelantado. Modelos específicos del paciente no pueden ser generalizados y previamente computados desde un FEM nuevo es construido para cada individuo. Estos modelos requieren más esfuerzo para construir, pero puede ser más exacta. Varios factores limitan la velocidad en que estos modelos pueden ser construidos y utilizados: 1) modificando parámetros al principio de la tubería del edificio modelo, como la colocación de los electrodos, requiere esfuerzo manual para actualizar todos los pasos posteriores; y 2) los pasos en el modelado de tubería no están fácilmente integrados uno con el otro, que requieren el paso de datos entre múltiples paquetes de software. A menudo, queremos evaluar diferentes situaciones como la colocación de los electrodos, parámetros de estimulación o diseños de electrodos. Para proporcionar retroalimentación significativa sobre el efecto de estos cambios en el efecto terapéutico que el paciente va a recibir, estos resultados deben ser precisa y generado rápidamente.
Nuestro objetivo es presentar nuevas técnicas de construcción específico para cada paciente modelos que aprovechan la velocidad obtenidos en modelos generalizados y automatizar muchos de los pasos de tubería para crear un entorno de modelado interactivo que proporciona cerca de visuales en tiempo real Comentarios acerca de los efectos de DBS. Una simulación interactiva permite al usuario probar predicciones y obtener resultados rápidamente sin concentrarse en detalles de construcción del modelo. Esto es beneficioso cuando hay un espacio de gran parámetro para explorar y cómo estos parámetros influyen en la simulación son inciertos. A describir los pasos en la canalización de procesamiento para generar modelos FEM interactivos, específico para cada paciente de adquisiciones de la proyección de imagen de resonancia magnética (MRI). Utilizando las herramientas y técnicas descritas en este documento reduce el coste de tiempo para la creación de modelos de campo bioelectric FEM y proporcionan una manera de hacer estos modelos accesibles a los investigadores y los clínicos que no son modelos a expertos.
Este protocolo describe cómo construir un modelo de elementos finitos específico para cada paciente de volúmenes adquiridos de MRI y luego simular el campo eléctrico inducido por un electrodo DBS. Los pasos principales en la creación de estos modelos son: 1) construir un modelo de elementos finitos (FEM) que representa el cerebro del paciente y el electrodo implantado 2) Añadir propiedades biofísicas de los parámetros del dispositivo DBS cerebro y estimulación a la FEM y resuelve la 3) el voltaje generado por el electrodo en el modelo. Dos modalidades de proyección de imagen son necesarios para construir un modelo específico de paciente para la simulación de DBS. Una resonancia magnética de T1 se utiliza para construir segmentaciones de la superficie del cerebro, ventrículos y núcleos específicos. Imágenes de difusión ponderada (DWI), una medida de difusividad de agua, se utilizan para estimar tensores de difusión en el tejido cerebral del15. Los tensores de difusión se convierten en tensores conductividad que cuantificar las propiedades biofísicas inhomogénea, anisotrópicas de los tejidos de un voxel por voxel base16. La distribución de voltaje a través del cerebro inducida por el electrodo se calcula resolviendo la ecuación de Poisson, que mediante la aplicación de FEM se simplifica a un sistema lineal de ecuaciones Ax = b donde A es una matriz de rigidez que representa la conductividad y geometría de la malla, x es la solución de voltaje en cada nodo de la malla, y b es modificado en base a las condiciones de contorno y fuentes de corriente.
1. tratamiento de la imagen
2. generación del modelo finitos del elemento
3. bioelectric campo cálculo
Al final de este protocolo se proporcionan todos los insumos necesarios para crear un modelo específico para cada paciente: la superficie del cerebro, geometría del electrodo y tensores conductividad. SCIRun debe también se ha creado una red que integra a todas las entradas para construir un modelo de elementos finitos y simular el campo bioelectric inducido. El modelo de simulación permite movimiento del electrodo dentro del cerebro y la modificación de parámetros tales como contactos activos o amplitud de estimulación.
Figura 1 se muestra la capacidad de simular y comparar las predicciones de la activación de la fibra a través de múltiples posiciones de los electrodos. Generación de extensiones de la fibra de la proyección de imagen de difusión no fue demostrado en el presente Protocolo, pero este análisis puede realizarse con cualquier método de tractografía determinista. Posición 2 predice una activación más robusta de la fibrado blanco en amplitudes menores de estimulación a través de todos los contactos en comparación a la posición 1. Este análisis se utiliza durante las etapas de planificación de la cirugía DBS para determinar la trayectoria de electrodo que efectivamente estimula la vía de fibra blanco.
Una característica novedosa de este sistema es la capacidad de cambiar rápidamente la geometría del electrodo en el modelo y la capacidad para simular múltiples contactos en proximidad cercana a una otra. Ambos de estos métodos se utilizan para proporcionar un mayor control sobre la forma y dirección del campo eléctrico alrededor del electrodo. La figura 2 ilustra la comparación de fibra activación las predicciones entre una axisimétrico y una direccional que DBS conducir mientras investigaba lugares de plomo para estimular vías centrales talámico fibra y evitando áreas tales como los núcleos sensoriales cercanas . Por la misma trayectoria de electrodo, podemos ver que la direccional delantera es capaz de dirigir la activación de la fibra hacia la región de destino, evitando la estimulación de fibras indeseables. Este análisis puede usarse para determinar cuándo sería necesario cambiar el dispositivo que el paciente reciba terapia DBS evitar estimulación de regiones cercanas que induciría efectos secundarios no deseados. Este enfoque es útil para dirigir el núcleo subtalámico para tratar los síntomas de la enfermedad de Parkinson, evitando la cápsula interna cercana.
Figura 1 : Comparación de la colocación de los electrodos y las predicciones de la activación de fibra blanco. Predicción de la activación del paquete de fibra total para amplitudes de estimulación (-0,5 V a-5.0 V) y todos los cuatro contactos para dos posiciones de los diferentes electrodos. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Figura 2 : Comparación de las predicciones de activación de paquete centrales talámico fibra con DBS axisimétrico y direccional conduce. (A) visualización de ambos el DBS de Medtronic 3387 cilíndrico plomo y el Sapiens DBS direccional de plomo con activación de cálculos de función sobre el objetivo centrales talámico fibrado para una amplitud de estimulación monopolar solo. (B) (i) una sección transversal rebanada a través de los paquetes de cable y fibra DBS. (ii) una proyección bidimensional de la superficie transversal con la identificación de la DBS plomo, blanco de fibras y fibras para evitar. (C) la propagación de la activación a través de fibras blanco y fibras de evitación como amplitud de la estimulación aumenta la axisimétrico y direccional DBS plomo. Las fibras activadas para una amplitud de estimulación dado aparecen en rojo, mientras que las fibras activadas no se muestran en azul. (D) una recopilación de todas las simulaciones que se muestra en el panel C, muestra la amplitud del umbral de estímulo previstos en todas las regiones de los paquetes de la fibra. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Este protocolo ha demostrado técnicas para reducir la carga de tiempo y coste computacional de construir modelos específicos de pacientes para DBS en un grado permite cerca de retroalimentación en tiempo real de resultados de la simulación. Retroalimentación rápida permite la exploración de un espacio de gran parámetro para entender mejor cómo los cambios de parámetro afectan los resultados del modelo. Estos parámetros incluyen plomo ubicación, opción de contactos activos y la amplitud, anchura de pulso y frecuencia de la onda de estimulación en esos contactos. Las características clave de la herramienta propuesta son: 1) una sencilla interfaz de usuario para ajustar los parámetros del modelo con cerca de visualización en tiempo real de cómo estos parámetros influyen en la simulación y 2) automatización de la creación del modelo de un pequeño conjunto de entradas: la superficie del cerebro, tensores de conductividad del tejido cerebral y una representación de la superficie de la geometría del electrodo. Esta automatización acelera la creación de modelos específicos del paciente para muchos individuos que tienen geometrías cerebro diferentes conductividades de tejido así como evaluar los efectos de insertar diseños de electrodos diferentes modelos existentes. Los pasos de preprocesamiento de imagen que se describe en este Protocolo no fueron totalmente automatizados y pueden tomar hasta un día de tiempo de procesamiento. Sin embargo, una vez completado los datos generados a partir de estos pasos se consideran estáticos, lo que significa que esta información no se modifica durante las simulaciones. La automatización de la creación del modelo surge de la capacidad del sistema para aplicar estos datos a la FEM del paciente específico sin esfuerzo manual. La red de SCIRun para llevar a cabo todos los de la generación de modelos, simulación, pasos de visualización sólo necesita ser construido una vez. Por lo tanto, sólo en los pasos de preprocesamiento de imagen necesitan realizar otra vez para generar un modelo específico para cada paciente para un paciente entrante.
La ganancia de rendimiento en la generación de resultados de la tubería de modelado es la integración de la generación de mallas, campo bioelectric cálculos y visualización de la solución en un entorno de software único. Técnicas actuales de modelado tales como generación de mallas adaptativo se utilizaron para crear mayor malla densidad alrededor del electrodo y una densidad más baja más lejos el electrodo que reduce el tiempo para construir y resolver la FEM. El software, SCIRun, también permite la automatización de la generación de mallas y cálculos de campo bioeléctrico. Movimiento definido por el usuario del electrodo usando los widgets interactivos desencadena la construcción de una nueva malla con la colocación de los electrodos actualizado. Esto incluye la modificación de las condiciones de contorno y valores de la conductividad para la nueva colocación de los electrodos.
La geometría del electrodo es tratada como un objeto de libre movimiento dentro del volumen del cerebro antes de que su posición está integrada en el FEM. Una implicación fundamental de este enfoque para la construcción de la malla es que múltiples electrodos pueden insertarse fácilmente en el modelo. Por ejemplo, una segunda copia de la geometría del electrodo puede colocarse varios milímetros de distancia y ambos se incluirán en el FEM. En investigaciones recientes, se han implantado dos electrodos en proximidad cercana a tratar la esclerosis múltiple temblor13 y se han utilizado en experimentos de primates no humanos para explorar la estimulación eficaz objetivos21. El beneficio del uso de electrodos múltiples es proporcionar mejor control del campo eléctrico generado en el tejido en un área más grande. Estimular con contactos activos en ambos electrodos puede dirigir actual hacia la región de destino y de las regiones que daría lugar a efectos secundarios negativos. Un control más fino de la estimulación sobre un área más grande también es útil para explorar lugares de estimulación diferentes cuando la ubicación exacta de lo objetivo es desconocida, como es el caso con muchas de las aplicaciones emergentes de la terapia de DBS. Sin embargo, determinar los parámetros para lograr la estimulación terapéutica es más difícil que un solo electrodo debido al aumento en un espacio de parámetros ya grandes.
Esperamos que esta herramienta de modelado interactivo podría proporcionar beneficios durante la planificación pre-operatoria para implante de DBS. Comentarios sobre el grado de estimulación en el tejido cerebral pueden permiten a los cirujanos modificar la ubicación de electrodos en su plan quirúrgico para proporcionar la estimulación terapéutica a la región de destino. Mientras que la terapia DBS fue el factor motivador primario para el desarrollo de esta herramienta, las técnicas presentadas en este trabajo se pueden aplicar a cualquier modelo de bioelectric campo FEM con estimulación diferentes o paradigmas de la grabación. Terapias de estimulación como la estimulación por corriente directa transcraneal para la depresión22 o el uso de electrodos de profundidad para el tratamiento de la epilepsia23 comparten los mismos desafíos que DBS en la determinación de la mejor ubicación de estimulación para lograr resultados terapéuticos. Electrocorticografía, una técnica de grabación con arreglos de electrodos en la superficie del cerebro para identificar regiones de inicio de convulsión, tiene el reto de determinar dónde colocar los electrodos para grabar en las regiones de objetivo en el cerebro24. Todas estas aplicaciones dependen de la colocación de los electrodos mientras que trata con la incertidumbre de cómo fluye la corriente a través del tejido de cerebro. Las técnicas presentadas en este trabajo reducen la carga de generación y uso de modelos computacionales ofreciendo retroalimentación significativa para los investigadores y clínicos que usan estos dispositivos que no son expertos en modelado.
Christopher R. Butson, Ph.D. ha desempeñado como consultor para NeuroPace Advanced Bionics, Boston Scientific, Intelect Medical, St. Jude Medical y neuromodulación funcional.
Este proyecto fue apoyado por el Instituto Nacional de salud subvenciones UH3, NS095554. Asistencia técnica fue proporcionada por el centro para la informática biomédica integrativa en la computación científica y la proyección de imagen de Instituto y fue posible en parte por el software desarrollado de NIH P41-GM103545, centro de integración biomédica informática.
Agradecimiento se extiende a Lexie piso y Nathan Galli en la computación científica y la proyección de imagen Instituto de producción y edición de la presentación de video y también a Theresa Lins para asistencia con la preparación del manuscrito.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
FreeSurfer | Athinoula A. Martinos Center for Biomedical Imaging | https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/ | |
3D Slicer | BWH, Harvard University | https://www.slicer.org/ | |
SCIRun | University of Utah Center for Integrative Biomedical Computing | http://www.sci.utah.edu/cibc-software/scirun.html |
Solicitar permiso para reutilizar el texto o las figuras de este JoVE artículos
Solicitar permisoThis article has been published
Video Coming Soon
ACERCA DE JoVE
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. Todos los derechos reservados