Integración de la operación de la red molecular a 2D-HPLC-MS para el análisis de muestras de péndulo de acónito

Para comenzar la preparación de los datos, exporte datos espectrales de masas sin procesar de HPLC-MS 2D. Junto a conectarse al servidor FTP GNPS en la interfaz WINSCP en la página Configuración de sesión, rellene la información de conexión. Después de completar la información, haga clic en el botón Inicio para establecer una conexión con el servidor FTP GNPS.

Cree redes moleculares abriendo un navegador web y visitando el sitio web de GNPS. Los nuevos usuarios deben registrarse para obtener una cuenta y luego iniciar sesión. En la interfaz principal del sitio web de GNPS, haga clic en Crear red molecular en Análisis de datos.

En la página Creación de tareas, haga clic en el botón seleccionar Archivos de entrada y, a continuación, seleccione y cargue el archivo de datos. En las pestañas Opción de flujo de trabajo, defina los distintos parámetros que generan la red molecular o MN. Estos parámetros incluyen el algoritmo de extracción de picos, el valor de pico sobre recorrido, el método de cálculo de similitud, etc. Después de realizar la configuración de parámetros adecuada según sea necesario, haga clic en el botón Enviar en la parte inferior de la página para ejecutar la tarea.

Una vez ejecutada la tarea, busque las tareas creadas en la pestaña Trabajos y haga clic en el nombre del flujo de trabajo para ver los resultados del análisis. El sitio web proporciona diagramas MN, sustitutos, redes simbióticas y otra información relacionada. Cuatro de los componentes alcaloides en las muestras de APB identificadas por el MN fueron aconitina, 14-benzoilaconine, 14-O-acetilneolina e hipaconitina.

Los cuatro compuestos tenían el mismo núcleo padre. La aconitina, la 14-bencil aconina, la 14-benzoilaconina y la hipaconitina fueron similares, y solo los sustituyentes fueron diferentes.