1. Isolement des tubules proximaux de la culture primaire
- Anesthésier le lapin, les deux reins d'accise et les placer dans une boîte de Pétri remplie de tampon de préparation stérile (DMEM/F12) dans une hotte à flux laminaire.
- Perfuser chaque rein avec 50 ml de tampon de préparation suivis par 50 ml de solution stérile saline tamponnée au phosphate, pH 7,4 (PBS) et une solution d'oxyde de fer PBS (45 ml + 5 ml). De-capsulate reins et les transférer dans la mémoire tampon de préparation contenant la déféroxamine.
- Récolter le cortex de chaque rein.
- Homogénéiser le tissu en utilisant un homogénéisateur Dounce de 15 ml. Verser l'homogénat plus de 2 mailles des tamis stériles (85 um sur le fond et 235 um sur le dessus) placé au-dessus d'un bécher de 1 L stérile. Rincez le tamis par la déféroxamine contenant du tampon.
- Recueillir tous les tissus à gauche sur le tamis 85 um dans un tube à centrifuger conique stérile rempli de 35-40 ml de tampon contenant la déféroxamine. Mélanger délicatement la suspension cellulaire.
- Placez une forte magnet extérieur du tube pour enlever le fer rempli de glomérules et laissez la suspension en place. Aspirer le fer de l'aimant à l'aide d'une pipette Pasteur. Répétez ce processus.
- Préparer 1 ml de milieu de digestion contenant 2,400-2,500 unités de collagénase I et 0,6 mg d'inhibiteur de trypsine de soja dissoutes dans le tampon contenant de la déféroxamine. Filtrez-stériliser le milieu de digestion.
- Réglez le volume de la suspension cellulaire à 40 ml, ajouter 1 ml de milieu de digestion. Incuber à température ambiante pendant 17 min doucement le mélange de la suspension, centrifugeuse à 50 xg pendant 2 min à 4 ° C, aspirer le moyen et ajouter la déféroxamine tampon frais.
- Répétez la procédure de retrait de fer avec l'aimant à plusieurs reprises, tourner la suspension à nouveau, aspirer moyen et ajouter 46 ml de milieu contenant pas de glucose.
- Mélanger doucement et mesurez 500 ul de la suspension dans deux tubes Eppendorf préalablement pesés. Spin cellules vers le bas à 10.000 xg pendant 1 min, aspirer les médias, et peser le culot. Calculez le rendement total de la masse humide et de protéines.
- Plaque les cellules stériles boîtes de 35 mm de la culture à la densité de 1 mg de protéine / plat en utilisant du glucose sans DMEM/F12. Cellules en culture dans 2 ml de milieu sans glucose DMEM/F12 toujours sur un agitateur orbital dans l'incubateur à 37 ° C (95% d'air / 5% de CO 2). 1,2
2. Rénale proximale Culture cellulaire Tubule
- Le milieu de culture est un mélange 50:50 de DMEM et Ham F-12 de mélange nutritif sans rouge de phénol, le pyruvate et le glucose, supplémenté avec 15 mM NaHCO 3, 15 mM d'HEPES, et 6 mM de lactate (pH 7,4, 295 mosmol / KGH 2 O). Les supports sont complétés par l'acide L-ascorbique-2-phosphate (50 pM), l'insuline bovine (10 nM), transferrine humaine (5 mg / ml), l'hydrocortisone (50 nm) et le sélénium (5 ng / ml) immédiatement avant changement quotidien des médias.
- Aspirer les vieux médias de la vaisselle en utilisant une technique stérile. Ajouter 2 ml de milieu frais chaud, à chaque plat en utilisant une technique stérile. Réinternes des cellules tubulaires proximales (RPTC) atteignent la confluence dans environ 5-6 jours après l'étalement. 1,2
3. L'infection adénovirale de RPTC
- Infection adénovirale est effectuée dans les cultures confluentes, de repos après le changement RPTC quotidienne de la presse. Dominant négatif PKC ε-mutant (dnPKC-ε) a été construit en remplaçant: 1) la lysine par l'arginine en position 436 du site de liaison à l'ATP et 2) alanine avec du glutamate à la position 159 du domaine pseudo-substrat. Ces mutations détruit l'activité kinase de la construction, sans modification de la conformation active de la PKC-ε 3. PKC-ε a été faite constitutivement active de suppression des résidus 154-163 de son domaine pseudosubstrat inhibitrice 4.
- Ajouter la solution de stock de l'adénovirus porteur caPKC-ε ADNc ou dnPKC-ε ADNc à chaque plat pour obtenir multiplicité désirée d'infection (MOI) résultant en une augmentation significative de la PKC-et epsilsur, les taux de protéine. Incuber RPTC par l'adénovirus pendant 24 heures. Changer les médias et les cellules de culture pour un autre h 24. Niveaux beaucoup plus élevés de phosphorylées et totale PKC-ε protéines peut être obtenue en utilisant 25-50 MOI de vecteur adénoviral codant caPKC-ε. De meilleurs résultats en MOI hausses encore plus importantes dans les niveaux de PKC-ε actif, mais il n'est pas recommandé chez RPTC en raison de la mort cellulaire rapide et la perte. Niveaux beaucoup plus élevés de la PKC-ε inactive la protéine peut être obtenue en utilisant 50-100 MOI dans RPTC sans produire d'effets indésirables 5.
- À 48 h après l'infection, les médias aspirés, se laver les monocouches avec du PBS, et recueillir des cellules pour l'analyse par immunoblot pour déterminer la teneur en protéines de la PKC ε-5.
4. Mesure de la respiration RPTC
- Préparer un tampon d'essai pour la mesure de l'état 3 de respiration (120 mM de KCl, 5 mM KH 2 PO 4, 10 mM d'HEPES, 1 mM MgSO 4, et 2 mM EGTA, pH 7,4). Pour mesurer complexe I-3 état couplé respiration, de compléter le tampon de dosage avec 5 mM de glutamate, malate 5 mM et 0,1 mg / ml digitonine. II complexe de couplage de 3 état respiration, de compléter le tampon de dosage avec 10 mM de succinate, 0,1 uM roténone, et 0,1 mg / ml digitonine. Pour couplage complexe IV-3 état respiration, de compléter le tampon de dosage avec 1 ascorbate mM, 1 mM de N, N, N ', N'-tétraméthyl-p-phénylènediamine (TMPD), et 0,1 mg / ml digitonine. Placez les solutions dans un bain d'eau à 37 ° C.
- Aspirer les médias à partir d'une boîte de culture contenant monocouche RPTC, ajouter 2 ml d'un tampon respiration à l'état chaud 3, grattez délicatement les cellules de l'antenne à l'aide d'une spatule en caoutchouc, et transférer la suspension dans la chambre de consommation d'oxygène équipé d'une électrode de type Clark.
- Etat de la mesure 2 respiration (en l'absence d'ADP). Initier état respiration 3 par addition d'ADP à une concentration finale de 0,4 mM. Initier l'état 4 respiration en ajoutant oligomycine à un concentr finaletion de 0,5 pg / ml. Respiration découplée est mesurée par addition de 0,5 FCCP uM pour les cellules respirent à l'état 3. 6,7
- Recueillir la suspension de cellules à partir de la chambre, précipiter la protéine avec de l'acide perchlorique, et le précipité centrifuger. Déterminer la concentration de protéines dans le culot cellulaire.
5. Analyse du potentiel de membrane mitochondriale (ΔΨm)
- Préparer 0,5 mM JC-1 solution dans le milieu de culture stérile.
- Ajouter lentement 20 ul de JC-1 solution pour chaque plat pour obtenir une concentration finale de 5 uM. Agiter le plat pour mélanger le colorant à fond. Retourner les boîtes dans l'étuve pendant 30 min.
- Mettez les plats sur la glace, les médias aspirés, et laver deux fois avec des monocouches PBS glacé. Aspirer le PBS, ajouter 1 ml de PBS frais, gratter les cellules du plat et de les transférer dans un tube Eppendorf. Break up monocouches dans des cellules individuelles en les pipetage de haut en bas.
- Faites tourner la suspension vers le bas à 1000 xg pendant 2 min, aspfurieux le surnageant, ajouter 1 ml de PBS au culot et remettre en suspension il pour obtenir une suspension cellulaire unique. Répétez cette étape si nécessaire.
- Spin cellules vers le bas à 1000 xg pendant 2 min, aspirer le surnageant, ajouter 0,5 ml de PBS, et remettre en suspension le culot. Analyser la fluorescence par cytométrie en flux en utilisant une excitation par un 488-nm laser argon-ion. Lire l'émission en deux canaux séparés, FL1 à 525 nm et à 590 nm FL2. Potentiel de membrane mitochondriale est exprimée en FL2/FL1 rapport de fluorescence 6.
6. Isolement des mitochondries
- Préparation des tampons d'isolation: tampon A (10 mM HEPES, 225 mM de mannitol, 75 mM de saccharose, 0,1 mM EGTA, pH 7,4), tampon B (tampon A contenant des inhibiteurs de protéase, 1 mM de Na 3 VO 4, 1 mM de NaF), et le tampon C (10 mM HEPES, 395 mM de saccharose, 0,1 mM EGTA, pH 7,4). Effectuez toutes les étapes de la glace.
- Laver deux fois avec des monocouches RPTC glacée tampon PBS. Grattez monocouches dans des tubes Eppendorf et les faire tournerà 500 xg pendant 5 min. Laver le culot dans 1 ml de tampon A.
- Remettre en suspension le culot dans 1 ml de tampon B, et transférer la suspension dans un homogénéisateur Dounce 2 ml.
- Homogénéiser les cellules dans l'homogénéisateur Dounce jusqu'à la plupart des cellules dans l'homogénat sont cassés lors de l'inspection au microscope.
- Centrifuger l'homogénat à 1000 xg pendant 5 min à 4 ° C. Recueillir le surnageant et le tourner vers le bas à 15.000 xg pendant 10 min à 4 ° C.
- Jeter le surnageant et remettre en suspension le culot contenant les mitochondries brut dans 1 ml de tampon C. Faites tourner les surnageants bas à 15.000 xg pendant 10 min à 4 ° C. Répéter le nettoyage des deux granulés fois plus de 5.
- Pour mesurer les activités des complexes respiratoires, rétablir la suspension mitochondriale granulés de 50-100 ul du tampon d'analyse et congeler dans l'azote liquide. Faire dégeler les échantillons lentement sur la glace.
7. Mesure de l'activité de la NADH-ubiquinone oxydoréductase (complexe I)
- Préparer le tampon de dosage: 10 mM KH 2 PO 4, 5 mM de MgCl2, pH 7,2. Ajouter un acide gras libre BSA et NADH pour obtenir des concentrations finales de 0,25% et 0,25 mm, respectivement. Ajouter 2 ul de antimycine Une solution (1 mg / ml) à une concentration finale de 2 mg / ml.
- Analyser les échantillons dans une plaque à 48 puits transparent. Inclure un échantillon témoin qui a tous les ajouts, mais pas de mitochondries. Pour chaque puits, ajouter 500 ul de tampon de dosage avec des ajouts et des mitochondries, et incuber la plaque à 30 ° C tout en mélangeant pendant 5 min.
- Démarrer la réaction en ajoutant 10 pl de 3,25 mM ubiquinone dans chaque puits. Enregistrer l'absorbance (340 nm) pendant 3 min dans des intervalles de 20 secondes. Ajouter 5 ul de solution de roténone (1 mg / ml) dans chaque puits et noter l'absorbance de 2 min. Calculer complexe I activité comme la roténone sensible oxydation du NADH 7.
8. Mesure de l'activité de la succinate-ubiquinone oxydoréductase (complexe II)
- Préparer le tampon de dosage contenant 0,25% d'acide gras libre-BSA, 20 mM de succinate de potassium, 0,25 mM 2,6-dichloroindophénol, 2 pg / ml antimycine A, et 10 pg / ml roténone.
- Analyser les échantillons en double dans une plaque à 48 puits transparente, y compris un échantillon témoin qui a tous les ajouts, mais pas de mitochondries. Pour chaque puits, ajouter 500 ul de tampon de dosage avec des ajouts et des mitochondries, et incuber la plaque à 30 ° C tout en mélangeant pendant 2 min.
- Démarrer la réaction en ajoutant 10 pl de 3,25 mM ubiquinone dans chaque puits. Enregistrer l'absorbance (595 nm) pendant 3 min dans des intervalles de 20 secondes. Calculer Complexe activité II par suite de la réduction du 2,6-dichloroindophénol. 7
9. Mesure de l'activité de l'ubiquinol-cytochrome c oxydoréductase (complexe III)
- Préparer le tampon d'essai contenant 0,1% d'acide gras libre-BSA, 80 mM de succinate de potassium, 10 mg / ml roténone, et 0,24 mM de potassium cyanure.
- Analyser les échantillonsen double dans une plaque à 48 puits transparente, y compris un échantillon témoin qui a tous les ajouts, mais pas de mitochondries. Pour chaque puits, ajouter ul 291 du tampon de dosage avec des ajouts et des mitochondries, et incuber la plaque à 30 ° C tout en mélangeant pendant 5 min.
- Démarrer la réaction en ajoutant 3 pi 6 mM de cytochrome c oxydé dans chaque puits. Enregistrer l'absorbance (550 nm) pendant 3 min dans des intervalles de 20 secondes. Ajouter 5 ul de antimycine Une solution (1 mg / ml) dans chaque puits et noter l'absorbance de 2 min. Calculer l'activité complexe III que la réduction antimycine A-sensible cytochrome c 7.
10. Mesure de l'activité de la cytochrome oxydase (complexe IV)
- Préparer cytochrome c réduit par l'ajout d'ascorbate de sodium à 9 mM solution de cytochrome c et la dialyse de la solution pendant une nuit à 4 ° C dans 1 litre de tampon phosphate (10 mM KH 2 PO 4, pH 7,2) contenant 5 mM de MgCl2. Préparer le tampon de dosage contenant0,1% d'acides gras libres BSA et antimycine A (2 pg / ml).
- Analyser les échantillons dans une plaque à 48 puits transparente, y compris un échantillon témoin qui a tous les ajouts, mais pas de mitochondries. Pour chaque puits, ajouter 233 ul de tampon de dosage avec des ajouts et des mitochondries, et incuber la plaque à 30 ° C tout en mélangeant pendant 5 min.
- Démarrer la réaction par addition de réduction du cytochrome c (90 pM concentration finale). Enregistrer l'absorbance (550 nm) pendant 3 min dans des intervalles de 20 secondes. Ajouter 2 ul de solution de KCN (8 pg / ml) dans chaque puits et noter l'absorbance pour encore 2 min. Calculer l'activité complexe IV que l'oxydation KCN sensible cytochrome c 7.
11. Mesure de l'activité de F 0 F 1-ATPase (ATP synthase)
- Préparer F 0 F 1-ATPase tampon de dosage (10 mM Tris-HCl, 200 mM de KCl, MgCl2 2 mM, pH 8,2). Remettre en suspension le culot dans mitochondriale le tampon de dosage, congeler les échantillons mitochondriaux en liquidationd 'azote et décongeler les échantillons lentement sur la glace.
- Analyser les échantillons en triple dans une plaque à 48 puits transparent. Pour chaque groupe de traitement, 2 puits sera exécuté pour mesurer l'activité ATPase totale (275 pi du tampon de dosage, 5 ul de suspension mitochondriale, et 5 pi d'éthanol à 95%) et 1 puits pour mesurer oligomycine insensible à la casse activité ATPase (275 pl d' le tampon de dosage, 5 ul de suspension mitochondriale, et 5 pi de 1 mg / ml solution oligomycine dans de l'éthanol à 95%).
- Incuber les échantillons à 31 ° C pendant 10 min avec une agitation constante. Ajouter 16 ul de 100 mM d'ATP solution (pH 7,0) et incuber à 31 ° C pendant 5 min avec une agitation constante.
- Transférer 200 ul du mélange d'incubation dans un tube contenant 50 pi de 3 M TCA. Incuber les échantillons sur la glace pendant 10 minutes et de les tourner vers le bas à 10.000 xg pendant 5 min à 4 ° C. Utilisez les surnageants et les boulettes de déterminer le phosphate et la teneur en protéines, respectivement.
- Déterminer la teneur en phosphate dans les surnageants en utilisant ledosage du phosphate inorganique. Préparer 100 ml de réactif par addition Sumner 0,88 g FeSO 4 à 10 ml de 3,75 MH 2 SO 4 et ajuster à 90 ml avec H 2 O. Ajouter 10 ml d'une solution de molybdate d'ammonium (0,66 g/10 ml H 2 O) à la solution de FeSO 4 dans H 2 SO 4. Protéger de la lumière.
- Charge plaque de 96 puits avec 50 ul de chaque norme phosphate (0 - 1,000 uM KH 2 PO 4) et 50 pi de chaque surnageant en double. Ajouter 250 ul de réactif Sumner dans chaque puits et incuber la plaque à 30 ° C pendant 15 min avec une agitation constante.
- Enregistrer l'absorbance à 595 nm à température ambiante. F 0 F 1-ATPase est déterminée en mesurant l'oligomycine sensible à la libération de l'ATP à partir de P i comme nous l'avons décrit précédemment. Calculer total et 7,8 oligomycine insensibles F 0 F 1-ATPase activités. Pour calculer le oligomycine-ATPase sensible activité, il faut soustraire oligomycine insensible à l'activité de l'ATPase totale 8,9.
12. Mesure de l'ATP intracellulaire contenu
- Placer les boîtes de culture contenant des monocouches RPTC sur la glace, moyen, aspiration et laver les monocouches deux fois avec du tampon PBS glacé. Ajouter 1 ml de PBS à chaque monocouche, gratter chaque monocouche dans du PBS, et recueillir la suspension cellulaire dans un tube Eppendorf. Faites tourner les tubes Eppendorf dans la microcentrifugeuse pendant 5 sec.
- Déterminer la teneur en ATP dans chaque échantillon RPTC par la méthode luciférase en utilisant la bioluminescence ATP Assay Kit HS II (Roche) et le protocole du fabricant. Déterminer la concentration en protéine de chaque échantillon et calculer la concentration d'ATP par mg de protéine 8.
13. Visualisation de la morphologie mitochondriale
- Changer les milieux de culture. Ajouter 2 ul d'une solution de 100 uM de Mitotracker Rouge 580 à chaque plat (concentration finale. 100 nM) et retourner les plats à la incubator pour 30 min.
- Examiner les monocouches direct au microscope à fluorescence en utilisant un objectif à immersion d'eau 5.
14. Analyse de la viabilité cellulaire
- À 24 h avant de commencer le dosage de préparer une solution à 50 mM de cisplatine pour traiter les cellules qui serviront de témoin positif pour l'apoptose (annexine V-cellules positives). En outre, préparer 500 mM solution de tert-butyle pour traiter les cellules qui serviront de témoins positifs pour les oncose (iodure de propidium cellules positives).
- Traiter 2 plats avec 2 pi de 50 mM cisplatine et 2 plats avec 2 pi de 500 mM de tert-butyle. Consacrer 1 plat pour un contrôle sans tache.
- À 24 h après le traitement avec le cisplatine et le TBHP, préparer le tampon de liaison (HEPES 10 mM, 140 mM NaCl, 5 mM de KCl, 1 mM de MgCl2, 1,8 mM CaCl 2) et de l'iodure de propidium (PI) solution (50 pg / ml) dans le tampon de liaison.
- Laver une fois avec des monocouches le buff contraignanter. Ajouter 1 ml de tampon glacé et 50 pi d'une solution IP à chaque plat sauf pour les sans-tache et l'annexine V-cellules positives. Couvrir et incuber plats sur la glace pendant 15 min avec agitation orbitale en douceur.
- Laver monocouches avec le tampon de liaison (10 min), ajouter 1 ml de tampon de liaison et 2 pi de l'annexine V-FITC solution à chaque plat sauf pour les cellules sans tache et PI-positif. Couvrir plats et incuber à température ambiante pendant 10 min avec agitation orbitale en douceur.
- Aspirer le tampon et laver les monocouches avec 1 ml de tampon glacé contraignant sur la glace pendant 10 min avec agitation orbitale en douceur. Répéter l'étape de lavage.
- Aspirer le tampon de liaison et ajouter 500 ul de tampon de liaison à chaque plat. Grattez délicatement les cellules en utilisant une spatule en caoutchouc et de transférer les cellules de couler des tubes de cytométrie. Disperser les cellules dans une suspension de cellules individuelles par pipetage des échantillons de haut en bas. Briser les amas de cellules.
- Quantifier PI et l'annexine V-FITC fluorescence immédiatement par flow cytométrie en utilisant une excitation à 488 nm et une émission à 590 et 530 nm pour PI et FITC, respectivement. Comptez 10.000 manifestations pour chaque échantillon.
- Mettre la fluorescence FITC sur l'axe X et la fluorescence PI sur l'axe des ordonnées des figures de cytométrie de flux de tracé de points. Cellules positives pour l'annexine V et négatif pour les PI sont considérés comme apoptotique. Cellules positives pour le PI et négatif pour l'annexine V sont considérés oncotique. 10,11