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Method Article
La combinaison de génération goutte monodispersée avec commande d'inertie de cellules et des particules, on décrit un procédé pour encapsuler un nombre désiré de cellules ou de particules dans une seule goutte à des taux kHz. Nous démontrons l'efficacité deux fois supérieures à celles d'encapsulation non ordonnée pour les gouttes simple et double-particules.
Microfluidic encapsulation methods have been previously utilized to capture cells in picoliter-scale aqueous, monodisperse drops, providing confinement from a bulk fluid environment with applications in high throughput screening, cytometry, and mass spectrometry. We describe a method to not only encapsulate single cells, but to repeatedly capture a set number of cells (here we demonstrate one- and two-cell encapsulation) to study both isolation and the interactions between cells in groups of controlled sizes. By combining drop generation techniques with cell and particle ordering, we demonstrate controlled encapsulation of cell-sized particles for efficient, continuous encapsulation. Using an aqueous particle suspension and immiscible fluorocarbon oil, we generate aqueous drops in oil with a flow focusing nozzle. The aqueous flow rate is sufficiently high to create ordering of particles which reach the nozzle at integer multiple frequencies of the drop generation frequency, encapsulating a controlled number of cells in each drop. For representative results, 9.9 μm polystyrene particles are used as cell surrogates. This study shows a single-particle encapsulation efficiency Pk=1 of 83.7% and a double-particle encapsulation efficiency Pk=2 of 79.5% as compared to their respective Poisson efficiencies of 39.3% and 33.3%, respectively. The effect of consistent cell and particle concentration is demonstrated to be of major importance for efficient encapsulation, and dripping to jetting transitions are also addressed.
Introduction
Continuous media aqueous cell suspensions share a common fluid environment which allows cells to interact in parallel and also homogenizes the effects of specific cells in measurements from the media. High-throughput encapsulation of cells into picoliter-scale drops confines the samples to protect drops from cross-contamination, enable a measure of cellular diversity within samples, prevent dilution of reagents and expressed biomarkers, and amplify signals from bioreactor products. Drops also provide the ability to re-merge drops into larger aqueous samples or with other drops for intercellular signaling studies.1,2 The reduction in dilution implies stronger detection signals for higher accuracy measurements as well as the ability to reduce potentially costly sample and reagent volumes.3 Encapsulation of cells in drops has been utilized to improve detection of protein expression,4 antibodies,5,6 enzymes,7 and metabolic activity8 for high throughput screening, and could be used to improve high throughput cytometry.9 Additional studies present applications in bio-electrospraying of cell containing drops for mass spectrometry10 and targeted surface cell coatings.11 Some applications, however, have been limited by the lack of ability to control the number of cells encapsulated in drops. Here we present a method of ordered encapsulation12 which increases the demonstrated encapsulation efficiencies for one and two cells and may be extrapolated for encapsulation of a larger number of cells.
To achieve monodisperse drop generation, microfluidic "flow focusing" enables the creation of controllable-size drops of one fluid (an aqueous cell mixture) within another (a continuous oil phase) by using a nozzle at which the streams converge.13 For a given nozzle geometry, the drop generation frequency f and drop size can be altered by adjusting oil and aqueous flow rates Qoil and Qaq. As the flow rates increase, the flows may transition from drop generation to unstable jetting of aqueous fluid from the nozzle.14
When the aqueous solution contains suspended particles, particles become encapsulated and isolated from one another at the nozzle. For drop generation using a randomly distributed aqueous cell suspension, the average fraction of drops Dk containing k cells is dictated by Poisson statistics, where Dk = λk exp(-λ)/(k!) and λ is the average number of cells per drop. The fraction of cells which end up in the "correctly" encapsulated drops is calculated using Pk = (k x Dk)/Σ(k' x Dk'). The subtle difference between the two metrics is that Dk relates to the utilization of aqueous fluid and the amount of drop sorting that must be completed following encapsulation, and Pk relates to the utilization of the cell sample. As an example, one could use a dilute cell suspension (low λ) to encapsulate drops where most drops containing cells would contain just one cell. While the efficiency metric Pk would be high, the majority of drops would be empty (low Dk), thus requiring a sorting mechanism to remove empty drops, also reducing throughput.15
Combining drop generation with inertial ordering provides the ability to encapsulate drops with more predictable numbers of cells per drop and higher throughputs than random encapsulation. Inertial focusing was first discovered by Segre and Silberberg16 and refers to the tendency of finite-sized particles to migrate to lateral equilibrium positions in channel flow. Inertial ordering refers to the tendency of the particles and cells to passively organize into equally spaced, staggered, constant velocity trains. Both focusing and ordering require sufficiently high flow rates (high Reynolds number) and particle sizes (high Particle Reynolds number).17,18 Here, the Reynolds number Re =uDh/ν and particle Reynolds number Rep =Re(a/Dh)2, where u is a characteristic flow velocity, Dh [=2wh/(w+h)] is the hydraulic diameter, ν is the kinematic viscosity, a is the particle diameter, w is the channel width, and h is the channel height. Empirically, the length required to achieve fully ordered trains decreases as Re and Rep increase. Note that the high Re and Rep requirements (for this study on the order of 5 and 0.5, respectively) may conflict with the need to keep aqueous flow rates low to avoid jetting at the drop generation nozzle. Additionally, high flow rates lead to higher shear stresses on cells, which are not addressed in this protocol. The previous ordered encapsulation study demonstrated that over 90% of singly encapsulated HL60 cells under similar flow conditions to those in this study maintained cell membrane integrity.12 However, the effect of the magnitude and time scales of shear stresses will need to be carefully considered when extrapolating to different cell types and flow parameters. The overlapping of the cell ordering, drop generation, and cell viability aqueous flow rate constraints provides an ideal operational regime for controlled encapsulation of single and multiple cells.
Because very few studies address inter-particle train spacing,19,20 determining the spacing is most easily done empirically and will depend on channel geometry, flow rate, particle size, and particle concentration. Nonetheless, the equal lateral spacing between trains implies that cells arrive at predictable, consistent time intervals. When drop generation occurs at the same rate at which ordered cells arrive at the nozzle, the cells become encapsulated within the drop in a controlled manner. This technique has been utilized to encapsulate single cells with throughputs on the order of 15 kHz,12 a significant improvement over previous studies reporting encapsulation rates on the order of 60-160 Hz.4,15 In the controlled encapsulation work, over 80% of drops contained one and only one cell, a significant efficiency improvement over Poisson (random) statistics, which predicts less than 40% efficiency on average.12
In previous controlled encapsulation work,12 the average number of particles per drop λ was tuned to provide single-cell encapsulation. We hypothesize that through tuning of flow rates, we can efficiently encapsulate any number of cells per drop when λ is equal or close to the number of desired cells per drop. While single-cell encapsulation is valuable in determining individual cell responses from stimuli, multiple-cell encapsulation provides information relating to the interaction of controlled numbers and types of cells. Here we present a protocol, representative results using polystyrene microspheres, and discussion for controlled encapsulation of multiple cells using a passive inertial ordering channel and drop generation nozzle.
Les protocoles de cette section décrivent les matériaux et l'équipement utilisés spécifiquement pour obtenir des résultats expérimentaux présentés. Notez que d'autres fournisseurs pour les produits chimiques et des équipements peuvent être utilisés.
1. La fabrication de dispositifs et de lithographie douce
Les techniques standard de lithographie douce, 21 dont un certain nombre ont été présentés dans les articles précédents Jove, 22 ont été utilisés pour créer des polydiméthylsiloxanes (PDMS) réseaux de microcanaux liés à des substrats de verre. Mis à part la fabrication de moule maître réplique par SU-8 photolithographie, les processus peuvent être effectuées en dehors d'une salle blanche ou une hotte propre, mais la poussière et les particules doivent encore être réduite au minimum pour obtenir des résultats cohérents.
2. Préparation de l'échantillon
3. Configuration expérimentale
4. Les résultats représentatifs
Résultats sont présentés qui obtenir à la fois à une particule contrôlé et commandé à double particules d'encapsulation (figure 3). En coupantle débit d'huile FC-40 en deux, une particule d'encapsulation devient deux particules d'encapsulation. A l'inverse, nous aurions pu augmenter le débit aqueuse pour fournir des particules à la buse plus rapidement, mais nous aurions également augmenté le risque de jet du flux aqueux. Histogrammes de la figure 3 présentent le nombre fractionnaire de particules par chute pour les deux cas, ainsi que des comparaisons avec les statistiques de Poisson. Les gouttes occasionnelles avec des particules zéro sont principalement dues à des particules «manquants» dans les trains commandés, tandis que les cas où il ya plus de particules encapsulées que résultat souhaité à partir locales fortes concentrations de particules et des particules qui, parfois, migrer vers l'une des deux positions verticales de focalisation. Notez que la flottabilité correspondant tel que décrit dans la section 2 n'a pas été utilisé. Au lieu de cela, la pompe à seringue a été physiquement incliné pour permettre la décantation des particules vers la sortie de seringue, ce qui conduit à une concentration élevée de particules pendant la course.
Un essai expérimental illustrant la nécessité d'une particule appropriée et les concentrations cellulaires est montré dans la figure 4. Sans ordre complet, des groupes localisés de l'ordre des particules et sont encapsulés, mais de nombreuses gouttes sont sans particules. Un histogramme montre l'efficacité d'encapsulation a diminué pour la souhaitée en deux encapsulation de particules.
Figure dispositif d'encapsulation 1.. a) ensemble du dispositif avec des entrées, de sortie et à long canal de commande. La hauteur du dispositif est de 52 um et la largeur du canal de commande est de 27 um. b) Les deux aqueuse et des entrées de pétrole ont des filtres gros débris avec des écarts de l'ordre de la largeur du canal de commande pour la vue agrandie de l'entrée d'huile. c) Le point de vue buse élargie montre des largeurs de canal égales de 27 um pour les canaux aqueux et l'huile, suivie par la contraction de la buse 22 um et l'expansion soudaine à un canal um 61 plus large.Notez que les dimensions de l'appareil présentées ici ont été vérifiés à l'aide d'un profilomètre après la microfabrication et différer un peu des dimensions nominales sur le masque. Une vraie image de la chaîne de commande et la buse sont disponibles en ligne en tant que figure supplémentaire 1 . Le fichier de masque d'AutoCAD a également été inclus en ligne comme un complément à ce manuscrit.
Figure 2. Hystérésis d'un goutte à la transition en utilisant un jet plus large dispositif (80 um de large x 22 um de hauteur). a) Au taux de FC-40 à débit constant (Q = 45 uL d'huile / min), la formation de baisse régulière se produit à 10 kHz en utilisant une solution aqueuse de débit Q aq = 8 ul / min. Comme le débit aqueuse est lentement augmenté à 10 m &u; L / min, d'éjection du courant de fluide aqueux est déclenché. b) Lorsque le débit est retourné à 8 ul / min jet continue. Notez que la formation de baisse régulière peut être rétablie par une brève pause de la pompe à débit aqueuse (une pause de 1 seconde est typique).
Figure 3. Encapsulation unique et double-particules. Une formation Drop) avec une cellule par goutte (Q = huile de 60 pi / min, Q aq = 9 pi / min) avec un taux de production baisse de 6,1 kHz, la taille de goutte moyenne de 24,4 pL, et une efficacité de capture unicellulaires D k = 79,5% et P = k 83,7% (λ = 0,95) pour une taille de l'échantillon de n = 517 gouttes d et n p = 491 particules de formation de gouttes. b) de deux cellules chaque goutte d'eau se fait simplement par la réduction de la FC-40 débit Q d'huile à 30 μL / min. Les grandes (39,8 pL) gouttes sont formées à un taux de 3,8 kHz avec une efficacité de capture à deux cellules D k = 71,5% et P k = 79,5% (λ = 1,80) pour un échantillon de n d = 383 et n gouttes p = 689 particules. cd) Deux histogrammes comparer les efficacités d'encapsulation de particules de chute D k de l'encapsulation simple et double-particules commandé avec la statistique de Poisson (encapsulation aléatoire). Noter que dans les deux cas, l'espacement des particules dans la direction d'écoulement est d'environ 17 à 18 um de totalement commandés en alternance, des particules. Vidéos supplémentaires montrant à la fois l'encapsulation simple et double-particules sont disponibles en ligne. Cliquez ici pour voir 3a films supplémentaires . Cliquez ici pour voir 3b films supplémentaires .
Concentration Figure 4. Affecte grandement l'efficacité d'encapsulation. A) Comme les baisses de concentration, l'ordre ne se produit pas complète, et donc des "trous" dans les trains sortent, laissant quelques gouttes de moins de particules attendus. B) L'histogramme montre la diminution de l'efficacité ( D k = 55,9%, P k = 70,9%) pour l'encapsulation de deux particules due à une valeur inférieure de λ = 1,57 où il ya peu près autant à une particule gouttes il ya deux particules gouttes. Ce chiffre résulte de l'huile de Q = 30 pi / min et Q aq = 9 pi / min, les conditions d'écoulement mêmes que pour la figure 3b. Une vidéo représentant supplémentaire est disponible en ligne. Cliquez ici pour voir 4 Movie supplémentaire .
Malgré des degrés relativement élevés de la commande, tous les gouttes contiennent le bon nombre de particules ou de cellules. Efficacité d'encapsulation peut être calculé comme le nombre de cellules ou de particules qui deviennent encapsulées dans gouttes avec l'occupation souhaitée divisée par le nombre total. Ces données brutes peuvent être obtenus soit à partir d'un algorithme automatisé à grande vitesse vidéo ou de l'imagerie d'un échantillon d'émulsion recueillies. Cela pe...
JE est un inventeur sur un brevet en instance sur la base de la technologie utilisée dans ce manuscrit.
Nous remercions RainDance Technologies pour l'échantillon de PFPE-PEG tensioactif utilisé dans cette étude, et nous remercions le BioMEMS Resource Center (Mehmet Toner, metteur en scène) pour le moule plaquette de silicium utilisé pour créer des répliques de canaux PDMS.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Nom du réactif | Entreprise | Numéro de catalogue | Commentaires |
AutoCAD | AutoDesk | ||
Masque de transparence | Fineline Imaging Inc | ||
SU-8 Photoresist | MicroChem | 2050 | |
Profilomètre Dektak | Veeco | ||
Boîte de Pétri | BD Falcon | 351058 | |
Kit PDMS élastomère de silicone | Dow Corning Corp | Sylgard 184, numéro de référence (240) 4019862 | |
Dessiccateur à vide | Jencons | 250-030 | |
Pompe à vide | Alcatel Vacuum Technology | 2010 C2 | |
Le régulateur de vide | Cole-Parmer | EW-00910-10 | |
Four | Thermo Scientific | Lindberg Blue M, OV800F | |
Biopsie, 0,75 mm | Harris | Uni-Core 15072 | |
Laboratoire Traitement Corona | Electro-Technic Products Inc | BD-20AC, SKU 12051A | |
Lames de verre | Sceau d'or | 3010 | |
Aquapel | PPG Industries | Stratégie Alternative | |
Microsphères de polystyrène, 9,9 um | Thermo | G1000 | |
OptiPrep | Sigma-Aldrich | D1556 | Non démontré |
Seringues Luer-Lok | BD | 1 ml: 309628 3 ml: 309585 | |
FC-40 huile fluorocarbonée | 3M Inc | Sigma-Aldrich, F9755 | |
PFPE-PEG fluoré | RainDance Technologies | ||
Huile minérale légère | Process Chemicals PTI | 08042-47-5 | Stratégie Alternative |
Surfactant huile minérale | Evonik Goldschmidt Corporation | ABIL EM 90 | Stratégie Alternative |
Tygon Tuyau PVC | SmallParts | TGY-010 | |
Calibre 30 Luer-Lok seringue sans aiguille, 1/2 " | SmallParts | NE-301PL-C | |
Microscope inversé | Carl Zeiss Imaging | Axio Observer.Z1 | |
Caméra haute vitesse | Vision de la recherche | Phantom V310 | |
Pompes seringue (2) | Chemyx Inc | Nexus 3000 | |
Huile de silicone | Dow Corning | 200 fluide, 10 cSt | En option pour le stockage d'émulsion |
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