This work was supported by grants BB/J016012/1 and BB/E007872/1 from the UK Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC) to Gail Preston.

NOTA: La elección del material de partida de la hoja y la normalización de las condiciones de crecimiento de las plantas es fundamental, ya que estos factores pueden afectar en gran medida la calidad, la variabilidad y el rendimiento de AWF (Figura 1). Parámetros a tener en cuenta se muestran en la Tabla 1 y se analizan con más detalle en la discusión. <table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0"><tbody><tr><td> Parámetro </td><td colspan="3"> Ejemplo estandarizaciones </td></tr><tr><td></td><td> Phaseolus vulgaris </td><td> Solanum lycopersicum </td><td> Arabidopsis thaliana </td></tr><tr><td> Tipo de hoja </td><td> Las primeras hojas verdaderas, completamente expandida, saludable </td><td> 2 ª y 3 ª hojas a partir de la parte inferior, 4 folletos más grandes toman folleto apical no se utiliza para la extracción apoplasto </td><td> Hojas en roseta totalmente expandidas </td></tr><tr><td> Edad de la planta </td><td> 21 días </td><td> 7-9 weeks </td&gt; <td> 7 semanas </td></tr><tr><td> Hora del día </td><td> Mitad del período de luz (12:00) </td><td> Mitad del período de luz (12:00) </td><td> Mitad del período de luz (12:00) </td></tr><tr><td> Hidratación </td><td> Todas las plantas bien regadas 1 hora antes de la cosecha </td><td> Todas las plantas bien regadas 1 hora antes de la cosecha </td><td> Todas las plantas bien regadas 1 hora antes de la cosecha </td></tr><tr><td> Luz </td><td> 16 h de luz, 400 mol m -2 s -1 </td><td> 16 h de luz, 400 mol m -2 s -1 </td><td> 10 horas de luz (día corto) desde la semana 2, 400 mol m -2 s -1 </td></tr><tr><td> Humedad </td><td> 70% </td><td> 70% </td><td> 70% </td></tr><tr><td> Temperatura </td><td> 22 ° C la luz, 18 ° C oscura </td><td> 22 ° C la luz, 18 ° C oscura </td><td> 21 ° C </td></tr></tbody></table> Tabla 1. Ejemplos de pará estandarizadatros de hojas utilizadas en extracciones AWF. 1. Generación de apoplasto Lavado Fluid NOTA: Durante este protocolo materila peligrosos inculding patógenos microbianos a partir de hojas infectadas no se debe lavar por el desagüe; se deben utilizar procedimientos más adecuados de eliminación. <ol><li> Elige un aparato basado en el tamaño de la hoja: <ol><li> Infiltrarse en hojas más pequeñas (por ejemplo, Arabidopsis, frijol) utilizando una jeringa sin aguja. Utilice un frasco de vacío para infiltrarse en las hojas que son demasiado grandes para caber en una jeringa. Utilice el método de frasco vacío para infiltrarse en varias hojas a la vez. </li><li> Divida hojas que son demasiado grandes para el método de infiltración disponibles en pequeñas secciones usando una cuchilla de afeitar. Secciones de hojas Enjuague completamente cortadas en agua destilada antes de la infiltración para eliminar los contaminantes citoplásmicos que exudan de las células dañadas. </li></ol></li><li> La infiltración de la hoja usando una jeringa de 60 ml: <ol><li> Separe la hoja de laplanta en el peciolo usando una cuchilla de afeitar. Para hojas compuestas, tales como tomate, separar folletos en la peciólulo. </li><li> Enjuague la hoja recién extirpado por inmersión en agua destilada para eliminar contaminantes de la superficie de la hoja. Seque la hoja secando suavemente con papel absorbente o papel. </li><li> Medir el peso de la hoja antes de la infiltración. </li><li> Rodar con cuidado y / o doblar la hoja en una jeringa de 60 ml y llenar la jeringa con agua destilada (otros fluidos de infiltración pueden ser utilizados, véase el debate). Expulsar todo el aire dentro de la jeringa al tiempo que reduce el émbolo hasta aproximadamente la marca de 40 ml. </li><li> Cubrir la punta de la jeringa, ya sea con un dedo con guante o un trozo de Parafilm, a continuación, crear una presión negativa dentro de la jeringa tirando del émbolo hacia el exterior hasta la marca de 60 ml. Suelte lentamente el émbolo. NOTA: la liberación de la presión puede resultar en la lisis celular y la contaminación citoplasmática rápidamente. </li><li> Desenchufe la punta de la jeringa y se expulsa el aire, y luego vuelva a conectar la punta y pulsemás hacia abajo sobre el émbolo para crear una modesta cantidad de presión positiva. </li><li> Repita los pasos 1.2.5 - 1.2.6 hasta que la hoja está completamente infiltrada, como se ve por el color oscuro de las zonas infiltradas. </li><li> Retire la hoja de la jeringa. Suavemente pero a fondo secar la hoja con papel absorbente para eliminar el líquido de la superficie. </li><li> Medir el peso de la hoja infiltrada. Calcular la diferencia de peso antes y después de la infiltración que se aproxima estrechamente el volumen de infiltración. </li></ol></li><li> Hoja infiltración de frasco de vacío: <ol><li> Separe la hoja de la planta en el pecíolo utilizando una hoja de afeitar. </li><li> Enjuague la hoja recién extirpado por inmersión en agua destilada para eliminar contaminantes de la superficie de la hoja. Seque la hoja secando suavemente con papel absorbente. </li><li> Medir el peso de la hoja antes de la infiltración. </li><li> Coloque la hoja (u hojas si infiltrarse múltiples hojas) en un 250 ml o más grande lado frasco brazo containing agua destilada (otros fluidos de infiltración se pueden usar, véase la discusión). Cubrir la totalidad de las hojas con el líquido. </li><li> Aplicar un vacío en el matraz. Agitar suavemente para liberar las burbujas de aire de las hojas. Con cuidado y lentamente liberar el vacío. NOTA: liberar el vacío rápidamente puede resultar en la lisis celular y la contaminación citoplasmática. </li><li> Repita el paso 1.3.5 hasta que la hoja está completamente infiltrada, como se ve por el color oscuro de las zonas infiltradas. </li><li> Retire la hoja del matraz. Suavemente pero a fondo secar la hoja con papel absorbente para eliminar el líquido de la superficie. </li><li> Medir el peso de la hoja infiltrada. Calcular la diferencia de peso antes y después de la infiltración que se aproxima estrechamente el volumen de infiltración. </li></ol></li><li> Recuperación de AWF por centrifugación: <ol><li> Coloque la hoja en un pedazo de 4 pulgadas (10 cm) de ancho Parafilm. Con una punta de pipeta de 5 ml (o un objeto de tamaño similar),enrollar la hoja dentro del Parafilm. </li><li> Inserte la hoja enrollada con punta de la pipeta en una jeringa de 20 ml. Coloque los bordes de las hojas de corte hacia arriba. Inserte la jeringa en un tubo de polietileno o policarbonato 50 ml limpio. </li><li> Centrifugar la jeringa dentro del tubo durante 10 min a 1.000 xg en un rotor de cubeta oscilante a 4 ° C. NOTA: El examen visual de las hojas después de la centrifugación debe revelar que la mayoría de la infiltración de fluido ha sido expulsado. Manchas verdes más oscuros indican que se requiere tiempo de centrifugación adicional. </li><li> Pipetear la AWF recuperado en fresco tubos de 1,5 ml. NOTA: El volumen de AWF debe coincidir aproximadamente con el volumen de infiltración para que la hoja; si el volumen es menos tiempo de centrifugación adicional o se requiere velocidad de centrifugación. </li><li> Centrifugar las muestras AWF a 15.000 xg durante 5 min para eliminar cualquier célula o materia particulada. Alternativamente, pasar la AWF a través de un filtro de 0,22 micras a remocinco células y partículas. </li><li> Pipetear el sobrenadante a un tubo nuevo. Mantener las muestras en hielo hasta el almacenamiento. </li><li> Almacenar las muestras AWF a -80 ° C. </li></ol></li></ol> 2. Los ensayos para la contaminación citoplasmática <ol><li> Mantener las muestras AWF en hielo para minimizar las reacciones enzimáticas (por ejemplo, proteólisis) y llevar a cabo los ensayos inmediatamente después de las etapas de centrifugación se han completado. NOTA: Para los ensayos de metabolitos, las muestras se pueden congelar inmediatamente después de la extracción y se almacenan a -80 ° C hasta su uso. </li><li> Para una malato deshidrogenasa estándar (MDH) protocolo de ensayo ver 15; de otro modo utilizar un kit de ensayo comercialmente disponible MDH. </li><li> Para una deshidrogenasa de glucosa-6-fosfato estándar (G6PDH) protocolo de ensayo ver 16; de lo contrario utilizar un kit de ensayo de G6PDH disponible comercialmente. </li><li> Para la cuantificación de metabolitos citoplasmáticos tales como glucosa-6-fosfato (G-6-P) utilizar GC-MS como se describe en el paso 5 </strong&gt;. De lo contrario, utilice un kit disponible comercialmente para el ensayo directo de G-6-P. </li></ol> 3. Cálculo del factor de dilución apoplasto <ol><li> Preparar dos volúmenes de fluido de infiltración utilizado anteriormente en la etapa 1.2.4 o 1.3.4 (por ejemplo, agua destilada). Añadir polvo de carmín de índigo a una solución a una concentración final de 50 mM, añadir nada a la otra. </li><li> Medir la absorbancia a 610 nm (OD 610) de 200 l de la solución de infiltración índigo carmín con un lector de placas. Corrija este valor restando el OD 610 de 200 l de solución de infiltración sin índigo carmín. Sustituir este valor corregido como OD 610infiltrate en la ecuación a continuación. </li><li> Realizar al menos tres infiltraciones de hoja de replicar como anteriormente (paso 1.2 o 1.3) con ambas soluciones de infiltración (con y sin índigo carmín). </li><li> Después de la infiltración, rinse las hojas en agua destilada para eliminar cualquier resto de carmín de índigo presente en las superficies exteriores. </li><li> Proceda con centrifugación como anteriormente (paso 1.4). </li><li> Determinar la densidad óptica promedio 610 de 200 l de las extracciones de AWF índigo carmín. Corrija este valor restando el valor medio de DO 610 de 200 l de índigo carmín libre AWF. Sustituir este valor corregido como OD 610AWF en la ecuación a continuación. </li><li> Calcular el factor de dilución (es decir, doble dilución) a partir de los valores de absorbancia corregida como: Apoplasto factor de dilución = OD 610infiltrate / (610infiltrate OD - OD 610AWF) </li><li> Concentración o actividad Multiplique los valores de AWF por el factor de dilución para estimar la concentración / actividad en el líquido apoplástico in planta. </li></ol> 4. Concentración de AWF de Resistencia Total por liofilización <ol><li> Encienda el liofilizador y unllow que se estabilice a la temperatura y presión de trabajo. </li><li> Aunar la cantidad deseada de muestras AWF frescos o almacenados. </li><li> Distribuir las muestras de manera uniforme entre 2 tubos ml de centrífuga. </li><li> Determinar el volumen de la reconstitución: El volumen de reconstitución = volumen antes de factor de dilución de liofilización / apoplasto </li><li> Con los párpados cerrados, congelar los tubos en nitrógeno líquido. </li><li> Transfiera los tubos congelados a uno o más vasos de liofilización refrigerados. Si bien la transferencia de los tubos, reemplace la tapa con una que ha sido perforado con un objeto afilado para permitir el intercambio de gases. </li><li> Coloque los vasos al liofilizador y liofilizar las muestras completamente. </li><li> Retire las muestras de la máquina y reconstituir el AWF añadiendo la cantidad calculada de agua destilada. </li><li> Vuelva a colocar la tapa no perforada y almacenar las muestras a -80 ° C. </li></ol> 5. Análisis de metabolitos por cromatografía de gases espectrometría de masas 17 &lt;ol&gt; <li> Pipeta 200 l de AWF en un tubo de 1,5 ml </li><li> Añadir 700 l de metanol que contiene 10 mg / ml ribitol como patrón interno. </li><li> Se calienta a 70 ° C durante 10 min. </li><li> Centrifugar durante 10 min a 11.000 x g. </li><li> Transferir 700 l de sobrenadante a un tubo de 1,5 ml frescos. </li><li> Añadir 375 l de cloroformo frío y agitar durante 10 seg. </li><li> Añadir 500 l de dH 2 O y agitar durante 10 segundos. </li><li> Centrifugar durante 15 min a 2200 x g. </li><li> Transferir 150 l de la capa acuosa superior a un nuevo tubo de 1,5 ml, a continuación, secar las muestras completamente en un concentrador de vacío sin calor. </li><li> Disolver las muestras en 30 l de piridina que contienen 20 mg / ml de clorhidrato de metoxiamina. </li><li> Incubar a 70 ° C mientras se agita vigorosamente durante 2 hr. </li><li> Añadir 50 l de MSTFA (N-metil-N- (trimetilsilil) trifluoroacetamida). </li><li> Incubar a 37 ° C mientras se agitaba durante 30 min. </li><li> Transferir las muestras de GC-MS borradorviales de vidrio atible. </li><li> Realizar análisis de GC-MS de las muestras. Consulte Lisec et al. 2009 17, para obtener detalles sobre la configuración del equipo GC-MS y el rendimiento. </li></ol>

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	<li>Felle, H. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Apoplastic+pH+during+low-oxygen+stress+in+barley.">Apoplastic pH during low-oxygen stress in barley.</a> Annals of Botany. 98 (5), 1085-1093 (2006).</li><li>Schaarschmidt, S., Kopka, J., Ludwig-M&#252;ller, J., Hause, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Regulation+of+arbuscular+mycorrhization+by+apoplastic+invertases:+enhanced+invertase+activity+in+the+leaf+apoplast+affects+the+symbiotic+interaction.">Regulation of arbuscular mycorrhization by apoplastic invertases: enhanced invertase activity in the leaf apoplast affects the symbiotic interaction.</a> The Plant Journal. 51 (3), 390-405 (2007).</li><li>Outlaw, W. H., De Vlieghere-He, X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Transpiration+rate.+An+important+factor+controlling+the+sucrose+content+of+the+guard+cell+apoplast+of+broad+bean.">Transpiration rate. An important factor controlling the sucrose content of the guard cell apoplast of broad bean.</a> Plant Physiology. 126 (4), 1716-1724 (2001).</li><li>Rico, A., Jones, R., Preston, G. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Adaptation+to+the+plant+apoplast+by+plant+pathogenic+bacteria.">Adaptation to the plant apoplast by plant pathogenic bacteria.</a> Plant Pathogenic Bacteria. , 63-89 (2009).</li><li>Rico, A., Preston, G. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Pseudomonas+syringae+pv.+tomato+DC3000+uses+constitutive+and+apoplast-induced+nutrient+assimilation+pathways+to+catabolize+nutrients+that+are+abundant+in+the+tomato+apoplast.">Pseudomonas syringae pv. tomato DC3000 uses constitutive and apoplast-induced nutrient assimilation pathways to catabolize nutrients that are abundant in the tomato apoplast.</a> Molecular Plant-Microbe Interactions. 21 (2), 269-282 (2008).</li><li>Solomon, P., Tan, K., Oliver, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+nutrient+supply+of+pathogenic+fungi;+a+fertile+field+for+study.">The nutrient supply of pathogenic fungi; a fertile field for study.</a> Molecular Plant Pathology. 4, 203-210 (2003).</li><li>Brunner, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Innate+immunity+in+plants+and+animals:+emerging+parallels+between+the+recognition+of+general+elicitors+and+pathogen-associated+molecular+patterns.">Innate immunity in plants and animals: emerging parallels between the recognition of general elicitors and pathogen-associated molecular patterns.</a> Current Opinion in Plant Biology. 5 (4), 318-324 (2002).</li><li>Fontaniella, B., Vicente, C., Armas, R., Legaz, M. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Effect+of+leaf+scald+(Xanthomonas+albilineans)+on+polyamine+and+phenolic+acid+metabolism+of+two+sugarcane+cultivars.">Effect of leaf scald (Xanthomonas albilineans) on polyamine and phenolic acid metabolism of two sugarcane cultivars.</a> European Journal of Plant Pathology. 119 (4), 401-409 (2007).</li><li>Mill&#225;n, A. F., Morales, F., Abad&#237;a, A., Abad&#237;a, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Effects+of+iron+deficiency+on+the+composition+of+the+leaf+apoplastic+fluid+and+xylem+sap+in+sugar+beet.+Implications+for+iron+and+carbon+transport.">Effects of iron deficiency on the composition of the leaf apoplastic fluid and xylem sap in sugar beet. Implications for iron and carbon transport.</a> Plant Physiology. 124 (2), 873-884 (2000).</li><li>Dragi&#353;i&#263; Maksimovi&#263;, J. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Filter+strip+as+a+method+of+choice+for+apoplastic+fluid+extraction+from+maize+roots.">Filter strip as a method of choice for apoplastic fluid extraction from maize roots.</a> Plant Science. 223 (1), 49-58 (2014).</li><li>Baker, C. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=An+internal+standard+technique+for+improved+quantitative+analysis+of+apoplastic+metabolites+in+tomato+leaves.">An internal standard technique for improved quantitative analysis of apoplastic metabolites in tomato leaves.</a> Physiological and Molecular Plant Pathology. 78, 31-37 (2012).</li><li>Nouchi, I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Overcoming+the+difficulties+in+collecting+apoplastic+fluid+from+rice+leaves+by+the+infiltration-centrifugation+method.">Overcoming the difficulties in collecting apoplastic fluid from rice leaves by the infiltration-centrifugation method.</a> Plant &amp; Cell Physiology. 53 (9), 1659-1668 (2012).</li><li>Boudart, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cell+wall+proteins+in+apoplastic+fluids+of+Arabidopsis+thaliana+rosettes:+identification+by+mass+spectrometry+and+bioinformatics.">Cell wall proteins in apoplastic fluids of Arabidopsis thaliana rosettes: identification by mass spectrometry and bioinformatics.</a> Proteomics. 5 (1), 212-221 (2005).</li><li>Lohaus, G., Pennewiss, K., Sattelmacher, B., Hussmann, M., Hermann Muehling, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Is+the+infiltration-centrifugation+technique+appropriate+for+the+isolation+of+apoplastic+fluid?+A+critical+evaluation+with+different+plant+species.">Is the infiltration-centrifugation technique appropriate for the isolation of apoplastic fluid? A critical evaluation with different plant species.</a> Physiologia Plantarum. 111 (4), 457-465 (2001).</li><li>Bergmeyer, H. U. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Malate+Dehydrogenase.">Malate Dehydrogenase.</a> Methods of Enzymatic Analysis. 2, 614 (1974).</li><li>Lohr, G. W., Waller, H. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Glucose-6-phosphate+Dehydrogenase.">Glucose-6-phosphate Dehydrogenase.</a> Methods of Enzymatic Analysis. 2, 636-643 (1974).</li><li>Lisec, J., Schauer, N., Kopka, J., Willmitzer, L., Fernie, A. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Gas+chromatography+mass+spectrometry-based+metabolite+profiling+in+plants.">Gas chromatography mass spectrometry-based metabolite profiling in plants.</a> Nature Protocols. 1 (1), 387-396 (2006).</li><li>Li, Z. C., McClure, J. W., Hagerman, A. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Soluble+and+bound+apoplastic+activity+for+peroxidase,+beta-d-glucosidase,+malate+dehydrogenase,+and+nonspecific+arylesterase,+in+barley+(Hordeum+vulgare+L.)+and+oat+(Avena+sativa+L.)+primary+leaves.">Soluble and bound apoplastic activity for peroxidase, beta-d-glucosidase, malate dehydrogenase, and nonspecific arylesterase, in barley (Hordeum vulgare L.) and oat (Avena sativa L.) primary leaves.</a> Plant Physiology. 90 (1), 185-190 (1989).</li><li>Dani, V., Simon, W. J., Duranti, M., Croy, R. R. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Changes+in+the+tobacco+leaf+apoplast+proteome+in+response+to+salt+stress.">Changes in the tobacco leaf apoplast proteome in response to salt stress.</a> Proteomics. 5 (3), 737-745 (2005).</li><li>Shabab, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fungal+effector+protein+AVR2+targets+diversifying+defense-related+Cys+proteases+of+tomato.">Fungal effector protein AVR2 targets diversifying defense-related Cys proteases of tomato.</a> Plant Cell. 20 (4), 1169-1183 (2008).</li><li>Cosgrove, D. J., Cleland, R. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Solutes+in+the+free+space+of+growing+stem+tissues.">Solutes in the free space of growing stem tissues.</a> Plant Physiology. 72 (2), 326-331 (1983).</li><li>Husted, S., Schjoerring, J. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Apoplastic+pH+and+ammonium+concentration+in+leaves+of+Brassica+napus.">Apoplastic pH and ammonium concentration in leaves of Brassica napus.</a> L. Plant Physiology. 109 (4), 1453-1460 (1995).</li><li>Kettle, A. J., Clark, B. M., Winterbourn, C. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Superoxide+converts+indigo+carmine+to+isatin+sulfonic+acid.">Superoxide converts indigo carmine to isatin sulfonic acid.</a> The Journal of Biological Chemistry. 279 (18), 18521-18525 (2004).</li><li>Bournonville, C. F. G., D&#237;az-Ricci, J. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quantitative+determination+of+superoxide+in+plant+leaves+using+a+modified+NBT+staining+method.">Quantitative determination of superoxide in plant leaves using a modified NBT staining method.</a> Phytochemical Analysis. 22 (3), 268-271 (2011).</li><li>Speer, M., Kaiser, W. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ion+relations+of+symplastic+and+apoplastic+space+in+leaves+from+Spinacia+oleracea+L.+and+Pisum+sativum+L.+under+salinity.">Ion relations of symplastic and apoplastic space in leaves from Spinacia oleracea L. and Pisum sativum L. under salinity.</a> Plant Physiology. 97 (3), 990-997 (1991).</li></ol>

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Optimización de la fuente de tejido de la planta La variación biológica y técnica puede ser grande cuando se realiza apoplasto extracciones, por lo tanto un flujo de trabajo altamente estandarizado es útil para aumentar la continuidad a través de experimentos (Figura 1). Es importante destacar que la fuente de tejido de la planta debe ser estandarizada, incluyendo el tipo de hoja, edad de la hoja, de crecimiento / condiciones ambientales y hora del día (Tabla 1). Existen grandes diferencias en la facilidad con que las diferentes hojas están infiltrados y, posteriormente, la AWF recuperaron por centrifugación; estas diferencias se correlacionan con el número de estomas, tamaño de la abertura y la resistencia mesófilo 12,14. Incluso entre los diferentes cultivares de P. vulgaris hay grandes diferencias en la facilidad y el rendimiento del procedimiento de extracción AWF; por ejemplo, las hojas de la variedad Tendergreen utilizado aquí son más susceptibles a la extracción AWF utilizando este método que el cultivar Canadian Wonder. DentroP. vulgaris las primeras hojas verdaderas son los más grandes y los más fáciles de infiltrar, lo que la elección obvia para extracciones apoplásticas. El volumen de aire y agua apoplástico se ha demostrado que varían con la edad de la hoja en varias especies que conducen a diferencias en AWF de extracción 12,14. En P. vulgaris, las hojas más viejas se vuelven mucho más difícil de infiltrar y rendir menos AWF la centrifugación; Por lo tanto, las hojas se cosecharon cuando alcanzaron plena expansión. Las hojas que son difíciles de infiltrar exigir posteriormente velocidades de centrifugación más altos para recuperar la AWF. Por ello se debería examinar cuidadosamente varios tipos de hojas diferentes y variedades antes de decidir sobre una fuente de tejido para las extracciones AWF gran escala. Las condiciones de crecimiento de la planta también deben normalizarse tanto como sea posible en el contexto del experimento. El uso de cámaras de cultivo es preferible, ya que permiten la humedad constante, la temperatura y lighregimientos t intensidad que se mantenga. La recolección de hojas siempre debe ocurrir en el mismo momento del día porque las concentraciones de metabolitos, enzimas, etc. varían durante el ciclo diurno 14. Por último, para asegurar que la planta deja todos tienen la presión de turgencia similares, las plantas deben regarse poco antes (~ 1 h) de la cosecha. Optimización de la infiltración de la hoja y centrifugación Contaminación citoplasmática indeseable de la AWF debido a la lisis celular parcial resultará si el estrés mecánico encontrado por las células es demasiado alta durante los pasos de infiltración o centrifugación. Por lo tanto, el procedimiento para un tipo dado de la hoja debe ser un equilibrio optimizado entre maximizar el rendimiento y minimizar la contaminación citoplasmática de la AWF. En todos los casos, se debe utilizar la velocidad de centrifugado baja a la que AWF se puede recuperar para evitar una posible rotura mecánica de las células de las hojas. Optimización de la centrifuvelocidad gación debe determinarse empíricamente para cada tipo de hoja por el seguimiento del volumen recuperado y apoplasto la contaminación a través de una gama de velocidades de centrifugación. Se ha observado que las actividades de enzima marcadora, como MDH, G6PDH y la isomerasa de glucosa-fosfato, siguen siendo bajos hasta que una fuerza centrífuga de umbral es superado, por encima del cual estas actividades aumentan rápidamente, presumiblemente debido a las fugas citoplasmática 9,12,14. El uso de Parafilm para el apoyo durante la etapa de centrifugación, como se ha señalado por Baker et al. 2012 11, puede mejorar la eficacia de la extracción AWF y puede minimizar el daño mecánico a la lámina de la hoja causado por plegado excesivo y compresión. Además, el uso de Parafilm mejora la visualización de la hoja después de la centrifugación cuando uno debe examinar la hoja de los daños y la integridad de la extracción AWF. Nouchi 12 describen la optimización de la recuperación AWF de secciones de hojas de arroz corte, que son difficult infiltrarse y requieren velocidades de centrifugado superiores a recoger AWF debido a sus pequeñas aberturas de los estomas. Mejora de la humectación de la superficie de la hoja de arroz, ya sea por remojo previo de las hojas en agua destilada o la adición de un agente tensioactivo para el fluido de infiltración, facilitado el proceso de infiltración. Una velocidad de centrifugado más alta (6.000 xg) también se utilizó durante el seguimiento de la contaminación apoplástico 12. Cuando se utilizan secciones de hoja de corte siempre hay el riesgo de que la contaminación citoplasmática será más prevalente incluso con un lavado extensivo de los sitios de la herida; hojas cortadas únicamente deben utilizarse cuando sea necesario. Para muchos estudios de agua destilada se utiliza como fluido de infiltración 11. Sin embargo, los compuestos se pueden añadir al fluido de infiltración, tales como sales o tampones, para mejorar la extracción de ciertos compuestos apoplásticas, especialmente proteínas 13. Lohaus 14 evaluó el efecto de la fuerza iónica y osmótica on la composición de la AWF recuperado y los encontró a ser insignificante. Los cambios en el pH del medio de infiltración, sin embargo, pueden afectar a la composición AWF 14. El manejo adecuado y el almacenamiento del fluido apoplástico extraído es importante. AWF se ha demostrado que contienen una abundancia de proteasas y otras enzimas 13,20, así como compuestos orgánicos volátiles. Por lo tanto, para reducir los cambios en la composición de AWF después de la recuperación, se recomienda mantener las muestras en hielo o almacenados a -80 ° C. Además, los ensayos enzimáticos de AWF se debe realizar lo más pronto posible después de la extracción para limitar la inactivación de la enzima debido a la proteolisis, dilución prolongado o congelación-descongelación. El proceso de infiltración diluye el líquido apoplástico y a menudo es necesario para determinar el alcance de esta dilución. La etapa de centrifugación también puede diluir la AWF con agua de los compartimientos intracelulares. Se necesita un factor de dilucióned para estimar in vivo apoplasto concentraciones químicas en cuando las mediciones se hacen en AWF. También se necesita un factor de dilución para concentrar AWF de nuevo a plena potencia cuando está siendo usado como un apoplasto imitando medio de crecimiento para los microbios - juego tanto en las concentraciones de metabolitos in vivo con la mayor precisión posible. Existen varias variaciones en el método descrito en el paso 4 para determinar el factor de dilución AWF mediante la medición de la dilución de un compuesto marcador añadido al fluido de infiltración. Para todos los métodos de dilución AWF el cálculo asume que el fluido de infiltración no está apreciablemente absorbe o se diluirá con las células de las hojas durante el proceso de recuperación AWF. Esta hipótesis ha sido verificada previamente para el paso de infiltración 14 pero no está verificado por la etapa de centrifugación. El compuesto marcador tampoco debe ser absorbida, transportada o mientras modificado en el apoplasto. Indigo carmín es el más utilizado y probado a fondo de los colorantes utilizadospara los cálculos de dilución AWF. Indigo carmín muestra una absorbancia baja a la resina de intercambio catiónico y las paredes celulares aisladas y ha demostrado ser adecuado para los cálculos AWF en Brassica napus, Pisum sativum, Solanum lycopersicum y Glycine max 11,21,22. Sin embargo, en algunos tipos de hojas, por ejemplo, el arroz y el pepino, índigo carmín parecía no ser recuperado totalmente después de la infiltración, lo que llevaría a una subestimación del factor de dilución AWF 12,21. La falta de recuperación de índigo carmín puede ser debido a su susceptibilidad a la escisión en sulfonato de isatina por superóxido 23, que se sabe que se produce en el apoplasto, especialmente bajo estrés 24. La escisión de índigo carmín en sulfonato de isatina se traducirá en una pérdida de absorbancia a 610 nm y un incremento a 245 nm. Si esta reacción se produce en una medida apreciable en el apoplasto, o si esta reacción puede ser inhibida por la adición de eliminadores de superóxido para infiltratlíquido iónico no se ha investigado hasta la fecha. Azul de dextrano se ha usado en lugar de índigo carmín para la cuantificación del factor de dilución AWF en el arroz hojas 12, aunque no se ha informado de su estabilidad y recuperación de la AWF. Alternativamente, los compuestos radiomarcados tales como [14 C] de sorbitol u otros estándares internos cuantificables se pueden utilizar en lugar de colorantes y la disminución de la radiactividad o la concentración mide y se utiliza para calcular el factor de dilución de una manera análoga 11,14,25. Limitaciones de la técnica Existen algunas advertencias para el método de aislamiento AWF infiltración-centrifugación. En primer lugar, la dilución de la apoplasto durante la infiltración puede obtener una respuesta de la planta. Si las células de las hojas que rodean detectan una concentración disminuida para ciertos componentes del fluido apoplástica, pueden responder mediante la excreción de metabolitos adicionales, distorsionando la interpretación de las concentraciones de metabolitos. Ense observó una evaluación de este problema que ni el tiempo entre la infiltración y la centrifugación ni diferencias moderadas en la fuerza iónica del fluido de infiltración afectó a la composición de la AWF extraída 14,22. Por lo tanto, los artefactos resultantes de apoplasto se cree dilución para ser mínimo. Una segunda desventaja potencial es que la elución de AWF por centrifugación no captura todas las moléculas presentes en el apoplasto por varias razones. Algunos compuestos, en cationes y proteínas particulares pueden estar estrechamente asociados con la pared celular cargada negativamente, y no se eluyen con la AWF 13. Otras moléculas tales como proteínas pueden ser demasiado grandes para eluir eficientemente fuera de la apoplasto a las velocidades de centrifugación utilizados 14. Especies de oxígeno reactivas son una clase importante de compuesto producido en el apoplasto, pero debido a la naturaleza de corta duración de estos compuestos, y los requisitos especificados para su producción, su presencia no está bien capturado por extracción AWF. No se sabe con qué precisión AWF representa la composición in vivo del fluido apoplasto y esto puede variar entre las especies. Existen varios ensayos para determinar la contaminación citoplasmática, aunque ninguno es universalmente aceptada. Los ensayos de enzimas citoplasmáticas predominantemente (por ejemplo, G6PDH, fosfato isomerasa de hexosa, MDH) tienen la ventaja de ser fácil de realizar, pero puede no correlacionarse bien con fugas citoplasmática 14,18. La evaluación de los metabolitos citoplasmáticos (por ejemplo, fosfatos de hexosa, clorofila) es quizás más indicativo pero no está bien establecida 11. Sin embargo, cualquier tipo de ensayo puede ser útil para la cuantificación relativa de contaminación entre muestras apoplástico. Idealmente, múltiples mediciones independientes deben ser utilizados para validar la integridad de la muestra AWF. Si bien reconocen sus limitaciones, la infiltración-centrifugatien técnica descrita aquí sigue siendo una técnica sencilla y robusta en el estudio de las proteínas apoplásticas, metabolitos primarios y secundarios e iones inorgánicos.

<html> El apoplasto de la planta es el espacio intercelular que rodea a las células vegetales. Este es un entorno dinámico en el que muchos de los procesos metabólicos y de transporte tienen lugar. El principal componente estructural de la apoplasto es la pared celular, que se monta y modificado por enzimas, proteínas estructurales y metabolitos situados dentro de la apoplasto. En las células vegetales saludables apoplasto se mantiene generalmente en un estado de acidez permite aminoácidos, azúcares y otros nutrientes para ser importados desde el apoplasto al citoplasma por H + symport 1. Durante el transporte de sacarosa, se mueve de sacarosa a partir de fuentes fotosintéticos a través del apoplasto y en la vasculatura del floema; a continuación, la sacarosa es transportada por un potencial osmótico mantenido por invertasas apoplásticas de escisión de sacarosa en los órganos del fregadero 2. Los azúcares y otros nutrientes también pueden ser transportados hacia arriba y se acumulan en las cavidades de los estomas a través de la corriente de transpiración 3. &quot;&gt; El apoplasto también representa un nicho ambiental donde muchos patógenos establecen su estilo de vida parasitaria. Patógenos bacterianos de plantas tienen la capacidad de multiplicarse a altas densidades en el apoplasto, que acceden a través de las aberturas naturales tales como estomas o a través de heridas 4. La concentración de amino ácidos y otros compuestos de nitrógeno en tomate apoplasto han demostrado ser suficiente para soportar los requisitos nutricionales de los patógenos bacterianos y fúngicos 5,6. respuestas de defensa primarios hacia patógenos microbianos también se producen en el apoplasto, a saber, la producción de especies reactivas del oxígeno por peroxidasas extracelulares . y oxidasas y el fortalecimiento de la pared celular a través de la reticulación y callosa deposición 7 La pared celular vegetal es rica en metabolitos secundarios con actividad anti-microbianas, la naturaleza bioquímica de estos metabolitos secundarios varía entre las especies 8. Como resultado de la mención anteriormenteed y otros procesos, el líquido apoplástico hoja contiene una variedad de proteínas, azúcares, ácidos orgánicos, aminoácidos, metabolitos secundarios, metales y otros cationes (por ejemplo, Mg 2+, K +, Na +, Ca 2+, Fe 2/3 +). Concentraciones de soluto en el apoplasto de brotes se controlan en gran medida por el equilibrio de los procesos de transporte que ocurren entre el apoplasto y el xilema, floema y el citoplasma 9. Sin embargo, las reacciones metabólicas y el crecimiento microbiano también consumen o producen solutos apoplásticas. La composición del apoplasto se sabe que difieren entre las especies de plantas y genotipos y en respuesta a las cambiantes condiciones ambientales, incluyendo la luz, la nutrición y bióticos y abióticos 9. Mediante el estudio de la composición de la apoplasto y cómo cambia, incluyendo propiedades tales como redox y el potencial osmótico, pH, nutrientes / disponibilidad metabolito y las actividades enzimáticas, se puede obtener nuevos conocimientos sobre cómo las plantas reresponden a su entorno. Comprensión o caracterizar los cambios moleculares que se producen en la solución apoplasto se complica debido a que es un compartimiento espacialmente estructurado y dinámico en el que los metabolitos y / o iones pueden ser volátiles, transitoria o asociado con la pared celular y la membrana plasmática. Además, se requieren diferentes técnicas analíticas para cubrir la gama de diferentes tipos químicos. Para estudiar la composición de la apoplasto soluble, líquido usualmente necesita ser extraído del tejido. Existen varios métodos para extraer fluido apoplasto de diversos tejidos, incluyendo un método de la tira de filtro nueva propuesta de 10, pero el método de extracción más establecido para las hojas es la infiltración-centrifugación. Esta técnica ha sido evaluada previamente 11-13 y Lohaus et al. 2001 14 proporcionar un examen a fondo de muchos de los parámetros técnicos del método. Como implica el nombre, la infiltración-centrifugación técnica es un método de dos etapas que implica esencialmente la sustitución del espacio de aire apoplástico con un fluido de infiltración acuosa, que se mezcla con el líquido apoplástico nativo, seguido de la recuperación de la mezcla de fluido de infiltración / apoplástico por centrifugación suave de las hojas. Como se diluye el líquido recuperado y no contiene todos los compuestos presentes en el apoplasto (véase más adelante), este líquido se conoce comúnmente como apoplasto fluido de lavado (AWF), o fluido de lavado intercelular veces, en lugar de líquido apoplástico. La técnica de infiltración-centrifugación es fácilmente escalable que permite muestras individuales o agrupados AWF de volumen adecuado que se generen y se sometieron a una amplia gama de técnicas analíticas bioquímicas y aguas abajo (por ejemplo, la electroforesis de proteínas, la medición de la actividad enzimática, RMN, muchos tipos de cromatografía y la masa espectrometría). Hoja AWF también es útil como un apoplasto imitando medio de crecimiento para el estudio de la interacción de colonizar la planta microbios ingenioh su entorno 5. En los siguientes protocolos se describe cómo realizar la técnica de infiltración-centrifugación utilizando Phaseolus vulgaris cv. Tendergreen hojas, y proporcionar algunos ejemplos de análisis posteriores con un enfoque en la metabolómica. Es importante destacar que los métodos para evaluar la calidad de AWF se proporcionan junto con consejos para optimizar el procedimiento para diferentes tipos de hojas.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="906">
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:309px;">Name of Material/ Equipment</td>
			<td style="width:291px;">Company</td>
			<td style="width:139px;">Catalog Number</td>
			<td style="width:167px;">Comments/Description</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:309px;">Eppendorf Microcentrifuge Tubes</td>
			<td style="width:291px;">Eppendorf</td>
			<td style="width:139px;">22364111</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:309px;">razor blade</td>
			<td style="width:291px;">Fisher</td>
			<td>12-640&#160;</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:309px;">60 ml syringe</td>
			<td style="width:291px;">Becton Dickinson</td>
			<td style="width:139px;">300865</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:309px;">20 ml syringe</td>
			<td style="width:291px;">Becton Dickinson</td>
			<td style="width:139px;">300613</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:309px;">4 inch parafilm</td>
			<td style="width:291px;">Bemis</td>
			<td style="width:139px;">PM-996</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:309px;">side arm flask</td>
			<td>SciLabware</td>
			<td>12972831</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:309px;">vacuum source</td>
			<td style="width:291px;"></td>
			<td style="width:139px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:309px;">5 ml pipette tips</td>
			<td style="width:291px;">Fisher</td>
			<td>50-813-28&#160;</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="23">
			<td height="23" style="height:23px;width:309px;">centrifuge</td>
			<td style="width:291px;">Beckman Coulter</td>
			<td>392932</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:309px;">Swinging bucket rotor</td>
			<td style="width:291px;">Beckman Coulter</td>
			<td>369702</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:309px;">indigo carmine</td>
			<td style="width:291px;">Sigma</td>
			<td style="width:139px;">I8130</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:309px;">microplate reader</td>
			<td style="width:291px;">Tecan</td>
			<td style="width:139px;">Infinite 200</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:309px;">96 well plates</td>
			<td style="width:291px;">Becton Dickinson</td>
			<td style="width:139px;">353072</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:309px;">freeze dryer</td>
			<td style="width:291px;">SciQuip</td>
			<td style="width:139px;">Christ Alpha 2-4 LD</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:309px;">microcentrifuge</td>
			<td style="width:291px;">biorad</td>
			<td>166-0612EDU</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:309px;">oxaloacetic acid</td>
			<td style="width:291px;">Sigma</td>
			<td>O4126</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:309px;">D-glucose-6-phosphate</td>
			<td style="width:291px;">Sigma</td>
			<td>G7250</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:309px;">NADH</td>
			<td style="width:291px;">Roche</td>
			<td>10128023001</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:309px;">MDH assay kit</td>
			<td style="width:291px;">Biovision</td>
			<td>K654-100</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:309px;">G6PDH assay kit</td>
			<td style="width:291px;">Sigma</td>
			<td>MAK015-1KT</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:309px;">G-6-P assay kit</td>
			<td style="width:291px;">Biovision</td>
			<td>K657-100</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:309px;">ribitol</td>
			<td style="width:291px;">Sigma</td>
			<td style="width:139px;">A5502</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:309px;">methanol</td>
			<td style="width:291px;">Sigma</td>
			<td style="width:139px;">650471</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:309px;">chloroform</td>
			<td style="width:291px;">Sigma</td>
			<td style="width:139px;">472476</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:309px;">vacuum concentrator</td>
			<td style="width:291px;">Thermor Scientific</td>
			<td>SC250EXP</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:309px;">methoxyamine hydrochloride</td>
			<td style="width:291px;">Sigma</td>
			<td style="width:139px;">226904</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">N-Methyl-N-(trimethylsilyl) trifluoroacetamide</td>
			<td style="width:291px;">Sigma</td>
			<td style="width:139px;">394866</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

the infiltration-centrifugation technique for extraction of apoplastic fluid from plant leaves using phaseolus vulgaris as an example

El apoplasto es un compartimento extracelular distinta en los tejidos de la planta que se encuentra fuera de la membrana plasmática y la pared celular incluye. El compartimiento apoplástico de hojas de la planta es el sitio de varios procesos biológicos importantes, incluyendo la formación de la pared celular, nutriente celular y la absorción de agua y de las exportaciones, las interacciones planta-endófitos y respuestas de defensa frente a patógenos. El método de infiltración-centrifugación está bien establecida como una técnica robusta para el análisis de la composición apoplasto soluble de varias especies de plantas. El fluido obtenido por este método se conoce comúnmente como apoplasto fluido de lavado (AWF). El siguiente protocolo describe un método de infiltración de vacío y centrifugación optimizada para la extracción de Phaseolus vulgaris AWF (habichuela) cv. Tendergreen hojas. Se discuten las limitaciones de este método y la optimización del protocolo para otras especies de plantas. AWF recuperado se puede utilizar en una amplia gama de aguas abajo experiments que tratan de caracterizar la composición del apoplasto y cómo varía en respuesta a las especies de plantas y genotipo, desarrollo de la planta y las condiciones ambientales, o para determinar cómo los microorganismos crecen en apoplasto fluidos y responden a los cambios en su composición.

Los resultados típicos para extracciones realizadas en AWF saludable de 3 semanas P. vulgaris cv. Tendergreen hojas, utilizando agua destilada como fluido de infiltración se muestran en la Tabla 2. Joven P. hojas vulgaris son susceptibles a la infiltración, y a la velocidad de centrifugación utilizado aquí (1.000 xg) la eliminación de la mayoría de fluido de infiltración por centrifugación se pueden ver directamente como las hojas vuelven a su color original verde. P. hoja vulgaris peso fresco fue en promedio de 1.1 xg antes de la infiltración y cedió 0,5 ml de AWF por gramo de peso fresco. La concentración de proteína de la AWF se determinó que era 0,18 ± 0,08 mg / ml utilizando un ensayo de proteínas Bradford estándar. El factor de dilución de estas hojas, calculados mediante la medición de la dilución índigo carmín, fue de 2,3 ± 0,3 veces. Los valores anteriores pueden variar sustancialmente entre las especies y los proyectos piloto son necesarios para determinar el rendimiento de AWF por gramo de hoja que frescoight, así como la concentración de proteína AWF y el factor de dilución que se puede esperar para un tipo de hoja determinado. El daño a la integridad de las células puede ocurrir tanto durante la etapa de infiltración, si los cambios en la presión son demasiado rápida, y durante la etapa de centrifugación, si la fuerza centrífuga es demasiado alta. Por lo tanto, es necesario para someter a ensayo muestras AWF para los marcadores de contaminación citoplasmática; idealmente, se realizan varios ensayos independientes. Aquí, los resultados de tres ensayos posibles se presentan en la Tabla 2. En extracciones bien realizados de P. vulgaris AWF, G6PDH era indetectable por un ensayo enzimático estándar. Esto es consistente con otros informes donde la actividad G6PDH se vuelve detectable sólo por encima de una fuerza centrífuga umbral de 12. En contraste, un nivel basal de actividad de la malato deshidrogenasa (2,5 U / ml) fue detectable en todos P. muestras vulgaris AWF utilizando un ensayo metabólico estándar. El aumento de la centrífuga parace encima de un umbral de 1.000 xg resultó en aumento de las actividades de MDH (resultados no mostrados). Como se sabe que el apoplasto de otras especies para contener la actividad endógena MDH 18, la cantidad detectada aquí se considera verdadera actividad apoplástico y aumentos significativos por encima de este nivel de referencia son indicativos de contaminación. Los metabolitos que se cree que son predominantemente citoplasmática, tales como hexosa-6-fosfatos, también se pueden utilizar para evaluar la contaminación de AWF. Aquí, el análisis GC-MS detecta cero o traza niveles de G-6-P en extracciones AWF. Por el contrario, en las secciones de raíz de maíz corte, G-6-P se detectó después de la extracción AWF a todas las velocidades de centrifugación y el aumento en la concentración a velocidades más altas, lo que indica la contaminación citoplasmática 10. El análisis de metabolitos por GC-MS de P. vulgaris hoja AWF produce típicamente 40-60 metabolitos identificables y un número aproximadamente igual de compuestos no identificados (Figura 2). Oácidos inorgá-, azúcares simples y aminoácidos representan la mayor parte de los metabolitos identificables, sin embargo, los metabolitos secundarios de las plantas también se han detectado y cuantificado de AWF 11. Varios picos ejemplo de estas diferentes clases de moléculas están etiquetados en la figura 2 Otras técnicas analíticas aguas abajo son aplicables a estas muestras AWF para cuantificar diversas moléculas, por ejemplo:. ICP-MS, RMN, HPLC, espectroscopía de absorción atómica, espectrometría de masas de proteínas. El componente proteico de la apoplasto también está representado en el AWF como se muestra en la Brilliant gel azul manchado SDS-PAGE Coomassie en la Figura 3. Entre otras funciones, las enzimas apoplásticas son responsables de la síntesis de la pared celular y la creación de reactivo extracelular especies de oxígeno. Los estudios proteómicos de AWF de varias especies se han identificado docenas de proteínas individuales y demostrado que el componente de proteína del apoplasto responde a Enviroestrés nmental 13,19. Lo ideal sería que el extracto de AWF debe estar libre de contaminación por proteínas citoplasmáticas como Rubisco; Sin embargo en la práctica esto es difícil de lograr. La presencia de una banda de proteína Rubisco a ~ 53 kDa tras SDS-PAGE proporciona un ensayo cualitativo más para la integridad de las muestras AWF. Por ejemplo, la muestra cargada en el carril 2 en la figura 3 contiene una mayor cantidad de contaminación que Rubisco de carril 1. <table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" class="jove_content" fo:keep-together.within-page="always"><tbody><tr><td></td><td> Phaseolus vulgaris AWF </td></tr><tr><td> Volumen de AWF (ml g -1 hoja FW) </td><td> 0.49 ± 0.09 </td></tr><tr><td> Conc proteína. (Mg ml -1) </td><td> 0.18 ± 0.08 </td></tr><tr><td> Factor de dilución </td><td> 2,3 ± 0,3 </td></tr><tr><td> Actividad G6PDH (U ml -1) </td><td&gt; No detectado </td></tr><tr><td> Glc-6-P (mg ml -1) </td><td> ninguno detectado </td></tr><tr><td> Actividad MDH (U ml -1) </td><td> 2,5 ± 0,9 </td></tr></tbody></table> Tabla 2. Los resultados típicos para extracciones AWF de P. vulgaris cv. Tendergreen hojas. <img alt="Figura 1" fo:content-width="6in" src="/files/ftp_upload/52113/52113fig1highres.jpg" /> Figura 1. Las tareas de extracción apoplasto estándar. Los números se refieren a los pasos en el protocolo. <img alt="Figura 2" src="/files/ftp_upload/52113/52113fig2highres.jpg" /> Figura 2. Un ejemplo GC-MS cromatograma de P. Vulgaris cv. . Tendergreen AWF Los picos de metabolitos ejemplo numeradas son: 1-malonato, 2-fosfato, 3-succinato, 4-desconocido, 5-malato, 6-asparagina, 7-ribitol (st internaandard), 8-citrato, 9-glucosa, 10-inositol, ácido 11-cafeico, 12-sacarosa. <img alt="Figura 3" fo:content-width="3in" src="/files/ftp_upload/52113/52113fig3highres.jpg" width="250" /> Figura 3. Un ejemplo SDS-PAGE gel teñido con Coomassie de P. Vulgaris extractos de hoja de AWF. Este gel proporciona una comparación entre los componentes proteicos de dos extracciones AWF que difieren en la cantidad de contaminación citoplasmática por la abundante enzima Rubisco plastidial. Después de la extracción AWF ambas muestras se sometieron a la precipitación de proteínas acetona en un exceso de 4 veces (v / v) de acetona fría y resolubilized en agua a un décimo del volumen original. Los carriles 1 y 2 contienen 40 g de proteína. La banda correspondiente a la cadena de gran Rubisco (~ 53 kDa) se indica mediante una flecha. M r: proteína de marcadores de peso molecular.

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The Infiltration-centrifugation Technique for Extraction of Apoplastic Fluid from Plant Leaves Using Phaseolus vulgaris as an Example

This protocol details the optimized extraction of apoplast washing fluid from plant leaves, using French bean plants (Phaseolus vulgaris) as a model example.

La técnica de infiltración-centrifugación para extracción de apoplástico fluido procedente de hojas de la planta Uso<em&gt; Phaseolus vulgaris</em&gt; Como ejemplo

The apoplast is a distinct extracellular compartment in plant tissues that lies outside the plasma membrane and includes the cell wall. The apoplastic ...

the-infiltration-centrifugation-technique-for-extraction-apoplastic

Research

JoVE Journal

Biology

The Infiltration-centrifugation Technique for Extraction of Apoplastic Fluid from Plant Leaves Using Phaseolus vulgaris as an Example

36.7K vistas.  University of Oxford. This protocol details the optimized extraction of apoplast washing fluid from plant leaves, using French bean plants (Phaseolus vulgaris) as a model example.

Video: The Infiltration-centrifugation Technique for Extraction of Apoplastic Fluid from Plant Leaves Using Phaseolus vulgaris as an Example

Testing the Physiological Barriers to Viral Transmission in Aphids Using Microinjection

Potato loafroll virus (PLRV), from the family Luteoviridae infects solanaceous plants. It is transmitted by aphids, primarily, the green peach aphid. When an uninfected aphid feeds on an infected plant it contracts the virus through the plant phloem. Once ingested, the virus must pass from the insect gut to the hemolymph (the insect  blood ) and then must pass through the salivary gland, in order to be transmitted back to a new plant. An aphid may take up different viruses when munching on a plant, however only a small fraction will pass through the gut and salivary gland, the two main barriers for transmission to infect more plants. In the lab, we use physalis plants to study PLRV transmission. In this host, symptoms are characterized by stunting and interveinal chlorosis (yellowing of the leaves between the veins with the veins remaining green). The video that we present demonstrates a method for performing aphid microinjection on insects that do not vector PLVR viruses and tests whether the gut is preventing viral transmission.
The video that we present demonstrates a method for performing Aphid microinjection on insects that do not vector PLVR viruses and tests whether the gut or salivary gland is preventing viral transmission.

Aphids are effective transmitters of plant viruses. Aphid microinjection of virus, the procedure we will show you today, is a technique allowing researchers to inject virus directly into the hemocoel of the aphid, bypassing the gut, one of the 2 major barriers for virus transmission in a circulative manner. The same technique is also used to inject dsRNA for RNAi.

Prueba de las barreras fisiológicas a la transmisión del virus en los áfidos con microinyección

Potato loafroll virus (PLRV), from the family Luteoviridae infects solanaceous plants. It is transmitted by aphids, primarily, the green peach aphid. When ...

Investigación

Biología

Testing Nicotine Tolerance in Aphids Using an Artificial Diet Experiment

Plants may upregulate the production of many different seconday metabolites in response to insect feeding. One of these metabolites, nicotine, is well know to have insecticidal properties. One response of tobacco plants to herbivory, or being gnawed upon by insects, is to increase the production of this neurotoxic alkaloid. Here, we will demonstrate how to set up an experiment to address this question of whether a tobacco-adapted strain of the green peach aphid, Myzus persicae, can tolerate higher levels of nicotine than the a strain of this insect that does not infest tobacco in the field.

In this video and assay is demonstrated that tests the tolerance of nicotine to two types of aphids one that infests tobacco plants in the field and one that does not.

Prueba de tolerancia a la nicotina en los áfidos El uso de un experimento de una dieta artificial

Plants may upregulate the production of many different seconday metabolites in response to insect feeding. One of these metabolites, nicotine, is well ...

A Technique for Serial Collection of Cerebrospinal Fluid from the Cisterna Magna in Mouse 

Alzheimer's disease (AD) is a progressive neurodegenerative disease that is pathologically characterized by extracellular deposition of &#946;-amyloid peptide (A&#946;) and intraneuronal accumulation of hyperphosphorylated tau protein. Because cerebrospinal fluid (CSF) is in direct contact with the extracellular space of the brain, it provides a reflection of the biochemical changes in the brain in response to pathological processes. CSF from AD patients shows a decrease in the 42 amino-acid form of A&#946; (A&#946;42), and increases in total tau and hyperphosphorylated tau, though the mechanisms responsible for these changes are still not fully understood. Transgenic (Tg) mouse models of AD provide an excellent opportunity to investigate how and why A&#946; or tau levels in CSF change as the disease progresses. Here, we demonstrate a refined cisterna magna puncture technique for CSF sampling from the mouse. This extremely gentle sampling technique allows serial CSF samples to be obtained from the same mouse at 2-3 month intervals which greatly minimizes the confounding effect of between-mouse variability in A&#946; or tau levels, making it possible to detect subtle alterations over time. In combination with A&#946; and tau ELISA, this technique will be useful for studies designed to investigate the relationship between the levels of CSF A&#946;42 and tau, and their metabolism in the brain in AD mouse models. Studies in Tg mice could provide important validation as to the potential of CSF A&#946; or tau levels to be used as biological markers for monitoring disease progression, and to monitor the effect of therapeutic interventions. As the mice can be sacrificed and the brains can be examined for biochemical or histological changes, the mechanisms underlying the CSF changes can be better assessed. These data are likely to be informative for interpretation of human AD CSF changes.

A Technique for Serial Collection of Cerebrospinal Fluid from the Cisterna Magna in Mouse

Transgenic (Tg) mouse models of AD provide an excellent opportunity to investigate how and why A&#946; or tau levels in CSF change as the disease progresses in human patients. Here, we demonstrate a refined cisterna magna puncture technique for serial CSF sampling from the mouse.

Una técnica para la recolección de serie del líquido cefalorraquídeo de la cisterna magna en el ratón

Alzheimer's disease (AD) is a progressive neurodegenerative disease that is pathologically characterized by extracellular deposition of &#946;-amyloid ...

Characterizing Herbivore Resistance Mechanisms: Spittlebugs on Brachiaria spp. as an Example

Plants can resist herbivore damage through three broad mechanisms: antixenosis, antibiosis and tolerance1. Antixenosis is the degree to which the plant is avoided when the herbivore is able to select other plants2. Antibiosis is the degree to which the plant affects the fitness of the herbivore feeding on it1.Tolerance is the degree to which the plant can withstand or repair damage caused by the herbivore, without compromising the herbivore's growth and reproduction1. The durability of herbivore resistance in an agricultural setting depends to a great extent on the resistance mechanism favored during crop breeding efforts3.
We demonstrate a no-choice experiment designed to estimate the relative contributions of antibiosis and tolerance to spittlebug resistance in Brachiaria spp. Several species of African grasses of the genus Brachiaria are valuable forage and pasture plants in the Neotropics, but they can be severely challenged by several native species of spittlebugs (Hemiptera: Cercopidae)4.To assess their resistance to spittlebugs, plants are vegetatively-propagated by stem cuttings and allowed to grow for approximately one month, allowing the growth of superficial roots on which spittlebugs can feed. At that point, each test plant is individually challenged with six spittlebug eggs near hatching. Infestations are allowed to progress for one month before evaluating plant damage and insect survival. Scoring plant damage provides an estimate of tolerance while scoring insect survival provides an estimate of antibiosis. This protocol has facilitated our plant breeding objective to enhance spittlebug resistance in commercial brachiariagrases5.

Characterizing Herbivore Resistance Mechanisms: Spittlebugs on Brachiaria spp. as an Example

This video explains mechanisms of host plant resistance to herbivory and demonstrates a no-choice test that estimates the relative contributions of antibiosis and tolerance to spittlebug resistance in Brachiaria spp.

Caracterización de los mecanismos de resistencia Herbívoro: salivazo en Brachiaria Spp. como ejemplo

Plants can resist herbivore damage through three broad mechanisms: antixenosis, antibiosis and tolerance1. Antixenosis is the degree to which the plant is ...

Detection of Histone Modifications in Plant Leaves

Chromatin structure is important for the regulation of gene expression in eukaryotes. In this process, chromatin remodeling, DNA methylation, and covalent modifications on the amino-terminal tails of histones H3 and H4 play essential roles1-2. H3 and H4 histone modifications include methylation of lysine and arginine, acetylation of lysine, and phosphorylation of serine residues1-2. These modifications are associated either with gene activation, repression, or a primed state of gene that supports more rapid and robust activation of expression after perception of appropriate signals (microbe-associated molecular patterns, light, hormones, etc.)3-7. 
Here, we present a method for the reliable and sensitive detection of specific chromatin modifications on selected plant genes. The technique is based on the crosslinking of (modified) histones and DNA with formaldehyde8,9, extraction and sonication of chromatin, chromatin immunoprecipitation (ChIP) with modification-specific antibodies9,10, de-crosslinking of histone-DNA complexes, and gene-specific real-time quantitative PCR. The approach has proven useful for detecting specific histone modifications associated with C4 photosynthesis in maize5,11 and systemic immunity in Arabidopsis3.

A reliable and useful approach to detect histone modifications on specific plant genes is described. The approach combines chromatin immunoprecipitation (ChIP) and real-time quantitative PCR. It allows detection of histone modifications on specific genes with a role in diverse physiological processes.

La detección de modificaciones de las histonas en hojas de las plantas

Chromatin structure is important for the regulation of gene expression in eukaryotes. In this process, chromatin remodeling, DNA methylation, and covalent ...

A Simple Method for Imaging Arabidopsis Leaves Using Perfluorodecalin as an Infiltrative Imaging Medium

The problem of acquiring high-resolution images deep into biological samples is widely acknowledged1. In air-filled tissue such as the spongy mesophyll of plant leaves or vertebrate lungs further difficulties arise from multiple transitions in refractive index between cellular components, between cells and airspaces and between the biological tissue and the rest of the optical system. Moreover, refractive index mismatches lead to attenuation of fluorophore excitation and signal emission in fluorescence microscopy. We describe here the application of the perfluorocarbon, perfluorodecalin (PFD), as an infiltrative imaging medium which optically improves laser scanning confocal microscopy (LSCM) sample imaging at depth, without resorting to damaging increases in laser power and has minimal physiological impact2. We describe the protocol for use of PFD with Arabidopsis thaliana leaf tissue, which is optically complex as a result of its structure (Figure 1). PFD has a number of attributes that make it suitable for this use3. The refractive index of PFD (1.313) is comparable with that of water (1.333) and is closer to that of cytosol (approx. 1.4) than air (1.000). In addition, PFD is readily available, non-fluorescent and is non-toxic. The low surface tension of PFD (19 dynes cm-1) is lower than that of water (72 dynes cm-1) and also below the limit (25 - 30 dyne cm-1) for stomatal penetration4, which allows it to flood the spongy mesophyll airspaces without the application of a potentially destructive vacuum or surfactant. Finally and crucially, PFD has a great capacity for dissolving CO2 and O2, which allows gas exchange to be maintained in the flooded tissue, thus minimizing the physiological impact on the sample. These properties have been used in various applications which include partial liquid breathing and lung inflation5,6, surgery7, artificial blood8, oxygenation of growth media9, and studies of ice crystal formation in plants10. Currently, it is common to mount tissue in water or aqueous buffer for live confocal imaging. We consider that the use of PFD as a mounting medium represents an improvement on existing practice and allows the simple preparation of live whole leaf samples for imaging.

A Simple Method for Imaging Arabidopsis Leaves Using Perfluorodecalin as an Infiltrative Imaging Medium

We describe the use of perfluorodecalin as an infiltrative mounting medium. This is a simple method for improving depth of imaging in Arabidopsis thaliana leaf tissue with minimal physiological impact.

Un método simple para imágenes Arabidopsis Uso de hojas perfluorodecalina como un medio de imágenes infiltrativas

The problem of acquiring high-resolution images deep into biological samples is widely acknowledged1. In air-filled tissue such as the spongy mesophyll of ...

Isolation of Viable Multicellular Glands from Tissue of the Carnivorous Plant, Nepenthes

Many plants possess specialized structures that are involved in the production and secretion of specific low molecular weight compounds and proteins. These structures are almost always localized on plant surfaces. Among them are nectaries or glandular trichomes. The secreted compounds are often employed in interactions with the biotic environment, for example as attractants for pollinators or deterrents against herbivores.
Glands that are unique in several aspects can be found in carnivorous plants. In so-called pitcher plants of the genus Nepenthes, bifunctional glands inside the pitfall-trap on the one hand secrete the digestive fluid, including all enzymes necessary for prey digestion, and on the other hand take-up the released nutrients. Thus, these glands represent an ideal, specialized tissue predestinated to study the underlying molecular, biochemical, and physiological mechanisms of protein secretion and nutrient uptake in plants. Moreover, generally the biosynthesis of secondary compounds produced by many plants equipped with glandular structures could be investigated directly in glands.
In order to work on such specialized structures, they need to be isolated efficiently, fast, metabolically active, and without contamination with other tissues. Therefore, a mechanical micropreparation technique was developed and applied for studies on Nepenthes digestion fluid. Here, a protocol is presented that was used to successfully prepare single bifunctional glands from Nepenthes traps, based on a mechanized microsampling platform. The glands could be isolated and directly used further for gene expression analysis by PCR techniques after preparation of RNA.

Isolation of Viable Multicellular Glands from Tissue of the Carnivorous Plant, Nepenthes

Plants glands are specialized structures responsible for the biosynthesis and secretion of many compounds involved in interactions with the biotic environment. To enable studies on their molecular and biochemical features, a mechanical micropreparation technique was established in order to isolate single metabolically active glands, here from the carnivorous plant Nepenthes.

Many plants possess specialized structures that are involved in the production and secretion of specific low molecular weight compounds and proteins. ...

Measuring the Osmotic Water Permeability Coefficient (Pf) of Spherical Cells: Isolated Plant Protoplasts as an Example

Studying AQP regulation mechanisms is crucial for the understanding of water relations at both the cellular and the whole plant levels. Presented here is a simple and very efficient method for the determination of the osmotic water permeability coefficient (Pf) in plant protoplasts, applicable in principle also to other spherical cells such as frog oocytes. The first step of the assay is the isolation of protoplasts from the plant tissue of interest by enzymatic digestion into a chamber with an appropriate isotonic solution. The second step consists of an osmotic challenge assay: protoplasts immobilized on the bottom of the chamber are submitted to a constant perfusion starting with an isotonic solution and followed by a hypotonic solution. The cell swelling is video recorded. In the third step, the images are processed offline to yield volume changes, and the time course of the volume changes is correlated with the time course of the change in osmolarity of the chamber perfusion medium, using a curve fitting procedure written in Matlab (the &#8216;PfFit&#8217;), to yield Pf.

Measuring the Osmotic Water Permeability Coefficient Pf of Spherical Cells: Isolated Plant Protoplasts as an Example

Measuring the osmotic water permeability coefficient (Pf) of cells can help understand the regulatory mechanisms of aquaporins (AQPs). Pf determination in spherical plant cell protoplasts presented here involves protoplasts isolation and numerical analysis of their initial rate of volume change as a result of an osmotic challenge during constant bath perfusion.

Medición de la osmótica de agua Coeficiente de Permeabilidad (P<sub&gt; F</sub&gt;) De células esféricas: protoplastos de plantas aisladas como ejemplo

Studying AQP regulation mechanisms is crucial for the understanding of water relations at both the cellular and the whole plant levels. Presented here is ...

Methods for the Extraction of Endosymbionts from the Whitefly Bemisia tabaci

Bacterial symbionts form an intimate relationship with their hosts and confer advantages to the hosts in most cases. Genomic information is critical to study the functions and evolution of bacterial symbionts in their host. As most symbionts cannot be cultured in vitro, methods to isolate an adequate quantity of bacteria for genome sequencing are very important. In the whitefly Bemisia tabaci, a number of endosymbionts have been identified and are predicted to be of importance in the development and reproduction of the pests through multiple approaches. However, the mechanism underpinning the associations remains largely unknown. The obstacle partially comes from the fact that the endosymbionts in whitefly, mostly restrained in bacteriocytes, are hard to separate from the host cells. Here we report a step-by-step protocol for the identification, extraction and purification of endosymbionts from the whitefly B. tabaci mainly by dissection and filtration. Endosymbiont samples prepared by this method, although still a mixture of different endosymbiont species, are suitable for subsequent genome sequencing and analysis of the possible roles of endosymbionts in B. tabaci. This method may also be used to isolate endosymbionts from other insects.

Methods for the Extraction of Endosymbionts from the Whitefly Bemisia tabaci

Here, we present a protocol to isolate endosymbionts from the whitefly Bemisia tabaci through dissection and filtration. After amplification, the DNA samples are suitable for subsequent sequencing and study of the mutualism between endosymbionts and whitefly.

Métodos para la extracción de endosimbiontes de la mosca blanca<em&gt; Bemisia tabaci</em

Bacterial symbionts form an intimate relationship with their hosts and confer advantages to the hosts in most cases. Genomic information is critical to ...

Experimental Protocol for Using Drosophila As an Invertebrate Model System for Toxicity Testing in the Laboratory

Emergent properties and external factors (population-level and ecosystem-level interactions, in particular) play important roles in mediating ecologically-important endpoints, though they are rarely considered in toxicological studies. D. melanogaster is emerging as a toxicology model for the behavioral, neurological, and genetic impacts of toxicants, to name a few. More importantly, species in the genus Drosophila can be utilized as a model system for an integrative framework approach to incorporate emergent properties and answer ecologically-relevant questions in&#160;toxicology research. The aim of this paper is to provide a protocol for exposing species in the genus Drosophila to pollutants to be used as a model system for a range of phenotypic outputs and ecologically-relevant questions. More specifically, this protocol can be used to 1) link multiple biological levels of organization and understand the impact of toxicants on both individual- and population-level fitness; 2) test the impact of toxicants at different stages of developmental exposure; 3) test multigenerational and evolutionary implications of pollutants; and 4) test multiple contaminants and stressors simultaneously.

Experimental Protocol for Using Drosophila As an Invertebrate Model System for Toxicity Testing in the Laboratory

In this paper, we provide a detailed protocol for exposing species in the genus Drosophila to pollutants with the goal of studying the impact of exposure on a range of phenotypic outputs at different developmental stages and for more than one generation.