Pour obtenir une culture anaérobie de sol mélangé, enfoncez le carottier dans les sédiments du champ jusqu’à ce que le haut du cylindre de prélèvement d’échantillon soit rincé avec la surface du sédiment. Tournez le carottier à 90 degrés pour libérer le noyau et tirez vers le haut jusqu’à ce que l’échantillon soit extrait de l’environnement. Pour les sédiments meubles, couvrez la base du carottier avec une nouvelle main gantée de nitrile pour éviter que l’échantillon ne tombe ou ne se dissémine dans l’eau lors de l’extraction.
Approchez rapidement à l’œil nu de six à sept centimètres de la base du noyau et coupez-le pour séparer le fond. Transférez immédiatement le fond du noyau dans une bouteille de culture, en minimisant autant que possible l’exposition à l’atmosphère aérobie. Après le transfert, repositionnez immédiatement le bouchon et maintenez-le en place avec le bouchon à vis.
Gardez l’échantillon au frais et réfrigérez le flacon de prélèvement à quatre degrés Celsius à votre retour au laboratoire.
