Criblage de modification des histones par chromatographie liquide, spectrométrie de mobilité des ions piégés et spectrométrie de masse à temps de vol

Une méthode est proposée utilisant un protocole d’extraction d’histones avec une efficacité de 95 %. Avec LC-TIMS-ToF MS/MS, en peu de temps, il est possible d’obtenir un dépistage des PTM présents dans l’histone. Et surtout, la possibilité de séparer les isomères.

La séparation des peptides isomères, bien que possible en utilisant uniquement la spectrométrie de masse en tandem, est souvent difficile. En incorporant TIMS, nous introduisons une dimension supplémentaire de séparation, simplifiant de nombreuses identifications d’isomères de position. De plus, la technologie passive augmente la sensibilité de ces expériences, améliorant encore notre capacité à analyser les variations épigénétiques.

Avec la capacité accrue d’identifier les positions PTM, il est possible de déterminer davantage la corrélation entre divers facteurs environnementaux ou biologiques et leurs effets sur l’épigénome. Les méthodes qui améliorent et facilitent l’analyse des histones peuvent être appliquées à plusieurs domaines de recherche, notamment la chimie médicale et environnementale. La dynamique de confirmation des protéines dans les états natifs ou endommagés sera établie à partir de la mise en œuvre de TIMS MS/MS avec HDX.

Grâce à la méthode LC-TIMS-ToF MS/MS et à la nano SM/MS LC-TIMS-ToF, les différences de PTM existant dans divers échantillons biologiques seront cartographiées.