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Un protocole robuste à surveiller les populations neuronales en Time-lapse vidéo-microscopie suivie de post-traitement logicielle est décrite. Cette méthode représente un outil puissant pour identifier les événements biologiques dans une population sélectionnée au cours d’expériences d’imagerie live.
Comprendre les mécanismes qui contrôlent les événements biologiques critiques des populations de cellules neurales, tels que la prolifération, la différenciation ou décisions de cellule de sort, seront crucial pour concevoir des stratégies thérapeutiques pour de nombreuses maladies affectant le système nerveux. Les méthodes actuelles de suivre les populations de cellules comptent sur leurs résultats finaux en images fixes et en général, ils ne parviennent pas à fournir une résolution temporelle suffisante pour identifier les caractéristiques comportementales dans des cellules individuelles. En outre, des variations dans la mort cellulaire, hétérogénéité comportementale au sein d’une population cellulaire, dilution, diffusion ou la faible efficacité des marqueurs utilisé pour analyser des cellules sont tous les handicaps importants qui mèneront à des afficheurs incomplètes ou incorrectes des résultats. À l’inverse, spectacle live d’imagerie et de la cellule unique de suivi dans des conditions appropriées représente un outil puissant pour surveiller chacun de ces événements. Un Time-lapse protocole vidéo-microscopie, suivi de post-traitement, est décrit ici, pour assurer le suivi des populations neuronales avec résolution unicellulaire, employant des logiciels spécifiques. Les méthodes décrites permettent aux chercheurs de répondre à des questions essentielles concernant la progression de biologie et de la lignée cellulaire des populations neuronales distinctes.
Afin de développer des stratégies thérapeutiques nouvelles et plus efficaces pour régénérer les populations neuronales, nous devons d’abord comprendre les mécanismes de base qui maintiennent les cellules avec un potentiel de régénération neuronal. Poursuivant cet objectif exige une connaissance approfondie des facteurs qui régulent l’équilibre entre la quiescence, prolifération/différenciation, le mode et le moment de la durée du cycle cellulaire, capacités migratoires, viabilité, division, etc.. Même si c’est une approche technique qui a travaillé pendant de nombreuses années1, imagerie en direct et observation directe restent encore la meilleure option pour surveiller les événements énumérés ci-dessus. Contrairement à nombreuses autres approches centrées sur les afficheurs de point final, en direct d’imagerie et unicellulaire suivi de fournir des informations sur toute la longueur d’une expérience de2,3,4,5, 6. ainsi, l’ajout de résolution temporelle permet la mort cellulaire, comportement de cellules hétérogènes ou décisions destin cellulaire, ainsi que plusieurs autres événements critiques d’identifier qui pourraient autrement passer inaperçus. Idéalement, ces caractéristiques de cellules devraient mieux être surveillés à la cellule unique niveau in vivo, où les deux intrinsèque (cellule autonome) et extrinsèques cues (niche de la cellule) sont pris en compte.
Cependant, bien que dans in vitro situation se produisent dans un environnement qui ne reproduit pas le milieu naturel, les conditions de culture faible densité généralement utilisées dans ces protocoles sont plus adaptées révéler des caractéristiques intrinsèques de la cellules. Par ailleurs, un contrôle plus simpliste du milieu environnant, en modifiant simplement le milieu de croissance, peut constituer un outil précieux pour étudier le rôle individuel de chaque facteur extrinsèque qui définit la niche neurale, ainsi que les facteurs environnementaux qui peuvent être induit dans les scénarios pathologiques7,8,9,10,11,12,13. Par conséquent, lorsqu’il est correctement configuré, comme dans le protocole proposé ici, imagerie live fournit une solution réalisable en vitro pour répondre à la plupart des questions énumérées précédemment.
En bref, ce protocole décrit le matériel, de logiciels, les conditions de culture et les principales étapes nécessaires pour réaliser avec succès une expérience d’imagerie live suivie d’une cellule unique de suivi. Cette approche offre des renseignements précieux qui permettant de révéler des aspects fondamentaux de la biologie et de la progression de la lignée, de plusieurs populations de neurones.
Les sections suivantes décrivent les étapes nécessaires pour son imagerie live suivie suivi de cellule unique de plusieurs populations de neurones (Figure 1). Toutes les procédures impliquant des animaux décrits dans le présent protocole doivent être effectués conformément aux directives du Conseil International pour Laboratory Animal Science (ICLAS).
Figure 1. Schéma illustrant les principales étapes expérimentales de la procédure, c'est-à-dire: cell culture, imagerie live, PICC et collecte de données, seule cellule de suivi et le résultat final. Les étapes sont numérotées en fonction du flux de travail du protocole. S’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.
1. Culture cellulaire : Isolation et plaquage de sélectionné Population neurale ou une lignée de cellules
NOTE : En conjonction avec ce protocole, des exemples de son application à des populations cellulaires distincts sont donnés pour valider son utilité pour analyser la biologie de cellules nerveuses. Ceux-ci incluent : les cellules souches neurales adultes (aNSCs) dérivé de la souris subépendymaire Zone (ZES) (pour un isolement détaillé protocole voir14) ; Astrocytes corticaux postnatales pour étudier une reprogrammation neuronale (pour une isolation détaillé protocole voir15) ; Astrocytes cérébelleux postnatals (pour une isolation détaillée méthode Voir16) ; et ligne de cellules de neuroblastome souris Neuro-2 a (N2a).
2. vivre d’imagerie en Time-lapse vidéo-microscopie
3. l’imagerie immunocytochimie (PICC), la collecte de données et traitement
4. cellule suivi
5. issue
La méthode décrite permet aux questions cruciales concernant la biologie de cellules de plusieurs populations de neurones doivent être résolus. Par exemple, il a été possible de surveiller la progression de la lignée neurogène et oligodendrogliogenic d’aNSCs7,8,14,18. Par le suivi unique aNSCs et leur progéniture (Figure 2 a, B), il a été possible de démontrer qu’aNSCs isolées in vitro conservent leur nature neurogène, produisant principalement des neuroblastes, et qu’ils suivent une séquence proposée dans vivo19 mais n’a pas été démontrée au niveau de la cellule unique. En outre, ce système de culture a permis des divisions cellulaires asymétriques à visualiser pour la première fois dans la lignée d’aNSC de la ZES (Figure 2 b), offrant un modèle unique pour étudier la NSC autorenouvellement8,14. De même et quelle que soit la lignée analysés, il était possible d’obtenir des données précieuses au sujet de la croissance des cellules, des séries de division, la viabilité des cellules ou longueur du cycle cellulaire.
Figure 2. Exemple d’aNSCs isolées de la ZES et analysée par imagerie direct et unique cellule de suivi. Images de contraste de phase dépeignent la progression du clone à différents moments (jour-h: min). L’image finale et correspond à l’immunocytochimie imagerie post (PICC) protéine fibrillaire acide gliale (GFAP, rouge), βIII-tubuline (vert) 4', 6-diamidino-2-phénylindole (DAPI, bleu). (A) analyse des arbres neurogène symétrique grâce à différentes séries amplifier les divisions pour générer des neuroblastes post-mitotiques. Flèches rouges indiquent les cellules incluses dans les arbres symétriques. Sur la droite, les arbres de la lignée correspondant aux clones et générés par le logiciel de tTt sont affichés. (B) exemple d’un progéniteur générant un arbre neurogène asymétrique, avec une branche subissant des divisions amplification pour produire des neuroblastes tandis que l’autre donne lieu à quiescentes cellules positives GFAP via un événement autorenouvellement potentiel. Sur la droite, s’affiche l’arborescence de la lignée généré par le logiciel de tTt. Dans tous les arbres de la lignée : « N » représente des neuroblastes post-mitotiques ; « G », les cellules quiescentes GFAP-positive ; « X », la mort cellulaire ; et « ? » une cellule perdue. Barre d’échelle représente 50 µm. s’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.
Imagerie en direct et seule cellule suivi analyse également fournit un affichage précis des capacités migratoires d’une population de neurones. Ces renseignements proviennent de postnatals astrocytes cérébelleux, soumis à une plaie zéro dosage20, générant des informations concernant la distance moyenne parcourue par les astrocytes, lors de la fermeture de la plaie (Figure 3). En outre, il était possible de voir que certains d'entre les astrocytes divisée pendant le processus de guérison, alors que d’autres restent inchangés tout au long de l’expérience. Étonnamment, ceux qui divisait semblent des comportements migratoires plus prolifique que leurs homologues non Division (voyageant deux fois comme beaucoup en moyenne). Ce phénomène suggère une hétérogénéité très intéressante dans la capacité d’astrocytes de former une cicatrice sur la blessure, ce qui serait ont été dilué dans la lecture d’une expérience d’analyse classique point final.
Figure 3. Analyse du comportement migratoire des postnatals astrocytes cérébelleux dans une égratignure plaie dosage. Images de contraste de phase dépeignent la plaie à différents moments (jour-h: min). Arbres de lignage, générés par le logiciel de tTt, illustrent le comportement représentatif, en termes de division cellulaire, des astrocytes en refermant la plaie. Histogramme montre la distance moyenne parcourue par les astrocytes analysées par la cellule de suivi (moyenne ± S.E.M.). Barre d’échelle représente 50 µm. s’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.
Une autre caractéristique intéressante des expériences vidéo-microscopie Time-lapse est la capacité à comparer la prolifération et la différenciation dans une population de cellules. Nous avons testé les cellules N2a plaqués dans des conditions qui favorisent la prolifération (en présence de 10 % sérum bovin fœtal (SVF)) ou différenciation (en présence de 0,5 % BF + acide arachidonique 10 µM). Il était possible de suivre la progression de la lignée de ces cellules dans des conditions prolifératives (Figure 4 a), tandis que la différenciation des cellules ne prolifèrent pas et elles forment des neurites (Figure 4 b). Remarquablement, seule cellule de suivi a permis de colonies avec différents prolifération capacités à distinguer et élongation des neurites (et rétraction) à évaluer, fournir des données précises et quantitatives qui peuvent ensuite être exportées.
Figure 4. Le suivi de la biologie cellulaire N2a prolifération (A) ou les conditions de la différenciation (B). Montrant la progression du clone à différents moments (jour-h: min) des images à contraste de phase. L’image finale correspond à l’immunocytochimie imagerie post (PICC) pour α-tubuline (vert). (A) seule cellule suivi permet des séries de division à surveiller, ainsi que l’hétérogénéité dans la réponse proliférative des cellules différentes. Sur la droite, l’arborescence de la lignée généré par le logiciel de tTt illustre le comportement prolifératif des cellules N2a. (B) des cellules dans des conditions de la différenciation quitter le cycle cellulaire et génèrent des neurites, un processus qui peut être effectivement mesuré par imagerie après analyse. Unique, suivi de la cellule, représentée par l’arborescence de la lignée à droite, illustre comment les cellules N2a sortie cycle cellulaire et arrêter la division cellulaire dans des conditions de la différenciation. Barre d’échelle représente 50 µm.S’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.
Vivre enfin, imagerie et cellule de suivi est extrêmement utile pour surveiller les changements morphologiques et moléculaires lorsque les cellules sont soumises à la reprogrammation. Imagerie Live des astrocytes postnatals transduites avec homologue Achaete-scute 1 (Ascl1) fournit des données précieuses concernant les changements morphologiques qui se produisent au cours de reprogrammation ou le blocage de la division cellulaire lorsque des astrocytes sont reprogrammé (voir Figure 5). En outre, Ascl1 transduction est associé à la transduction d’un construct codant pour la protéine de fluorescence verte (GFP) sous le contrôle du promoteur Double Cortin (DCX), il est possible de définir le point de temps précis lorsque neuronale des marqueurs spécifiques commencent à être exprimée dans les cellules reprogrammés (Figure 5). Time-lapse vidéo-microscopie permet également le nombre de cellules qui complètent avec succès la reprogrammation pour être quantifié et comparées aux cellules qui meurent au cours de ce processus. Surveillance des événements conduit à l’identification des critiques « checkpoints » dans les cellules qui ont été avec succès reprogrammé9.
Figure 5. Analyse des astrocytes corticaux postnatals, soumis à une reprogrammation neuronale. La reprogrammation a été induite par transduction avec des vecteurs de protéine (DP) de Fluorescence rouge-Ascl1 pro-neurogène. Conversion neuronale a été suivie par transduction Co avec un vecteur codant la GFP sous le contrôle d’un promoteur DCX. Images de contraste de phase montrent la progression de reprogrammation à différents moments (jour-h: min). Images de fluorescence d’expression DP et GFP, respectivement. Imagerie en direct et unique cellule de suivi a permis des événements cruciaux à suivre, comme les changements morphologiques, l’absence de division cellulaire lors de la reprogrammation, la mort cellulaire, et l’heure exacte lorsque reprogrammé les cellules commencent à exprimer les marqueurs neurones peut être définis . Barre d’échelle représente 80 µm. s’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.
Une des valeurs plus importantes de l’imagerie live est la possibilité d’effectuer le traçage précis de lignée, élucider les aspects cruciaux de la progression de la lignée dans une population de neurones. Traçage de la lignée est défini comme l’identification et surveillance de tous les descendants d’un ancêtre unique, du fondateur du clone pour le clone subséquent formé21. Remarquablement, les méthodes alternatives de lignée tracing (p. ex., transduction virale ou journaliste multicolor constructions21) présentent un inconvénient critique, auquel cas le résultat final est basé sur des images fixes et il ne le fait pas nécessairement constituent la séquence entière. Cela signifie que la mort cellulaire, hétérogénéité dans le comportement de la population cellulaire, dilution, épandage ou mauvaise efficacité des marqueurs, ainsi que d’autres handicaps importants, conduire à des afficheurs incomplètes ou incorrectes des résultats2. En outre, imagerie live permet au chercheur d’analyser les caractéristiques importantes de la biologie des populations de neurones, tels que la mode et le moment de la division cellulaire, la croissance cellulaire, migration, prolifération et différenciation, longueur du cycle cellulaire, neurite formation, de complexité et de longueur, cellule sort sélection (différenciation), ou la conversion (reprogrammation).
En outre, l’imagerie live peut être facilement complété par toute autre analyse destinée à obtenir des données de cellules uniques tels que, par exemple, le séquençage de RNA. Toutefois, pour réaliser des prestations combinées de l’imagerie live et d’autres techniques exige que ces cellules précédemment contrôlés dans les films sont plus tard réidentifiés et individuellement prélevés pour l’analyse secondaire. Ceci peut être réalisé à l’aide de microscopes qui incluent les coordonnées positionnelles, en appliquant des reporters fluorescentes pour des cellules spécifiques ou analyse de la répartition des groupes de cellules comme références. En effet, la combinaison du profil transcriptome et le comportement des cellules individuelles peuvent représenter une voie puissante pour élucider les nouveaux signaux moléculaires impliqués dans la biologie des cellules.
L’un des principaux problèmes qui peuvent compromettre une expérience d’imagerie live est une densité de culture cellulaire insuffisante. Comme indiqué précédemment, à haute densité l’excès de débris ou de dissociation pauvre (formation de touffe) peuvent affecter la qualité et la résolution spatiale des images, faisant seule cellule suivi infaisable. Par conséquent, les conditions des populations cellulaires distincts à l’étude devraient être positionnées sur le plus petit nombre de cellules possibles sans compromettre la viabilité de la culture cellulaire.
La fréquence d’acquisition d’images est également cruciale et doit être ajustée avec soin, surtout lorsque l’éclairage de fluorescence est utilisé. Une surexposition aux transmis et surtout lumière de fluorescence peut compromettre la viabilité des cellules. Par ailleurs, une lenteur excessive entre la capture des images peut interférer avec la résolution temporelle de l’analyse.
Une autre étape cruciale lors de l’expérience d’imagerie live est l’ajustement périodique de mise au point. Échec dans le bon réglage/re-setting de la distance focale d’entraver suivi de cellule unique. En outre, il est nécessaire de bien vérifier que la chambre d’incubation conserve la température adéquate, l’humidité et niveaux de CO2 , modifiant des variations indésirables que peuvent induire la mort cellulaire.
Enfin, une fois que le PICC a été effectuée, il est important de récupérer correctement la position xyz zéro avant la dernière série d’acquisition d’images. Mauvais re-réglage de le xyz position zéro rendra difficile de faire correspondre les images à contraste de phase et d’immunofluorescence, empêchant l’identification de la descendance de la cellule.
Bien que cette approche présente de multiples aspects positifs, certaines limitations à l’imagerie direct des populations neuronales persistent. Par exemple, la densité cellulaire faible requise pour effectuer le suivi des succès monocellulaire d’aNSCs rend impossible d’employer des épreuves biochimiques, tels que Western blotting14. En outre, surveillance divisant rapidement les populations comme les astrocytes cérébelleux ou cellules N2a est temporellement limité comme c’est souvent trop difficile de suivre les cellules comme les cultures près de confluence. En outre, plusieurs méthodes de culture, ainsi que les restrictions biologiques inhérentes liées à l’isolement de cellules, souvent compromettent la viabilité des cellules sur de longues périodes, limitant la durée des expériences d’imagerie live. Enfin, isoler les cellules de leur environnement naturel a des effets positifs et négatifs. Cellules isolées de leur niche physiologique peuvent ne pas recevoir les signaux importants qui modulent leur comportement, tandis que dans le même temps, il représente un moyen puissant pour tester l’effet de ces signaux individuellement dans la progression de la lignée des neurones spécifiques populations.
Étant donné les limitations décrites ci-dessus, il est clair que le parfait scénario méthodologique serait à réaliser direct d’imagerie et unique cellule suivi expériences sous des conditions physiologiques normales in vivo. Cependant, les techniques actuelles sont incapables de suivre les cellules individuelles pendant de longues périodes de temps dans les régions profondes du cerveau2. Par conséquent, l’avenir de l’imagerie live devrait se concentrer sur surmonter cette limitation, visant à analyser entièrement la biologie cellulaire des cellules individuelles en vivo avec le plus petit possible interférences de l' environnement physiologique3.
Les auteurs n’ont rien à divulguer.
Nous remercions Beatriz Gascon pour son travail d’assistance et de l’art à la Figure 1. Nous remercions également m. C. Norris pour son aide. Le travail présenté ici a été appuyé par les subventions de recherche, « Red de excelencia Consolider-Ingenio espagnol Ion Channel Initiative » (BFU2015-70067REDC), MEC (BFU2014-53654-P), BRADE-CM (S2013/ICE-2958), Université Complutense de Madrid-Santander (PR26/16-18 b-3) et Fundación Ramon Programme de Areces Grant (PR2018/16-02). Felipe Ortega reconnaît le Ramon y Cajal programme du ministère espagnol de l’Economie et compétitivité (MEC : RYC-2013-13290).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Poly-D-lysine | Sigma | P0899 | Working solution 0.02 mg mL-1 |
24 wells plate | Falcon | 352047 | |
Dulbecco’s modified Eagle’s medium (DMEM): F12 Nutrient Mixture medium (-L Glutamine) | Invitrogen | 21331-020 | |
DMEM High Glucose medium | Sigma | D6546 | |
Bovine Serum Albumin | Sigma | A6003 | |
Triton X-100 | Merck | 11869 | non-ionic surfactant |
Mouse anti-β III Tubulin | Sigma | T8660 | |
Rabbit anti-GFAP | DakoCytomation | Z0334 | |
Mouse anti-α Tubulin | Sigma | T5168 | |
Anti-Mouse FITC | Jackson Laboratories | 715-095-150 | |
Anti-Rabbit Cy3 | Jackson Laboratories | 711-165-152 | |
Brightfield/Phase contrast/fluoresence microscope | Nikon | TE-2000-E | |
CFI PLAN FLUOR DLLL 10X objetives | Nikon | Ref 280MRH10101 | |
CFI SUPER PLAN FLUOR ELWD AMD 20X objetives | Nikon | Ref 280MRH48230 | |
pE-300 LED fluorescence | Cool LED | Ref Number 1981 | |
310M-201 Incubation system (temperature) | OKO-Lab | Serial Nº VOF007307 | |
Pro-ScanII Motorized stage system | Prior | Serial Nº 60018 | |
High precision microscope camera version 4.2 | ANDOR Zyla | VSC-03650 | |
Specifc software for live imaging with timelapse module: NIS-Elements AR4.5 | Nikon | NIS-Elements AR4.5 -Hasp ID: 13CE819E | |
OKO touch Incubation system (CO2) | OKO-lab | Serial number 1716 | |
Murine Neuro-2a Neuroblastoma Cell line | ATCC | ATCCCCL131 | |
HEPES buffer solution 1 M | Invitrogen | 15630-056 |
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