Après avoir effectué tous les tours et capturé des images fluorescentes des plantules d’Arabidopsis, ouvrez les données expérimentales dans le logiciel de l’analyseur. Pour générer un masque de tray, cliquez sur l’option Créer un nouveau type de tray. Choisissez ensuite un numéro d’image à l’arrondi et cliquez sur charger l’image dans la partie supérieure de l’écran.
Ensuite, pour entrer dans le nouveau mode de forme, cliquez sur l’un des boutons qui représentent différents outils de dessin de formes. Dessinez les zones d’intérêt sur l’image de la plaque. Choisissez les différents génotypes sur la plaque et donnez-leur des noms appropriés.
Cliquez sur Échap pour quitter le mode de forme. Cliquez ensuite sur stocker le type de plateau pour enregistrer le masque de plateau généré. Allez maintenant dans l’option de modification par type de bac et sélectionnez le masque généré.
Pour générer un masque végétal avec une grande précision, utilisez l’image acquise après 180 minutes de mesure Pour définir la valeur de seuil minimale pour l’intensité du signal fluorescent, supprimez la coche du seuil automatique. Définissez un seuil manuel à zéro et cliquez sur aperçu. Ensuite, choisissez le tour 91.
Cliquez sur Actualiser l’aperçu et vérifiez si le masque de matrice couvre tous les génotypes de l’image de plaque. Ajustez l’arrière-plan de l’image et utilisez les options de couleur pour mettre en surbrillance le masque de barre d’état sur l’image de la plaque. Cliquez sur exécuter, cochez uniquement sur le tour 91 et lancez l’analyse.
Une fois que le menu de fin apparaît à l’écran, choisissez le tour exécuté et cliquez sur Changer d’analyseur pour analyser les données afin d’exporter les données pour ce point temporel spécifique. Cliquez ensuite sur l’icône d’ouverture de la partie d’exportation pour extraire les fichiers de l’archive exportée. Dans le mode de réglage de l’analyse locale, cliquez sur Créer un nouveau type de plateau pour accéder au menu du générateur de masques.
Cliquez ensuite sur charger l’image et choisissez le quatrième tour. Dans le coin supérieur droit de l’écran, cliquez sur charger à partir d’un fichier et chargez le fichier XSEL. L’image de la plaque apparaît avec le masque de plateau appliqué.
Donnez un nom au masque végétal et cliquez sur le type de bac de stockage. Appliquez le masque végétal en sélectionnant son nom dans l’option de modification par type de plateau. Décochez ensuite le seuil automatique pour permettre la manipulation manuelle du seuil.
Dans le menu de prévisualisation, modifiez la valeur du seuil de faible à élevé jusqu’à ce que le masque végétal généré s’adapte parfaitement à la région d’intérêt dans chacun des génotypes. Choisissez ensuite le dernier tour pour vérifier si le masque correspond à tous les tours de mesures. Pour effectuer l’analyse de tous les cycles de mesure, cliquez sur exécuter, puis sur démarrer l’analyse.
Par rapport aux conditions de contrôle en présence de 6-benzylaminopurine, des différences notables ont été observées pendant la phase exponentielle de synthèse de la chlorophylle chez les plantules d’Arabidopsis de type sauvage.
