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  • Déclarations de divulgation
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  • matériels
  • Références
  • Réimpressions et Autorisations

Résumé

We describe the isolation of cardiac extracellular matrix from C57Bl/6J control mice, tight-skin mice, and tight-skin mice treated with the IRF5 inhibitory peptide. We also describe the vasodilation studies on the isolated vessels from C57Bl/6J, tight-skin mice and tight-skin mice treated with the IRF5 inhibitory peptide.

Résumé

The interferon regulatory factor 5 (IRF5) is crucial for cells to determine if they respond in a pro-inflammatory or anti-inflammatory fashion. IRF5's ability to switch cells from one pathway to another is highly attractive as a therapeutic target. We designed a decoy peptide IRF5D with a molecular modeling software for designing small molecules and peptides.

IRF5D inhibited IRF5, reduced alterations in extracellular matrix, and improved endothelial vasodilation in the tight-skin mouse (Tsk/+). The Kd of IRF5D for recombinant IRF5 is 3.72 ± 0.74 x 10-6 M as determined by binding experiments using biolayer interferometry experiments. Endothelial cells (EC) proliferation and apoptosis were unchanged using increasing concentrations of IRF5D (0 to 100 µg/mL, 24 h). Tsk/+ mice were treated with IRF5D (1 mg/kg/d subcutaneously, 21 d). IRF5 and ICAM expressions were decreased after IRF5D treatment. Endothelial function was improved as assessed by vasodilation of facialis arteries from Tsk/+ mice treated with IRF5D compared to Tsk/+ mice without IRF5D treatment. As a transcription factor, IRF5 traffics from the cytosol to the nucleus. Translocation was assessed by immunohistochemistry on cardiac myocytes cultured on the different cardiac extracellular matrices. IRF5D treatment of the Tsk/+ mouse resulted in a reduced number of IRF5 positive nuclei in comparison to the animals without IRF5D treatment (50 µg/mL, 24 h). These findings demonstrate the important role that IRF5 plays in inflammation and fibrosis in Tsk/+ mice.

Introduction

La régulation de la croissance cellulaire et les réponses immunitaires de mort cellulaire est essentielle pour le rôle de la famille des facteurs de transcription de facteurs de régulation de l'interféron. IRF5 est soulignée comme étant cruciale pour la régulation des réponses immunitaires entre le type 1, une réponse inflammatoire et la promotion de type 2, une réparation tissulaire réponse immunitaire ciblage. IRF5 est la clé 1 dans le cancer, l' auto - immunité et 2, 3, 4, 5.

La souris étanche peau (Tss / +) est un modèle pour la fibrose tissulaire et la sclérodermie due à une mutation de duplication dans le gène de la fibrilline-1. Cette mutation se traduit par une peau étanche et une augmentation du tissu conjonctif. Ces souris développent une inflammation du myocarde, la fibrose et finalement une insuffisance cardiaque 5, 6, 7,> 8, 9. La sclérodermie est une maladie auto - immune affectant fibrotique environ 150.000 patients aux Etats-Unis 6. Les caractéristiques de cette maladie sont une fibrose d'organes internes , y compris le cœur 7, 8, 9, 10, 11.

La nature de l'étude a demandé la conception d'un peptide inhibiteur. L'approche du logiciel a été choisi sur une approche traditionnelle en utilisant un phage display. L'approche du logiciel est plus facile et moins consommatrice de temps. La banque de données RCSB est utilisé pour identifier les sites de liaison appropriés 12. Pour étudier l'interaction du peptide nouvellement conçu avec la protéine recombinante et de se concentrer sur les paramètres de liaison, une technique appelée interférométrie biocouche a été utilisée. Biocouche interférométrie est un techniq biocapteur baséue qui détermine l'affinité de liaison, d'association et de dissociation en utilisant un biocapteur et un échantillon de liaison. Le biocapteur peut être fluorescence, luminescence, radiométrique et colorimétriquement marqué. La mesure est basée sur l' addition ou l' épuisement de masse ressemblant à l' association et la dissociation 13, 14. Le but de cette étude était de comprendre le rôle de IRF5 dans l'inflammation du myocarde et de la fibrose. L'objectif était de mieux comprendre le rôle de IRF5 dans le développement de la fibrose tissulaire et la sclérodermie.

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Protocole

Cette étude a été réalisée en stricte conformité avec les recommandations du Guide pour le soin et l'utilisation des animaux de laboratoire des National Institutes of Health. Le protocole a été approuvé par le Institutional Animal Care et utilisation Comité (Protocole: AUA # 1517). Toute recherche impliquant des souris a été réalisée en conformité avec la politique du PHS.

1. Conception de Decoy Peptide

  1. Trouver la structure 3D de la IRF5 et baser la conception sur elle. Concevoir un 17 mer, appelé IRF5D (ELDWDADDIRLQIDNPD), où aspartate (D) est remplacé par la serine (S) pour imiter la phosphorylation dans IRF5 à 421-438 (ELSWSADSIRLQISNPD). Analyse des groupes 3D sulfhydryles et les connaissances du mécanisme de IRF5 d'activation, à savoir, la serine phosphorylation, a suggéré qu'une stratégie de ciblage IRF5 était de générer un peptide leurre. Voir Figure 1. Pour identifier la meilleure région dans la structure 3D, utiliser un logiciel de modélisation moléculaire pour la conception de petits molecules et des peptides 15.
    REMARQUE: L'étape critique dans ce procédé est la disponibilité de la structure 3D de la protéine cible et de ses sites de liaison possibles. La structure 3D de IRF5 représente avec précision comment se dimérise IRF5 après phosphorylation. La substitution de l'aspartate pour la serine ou la thréonine est sous-traitée. Le peptide est synthétisé séparément sans être lié à IRF5.
  2. Répliquer la phospho-domaine simplement en substituant D pour S. Sur la base de la séquence d' origine (ELSWSADSIRLQISNPD, faire un nouveau IRF5S peptide avec la séquence d'acides aminés de Ac-ELDWDADDIRLQIDNPD-NH 2 (IRF5D).

2. interférométrie couche biologique (BLI)

NOTE: La purification pour IRF5 recombinant a été confiée. 16

  1. étiquette de biotine IRF5 dans un rapport molaire de 1: 1 de biotine au ligand avec un réactif de biotinylation incorporant un agent de liaison à longue chaîne. La longue liaison de la chaîne assurera une liga plus active et homogènesurface nd.
    1. Ajouter 1 mL de 2 mg / mL à IRF5 13 ul de 20 mM de réactif de biotine ou d'augmenter le volume si nécessaire. Incuber sur la glace pendant 2 h. Après marquage, utilisez une colonne de dessalage de spin pour éliminer le mélange de réaction de la protéine marquée.
  2. Incuber le ligand marqué à la biotine avec les biocapteurs pendant 15 min. Évitez de trop-étiquetage et d'ajuster le rapport 1: 1 molaire. Après marquage, utilisez une colonne de dessalage de spin pour éliminer le mélange de réaction de la protéine marquée.
  3. Incuber la biotine marquée biocapteurs IRF5 pendant 10 minutes à différentes concentrations de peptide IRF5 leurre. Les taux d'association et de dissociation ont été déterminées de la manière décrite 10, 17, 18.

3. Apoptose et prolifération Assays

  1. Essai de prolifération via bioréduction du tétrazolium
    1. Administrer IRF5D dilué dans du PBS (1 mg /kg / j, injecter un volume de 20 ul dans une souris de 20 g) par voie sous- cutanée avec une aiguille de calibre 27 par une technique de Scruffing standard ou par du PBS seul Tss / + et C57BL / 6J pendant 21 jours.
    2. Anesthésier les souris avec de l'isoflurane (5%) et d'effectuer une dislocation cervicale. Exciser le cœur en coupant ouvert la poitrine le long du sternum. Soulevez le coeur avec une pince et retirer le cœur.
    3. Lyser les coeurs avec un tampon de lyse protéique contenant 50 mM de Tris-HCl pH 7,4, 0,5% de NP-40, 250 mM de NaCl, 5 mM d' EDTA, 50 mM de NaF et 10 déterminer la concentration en protéine par dosage de Bradford 19.
    4. Manteau plaques à 96 puits avec C57BL / 6J matrice cardiaque isolé comme décrit dans la section 7. Diluer le PBS suspendu C57Bl 6J / matrice cardiaque à une concentration de 20 pg / ml et ajouter 30 ul du C57BL / 6J cardiaque à chaque puits. Laisser reposer une nuit à 37 ° C dans l'incubateur.
    5. cellules ombilicales humaines de culture de la veine à l'aide de 500 ml de endothéliale basale mdias avec 0,4% d'extrait de cerveau bovin, 0,1% d'acide ascorbique, 0,1% d'hydrocortisone, 0,1% de facteur de croissance épidermique humain, du sérum de foetus de bovin à 2% et de la gentamycine / amphotéricine B lui ajoute 0,1%. Culture des cellules sur des plaques à 96 puits à 5% de CO 2 et 95% l' air ambiant avec une densité de 25.000 cellules par puits. Stimuler avec des concentrations croissantes IRF5D entre 0-100 pg / ml dans le milieu (les volumes sont compris entre 0 et 50 ul / ml).
    6. Déterminer la prolifération cellulaire au bout de trois jours et évaluer les différences d'absorbance sur un lecteur de microplaques. La réaction est une bioréduction de MTS composé de tétrazolium. NADPH ou NADH est produit par déshydrogénases dans les cellules métaboliquement actives.
    7. Comme composé tétrazolium MTS est stocké congelé à -20 ° C, décongélation du composé lentement pendant environ 90 minutes à la température ambiante. Pipette 20 ul dans chaque puits d'une plaque de 96 puits et ajouter 100 ul de milieu de culture à elle. Incuber la plaque à 37 ° C pendant 1 à 4 h dans un humidified, 5% de CO 2 chambre.
    8. Mesurer l'absorbance à une longueur d'onde de 490 nm.
  2. Dosage de l' apoptose par l' activité de la caspase
    NOTE: Le dispositif expérimental est le même que ci-dessus 3.1.1 à 3.1.5.
    1. Stimuler les cellules avec des concentrations croissantes IRF5D entre 0 à 100 pg / ml dans le milieu.
    2. Ajouter la détection verte sur le substrat à l'CEs Caspase 3/7 et incuber pendant 30 min à 37 ° C. Évaluer la fluorescence sur un lecteur de microplaques simultanément avec une longueur d'onde d'absorption / émission de 502/530 nm. Exécutez les expériences en triple.
      REMARQUE: L'agent fluorescent vert est un peptide à quatre acides aminés lié à un colorant de liaison d'acide nucléique. Ce réactif devient fluorescent lorsqu'il est clivé après caspase 3 et 7 activation. Cette fluorescence est mesurée. L'avantage est une réduction des étapes de lavage.

4. Évaluation de la IRF5 et ICAM-1 Expression dans la Heart

  1. Administrera IRF5D dilué dans du PBS (1 mg / kg / j, injecter un volume de 20 ul dans une souris de 20 g) par voie sous- cutanée avec une aiguille de calibre 27 par une technique de Scruffing standard ou par du PBS seul Tsk / + et C57BL / 6J fois par jour pendant 21 jours.
  2. Anesthésier les souris avec de l'isoflurane (5%) et d'effectuer une dislocation cervicale. Exciser le cœur en coupant ouvert la poitrine le long du sternum. Soulevez le coeur avec une pince et retirer le cœur.
  3. Lyser les coeurs avec un tampon de lyse protéique contenant 50 mM de Tris-HCl pH 7,4, 0,5% de NP-40, 250 mM de NaCl, 5 mM d' EDTA, 50 mM de NaF et 10 déterminer la concentration en protéine par dosage de Bradford 19.
    1. Effectuer un western blot sur des lysats de cœurs. Diluer les échantillons à 25 ug de protéine totale et un volume de 40 ul avec du tampon d'échantillon de Laemmli contenant 5% de mercaptoéthanol. Exécutez les échantillons sur un 4 - gel TGX 15% à 50 mV pendant 5 min. Augmenter la tension à 100 mV pendant 1 h jusqu'à ce que le front de colorant se épuise.
    2. Placer le gel dans 1 x tampon de transfert (Tris 25 mM, glycine 190 mM, methanol à 20%, ajuster le pH à 8,3 si nécessaire) et on incube pendant 10 - 15 min.
    3. Assembler le sandwich de transfert (éponge, filtre, gel, membrane de cellulose, filtre, éponge). Assurez-vous qu'aucune bulle sont piégés entre les deux. Le transfert doit se trouver sur la cathode et le gel sur l'anode. Transférer pendant 1 h dans une chambre froide à 100 mA.
    4. Le lendemain, rincez la tache, puis bloquer le fond dans 5% de lait écrémé en poudre pendant 30 min à température ambiante. Rincer la tache avec une solution saline tamponnée Tris contenant 5% de Tween trois fois pendant 5 minutes chacun.
    5. Incuber une nuit avec les anticorps primaires en utilisant des anticorps polyclonaux primaires à IRF5 ou ICAM-1. Diluent les anticorps dans une solution saline tamponnée au Tris à une dilution de 1: 1000.
    6. Diluer les anticorps secondaires dans une solution saline tamponnée Tris et incuber la tache pendant 1 h à température ambiante. âne Pour les anticorps secondaires, l'utilisation peroxydase de raifort conjugué anti-Ig de sourisG (1: 10000) et la peroxydase de raifort âne IgG anti-chèvre (1: 10.000), respectivement.
    7. Appliquer une chimioluminescence au transfert après le mélange des composants selon le protocole du fabricant et on incube pendant 3 minutes à la luminescence des bandes d'intérêt. Exposer le blot à un film X-ray. Utilisez ImageJ pour mesurer la densité. Normaliser les valeurs de densité des bandes de contrôle 10.

5. Évaluation du nombre de cellules inflammatoires après IRF5 Inhibition

  1. Administrera IRF5D dilué dans du PBS (1 mg / kg / j) par voie sous- cutanée avec une aiguille de calibre 27 par une technique de Scruffing standard ou par du PBS seul Tss / + et C57BL / 6J pendant 21 jours.
  2. Anesthésier les souris avec de l'isoflurane (5%) et d'effectuer une dislocation cervicale. Exciser le cœur en coupant ouvert la poitrine le long du sternum. Soulevez le coeur avec une pince et retirer le cœur. Snap congeler et conserver les coeurs excisés jusqu'à l'analyse.
  3. Monter les coeurs congelés sur tissdétenteurs ue appropriées pour le cryostat en cours d'utilisation. Couper 10 um d'épaisseur des coupes congelées sur un cryostat pour l'immunohistochimie.
  4. Fixer les sections congelées avec 1% de paraformaldehyde dans du tampon phosphate salin pendant 20 min à température ambiante. Perméabiliser les sections avec 0,5% de Triton X-100 dans du PBS pendant 5 min.
    Attention: paraformaldéhyde est un cancérogène réglementé et doit être manipulé avec précaution.
  5. Diluer anti-lapin CD64, un monocyte / macrophage marqueur 1: 200 dans du PBS. Appliquer sur les parties fixes et incuber pendant 30 min à 37 ° C.
  6. Laver les lames dans du PBS pendant 5 min trois fois à la température ambiante.
  7. Diluer anti-rat NIMP, primaire marqueur neutrophiles 1: 200 dans du PBS. Appliquer sur les parties fixes et incuber pendant 30 min à 37 ° C.
  8. Laver les lames pendant 5 min à trois reprises avec du PBS à la température ambiante.
  9. Diluer les anticorps secondaires anti-lapin Alexa 488 conjugué et anti-rat Alexa 488 conjugué 1: 200 dans du PBS.
  10. Appliquer anti-lapin Alexa 488 et conjugué anti-rat Alexa 488 anticorps secondaires conjugués aux sections pendant 30 min à 37 ° C en conséquence. Le volume d'anticorps varie en fonction de la taille de la section. Le montant devrait couvrir la section généreusement. Dans la plupart des cas, le volume est compris entre 100 et 200 ul.
  11. Utiliser 4 ', 6-diamidino-2-phénylindole (DAPI) comme colorant nucléaire dans une dilution 1: 1000 dans du PBS. Ajouter 1 pi dans 1 ml de PBS et utiliser le DAPI dans la dernière étape de lavage. Ajouter un média de montage aqueux à une lamelle et mettez-la sur la diapositive.
  12. Analyser les sections marquées par fluorescence par microscopie confocale en utilisant un objectif d'huile 40X. Utiliser excitation des longueurs d'onde 488 et d'émission des longueurs d'onde supérieures à 530 nm pour CD64 et NIMP. DAPI a été excité à 360 nm et émise à 460 nm en bleu. Distinguer monocytes / macrophages et des neutrophiles (n = 10 images par anticorps, de 3 souris différent dans chaque groupe) par leur étiquetage différent et les compter. Exprimez les données que le nombre de cellules comptées.

6. Cellule vasodilatation dépendante après IRF5 Inhibition

  1. Anesthésier les souris C57BL / 6J témoins et / Tsk + souris avec et sans traitement avec un peptide de la kétamine (80 - 100 mg / kg) / xylazine (10 à 12,5 mg / kg) du mélange. Injecter le mélange kétamine / xylazine intrapéritonéale. Retiens la souris manuellement.
    1. Utilisez une jauge 25 ou plus petite aiguille. Insérez l'aiguille dans le quadrant inférieur droit de l'abdomen. Retirer le piston avant l'injection afin d'assurer que l'aiguille ne pénètre pas dans un vaisseau sanguin ou de l'intestin.
  2. Une fois un niveau suffisant de l'anesthésie a été atteinte, fixer la souris en position couchée, essuyez la fourrure avec de l'alcool imbibé tampon de gaze, et en utilisant une paire de ciseaux ouvrir la cavité thoracique et retirez le cœur.
    NOTE: Exsanguination sera euthanasier la souris et faire une dissection plus facile en réduisant la pression dans le système vasculaire minimisant ainsi les saignements lors de la coupe des vaisseaux sanguins.
    1. Ouvrez le usin de la peauga paire de ciseaux, découper de la partie latérale de la poitrine à la mâchoire avec soin à ne pas perturber les tissus sous-jacents vers l'avant de la mâchoire.
    2. Disséquer l'artère facialis en retirant le tissu mou autour d'elle.
    3. Attention: Ne pas blesser le navire ou un remorqueur sur facialis artère tout en gardant le tissu exposé baigné dans un tampon MOPS (2,0 mM CaCl 2 · 2H 2 O, EDTA 0,02, glucose 5,0 mM, KCl 4,7, 1,17 mM MgSO 4 · 7H 2 O, MOPS 3,0 mM, 145 mM de NaCl, 1,2 mM de NaH 2 PO 4 · H 2 O, de 2,0 mM d' acide pyruvique) pour éviter la dessiccation. Effectuer un zoom sous dissection microscope binoculaire stéréo (grossissement de 3,5X à 45X) et une source de lumière à fibre optique.
  3. Isoler l'artère facialis.
    1. Attrapez la proximal facialis à la première bifurcation et distale à l'endroit où l'artère est coupée. Couper l'artère de l'artère parente, l'artère carotide externe. Retirez le arterie de facialiss des souris témoins, Tsk + / souris avec et sans traitement IRF5D.
    2. Tout en maintenant l'artère dans la pince, couper les deux branches venant du facialis, permettant au navire d'être soulevé doucement alors que tout le tissu environnant de uncut peut être identifiée et séparée.
    3. Continuez ainsi jusqu'à ce que la bifurcation est atteinte coupant les deux artères fille pour libérer le navire. Il n'y a pas besoin de serrer les récipients avant la coupe due à la pression soulagée dans la vasculature d'enlever le coeur. Mettez le récipient dans un tampon MOPS tandis que l'autre artère facialis est disséquée et isolé.
    4. Cathétériser les vaisseaux en les attachant sur des pipettes en verre avec un diamètre de la borne de 125-175 um. Précharger les pipettes de verre et de réservoirs tampons avec un tampon MOPS.
      Attention: éviter que des bulles d'air de se former dans les pipettes.
    5. Attachez les navires sur les pipettes en utilisant des sutures ophtalmiques.
  4. Monter les chambres de navire sur un micr triocular inverséoscope avec une fixation de caméra vidéo. Exécuter la vidéo par le biais d'un système de mesure d'épaisseur vidéo pour les mesures sur l'écran des vaisseaux. 20
    1. Pressurisez dans un processus en deux étapes. Tout d'abord, les réservoirs remplis de MOPS à une hauteur au-dessus du récipient égale à la pression de 20 mm Hg, ouvrir manuellement les robinets d'isolement dans les lignes de réservoir vers la cuve. Inspecter le navire pour des signes de fuites autour des attaches le long de la longueur du navire. Deuxièmement, augmenter les réservoirs à 60 mmHg et réinspecter le navire.
    2. Une fois sous pression à 60 mmHg, permettre aux navires de s'équilibrer pendant 30 min.
  5. Afin d'évaluer la vasodilatation en réponse à l' acétylcholine (10 -7 à 10 -4 M) preconstrict le récipient à un diamètre de 50 - 75% de son diamètre maximal à l' aide de 1 à 3,0 x 10 -8 à 10 -7 M U46619. Après avoir laissé le récipient se stabiliser pendant 6 min, ajouter acétylcholine dans le bain en deux étapes min de durée de telle sorte que lales concentrations finales dans le bain est de 10 -7, 10 -6, 10 -5, 10 -4. Mesurer la vasodilatation dans les trois groupes.

7. Isolation of Cardiac Matrice Extracellulaire

  1. Anesthésier les souris C57BL / 6J témoins et / Tsk + souris avec et sans traitement peptidique avec de l'isoflurane (5%) et d'effectuer une dislocation cervicale. Exciser le cœur en coupant ouvert la poitrine le long du sternum. Soulevez le coeur avec une pince et retirer le cœur.
  2. Mettre les cœurs enlevés dans un bêcher et on ajoute 15 ml hypertonique 1% de dodécylsulfate de sodium (SDS). Agiter coeurs dans la solution à 1% de SDS pendant 18 heures à température ambiante pour briser les cellules en ajoutant une barre d'agitation à la solution SDS 1% et de mettre le bécher sur une plaque d'agitation.
    Attention: Il faut savoir que la matrice extracellulaire se désintégrera si on les laisse trop longtemps dans une solution hypertonique. Inversement, si les cœurs ne sont pas agités assez longtemps dans une solution hypertonique, les cellules ne sera pas correctementdissoudra et il y aura des débris cellulaires laissée dans le bêcher.
  3. Laver pendant 30 min dans 15 ml de 0,5% de Triton X-100. Laver ensuite pendant 15 minutes avec 15 ml de PBS. Decellularize chaque coeur individuellement.
  4. Snap-gel de la matrice extracellulaire dans l'azote liquide et Pulvérisation la matrice extracellulaire cardiaque congelé avec un mortier et un pilon pré-refroidi.
  5. Faire une suspension de la matrice en poudre dans du PBS contenant 1% d'antibiotique. Le volume ajouté dans la plupart des cas est de 300 pi. Soniquer la suspension pendant 30 - 60 s sur la glace sur le réglage élevé.
    NOTE: Il est très important que l'échantillon maintient froid. Soyez conscient que la suspension est très visqueux en raison de la teneur en glycanes riches en protéines.
  6. Déterminer la concentration de protéines en utilisant un dosage de Bradford.
    REMARQUE: Assurez-vous que il est anti-biotiques et anti-fongique dans la suspension. Pénicilline / Streptomycine sont le plus couramment utilisé et recommandé.

8. Évaluation des translocation nucléaire par Immunohistochemistry

  1. Les plats de pelage et de diapositives utiliser une concentration finale de 20 pg / ml de la matrice extracellulaire cardiaque dans du PBS. Pipeter 500 ul de la solution cardiaque de la matrice extracellulaire dans une boîte de 100 mm pour le revêtement et 150 ul de la solution de matrice extracellulaire sur une lame finale.
  2. Inhibition IRF5 en ajoutant IRF5D dans un 50 pg concentration / mL pendant 24 h de rat myocytes cardiaques néonatales dans la culture. Laisser contrôler les cultures de myocytes non traitée.
  3. Évaluer le trafic de IRF5 du cytosol au noyau par immunofluorescence et analyse par microscopie confocale. Identifier l'étiquetage vert pour IRF5, identifiez le DAPI bleuissement pour le noyau
  4. Appliquer l'anticorps anti-IRF5 primaire. L'anticorps primaire a été utilisé dans une dilution 1: 200 dans du PBS. Incuber les lames pendant 30 min à 37 ° C et suivre trois étapes de lavage de 5 min. L'anticorps secondaire était de chèvre Alexa 488 marqué par un anticorps anti-IgG de souris.
  5. Diluer l'anticorps secondaire 1: 1000 dilution dans du PBS. Incuber l'anticorps secondaire pendant 30 min à 37 ° C. Atteindre coloration nucléaire avec DAPI. Diluer le DAPI 1: 1000 dans du PBS. Laver les lames un total de 3 fois pendant 5 minutes et ajouter DAPI à la troisième et dernière étape de lavage.
  6. Capturer le trafic en utilisant la microscopie confocale et mesure l' intensité de fluorescence dans les noyaux et le cytosol 10 comme décrit précédemment. Identifier l'étiquetage vert pour IRF5, identifiez le DAPI bleuissement pour le noyau. Les cellules qui présentent des noyaux bleus avec étiquetage vert en eux contiennent activés IRF5, qui traite du cytosol vers le noyau. étiquetage vert Lorsque IRF5 est pas activé se trouve dans le cytosol.
  7. Analyser les cellules marquées par fluorescence par microscopie confocale en utilisant un objectif d'huile 40X. Utilisez une longueur d'onde d'excitation de 488 nm et d'émission des longueurs d'onde supérieures à 530 nm pour IRF5. Utiliser une longueur d'onde d'excitation de 360 ​​nm et une longueur d'onde d'émission de 460 nm pour la visualisation du DAPI.

9. Statistiques

  1. Effectuer une analyse de variance (ANOVA) pour des mesures répétées au sein et entre les groupes. Suivez ANOVA avec la modification de Bonferroni des étudiants t-test. Exprimez les données que l'erreur standard de la moyenne.

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Résultats

Les résultats ont démontré à la figure 1 montrent comment concevoir un peptide. La figure 1, en haut à gauche montre la zone (entre les 2 flèches jaunes, les acides aminés (aa) 425-436) dans IRF5 qui est phosphorylée par un certain nombre de kinases. Figure 1, en haut à droite, montre un ovale jaune où domaine phosphorylée de IRF5 lie. La structure dimérique de 3DSH a été mis en rotation pour observer une fente ou une vall?...

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Discussion

L'objectif était de concevoir un inhibiteur de IRF5 pour élucider le rôle de IRF5 sur l'inflammation, la fibrose et la fonction vasculaire dans le cœur des Tsk / + souris. Les conclusions sont que IRF5D n'a pas induit la prolifération ou l'apoptose. En outre, l'inflammation a été réduite et la fonction vasculaire améliorée. Ces données suggèrent que IRF5 joue un rôle mécanistique important dans le développement de l'inflammation et de la fibrose dans le cœur de souris + / Tsk, et ...

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Déclarations de divulgation

The authors declare that they have no competing financial interests.

Remerciements

This work was supported by NIH grants HL-089779 (DW), HL-112270 (KAP) and HL-102836 (KAP) and Cimphoni Life Sciences (part of DW salary). The authors thank Meghann Sytsma for editing the manuscript.

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matériels

NameCompanyCatalog NumberComments
 Triton X 100Sigma AldrichX100- 100ml
Alexa 488-labeled goat anti-mouse IgG antibody Thermo FisherA11001
Bardford reagentThermo Fisher23200Pierce 
BiosensorsForte-BioMR18-0009
CD64 (H-250)Santa Cruz Biotechnologiessc-15364
CellEvent Caspase-3/7 SubstrateThermo Fisher/Life TechnologiesC10427
CellTiter AQueous One Solution Cell Proliferation Assay kitPromegaG3580Promega
DAPI (4′,6-diamidino-2-phenylindole)Thermo FisherD-13061:1,000 dilution in PBS
donkey anti rat Alexa 488Thermo FisherA-212081:1,000 dilution in PBS
ECL plusGE healthcare/AmershamRPN2133After a lot of trial and error we came back to this one
Eclipse TE 200-U microscope with EZ C1 laser scanning softwareNikon
goat anti rabbit Alexa 488Thermo FisherA-110081:1,000 dilution in PBS
HRP  anti-goatSanta Cruz Biotechnologiessc-516086!:10,000 dilution in TBS
HRP donkey anti-mouseSanta Cruz Biotechnologiessc-23151:10,000 dilution in TBS
ICAM-1 antibodySanta Cruz Biotechnologiessc-15111:200 dilution in PBS
IRF5 antibody (H56)Santa Cruz Biotechnologiessc-98651
Micro plate reader Elx800Biotek
NIMP neutrophil markerSanta Cruz Biotechnologiessc-1338211:200 dilution in PBS
Octet REDForte Bioprotein-protein binding
Peptide design  Medit SA softwareRCSB.org
Recombinant IRF5 protein synthesisTopGene Technologiesprotein expression, synthesis service
sodium dodecyl phosphateSigma Aldrich436143detergent
KetaminePharmacySchedule III controlled substance, presciption required 
XylazineMedVet
3.5X-45X Trinocular Dissecting Zoom Stereo Microscope with Gooseneck LED LightsAm ScopeSKU: SM-1TSX-L6W
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Références

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