Para comenzar, calcule el número de pozos necesarios para el experimento. Luego, descongele una cantidad adecuada de muestra normal del sistema operativo. Agregue suficientes medios RPE para lograr una concentración final del sistema operativo de cuatro veces 10 a la sexta por mililitro.
Retire el medio apical y agregue 50 microlitros de cuatro veces 10 al sexto OS por mililitro con concentraciones apropiadas de ligandos puente. Después de agregar el sistema operativo, incube las muestras para varios puntos de tiempo. Al final de la incubación, agregue 16.67 microlitros de cuatro veces el tampón de muestra de Laemmli con inhibidores de la proteasa para lisar tanto las células como el SG suprayacente que contiene sobrenadante.
Con una pipeta P200, rasque la superficie Transwell y recoja el sobrenadante celular combinado y el lisado celular. Vortex y dejar a temperatura ambiente durante 30 minutos para una desnaturalización completa. La mancha occidental de la rodopsina mostró que la banda de rodopsina intacta era indistinguible en las células de RPE cargadas de control y UAM.
Sin embargo, los productos de escisión de la rodopsina fueron mayores en el grupo UAM, lo que sugiere una disfunción degradativa leve en el sistema fagolisomal. Los niveles iguales de GAPDH indican que el recuento de células entre pozos es igual. Diferentes anticuerpos de rodopsina reconocen diferentes fragmentos de degradación.
4D2 reconoce el extremo final de la rodopsina que está intacto hasta los últimos pasos de la degradación lisosomal. En contraste, 1D4 reconoce el extremo C de la rodopsina que se degrada antes en el proceso fagolisomal.