Ingénierie d’assembloïdes tendineux pour sonder la diaphonie cellulaire dans la maladie et la réparation

Résumé

Ici, nous présentons un système modèle assembloïde pour imiter la diaphonie cellulaire tendineuse entre le tissu central du tendon porteur et un compartiment extrinsèque contenant des populations cellulaires activées par la maladie et la blessure. Comme cas d’utilisation important, nous démontrons comment le système peut être déployé pour sonder l’activation des cellules endothéliales extrinsèques pertinentes pour la maladie.

Résumé

Les tendons permettent la locomotion en transférant les forces musculaires aux os. Ils reposent sur un noyau tendineux résistant comprenant des fibres de collagène et des populations de cellules stromales. Ce noyau porteur est englobé, nourri et réparé par une couche de tissu de type synovial comprenant le compartiment tendineux extrinsèque. Malgré cette conception sophistiquée, les blessures aux tendons sont courantes et le traitement clinique repose toujours sur la physiothérapie et la chirurgie. Les limites des systèmes modèles expérimentaux disponibles ont ralenti le développement de nouveaux traitements modificateurs de la maladie et de régimes cliniques de prévention des rechutes.

Les études in vivo chez l’homme se limitent à comparer des tendons sains à des tissus malades ou rompus en phase terminale prélevés lors d’une chirurgie réparatrice et ne permettent pas l’étude longitudinale de la maladie tendineuse sous-jacente. Les modèles animaux in vivo présentent également des limites importantes en ce qui concerne la complexité physiologique opaque, le fardeau éthique pour les animaux et les coûts économiques importants associés à leur utilisation. De plus, les modèles animaux in vivo sont mal adaptés à l’exploration systématique des médicaments et des voies d’interaction multicellulaires et multitissulaires. Les systèmes modèles in vitro plus simples ont également échoué. L’une des principales raisons est l’incapacité à reproduire correctement la charge mécanique tridimensionnelle nécessaire pour étudier de manière significative les cellules tendineuses et leur fonction.

Le nouveau système de modèle 3D présenté ici atténue certains de ces problèmes en exploitant les explants de noyau de tendon de la queue murine. Il est important de noter que ces explants sont facilement accessibles en grand nombre à partir d’une seule souris, conservent des modèles de charge in situ 3D au niveau cellulaire et présentent une matrice extracellulaire de type in vivo. Dans ce protocole, des instructions étape par étape sont données sur la façon d’augmenter les explants de noyau tendineux avec des hydrogels de collagène chargés de cellules endothéliales dérivées de muscles, de fibroblastes dérivés de tendons et de macrophages dérivés de la moelle osseuse pour remplacer les populations de cellules activées par les maladies et les blessures dans le compartiment tendineux extrinsèque. Il est démontré comment les assembloïdes tendineux qui en résultent peuvent être mis à l’épreuve mécaniquement ou par des stimuli microenvironnementaux définis pour étudier la diaphonie multicellulaire émergente pendant la maladie et la blessure.

Introduction

Dans leur fonction de transfert des forces musculaires vers les os pour permettre le mouvement, les tendons sont confrontés à certaines des contraintes mécaniques les plus extrêmes du corps humain ^1,2,3. En raison du vieillissement des sociétés, de l’augmentation de la prévalence de l’obésité et de la popularité croissante des activités sportives exigeantes mécaniquement, la prévalence des maladies et des blessures des tendons devrait augmenter dans les pays développés ^4,5,6. La mise au point de nouveaux schémas thérapeutiques modificateurs de la maladie fondés sur des données probantes pour lutter contre cette augmentation a été entravée par les limites des systèmes modèles actuellement disponibles ^1,7,8.

Idéalement, les modèles de réparation des maladies et des blessures permettraient d’étudier comment l’organe cible traite un ensemble défini de paramètres d’entrée (imitant les déclencheurs de la maladie, tableau 1) en paramètres de sortie mesurables (représentant les caractéristiques de la maladie, tableau 2) tout en contrôlant les facteurs de confusion. Les études utilisant de tels systèmes modèles seraient alors en mesure d’identifier les processus (patho-)physiologiques sous-jacents à la réparation des maladies et des blessures et d’acquérir des connaissances qui pourraient être exploitées pour prévenir ou réduire les caractéristiques des maladies et des blessures dans les cliniques. En appliquant ce principe aux tendons, un système modèle utile devrait récapituler les parties centrales de la réponse tendineuse in vivo à la maladie et à la lésion, qui englobent les caractéristiques suivantes : microdommages, inflammation, néovascularisation, hypercellularité, renouvellement accéléré de la matrice et décloisonnement 9,10,11,12,13,14,15 . En utilisant ces caractéristiques comme base, les exigences suivantes pour un système de modèle de réparation des maladies et des blessures tendineuses réussi peuvent être déduites.

On suppose que la surcharge mécanique est un facteur central dans les blessures aux tendons et la pathogenèse des maladies et constitue donc une approche expérimentale couramment utilisée pour créer des microdommages¹⁶. La capacité de charge mécanique contrôlable est donc une condition préalable essentielle pour les modèles de réparation des maladies et des blessures des tendons. Idéalement, le système de modèle permet trois modes principaux : le chargement par étirement unique jusqu’à l’endommagement, le chargement par fatigue et le déchargement ^8,17,18. Lors de la déformation mécanique, les cellules résidentes des tissus subissent une combinaison complexe de forces de tension, de forces de cisaillement (dues au glissement des fibres de collagène entourant les cellules) et de forces de compression se produisant pendant le déchargement ou à proximité de l’enthèse^19,20. Les systèmes modèles doivent recréer ces modèles de charge complexes aussi fidèlement que possible.

Une autre façon d’introduire des microdommages matriciels consiste à tirer parti des facteurs de stress biochimiques qui imitent les prédispositions systémiques aux maladies et aux lésions tendineuses, telles que les cytokines (pro-)inflammatoires, le stress oxydatif ou les concentrations élevées de glucose 21,22,23. Par conséquent, un microenvironnement de niche contrôlable est avantageux pour un système modèle de réparation des maladies et des blessures des tendons.

Une condition préalable commune pour que les systèmes modèles soient capables de récapituler l’inflammation, la néovascularisation et l’hypercellularité est la présence sélective de populations cellulaires qui pilotent ces processus²⁴. Pour les processus inflammatoires, ces populations comprennent les neutrophiles, les lymphocytes T et les macrophages, tandis que les cellules endothéliales et les péricytes seraient nécessaires pour étudier la néovascularisation 25,26,27,28,29. Les fibroblastes tendineux sont non seulement vitaux pour la réparation des tendons mais, en tant que cellules prolifératives et migratrices, ils sont également partiellement responsables de l’hypercellularité locale observée dans les maladies tendineuses 30,31,32,33,34,35,36.

Outre les changements dans les populations cellulaires résidentes, la composition de la matrice tendineuse est également modifiée dans les maladies et les lésions tendineuses 7,37,38,39,40. Pour présenter les bons signaux microenvironnementaux pertinents pour la maladie, les systèmes modèles devraient être capables d’intégrer une composition matricielle extracellulaire adaptée au stade de la maladie ou de la lésion ciblée, par exemple, en permettant des combinaisons proportionnelles pertinentes de collagène-1, de collagène-3 et de fibronectine^{cellulaire 41}.

La compartimentation des tendons sains dans le noyau tendineux et les compartiments extrinsèques (c’est-à-dire endoténon, épiténon et paraténon) est essentielle à leur fonction et souvent perturbée dans les tendons malades ou blessés 1,42,43,44,45,46,47 . L’intégration de la compartimentation tendineuse 3D dans les systèmes modèles tendineux est donc non seulement nécessaire pour simuler plus étroitement les processus sous-jacents à la décompartimentation et à la recompartimentation, mais aide également à établir les gradients spatio-temporels corrects des cytokines et des nutriments^48,49.

Enfin, la modularité est un autre atout central des systèmes modèles, permettant aux chercheurs de combiner la contribution relative correcte et l’interaction entre les facteurs de stress décrits précédemment au cours des processus étudiés ^8,17.

Outre la sélection des modalités d’entrée optimales, une étape importante consiste à être capable de mesurer, d’observer et de suivre les changements dans la sortie résultante. Les propriétés mécaniques du système modèle (c’est-à-dire la longueur de la région des orteils, le module d’élasticité linéaire, la déformation de traction maximale, la contrainte de traction maximale, la résistance à la fatigue et la relaxation des contraintes) sont centrales ici, car elles caractérisent la fonction principale du tendon 50,51,52. Pour relier ces changements fonctionnels aux changements au niveau des tissus, il est important de mettre en place des méthodes de détection des dommages structurels à la matrice (collagène) et de suivre la prolifération et le recrutement de populations cellulaires pertinentes pour la maladie et la réparation 30,53,54,55,56,57,58,59,60.

Pour étudier l’interaction intercalaire émergente entre cellules et entre cellules et cellules, il faut être en mesure d’isoler ou de marquer des protéines en quantités adéquates pour la quantification (c.-à-d. ELISA, protéomique, immunohistochimie, cytométrie en flux)14,21,61,62. L’analyse de l’expression génique spécifique à la population ou au moins au compartiment devrait également être possible (c.-à-d. tri cellulaire activé par fluorescence [FACS], séquençage de l’ARN unicellulaire/en vrac et réaction en chaîne par polymérase quantitative en temps réel (RT-qPCR)⁾21,24,27,63. Le système de modèle doit permettre de mesurer autant de paramètres de sortie susmentionnés sur le même échantillon et sur plusieurs échantillons d’une manière suffisamment rapide pour débloquer des études à haut débit.

Parmi les systèmes modèles actuellement disponibles pour étudier les maladies et les blessures des tendons humains, le corps humain lui-même est, bien sûr, le plus représentatif. C’est aussi le moins compatible avec une intervention expérimentale. Alors que les patients souffrant de lésions tendineuses aiguës sont abondamment disponibles pour des études cliniques, les patients atteints de tendinopathie précoce (la maladie tendineuse la plus courante) sont en grande partie asymptomatiques et ne sont souvent pas détectés cliniquement jusqu’à ce que des changements plus graves se manifestent 14,64,65. Il est donc difficile de déterminer le moment critique où l’homéostasie tendineuse déraille et les mécanismes à l’origine de ce déraillement 16,66,67,68,69. De plus, l’extraction de biopsies de tendons sains est un défi éthique, car elle peut entraîner des dommages persistants. Les restes de tendon des ischio-jambiers provenant d’une chirurgie de reconstruction du ligament croisé antérieur sont souvent utilisés comme témoins sains, mais diffèrent sans doute par leur fonction, leurs propriétés mécaniques, leurs populations cellulaires et la composition de la matrice par rapport à la coiffe des rotateurs, au tendon d’Achille et aux tendons rotuliens couramment touchés par les maladies et les blessures tendineuses 70,71,72,73.

Les modèles animaux in vivo sont plus accessibles et plus faciles à utiliser, mais leur utilisation impose un fardeau éthique important aux animaux et un coût économique aux chercheurs. De plus, la plupart des animaux modèles populaires ne développent pas spontanément de lésions tendinopathiques (c’est-à-dire les rats, les souris, les lapins) ou n’ont pas les amorces et les souches génétiquement modifiées nécessaires pour suivre les voies de communication multicellulaires impliquées (c’est-à-dire les chevaux, les lapins).

Les systèmes de modèles in vitro 2D simples se situent de l’autre côté du spectre de la complexité/traçabilité et permettent une étude contrôlée et rapide de voies de communication intercellulaires spécifiques en réponse à un ensemble de déclencheurs plus contrôlables ^8,74. Cependant, ces systèmes simplifiés ne parviennent généralement pas à récapituler la charge mécanique multidimensionnelle (c’est-à-dire la traction, la compression et le cisaillement) qui est au cœur de la fonctionnalité des tendons. De plus, les rigidités (trop) élevées du plastique de culture tissulaire ont tendance à l’emporter sur les signaux matriciels fournis par les revêtements destinés à imiter l’état pathologique d’intérêt^75,76.

Pour surmonter cet inconvénient, des systèmes de modèles 3D d’ingénierie tissulaire de plus en plus sophistiqués ont été développés pour fournir une matrice chargeable dont la composition peut au moins être partiellement adaptée à l’état pathologique souhaité 77,78,79. Pourtant, ces systèmes ont non seulement du mal à reproduire avec précision les compositions complexes de la matrice extracellulaire in vivo et les modèles de charge cellulaire, mais manquent généralement de chargeabilité à long terme et d’interfaces compartimentales nécessaires pour étudier les voies de communication intercompartimentales qui coordonnent la réparation des maladies et des lésions tendineuses 48,49,80.

Les systèmes de modèles d’explants de tendons ex vivo présentent l’avantage distinct d’une composition matricielle intégrée de type in vivo qui comprend des niches péricellulaires, des barrières intercompartimentales, ainsi que des gradients spatio-temporels de cytokines/nutriments et récapitule des schémas de charge complexes lorsqu’ils sont étirés⁸. En raison des limites de diffusion des nutriments en fonction de la taille, les explants provenant de modèles animaux plus grands (c.-à-d. les chevaux) sont difficiles à maintenir en vie pour l’étude à long terme des maladies tendineuses et de la réparation des blessures 81,82,83. Pendant ce temps, les petits explants d’espèces murines (c’est-à-dire le tendon d’Achille, le tendon rotulien) sont difficiles à serrer et à charger mécaniquement de manière reproductible. Leur taille limite également la quantité de matériel qui peut être collectée pour les lectures au niveau des cellules, des protéines et des gènes sans regrouper les échantillons et diminuer le débit. En ce sens, les faisceaux tendineux de la queue murine offrent le potentiel de débloquer l’étude à haut débit des maladies tendineuses et de la réparation des blessures, car ils sont facilement disponibles en grande quantité à partir d’une seule souris, préservent la composition complexe de la matrice péricellulaire in vivo et récapitulent les modèles de charge cellulaire. Au cours du processus d’extraction, cependant, ils perdent la majeure partie de leur compartiment extrinsèque et les populations vasculaires, immunitaires et fibroblastiques qui sont maintenant considérées comme à l’origine des maladies tendineuses et de la réparation ^8,18.

Pour combler cette lacune, un système modèle combinant les avantages des explants de noyau dérivés du tendon de la queue murine avec les avantages des systèmes de modèles 3D à base d’hydrogel a été développé. Ce système modèle consiste en un hydrogel chargé de cellules (collagène-1) moulé autour des explants du tendon de la queue^84,85. Dans cet article, les étapes de fabrication nécessaires sont fournies en détail ainsi que des lectures utiles qui peuvent être obtenues en co-cultivant des explants de noyau (compartiment intrinsèque) dans un hydrogel de collagène de type 1 chargé de cellules endothéliales (compartiment extrinsèque).

Protocole

Toutes les méthodes décrites ici ont été approuvées par les autorités compétentes (numéros de licence du canton de Zurich ZH104-18 et ZH058-21). Une vue d’ensemble est présentée à la figure 1.

1. Isolement des composants assembloïdes tendineux de souris âgées de 12 à 15 semaines (c.-à-d. B6/J-Rj)

1. Euthanasier les souris par asphyxie induite par le gaz_CO2 . Pour maximiser le rendement, ne traitez pas plus de 3 souris à la fois et procédez à l’isolement cellulaire immédiatement après l’euthanasie.
2. Assurer la mort par induction bilatérale du pneumothorax.
3. Stérilisez la peau de la souris avec de l’éthanol à 80 % et déplacez la souris vers une cagoule de biosécurité stérile.
4. Isoler les explants du noyau du tendon de la queue.
   1. Utilisez un scalpel (n° 21) pour séparer la queue de la souris en la coupant à sa base.
   2. En commençant par le bout de la queue, saisissez-la avec la pince à épiler et remuez-la pour casser la peau. Ensuite, retirez doucement la pince à épiler de la queue pour exposer les explants du noyau du tendon.
   3. Placer les explants du noyau tendineux dans le milieu de culture standard (DMEM/F12 + 10 % FBS + 1 % pénicilline/streptomycine + 1 % amphotéricine + 1 % d’acides aminés non essentiels) et les séparer de la partie de la queue arrachée à l’aide d’une lame de scalpel fraîche (n° 21).
   4. Répétez les étapes 1.4.2. et 1.4.3. jusqu’à ce que toute la queue soit traitée et que les explants tendineux deviennent plus courts que 25 mm.
   5. Coupez les explants isolés en morceaux de 25 mm de long à l’aide d’une nouvelle lame de scalpel (n° 21).
   6. Mesurez le diamètre moyen des explants de carottes avec un microscope optique connecté à un logiciel d’analyse d’images via une caméra numérique à monture C amovible.
      1. Utilisez pointer-cliquer pour sélectionner l’outil de mesure de ligne sur le côté droit.
      2. Mesurez le diamètre de l’explant à trois endroits différents et calculez leur diamètre moyen.
      3. Pour faciliter le serrage et les essais mécaniques ultérieurs, ne procéder qu’avec des explants de carottes d’un diamètre moyen supérieur à 100 μm.
   7. Le déchargement combiné à l’exposition à des conditions de culture standard (37 °C, 20 %_O2, supplémentation sérique) modifie l’expression des gènes dans les 6 heures suivant l’isolement et entraîne une dégradation dans les 7 jours²¹. Pour commencer avec un état quasi-homéostatique, produisez les assembloïdes tendineux et commencez les expériences immédiatement après l’isolement du noyau tendineux.
   8. Selon la configuration expérimentale, des explants de noyau de tendon dévitalisés sont nécessaires comme groupe témoin. Pour dévitaliser les explants de noyaux tendineux, congelez-les dans un petit récipient rempli d’azote liquide pendant 5 s à l’aide d’une pince à épiler, puis décongelez-les pendant 5 s à température ambiante (RT). Répétez ce cycle de gel-dégel 3 fois et passez à l’étape 4 (« Serrage des explants du noyau »).
      ATTENTION : L’azote liquide peut provoquer des brûlures par le froid, l’asphyxie et fragiliser de nombreux matériaux ordinaires. N’utilisez que des contenants conçus pour les liquides à basse température et portez des vêtements de protection (c.-à-d. écran facial, gants appropriés, chaussures fermées).
5. Isolez les fibroblastes tendineux.
   1. Utilisez un scalpel (n° 21) pour faire une incision transversale au milieu du pied de la souris. Faites deux coupes perpendiculaires au pied le long des côtés des pattes arrière et jusqu’aux hanches à partir de chaque extrémité de cette incision.
   2. Utilisez la pince à épiler pour fixer le rabat de peau découpé au pied et décoller la peau recouvrant les muscles du mollet. Lorsque vous isolez les cellules endothéliales de la même souris, retirez toute la peau à la place.
   3. Séparez le tendon d’Achille de l’os du calcanéum avec une nouvelle lame de scalpel (n° 21). Fixez l’extrémité libre du tendon d’Achille avec la pince à épiler et séparez l’autre extrémité du muscle gastrocnémien.
   4. Lavez le tendon d’Achille une fois dans PBS et utilisez le scalpel (n° 21) pour retirer tout le tissu musculaire restant jusqu’à ce qu’il ne reste que le tissu tendineux blanc. Si les cellules endothéliales sont isolées de la même souris, laissez le tendon d’Achille dans le PBS et passez à l’étape 1.6. premier.
   5. Mettez en commun les tendons d’Achille d’un animal dans un tube en plastique de 15 mL contenant 10 mL de milieu de digestion tendineux (DMEM/F12 + 1 % de pénicilline/streptomycine + 1 % d’amphotéricine + 2 mg/mL de collagénase 1) et digérez pendant 6 à 8 h à 37 °C sous une agitation lente et constante à l’aide d’un agitateur orbital à basse vitesse à 15 tr/min.
   6. Centrifuger la solution tendineuse digérée à 500 x g pendant 5 min à RT, aspirer le surnageant et remettre en suspension dans 8 mL de milieu de culture standard (DMEM/F12 + 10 % FBS + 1 % pénicilline/streptomycine + 1 % amphotéricine + 1 % d’acides aminés non essentiels) et culture dans un ballon de culture T25 dans des conditions de culture standard (37 °C, 20 % O₂) pendant 7 jours sans changement de milieu. Après cela, changez de support une fois par semaine.
   7. Diviser les cellules à 80 % de confluence dans une fiole de culture T150 (1:6). Congeler les cellules au passage 2 dans 2 mL de milieu de congélation filtré stérile (70 % DMEM/F12 + 20 % FBS + 10 % DMSO) répartis dans deux cryotubes de 1,5 mL et les conserver à -80 °C jusqu’à nouvel ordre. Utilisez de la trypsine pour retirer les cellules du plastique de culture tissulaire.
6. Isolez les cellules endothéliales d’origine musculaire.
   1. Si les fibroblastes tendineux ne sont pas isolés de la même souris, commencez par les étapes 1.5.1 et 1.5.2.
   2. Utilisez des ciseaux pour séparer les pattes arrière du corps en coupant au niveau de l’articulation de la hanche.
   3. Lavez les pattes arrière une fois dans du PBS froid (~ 4 °C), retirez les muscles (quadriceps fémoral, long extenseur des doigts, soléaire et gastrocnémien) avec un scalpel (n° 21) et placez les muscles dans une boîte de Pétri sur de la glace.
   4. Utilisez une lame de scalpel fraîche (n° 21) pour émincer le tissu musculaire en morceaux de moins de 1 mm³ tout en gardant la boîte de Pétri sur de la glace.
   5. Regrouper le tissu musculaire haché des deux pattes arrière dans un tube en plastique de 50 mL contenant 12,5 mL de milieu de digestion musculaire (PBS + 2 mg/mL de collagénase IV + 2 mg/mL de dispase II + 2 mM de CaCl₂).
   6. Placez le tube en plastique dans un bain-marie à 37 °C pendant 10 min. Agitez vigoureusement la solution et remettez-la en place pendant 10 minutes supplémentaires. Répétez jusqu’à ce que la solution semble homogène et qu’il ne reste que des morceaux (blancs) de tendon et de fascia (environ 4 x 10 min). Pendant ce temps, continuez avec l’isolement des fibroblastes tendineux ou l’isolement des macrophages.
   7. Ajoutez 12,5 ml de PBS froid + 10 % de FBS dans le tube en plastique pour arrêter la digestion.
   8. Utilisez un porte-pipette à piles équipé d’une pipette de 50 ml pour aspirer la suspension du tube en plastique. Équipez le tube en plastique d’une crépine à cellules de 400 μm et filtrez la suspension pour éliminer les débris. Répétez le processus avec une crépine de 100 μm.
   9. Centrifuger la suspension filtrée à 400 x g pendant 5 min à RT. Remettre en suspension dans 10 mL de PBS froid + 10 % FBS et centrifuger à nouveau.
   10. Remettre en suspension dans 8 mL de milieu de culture endothélial (mélange 1:1 de DMEM/F12 et de la trousse d’endopan 3 + 10 U/mL d’héparine + 20 % de FBS + 1 % de pénicilline/streptomycine + 1 % d’amphotéricine + 30 mg/mL de supplément de croissance endothéliale) complété par de la puromycine (4 mg/mL) pour la sélection de la population.
   11. Ensemencer les cellules d’une souris dans une fiole de culture T25 préalablement enduite de 2 mL d’une solution de gélatine stérile à 0,2 % pendant 2 h à 37 °C, puis séchée pendant une nuit à RT après avoir retiré l’excédent de solution. Préparez les flacons la veille de l’isolement.
   12. Après 24 h dans des conditions de culture standard (37 °C, 20 % O₂), prélever le milieu de supplémentation en puromycine, laver les cellules fixées une fois avec du PBS et les cultiver dans 8 mL de milieu de culture endothélial.
   13. Passer les cellules 1:5 à 80 % de confluence dans des flacons recouverts de gélatine et les utiliser dans des expériences jusqu’à P2. Utilisez une solution de détachement cellulaire autre que la trypsine (Table des matières) pour retirer les cellules du plastique de culture tissulaire et ne les congelez pas.
7. Isoler les macrophages dérivés de la moelle osseuse.
   1. Si les fibroblastes tendineux ou les cellules endothéliales ne sont pas isolés de la même souris, effectuez d’abord les étapes 1.5.1, 1.5.2, 1.6.2 et 1.6.3.
   2. Après avoir enlevé la peau, le tendon et les tissus musculaires, lavez les os restants (fémur et tibia) une fois dans du PBS froid (~4 °C).
   3. Placer les os dans du PBS frais et froid (~4 °C) et utiliser un scalpel (n° 21) pour couper progressivement les épiphyses jusqu’à ce que la moelle osseuse soit exposée. Il apparaît sous la forme d’un point rouge des deux côtés de l’os.
   4. Équiper une seringue d’une aiguille d’injection de 0,4 mm x 25 mm (G27) et la remplir de 10 mL de milieu de culture de macrophages (DMEM/F12 + 10 % FBS + 1 % pénicilline/streptomycine + 1 % d’amphotéricine + 1 % d’acides aminés non essentiels).
   5. Tenir un os après l’autre au-dessus d’un tube en plastique de 50 mL, insérer l’aiguille d’injection à environ 1 mm de profondeur dans la moelle osseuse exposée sur le dessus et rincer la moelle osseuse en vidant la seringue. La moelle osseuse évacuée apparaît comme une structure en forme de tube rougeâtre lorsqu’elle est suspendue dans le milieu.
   6. Dissoudre la moelle osseuse en la pipetant doucement de haut en bas à plusieurs reprises à l’aide d’une pointe de pipette de 1 ml. Utilisez un porte-pipette à piles équipé d’une pipette de 50 ml pour filtrer la suspension cellulaire à travers une crépine de 100 μm dans le tube en plastique de 50 ml et centrifugez-la à 350 x g pendant 5 min à RT.
   7. Retirer le surnageant, remettre la pastille en suspension dans 10 mL de tampon de lyse des globules rouges (GR) et centrifuger à nouveau à 350 x g pendant 10 min à température ambiante.
   8. Remettre la pastille en suspension dans 5 mL de milieu de culture de macrophages (DMEM/F12 + 10 % FBS + 1 % pénicilline/streptomycine + 1 % d’amphotéricine + 1 % d’acides aminés non essentiels) et l’ensemencer dans des boîtes de Pétri non traitées d’un diamètre de 100 mm (5-8 x 10⁶ cellules par boîte).
   9. Après 4 h, ajouter 5 mL de milieu de culture de macrophages complété par 40 ng/mL de facteur de stimulation des colonies de macrophages (m-CSF) au milieu de culture cellulaire sans m-CSF (mélange 1:1) pour obtenir une concentration finale de 20 ng/mL de m-CSF.
   10. Après 6 jours, utilisez les cellules dans des expériences ou congelez-les jusqu’à nouvel ordre. Utilisez une solution de détachement cellulaire autre que la trypsine (Table des matières) pour retirer les cellules du plastique de culture tissulaire.
       REMARQUE : Une fois isolées, les cellules ne se dilatent plus. Les méthodes d’isolement cellulaire décrites ici fonctionnent également avec des souris et des rats en dehors de la tranche d’âge indiquée.
8. Pour vérifier le phénotype des populations cellulaires isolées par cytométrie en flux, passez à l’étape 6.3.4.

2. Isolement du collagène de rats Wistar ou Sprague-Dawley

1. Suivez le protocole d’isolement décrit en détail ailleurs⁸⁶. Il fonctionne également avec les souris, bien qu’avec un rendement beaucoup plus faible.
2. Déterminer la concentration de la solution obtenue avec un test d’hydroxyproline, évaluer la pureté avec SDS-page et stocker la solution à 4 °C jusqu’à son utilisation dans les expériences.

3. Production des composants du système de culture

1. Imprimez en 3D les supports de pince, la station de montage et les moules de la chambre.
   1. Chargez le fichier .stl joint (fichier supplémentaire 1) pour les supports de pince, la station de montage et les moules de la chambre dans le logiciel de tranchage. Pour adapter les numéros d’objet selon vos besoins, utilisez le pointer-cliquer pour sélectionner les objets et copiez-collez pour les multiplier.
   2. Appuyez sur Exporter le code G (Ctrl-R) pour générer le code G, puis exportez-le (Ctrl-G).
   3. Chargez le G-code dans une imprimante 3D.
   4. Utilisez des filaments non colorés et biocompatibles pour le processus d’impression (c’est-à-dire de l’acide polylactique).
   5. Coupez des filets de 3 mm dans les trous du support de pince qui portera les vis à l’aide d’un coupe-filet (Fichier supplémentaire 2 et Fichier supplémentaire 3, trous 1 et 3).
   6. Placez des goupilles en acier inoxydable dans le trou à l’arrière du support de pince (fichier supplémentaire 2 et fichier supplémentaire 3, trou 4).
   7. Stérilisez les supports de pince et la station de montage avec une lumière UV pendant au moins 1 h avant utilisation. Ne réutilisez pas les supports de pince imprimés en 3D.
   8. Vous pouvez également produire les supports de pinces et la station de montage avec du polyétherimide en utilisant les plans joints (fichier supplémentaire 2, fichier supplémentaire 3 et fichier supplémentaire 4), ce qui est plus coûteux mais permet de meilleures méthodes de stérilisation (c.-à-d. autoclavage) et une utilisation répétée.
2. Coulez les chambres à l’aide des moules imprimés en 3D.
   1. Remplissez les moules de la chambre avec du silicone.
   2. Dégazer le silicone dans une chambre à vide (90 mbar) pendant 30 min.
   3. Laisser polymériser la solution à RT pendant une nuit ou sur une plaque chauffante à 70 °C pendant 1 h, en fonction de la résistance à la chaleur des filaments utilisés pour les moules.
   4. Retirez délicatement les chambres polymérisées des moules et coupez le silicone superflu avec un scalpel (n° 21).
   5. FACULTATIF : Si les assemblages et, par conséquent, les chambres environnantes doivent être chargés mécaniquement, renforcer les trous dans les chambres en silicone avec des tubes creux en acier inoxydable.
3. Usinez les pinces métalliques en acier inoxydable à l’aide du plan ci-joint (fichier supplémentaire 5).
4. Avant chaque utilisation, lavez les pinces en acier inoxydable, les supports de pinces en polyétherimide, les vis et la chambre en silicone.
   1. Sonicate pendant 10 min dans de l’éthanol à 80 % (EtOH) et de l’eau osmosée à 20 % (ROW).
   2. Sonicate pendant 10 min dans 50% d’EtOH et 50% d’Isopropanol.
   3. Rincer 3x avec ROW.
   4. Sonicate pendant 10 min dans un concentré de nettoyage alcalin à 0,5 % (c.-à-d. 3 mL dans 600 mL de ROW).
   5. Sonicate pendant 10 min dans un concentré de nettoyage alcalin à 0,5 %.
   6. Laisser agir le concentré de nettoyage alcalin à 0,5% en agitant pendant 1 h 50 min.
   7. Rincer 3x avec ROW.
   8. Sonicate pendant 10 min d’emboîtement.
   9. Séchez les composants à l’air libre et autoclavez-les.

4. Serrage des explants du noyau

1. Placez les supports de pince assortis avec une pince métallique chacun dans la station de montage.
2. Placez des morceaux de papier autoclave humide (4 mm x 25 mm) sur les pinces métalliques, puis coupez le papier le long des bords intérieurs des pinces avec un scalpel (n° 21). Découpez 2 autres morceaux de papier plus petits (4 mm x 1,5 mm) d’un autre morceau de papier et gardez-les humides.
3. À l’aide d’une pince à épiler pointue, placez 8 explants de carottes sur le papier entre les pinces métalliques avec leurs extrémités sur les pinces métalliques.
4. Couvrez les extrémités des explants de carottes avec les petits morceaux de papier préparés (4 mm x 1,5 mm), puis placez des pinces métalliques dessus. Utilisez un tournevis et les petites vis (M3 x 6 mm) pour fixer les explants du noyau entre les pinces métalliques et le support de pince.
5. Transférez soigneusement les explants du noyau clampé dans les chambres de culture en silicone et remplissez ces chambres avec 2 mL de milieu de culture cellulaire standard (DMEM/F12 + 10 % FBS + 1 % pénicilline/streptomycine + 1 % d’amphotéricine + 1 % d’acides aminés non essentiels).
6. FACULTATIF : Si les assemblages/chambres environnantes doivent être chargés mécaniquement, fixez-les avec des vis supplémentaires (M3 x 16 mm) dans le trou 3 (Fichier supplémentaire 2 et Fichier supplémentaire 3, trou 3).

5. Préparation et coulée d’hydrogel de collagène

1. Retirer les cellules cibles du plastique de culture tissulaire avec la solution de détachement cellulaire, les centrifuger à 400 x g pendant 5 min à RT et les remettre en suspension dans 1 mL de milieu de culture standard.
2. Pour un assembloïde, 10 μL de PBS (20x), 1,28 μL de 1 M de NaOH (125x), 8,72 μL d’eau doublement distillée (ddH₂O, 23x), 80 μL de collagène-1 (2,5x ou 1,6 mg/mL final) et 100 μL (2x) de milieu de culture standard (pour les assembloïdes à noyau // acellulaires) ou de suspension cellulaire sont nécessaires. Préparez ces composants dans deux solutions distinctes et mélangez-les uniquement immédiatement avant la coulée.
   1. Solution de réticulation : Regrouper le PBS, le NaOH, le ddH₂0 et la suspension cellulaire de jusqu’à 12 assembloïdes (+marge de sécurité de 10 %) dans une solution de réticulation et la conserver dans un tube en plastique de 15 mL sur de la glace. Ajustez la concentration de la suspension cellulaire pour obtenir les concentrations finales suivantes après avoir mélangé les deux solutions : 250 000 cellules/mL de fibroblastes tendineux, 500 000 cellules/mL de cellules endothéliales dérivées de muscles ou 370 000 cellules/mL de macrophages dérivés de la moelle osseuse.
   2. Solution de collagène-1 : Regrouper la solution de collagène-1 nécessaire pour un maximum de 12 assembloïdes (+marge de sécurité de 10 %) dans un autre tube en plastique de 15 ml et la conserver sur de la glace.
3. Une fois que la solution de réticulation et la solution de collagène-1 sont prêtes sur la glace, aspirer le milieu de culture cellulaire des chambres de culture contenant les explants à noyau serré.
4. Ajoutez la solution de collagène-1 à la solution de réticulation avec une pipette de 1000 μL et mélangez les deux solutions en pipetant rapidement de haut en bas sans créer de bulles. Couvrir les explants de chaque noyau tendineux avec 200 μL de solution mélangée en les pipetant dans les rainures prévues par les chambres en silicone.
5. Laissez les hydrogels polymériser pendant 50 min à 37 °C.
6. Remplissez soigneusement les chambres de culture en silicone avec 1,5 ml du milieu de co-culture respectif en le pipetant dans les coins des chambres.
   1. Pour la co-culture de fibroblastes de base/fibroblastes, remplissez DMEM/F12, 10 % FBS, 1 % d’acides aminés non essentiels, 1 % de pénicilline/streptomycine, 1 % d’amphotéricine, 200 μM d’acide L-ascorbique, 20 ng/mL de facteur de stimulation des colonies de macrophages.
   2. Pour la co-culture de carottes // macrophages, remplir DMEM/F12, 10 % FBS, 1 % d’acides aminés non essentiels, 1 % de pénicilline/streptomycine, 1 % d’amphotéricine, 200 μM d’acide L-ascorbique, 20 ng/mL de facteur de stimulation des colonies de macrophages.
   3. Pour la co-culture de cellules endothéliales de base, remplissez le mélange 1:1 de DMEM/F12 et le kit endopan 3 + 10 U/mL d’héparine + 20 % de FBS + 1 % de pénicilline/streptomycine + 1 % d’amphotéricine + 30 mg/mL de supplément de croissance endothéliale.
7. Cultivez les assembloïdes dans les conditions de culture appropriées à l’hypothèse. Pour imiter un environnement de niche semblable à une lésion, par exemple, cultivez-les à 37 °C et 20 %_O2. Changez le milieu de culture deux fois en 1 semaine. Pour prévenir les infections, placez les chambres dans une grande boîte de Pétri ou une boîte stérile avant de les mettre dans un incubateur.
   REMARQUE : Le temps de culture dépend de l’hypothèse et de la configuration de la co-culture. Par exemple, les assembloïdes de fibroblastes dans un environnement de niche semblable à une lésion deviennent mécaniquement instables après environ 3 semaines.

6. Méthodes de lecture disponibles

1. Effectuer une microscopie à fluorescence, y compris des tests de viabilité et de morphologie.
   1. En général, les assembloïdes peuvent être imagés comme des montages complets. Pour ce faire, retirez les assemblages des pinces en les coupant avec des ciseaux près des pinces et en les transférant sur une plaque à 12 puits.
   2. Lavez les assembloïdes une fois avec du PBS.
   3. Si une analyse de viabilité est effectuée, colorer chaque assembloïde avec 100 μL d’homodimère d’éthidium 4 x 10⁻⁶ M dans du PBS (EthD-1) pendant 20 min à 37 °C dans l’obscurité.
   4. Lavez les assembloïdes 3 fois avec du PBS, puis fixez-les avec 500 μL de formaldéhyde à 4 % chacun pendant 20 min à RT.
      ATTENTION : Le formaldéhyde à 4 % a des effets allergènes, cancérigènes et mutagènes, est toxique pour la reproduction et peut causer une toxicité pour le développement (reprotoxicité) ou des dommages aux organes. Portez des vêtements et des gants de protection, des lunettes de protection et un masque ou une autre protection respiratoire.
   5. Lavez les assembloïdes 3x avec du PBS et continuez avec le protocole de coloration de votre choix. Une sélection de taches a été décrite précédemment^84,85.
      REMARQUE : Évitez les colorations qui utilisent des fluorophores dont la longueur d’onde d’émission est proche de celle de l’autofluorescence du collagène (environ 480 nm).
2. Selon les instructions du fabricant, effectuez l’isolement de l’ARN spécifique au compartiment pour la RT-qPCR ou le séquençage de l’ARN à l’échelle du génome.
   1. Retirez les assemblages des pinces avec des ciseaux.
   2. FACULTATIF : Utilisez une pince à épiler pour séparer les explants du noyau du compartiment d’hydrogel extrinsèque.
   3. Pool 20-24 explants de 20 mm ou 2 hydrogels de collagène chargés de cellules pour isoler des quantités suffisantes d’ARN.
   4. Utilisez 1 mL de trizol froid et de perturbation mécanique (c’est-à-dire des billes métalliques ou un broyage cryogénique) pour détruire la matrice extracellulaire des explants de noyau ou des hydrogels de collagène regroupés.
      ATTENTION : Toxicité orale, cutanée et par inhalation. Provoque une irritation de la peau et des yeux. Ne manipulez qu’avec des gants et dans une enceinte de sécurité chimique.
   5. Poursuivre l’isolement de l’ARN du lysat cellulaire à l’aide de trousses d’extraction d’ARN standard décrites précédemment ou décrites dans les instructions du fabricant^84,85.
3. Cytométrie en flux spécifique au compartiment.
   1. Retirez les assemblages des pinces avec des ciseaux.
   2. FACULTATIF : Utilisez la pince à épiler pour séparer les explants du noyau du compartiment d’hydrogel extrinsèque.
   3. Digérer les compartiments dans 1 mL de PBS avec la collagénase I (3 mg/mL) et la dispase II (4 mg/mL) pendant 4 h à 37 °C sous agitation constante.
   4. Centrifuger la solution digérée à 500 x g pendant 5 min à RT et aspirer le surnageant.
   5. Remettre la pastille en suspension dans 100 μL de tampon FACS (1 % FBS dans PBS) contenant les anticorps conjugués au fluorophore de votre choix. Une sélection d’anticorps conjugués aux fluorophores fonctionnels a été décrite précédemment^84,85.
   6. Incuber la solution de coloration pendant 30 min à RT.
   7. Diluer la solution de coloration avec 1,4 mL de tampon FACS et la centrifuger pendant 5 min à 500 x g à RT.
   8. Remettre la pastille en suspension dans 350 μL de tampon FACS et filtrer la solution à travers un capuchon de crépine en maille de nylon de 100 μm avant de l’analyser avec le cytomètre en flux de votre choix selon les instructions du fabricant.
4. Analysez le surnageant.
   1. Remplacer le milieu de coculture par un milieu de coculture sans sérum 3 jours avant le prélèvement surnageant.
   2. Effectuez une analyse immédiate et différée du surnageant enrichi et non dilué avec des kits de test immuno-enzymatique (ELISA) et de découverte à méso-échelle (MSD). Pour l’analyse retardée, conserver le surnageant dans des tubes en plastique de 1,5 mL à -80 °C.
5. Évaluer les propriétés mécaniques de l’assemblage.
   1. Utiliser un dispositif d’étirement sur mesure pour appliquer des forces mécaniques et mesurer les propriétés mécaniques²². Les goupilles en acier inoxydable et les vis en acier inoxydable permettent également de fixer les pinces à d’autres appareils d’étirement.
   2. Comme les propriétés mécaniques de l’assembloïde sont largement déterminées par celles de l’explant de noyau ^{intégré 18}, mesurez les propriétés mécaniques de l’explant de noyau avant de l’intégrer dans un hydrogel afin de réduire le risque de destruction de l’hydrogel fraîchement coulé dans le processus de mesure.

Discussion

Dans l’ensemble, le système de modèles assembloïdes présenté ici comporte plusieurs étapes critiques à souligner. Premièrement, la qualité du système modèle dépend de la qualité de ses composants. Il est essentiel de vérifier l’explant du noyau et les populations cellulaires à ensemencer au microscope avant de lancer le processus d’assemblage. Il est également important de vérifier le phénotype des populations cellulaires isolées au moins une fois par cytométrie en flux. En particulier lorsqu’un nouveau lot de collagène-1 est utilisé pour la première fois, il est avantageux de vérifier la vitesse de réticulation lors d’un essai avant d’y intégrer des cellules. L’assemblage assembloïde nécessite beaucoup de manutention manuelle, ce qui augmente le risque d’infections. Pour minimiser le risque d’infections, travaillez dans une cagoule de biosécurité stérile avec un flux d’air laminaire, changez souvent de gants et décontaminez les gants ainsi que l’espace de travail avec de l’éthanol à 80 %. Pour des raisons similaires, n’utilisez pas les porte-pinces imprimés en 3D plus d’une fois. Avant le processus d’enrobage lui-même, il est important de garder tous les composants de l’hydrogel (solution de réticulation, solution de collagène-1) sur de la glace pour éviter une réticulation prématurée. Par conséquent, il faut travailler rapidement une fois que les cellules sont ajoutées à la solution de réticulation pour limiter la mort cellulaire due au pH élevé et à la basse température de la solution de réticulation. Pour éviter la mort cellulaire liée au dessèchement dans l’explant de noyau, aspirez le milieu recouvrant les explants de noyau clampé immédiatement avant de mélanger la solution de réticulation avec la solution de collagène-1. Pour garantir le placement central de l’explant de noyau dans l’hydrogel, il est idéal de couler l’hydrogel autour d’un explant de noyau serré et légèrement tendu. Pour ce faire, utilisez la goujon et la vis à boulon M3 x 16 mm pour fixer les supports de serrage à un jeu de plaques (imprimées en 3D) avec des trous aux longueurs appropriées. Après le temps de polymérisation de 50 minutes, l’explant de noyau intégré peut être à nouveau détendu en fonction des conditions de culture souhaitées. La tension subie par l’assemblage pendant la culture a un impact profond sur les résultats expérimentaux et doit être maintenue uniforme entre les échantillons et les conditions²¹.

Néanmoins, l’impact important de la (dé)charge mécanique sur les résultats expérimentaux est un avantage majeur du modèle assembloïde par rapport à la plupart des alternatives d’ingénierie tissulaire, d’autant plus que la composition matricielle maintenue de l’explant central devrait également recréer les modèles complexes de charge in vivo au niveau cellulaire⁹⁰. Alors qu’en pratique, seules les mesures du module d’élasticité linéaire, de la déformation maximale en traction et de la contrainte de traction maximale des assembloïdes ont été démontrées jusqu’à présent, des protocoles de mesure de la résistance à la fatigue et de la relaxation des contraintes ont été décrits ailleurs pour les explants de noyau de tendon et devraient être applicables aux assembloïdes^91,92. En plus des modèles de chargement in vivo, la modularité à plusieurs niveaux de l’assembloïde est probablement son plus grand avantage. Grâce aux chambres de culture individuelles, un ensemble contrôlable de conditions de niche peut être réglé séparément pour chaque échantillon (c’est-à-dire la température, la tension en oxygène, la concentration de glucose, la supplémentation, les stimulateurs, les inhibiteurs et l’étirement statique avec une plaque). Ensuite, la rigidité de la matrice et la composition matricielle du compartiment extrinsèque sont personnalisables grâce à la composition de l’hydrogel et permettraient par exemple d’étudier l’impact d’un microenvironnement tissulaire de plus en plus malade en incorporant plus de collagène-3 et de fibronectine cellulaire 93,94,95. Les populations cellulaires évaluées dans le compartiment extrinsèque sont facilement adaptables en sélectionnant les cellules à ensemencer, mais peuvent également être modifiées dans l’explant du noyau tendineux en tirant parti des lignées cellulaires génétiquement modifiées établies et des lignées de souris (c’est-à-dire la déplétion cellulaire de ScxLin)⁹⁶. La composition matricielle et cellulaire différente des deux compartiments fournit en outre une structure 3D compartimentée unique qui est une autre caractéristique du tendon central ^1,30,46.

Lors de l’utilisation de ce système, il est important de considérer les conséquences de la modularité du système sur la granularité des paramètres de résultat. Bien que la prolifération et le recrutement cellulaires puissent être évalués séparément pour chaque compartiment, les propriétés mécaniques, les composants du sécrétome et les produits de dégradation ne sont actuellement mesurables que pour l’assembloïde complet. En ce qui concerne le débit, une personne correctement formée peut préparer jusqu’à 50 assemblages en une journée de travail normale, le principal goulot d’étranglement étant la procédure de serrage. Bien que certaines des méthodes de lecture s’excluent mutuellement, il est possible d’évaluer les propriétés mécaniques et les composants du sécrétome de manière répétitive sur le même échantillon, ainsi que la composition de la population cellulaire (cytométrie en flux), le transcriptome cellulaire (RT-qPCR, séquençage de l’ARN) ou la distribution de la matrice et des cellules (immunocytochimie/microscopie à fluorescence) aux points d’évaluation. Dans des publications antérieures, ces méthodes ont été déployées pour caractériser de manière approfondie les interactions intercellulaires et intercompartimentales dans les assembloïdes de cœur / fibroblaste et noyau // macrophage exposés à une niche de type lésionnel^84,85. Dans ce travail, la capacité du système modèle assembloïde à sonder l’interaction intercompartimentale entre les cellules endothéliales centrales et extrinsèques sous différents stimuli microenvironnementaux a été explorée.

La modularité du système de modèle permet d’affiner la méthode à l’avenir, ce qui est nécessaire pour surmonter les limitations suivantes de l’itération de conception actuelle. L’analyse cytométrique en flux présentée dans ce travail et les données de séquençage de l’ARN unicellulaire publiées récemment ont révélé que les populations de ténocytes résidents du noyau tendineux et de tendons d’Achille sont plus hétérogènes qu’on ne le pensait auparavant 24,34,59,84,97. De plus, le comportement migratoire des populations cellulaires initialement résidentes du noyau ou de l’hydrogel brouille la compartimentation assembloïde pendant la culture. Ces deux facteurs combinés rendent difficile l’attribution de différences transcriptomiques à des types cellulaires spécifiques et la séparation des processus basés sur la prolifération et la migration. Cette limitation pourrait être surmontée en affinant la population d’entrée avec le tri cellulaire activé par fluorescence (FACS) basé sur la composition cellulaire des tendons sains ou malades caractérisés dans des études in vivo récentes, en améliorant la lecture en mettant en œuvre le séquençage de l’ARN unicellulaire et en intégrant des marqueurs de prolifération tels qu’une coloration EdU (5-éthynyl-2'-désoxyuridine) pendant la microscopie.

Les assembloïdes présentés ici partagent également une faiblesse avec la plupart des systèmes in vitro actuellement disponibles qui simulent des organes malades déconnectés du reste du corps^98,99. Cependant, la plate-forme basée sur la chambre de culture utilisée ici positionne bien le système modèle pour l’intégration dans une plate-forme multi-organes où des assembloïdes imitant différents organes sont connectés et les interactions inter-organes peuvent être étudiées.

À la base, le système de modèle est basé sur la position des tendons de rongeurs, ce qui entraîne son propre ensemble unique d’inconvénients. Premièrement, la traduisibilité des résultats est entravée par le fait que les souris de type sauvage ne développent pas ou ne souffrent pas de maladies tendineuses ^8,100,101. L’intégration de tissus et de cellules d’humains ou de souches de souris nouvellement développées qui présentent des aspects de la maladie tendineuse pourrait atténuer ce problème¹⁰². Le passage à un assembloïde d’origine humaine est particulièrement intéressant, car il permettrait des études avec des tissus dérivés de patients provenant de tendons de différentes maladies (c’est-à-dire tendinite, tendinose ou péritendinite) et même des donneurs résistants au traitement qui pourraient débloquer des programmes de traitement plus personnalisés. Deuxièmement, les explants de tendon de la queue murine ne gèrent pas particulièrement bien les microdommages induits par la surcharge, ce qui limite l’applicabilité du système modèle pour l’étude des lésions tendineuses aiguës.

Pour toutes ces raisons, les assembloïdes explant // hydrogel sont dans une position privilégiée pour étudier la biologie du noyau tendineux, les interactions structure-fonction de la matrice et les interactions intercompartimentales entre des populations cellulaires spécifiques en réponse à des microdommages induits par des niches. Les informations recueillies à partir de ces études à haut débit pourraient orienter la recherche in vivo et le développement de traitements.

matériels

Name	Company	Catalog Number	Comments
0.4 mm x 25 mm injection needle (G27)	Sterican	9186174
3D printing filament: Clear polylactic acid prusament	Prusa	NA
4% formaldehyde	Roti-Histofix	P087.4
Accutase cell detachment solution	Sigma-Aldrich	A6964-100ML
Amphotericin	VWR	L0009-100
Attachable digital C-mount camera: Moticam 2	Motic	NA
Bolt screw M3 x 16 mm, stainless steel	RS PRO	1871235
Bolt screw M3 x 6 mm, stainless steel	RS PRO	1871207
CaCl2	Sigma-Aldrich	C5670
CD146 antibody: PE anti-mouse	BioLegend	134703
CD206 antibody: Alexa Fluor 488 anti-mouse	BioLegend	141709
CD31 antibody: Alexa Fluor 488 anti-mouse	BioLegend	102413
CD86 antibody: PE anti-mouse	BioLegend	105007
Collagenase I	Thermo Fisher Scientific	17100017
Collagenase IV	Gibco	17104-019
Dialyzed Fetal Bovine Serum (FBS)	Sigma-Aldrich	F0392-100ML
Dimethyl sulfoxide (DMSO)	Sigma-Aldrich	7000183
Dispase II	Sigma-Aldrich	D4693-1G
DMEM/F12	Sigma	7002211
Dowel Pin, 3 mm x 16 mm, stainless steel	Accu	HDP-3-16-A1
Dragon Skin 10 Slow/1 silicone	KauPO	09301-004-000001
Endopan 3 Kit	Pan-Biotech	P04-0010K
Endothelial cell growth supplement	Lonza	CC-3162
Eppendorf safe-lock plastic tubes (1.5 mL)	Eppendorf	30121023
Ethidium homodimer, EthD-1, 2 mM stock in DMSO	Sigma-Aldrich	46043-1MG-F
F4/80 antibody: Apc/fire 750 anti-mouse	BioLegend	123151
Falcon plastic tube (15 mL)	Corning	352096
Falcon plastic tube (50 mL)	Corning	352070
Flow cytometer: LSR II Fortessa	BD Bioscience	23-11617-02
Gelatin	Invitrogen	D12054
Hellmanex III alkaline cleaning concentrate	Sigma	Z805939-1EA
Heparin	Sigma-Aldrich	H3149-10KU
Hydroxyproline assay	Sigma-Aldrich	MAK008
Image analysis software: Motic Images Plus 3.0 ML	Motic	NA
L-Ascorbic Acid Phosphate Magnesium Salt n-Hydrate	Wako Chemicals	013-19641
LSE Low Speed Orbital Shaker	Corning	6780-FP
MEM non-essential amino acids	Sigma	7002231
Mouse macrophage-stimulating factor (m-CSF)	PeproTech	315-02-50ug
MSD assay	Mesoscale Discovery	various
NucBlue	Thermo Fisher Scientific	R37605
Nylon mesh strainer cap, 100 µm	Corning	734-2761
Original Prusa i3 MK3S 3D printer	Prusa	i3 MK3S
Penicillin-Streptomycin	Sigma-Aldrich	P4333
Phosphate-buffered saline (PBS), ph 7.4, sterile, 10 L	Gibco	10010001
Puromycin	Gibco	A1113803
RBC lysis buffer	VWR	786-650
recombinant m-CSF	PeproTech	315-02
RNA extraction kit: Rneasy plus Micro	Qiagen	74034
Slicing software: PrusaSlicer	Prusa	NA	Version 2.6.0 or higher
Sterile Cell Strainer 100 µm	Fisherbrand	22363549
Surgical scalpel blade No. 21	Swann-Morton	307
Trizol reagent	Thermo Fisher Scientific	15596018
Trypsin-EDTA (0.5 %)	Gibco	15400054