10.5 : Termination of Translation

לתת-היחידה הריבוזומלית הגדולה יש כמה מבנים חשובים החיוניים לתרגום. אלה כוללים את מרכז העברת הפפטידיל (PTC) - שהוא האתר שבו נוצר הקשר הפפטידי - וצינור גדול, פנימי, מלא מים שדרכו נע הפוליפפטיד המתהווה. מבנה אחרון זה נקרא מנהרת היציאה הפפטידית, והוא מתחיל ב-PTC ומשתרע על פני הגוף של תת-היחידה הריבוזומלית הגדולה. במהלך התרגום, כאשר שרשרת הפוליפפטיד המתהווה מסונתזת, היא עוברת דרך מנהרת היציאה הפפטידית. לאחר מכן הוא יוצא החוצה בצד הממס, שם שרשרת הפפטיד מקופלת לאחר מכן לחלבון.

מנהרה זו הנוצרת על ידי RNA ריבוזומלי 23S יוצרת משטח הידרופילי גדול, המכיל טלאים הידרופוביים זעירים. ממדי המנהרה (כ-10 ננומטר ×-1.5 ננומטר) יכולים להכיל שרשראות פוליפפטידים גדלות ולא מובנות, כמו גם מולקולות ממס. פנים מנהרת היציאה הפפטידית אינו משלים לשום פפטיד . לפיכך, שרשרת הפוליפפטיד אינה "נדבקת" לקירות ויכולה בקלות להחליק דרכה. ברגע שהוא מגיע למיקום במנהרת היציאה שבו יש מספיק מקום, שרשרת הפפטיד המתהווה מתחילה להתקפל ועשויה ליצור בהצלחה כמה אזורים סליליים α. עם זאת, רוב קיפול החלבונים מתרחש ברגע שהפוליפפטיד יוצא מהריבוזום.