Method Article
Cette expérience visualisé est un guide pour utiliser un clone moléculaire fluorescent du VIH pour vivre des expériences d'imagerie confocale.
En fusionnant la protéine fluorescente verte à leurs protéines préférées, les biologistes ont maintenant la possibilité d'étudier les processus cellulaires vivants complexes en utilisant la microscopie à fluorescence vidéo. Pour suivre les mouvements de la protéine virus d'immunodéficience humaine noyau pendant de cellule à cellule de la transmission du virus de l'immunodéficience humaine, nous avons GFP-taggés la protéine Gag dans le contexte d'un clone moléculaire infectieux du VIH, appelé VIH Gag-iGFP. Nous étudions ce clone viral en utilisant la microscopie confocale vidéo. Dans l'expérience suivante visualisées, nous transfecter une lignée cellulaire humaine T avec le VIH Gag-iGFP, et nous utilisons des CD4 non infectés marqués par fluorescence + cellules T pour servir de cellules cibles du virus. En utilisant les différentes étiquettes fluorescentes, nous pouvons facilement suivre la production virale et de transport à travers les structures intracellulaires appelées synapses virologiques. Simple perméables aux gaz chambres d'imagerie nous permettent d'observer des synapses avec la microscopie confocale en direct de minutes à plusieurs jours. Ces approches peuvent être utilisées pour suivre protéines virales comme ils se déplacent dans d'une cellule à l'autre.
Cette méthode a été utilisée dans la recherche présentée dans Hübner et al Sciences 323:. 1743-1747 (2009) .
1. Aperçu
De cellule à cellule propagation du VIH a été initialement décrite en utilisant des cellules Jurkat infectées au VIH que les cellules du donneur et de cellules CD4 + primaires lymphocytes T comme les cellules d'accepteur 1,2,3. Dans ces études, le virus a été détecté dans les cellules fixes utilisant une coloration d'anticorps. Pour suivre le transfert de virus de cellule à cellule dans les cellules vivantes, nous exploitons un recombinant, clone moléculaire infectieux du VIH appelé VIH Gag-iGFP 4. Il porte la protéine fluorescente verte (GFP) inséré en interne en la protéine Gag entre les domaines MA et CA. Ce clone moléculaire infectieux du VIH conserve sans la nécessité d'un virus assistant. Les particules virales à partir de ce clone sont stoechiométriquement chargé avec la protéine fluorescente verte, fournissant un signal fort de fluorescence pour surveiller l'assemblage viral et de transfert entre cellules. Lorsqu'il est utilisé en conjonction avec la cellule de suivi des inertes colorants fluorescents, les cellules réceptrices peuvent être discriminés à partir des cellules du donneur d'entrée, et permettant de visualiser le transfert du VIH d'une cellule T infectée à une cellule T non infectées 5. La formation des synapses virologiques et le transfert de virus d'une cellule à l'autre peut alors être observé dans les cellules vivantes alors qu'elles sont cultivées dans un récipient hermétique, perméable aux gaz de chambre d'imagerie.
(Jour 1)
2. Préparation du VIH Gag-iGFP transfectées cellules Jurkat T
(Jour 2)
3. Récupération à partir de cellules vivantes avec le VIH Jurkats transfectées Gag-iGFP et la coloration des cellules cibles avec des colorants fluorescents
(Jour 3)
4. Surveillance de cellule à cellule de transfert du VIH Gag-iGFP utilisant imagerie de cellules vivantes
Nous utilisons régulièrement le VIH Gag-iGFP cellules Jurkat transfectées 48 heures post-transfection. Cependant, nous avons utilisé avec succès des cellules dès 24 heures, et au plus tard 72 heures après transfection.
5. Considérations pour les plates-formes de microscopie: disque rotatif imagerie confocale
Après le chargement d'une chambre d'imagerie ibidi avec les cellules, nous avons immédiatement monter l'appareil sur un microscope optique inversé (iX71 Olympus, Center Valley, Pennsylvanie). La chambre ibidi devrait être transféré à la loupe seulement par le personnel de laboratoire BL2 + formés portant des vêtements de sécurité appropriés. Bien imagerie des cellules vivantes utilise couramment chambres d'incubation coûteux à maintenir une stabilité à 37 ° C l'environnement, ceci a été réalisé en utilisant un appareil de chauffage simple et économique thermostatique (ASI 400, Nevtek, Williamsville, Virginie) avec une pointe de T-type de thermocouple monté à côté l'échantillon de rétroaction bonne température. Nous avons trouvé à l'aide de CO 2-média indépendant nous permet de maintenir la viabilité des cellules de haute tout en évitant l'utilisation d'une chambre de CO 2. Afin d'atténuer les fluctuations de température plateforme contre dans la chambre et pour bloquer la lumière ambiante de fond, un grand linceul noir est drapée sur l'ensemble microscope / chauffe-setup créer une poche d'air isolant autour du système. Ceci réduit considérablement les variations de température et de la dérive de l'échantillon associée liés à la température, mais nécessite de pré-chauffage pendant 30 minutes avant le montage de l'échantillon.
6. Acquisition de données, de transfert et de traitement d'image
Les images sont prises avec un objectif 60x 1,42 NA immersion dans l'huile (UPlanApo N, Olympus) que l'ouverture numérique élevée (NA), améliore considérablement la résolution. Pour créer des images 3D confocale, la numérisation est effectuée par une unité de disque rotatif confocale (CSU-10, Yokagawa, Japon) qui utilise simultanément> 800 places confocale à augmenter considérablement la vitesse de balayage. Pour compléter sa vitesse, la CSU-10 est couplé à une très sensible électrons multipliant dispositif à couplage de charge (EMCCD, ixon + 897, Technologies Andor, Irlande) pour permettre à la caméra rapide, l'imagerie de faible luminosité qui diminue à la fois photoblanchiment et de phototoxicité. La source de lumière de fluorescence est un multi-longueur d'onde ARKR ions de gaz laser (Innova 70C, Coherent, Santa Clara), où la longueur d'onde désirée (488 nm) et la puissance du laser mesurée juste avant l'objectif du microscope (<1 mW) sont sélectionnés par un modulateur acousto- optiques filtre accordable (AOTF), (Technologies Andor). Afin de réduire davantage photoblanchiment et d'étendre l'imagerie en temps total, le AOTF rapidement (microsecondes) coupe le faisceau laser à chaque fois que l'appareil est inactif (10-20 ms) tandis que l'image nouvellement acquises est délivrée par le CCD (15-30 ms d'exposition) à l'ordinateur. La lumière laser est couplé au système de disque rotatif utilisant une 405/488/568/647 quadribande miroir dichroïque (Semrock, Rochester, NY). Émission de fluorescence est filtré en utilisant un filtre passe-bande 525 / 50 (Semrock) à l'intérieur une roue à filtres (Ludl Electronic Products, Hawthorne, NY) monté bntre la caméra EMCCD et l'unité de disque confocale filer. Tout le matériel et l'acquisition, y compris un z-scène (Mad Labs ville, Madison, WI), sont contrôlés par le Andor iQ v1.8 logiciel. Afin de maximiser la vitesse d'acquisition à environ 01/02 à 01/09 secondes piles d'images 3D, nous recadrer la zone d'enregistrement de caméra de l'EMCCD jusqu'au voisinage immédiat de la cellule-paire. Par ailleurs, au détriment de certaines informations en z, un grand z-étape entre 0.45 à 0,75 um peut être utilisé pour accélérer l'acquisition. Imagerie dans ces conditions, peut durer jusqu'à 6 heures - en utilisant en continu de 20 à 60 segments minute - avec photoblanchiment minime. Au total, chaque segment de données occupe généralement 50 à 20 Go d'espace alors que des dizaines de milliers d'images sont prises. Pour faciliter le transport et l'analyse des fichiers de données volumineux, chaque ensemble d'acquisition doit être décomposé et exportés comme une segments TIFF Gb fichier image en utilisant l'Andor iQ v1.8 logiciel. A partir de là, de nombreux logiciels sont disponibles pour une excellente analyse de l'image, comme Metamorph, Volocity et ImageJ (nous vous recommandons de ses îles Fidji variation).
Lorsque deux marqueurs fluorescents doivent être suivis, nous enregistrer simultanément deux d'entre eux, sans ralentir l'acquisition en utilisant un "mode écran partagé." Les deux marqueurs sont excités par deux lignes laser ARKR à la fois (souvent 488 et 568 nm). Inséré directement devant la caméra EMCCD est une image (OptoSplit II, Cairn, Kent, UK) séparateur qui sépare les deux images différentes. Chaque image est ensuite filtrée de manière indépendante en utilisant des filtres de fluorescence (Semrock) et projetée côte-à-côte sur la caméra à la fois la création du "split-screen" en vigueur. Ce serait alors besoin de culture manuelle et l'alignement des images plus tard dans le traitement d'image.
7. Considérations de traitement d'image et analyse de données
Nous généralement effectuer une analyse d'image avec Volocity (PerkinElmer, Waltham, MA) sur les ordinateurs Macintosh (Apple, Inc.) Filature des images de disque laser, microscopie confocale sont d'abord ajustées dans leur intensité pour corriger photoblanchiment, puis déconvoluées avec Volocity. Mesures de l'intensité et le suivi des points lacrymaux Gag est effectué avec le module de quantification Volocity. Pour les ensembles de l'image où le mouvement par rapport à une synapse pré-formé doit être calculé, un algorithme de suivi automatisé est employé qui suit le bouton synaptique à travers la séquence entière. L'inspection manuelle des régions d'intérêt défini par le logiciel Alignement automatique doit être effectuée pour confirmer que le logiciel a correctement suivi l'objet désiré. Pour les objets, où le contraste avec les objets environnants est trop faible, le suivi manuel ne peut être effectuée sur une base trame par trame. Le progiciel permet Volocity l'exportation de l'emplacement XYZ, le volume et le signal intégré dans les objets désirés. La distance entre la synapse et la vitesse de l'objet suivi sont calculées en normalisant les mouvements vers le centre du bouton synaptique.
8. Les résultats représentatifs
Dans les 10 à 15 minutes de mélange ne doit être en mesure de visualiser le VIH Gag-iGFP cellules Jurkat exprimant adhérant aux cellules CD4 + primaires T. Imagerie ces conjugués, on peut évaluer les mouvements des points lacrymaux Gag dans les cellules infectées ainsi que dans les cellules cibles après synaspe. On peut observer le mouvement des Gag-iGFP lacrymaux dans les cellules cibles, peu après les synapses se forment.
Nous décrivons ici une méthode simple pour visualiser le transfert du VIH de la cellule-cellule. Des recherches récentes de notre laboratoire et les autres »suggère que ce pourrait être le mode prédominant de la propagation du VIH entre les cellules T. La méthode décrite ici emploie une forme recombinante du VIH, appelé VIH Gag-iGFP, qui porte une étiquette codée génétiquement la protéine fluorescente verte dans le noyau protéique, Gag structurelles. En raison de niveaux élevés de GFP produite dans chaque particule virale, ce clone compétents pour la réplication du VIH permet aux chercheurs de suivre particules virales en temps réel. Ce virus devrait être particulièrement utile dans les études concernant le transfert d'assemblage et de cellule à cellule du VIH.
Le transfert du VIH d'ici à cellules de transfert est très efficace. Pendant une heure trois co-culture, nous la routine voir le virus transféré à 20-30% des cellules T primaires évaluée par cytométrie en flux. Efficacités similaires sont qualitativement vu pendant imagerie des cellules vivantes. Infectées par des virus les cellules T commencent synapses formant avec infectés primaires cellules T presque immédiatement après l'initiation de la co-culture. Intéressant, non pas toutes les écoles primaires des cellules T sont capables d'interagir avec des cellules Jurkat infectées par le VIH, malgré les interactions forcées avec pinces optiques (observations non publiées, GM). VIH Gag-iGFP sera sans doute utile pour déterminer des sous-ensembles de cellules T qui sont plus sensibles à la cellule-cellule de transfert, à la fois in vitro et in vivo.
Cet examen a été soutenue par les Instituts nationaux de subventions de la santé, AI074420-02, le Prix Burroughs Wellcome chercheur, bourses de carrière Hirschl à BKC et par le Centre de la NSF pour la biophotonique Sciences et Technologie, l'accord de coopération PHY012099, et un système de santé UCD bourse de recherche à TH UCD CNTC NCRR ULRR024146.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Jurkat T Cells | ATCC | ||
Leukocyte buffy coats from whole blood | New York Blood Center | ||
RPMI | Sigma-Aldrich | ||
Fetal Bovine Serum | Hyclone | ||
Penicillin/Streptomycin | Invitrogen | ||
Nucleofector System and Solution V | Lonza Inc. | ||
EndoFree Maxi Prep Kits | Qiagen | ||
HIV Gag-iGFP plasmid | Chen Laboratory | ||
CD4+ T Cell Isolation Kit | Miltenyi Biotec | ||
Ficoll-Paque | GE Healthcare | ||
Celltracker/CellTrace Dyes | Invitrogen | ||
CO2-Independent Media | Invitrogen | ||
Imaging Chambers | Ibidi | ||
Olympus IX-71 Inverted Microscope | Olympus Corporation | ||
PlanApo N 1.42NA 60X oil objective | Olympus Corporation | ||
Innova 70C ArKr ion gas laser | Coherent Inc. | ||
CSU-10 Nipkow-type spinning disk confocal unit | Yokogawa | ||
Di01-T405/488/568/647-13x15x0.5 dichroic beamsplitter | Semrock | ||
525/50 bandpass filter | Semrock | ||
iXon+ 897 electron-multiplied charged coupled devise camera | Andor | ||
ASI 400 Thermostatic Heater | Nevtek |
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