כימות של זנים במודל חזירי של הרחבת עור באמצעות סטריאו Multi-הצגת Isogeometric קינמטיקה

Summary

פרוטוקול זה משתמש סטריאו רב במטרה ליצור מודלים תלת-מימדיים (3D) מתוך רצפים לא מכוילים של תמונות, מה שהופך אותו במחיר סביר מתכווננת להגדרה כירורגי. מפות זנים בין מודלי 3D הן לכמת עם קינמטיקה isogeometric המבוסס שגם, אשר להקל ייצוג של משטחים חלקים מעל המשתלב גס שיתוף הזהה parameterization.

Abstract

Tissue expansion is a popular technique in plastic and reconstructive surgery that grows skin in vivo for correction of large defects such as burns and giant congenital nevi. Despite its widespread use, planning and executing an expansion protocol is challenging due to the difficulty in measuring the deformation imposed at each inflation step and over the length of the procedure. Quantifying the deformation fields is crucial, as the distribution of stretch over time determines the rate and amount of skin grown at the end of the treatment. In this manuscript, we present a method to study tissue expansion in order to gain quantitative knowledge of the deformations induced during an expansion process. This experimental protocol incorporates multi-view stereo and isogeometric kinematic analysis in a porcine model of tissue expansion. Multi-view stereo allows three-dimensional geometric reconstruction from uncalibrated sequences of images. The isogeometric kinematic analysis uses splines to describe the regional deformations between smooth surfaces with few mesh points. Our protocol has the potential to bridge the gap between basic scientific inquiry regarding the mechanics of skin expansion and the clinical setting. Eventually, we expect that the knowledge gained with our methodology will enable treatment planning using computational simulations of skin deformation in a personalized manner.

Introduction

הרחבת רקמות היא טכניקה נפוצה לכירורגיה פלסטית ושיחזור כירורגיה שצומחת עור in vivo לתיקון פגמים בעור גדול ^1. נוימן, ב 1957, היה המנתח הראשון לתעד הליך זה. הוא מושתל בלון מתחת לעור של מטופל מנופח אותו בהדרגה על פני תקופה של מספר שבועות לצמוח רקמה חדשה, ואף להשפיע אוזן ^2. העור, כמו רוב רקמות ביולוגיות, מסתגל הכוחות המופעלים דפורמציות כדי להגיע הומאוסטזיס מכני. כאשר נמתח מעבר למשטר הפיזיולוגי, עור גדל ^{3, 4.} אחד היתרונות המרכזיים של הרחבת רקמות הוא הייצור של עור עם כלי דם תקינים אותה נושאת השיער, תכונות מכאניות, צבע וטקסטורה כמו הרקמה שמסביב ^5.

לאחר השקתו לפני שישה עשורים, expansio העורn אומצה באופן נרחב על ידי פלסטיק ומנתחים שיקומיים, והוא משמש כיום לתקן כוויות, מומים מולדים גדולים, ועל שחזור שד לאחר כריתת שד ^{6, 7.} עם זאת, למרות השימוש בו נפוץ, נהלי התרחבות עור עלולים לגרום לסיבוכים ^8. זה נובע בחלקו מחוסר ראיות מספיקות כמותית צורך להבין את mechanobiology היסוד של ההליך ועל מנת להנחות את המנתח במהלך התכנון לפני הניתוח ^{9, 10.} פרמטרים עיקריים בטכניקה זו הם בשיעור המילוי, מילוי נפח לכל אינפלציה, הבחירה של הצורה והגודל של ההרחבה, ואת המיקום של המכשיר ^{11, 12.} תכנון לפני ניתוח נוכחי מסתמך במידה רבה על הניסיון של הרופא, וכתוצאה מכך מגוון רחב של פרוטוקולים שרירותיים כי לעתים קרובות שונה greatl^{13 y, 14, 15.}

כדי להתמודד עם פערי הידע הנוכחיים, אנו מציגים פרוטוקול ניסוי לכמת עיוות נגרמת רחבה במודל חיה חזירי של הרחבת רקמות. הפרוטוקול מסתמך על שימוש סטריאו רב-נוף (MVS) לשחזר תלת ממדי (3D) בגיאומטריות מתוך רצפים של דו-ממדי (2D) תמונות עם עמדות מצלמה לא ידועות. העסקת splines, ייצוג של משטחים חלקים מוביל את החישוב של מפות העיוות המתאימות באמצעות תיאור isogeometric (IGA). הניתוח של הגיאומטריה מבוסס על המסגרת התיאורטית של מכניקת רצף של ממברנות שיש parameterization מפורשת ^16.

אפיון דפורמציות רלוונטי מבחינה פיזיולוגית של חיים חומרים על פני תקופות זמן ארוכות עדיין נותרה בעיה מאתגרת. אסטרטגיות נפוצותהדמיה של רקמות ביולוגיות כוללת מתאם תמונה דיגיטלית סטריאוסקופית, מערכות ללכידות תנועה מסחריות עם סמנים רעיוניים, ו fluoroscopy כנפי וידאו ^{17, 18, 19.} עם זאת, טכניקות אלה דורשות התקנה ניסיונית מגבילה, בדרך כלל יקרים, שמשו בעיקר עבור vivo לשעבר או אקוטי במסגרות vivo. עור יש את היתרון של להיות מבנה דק. למרות שזה מורכב מכמה שכבות, הדרמיס הוא אחראי במידה רבה את תכונות מכניות של רקמות ולכן עיוות משטח הוא בעל חשיבות ראשונה במעלה ^20; נחות kinematical סבירות יכולות להתבצע לגבי מתוך עיוות מטוס ^{21, 22.} יתר על כן, עור כבר חשוף לסביבה החיצונית, כך שניתן להשתמש בכלי הדמיה קונבנציונליים כדי ללכוד הגיאומטריה שלה. Here אנו מציעים את שימוש MVS כגישה סבירה וגמישה כדי לפקח in vivo דפורמציות של עור לאורך מספר שבועות מבלי להתערב majorly עם פרוטוקול הרחבת רקמות. MVS היא טכניקת מפיקת ייצוגי 3D אובייקטים או סצנות מתוך אוסף של תמונות 2D עם מצלמה ידועה זוויות ^23. רק בשלוש השנים האחרונות, מספר קודים מסחריים הופיעו (ראה רשימת חומרים עבור דוגמאות). הדיוק הגבוה של שיקום המודל עם MVS, עם שגיאות נמוכות כמו 2% ^24, עושה גישה זו מתאימה לאפיון קינמטיקה של עור in vivo על פני תקופות זמן ארוכות.

כדי להשיג את מפות עיוות המקבילות של עור במהלך הרחבת רקמות, נקודות בין שתי תצורות גיאומטריות מותאמות. כמקובל, חוקר ביומכניקה חישובית השתמש משתלב אלמנטים סופיים וניתוח הפוך כדי לאחזר את מפת העיוות^{25, 26.} הגישה IGA מועסק כאן משתמשת בפונקציות בסיס שגם אשר מציעים כמה יתרונות לניתוח קרומים דקים ^{27, 28.} כלומר, את הזמינות של פולינומים מדרגה גבוהות מקלת ייצוגים של גיאומטריות חלקות אפילו עם משתלב מאוד גס ^{29, 30.} בנוסף, ניתן להתאים אותו parameterization הבסיסית לכל טלאי המשטח, אשר עוקף את צורך בעיה הפוכה לתת דין וחשבון על discretizations שאינו תואם.

השיטה המתוארת כאן פותחת אפיקים חדשים ללמוד מכניקה לעור רלוונטי במסגרות vivo על פני תקופות זמן ארוכות. בנוסף, אנו מלאי תקווה כי המתודולוגיה שלנו היא צעד שמאפשר לקראת המטרה הסופית לפתח כלים חישוביים לתכנון טיפול אישי במסגרת הקלינית.

Protocol

פרוטוקול זה כרוך בניסויים בבעלי חיים. הפרוטוקול אושר על ידי IRB של אן רוברט ה לוריא החולים לילדים של טיפול בבעלי חיים מרכז המחקר שיקגו ועדת שימוש כדי להבטיח יחס הומאני של חיות. התוצאות עבור שני מחקרי התרחבות באמצעות פרוטוקול זה פורסמו במקום אחר ^{16, 31.}

ביצוע של פרוטוקול זה דורש צוות עם מומחיות משלימים. חלקו הראשון של הפרוטוקול מתאר את ההליך הכירורגי על המודל החייתי, המחייב אנשי עם הכשרה רפואית מתאימה. הניתוח שלאחר מכן, ובפרט סעיפים 4 ו 5, כרוך כישורי תכנות מחשבים בסיסיים ב- C ++ ו- Python, ושימוש פגז שורת הפקודה.

1. הליך כירורגי עבור מיקום Expander

הערה: עובדים המבצעים את הפעולה צריכים לקרצף ולבוש חלוקים בצורה סטרילית. Sterilמגבות וילונות דואר מוחלים ברחבי בתחום כירורגית כדי לשמור על סטריליות. כל המכשירים, תפרים, ו מרחיבי הרקמות מתקבלים באריזת סטרילית טפלו רק על ידי אנשי סטרילי. עקרות של האתר האופרטיבי אסורות פר עד ההליך הושלם.

1. לאקלם חזירים מיניים יוקטנו תינוק בן חודש אחד לדיור רגיל למשך שבוע, ולהאכיל כרצונך.
2. ביום הניתוח, להרדים את החיה באמצעות קטמין / acepromazine לזירוז (4 - 6 מ"ג / ק"ג), אז isoflurane לצורך תחזוקה. הערכת עומק ההרדמה על ידי ניטור רפלקס palpebral. כמו כן, לפקח סימנים חיוניים (דופק, חום גוף, קצב נשימה, ו / או בתגובה לצבוט ידי מלקחי רקמות). החל משחת עיניים לעיניים כדי להגן מפני שפשופים בקרנית.
3. נהל אנטיביוטיקה מראש פרוצדורלית ולנקות את עור הגב עם סבון כירורגי מבוסס כלורהקסידין. העברת ארבעה 10 x 10 ס"מ ² רשתות, שניים מכל צד שלבעלי חיים, עם סימוני קו 1 סנטימטר על עור החזיר באמצעות מדיום להעברת קעקוע. הרשתות מתאימות ארבעה האזורים הבאים: מקור שמאל, ימין מקורי, זנב שמאלי, ואת זנב תקין. השתמש בתבנית עם הפניה קו האמצע כדי להבטיח מיקום סימטרי של דפוסי הרשת.
   1. צור את הרשתות על נייר ידי התחקות לרשת מתאר בכבדות עם עט כדורי. לשטוף את האזור על החיה, כאשר הרשת היא להציב עם איזופרופיל אלכוהול לחיטוי.
   2. החל את הרשת (צד-דיו עט למטה) ישירות על העור. האלכוהול משמש עלוקה חלק הדיו מעל הנייר, העברת רשת אל העור של החיה.
4. להזריק הרדמה מקומית (1% לידוקאין עם 1: 100,000 אפינפרין) תת עורי באתר של כל חתך מתוכנן.
5. עושה חתך משני צדי החיה בתוך האמצע בין שתי הרשתות.
   הערה: החתכים ממוקמים בצד השמאל ובצד ימין של החיה בין 2 הרשתות עלהצד הזה. ישנו חתך צדדי שמאל חתך צדדי תקין
6. השתמש hemostat לפתח מנהרה תת עורית מתחת לרשת של עניין. לאחר פיתוח מנהרה, הכנס את ההרחבה מתחת לרשת.
   הערה: מנהרות ממוקמות בשום רשת כי תהיה הרחבת רקמות.
7. מניח את היציאה לאינפלצית הרחבה מרחוק דרך מנהרה תת עורית שפותחה באופן דומה לאורך קו אמצע הגב של החיה. פצעי תיקון על ידי תפירה.
8. לאחר הניתוח, לטפל בבעלי חיים עם אנטיביוטיקה מניעתית (Ceftiofur 5 מ"ג / ק"ג IM פעם) כמו גם משככי כאבים (עצירות .05 - 0.1 מ"ג / ק"ג) באמצעות הזרקה תוך שרירית מדי 12 h עבור 4 מנות, עם מנות נוספות זמינות ראיות מצוקה חיה.
9. תצפיות על בעלי חיים ברציפות במשך 2 h לאחר הניתוח, כולל מדידה שגרתית של סימנים חיוניים עד שהם חזרו ambulation ומסוגלים לשמור טמפרטורה נורמלית. בית החיה בכלוב הצג נפרד עד שאניt הוא מסוגל ללכת באופן עצמאי על כל 4 רגליים לפני העברת אותו בחזרה לאזור הדיור הרגיל שלו ולהשאיר אותו ללא השגחה.
10. לאחר תקופת התאוששות הרדמת פוסט מיידית, לבדוק חיות יומיות להעריך ריפוי פצע. הסר את התפרים 14 ימים לאחר הניתוח. חתכים אלה אינם דורשים רטבים. השאר את החתכים לרפא עבור 3 - 4 שבועות לפני תחילת הרחבה

פרוטוקול האינפלציה 2.

הערה: התזמון של inflations וכמות הפתרון המשמשת בכל הרחבה תלויה בשאלה ספציפית נלמד. כדי לאפיין את ההשפעה של גיאומטריות הרחבה שונות, פרוטוקול מתאים הוא לבצע חמישה שלבי אינפלציה ב 0, 2, 7, 10, ו 15 ימים כדי להשיג כרכי מילוי של 50, 75, 105, 165, ו 225 סמ"ק בהתאמה.

1. לפני כל צעד האינפלציה, להרדים קטאמין וניהול של בעלי חיים (4 - 6 מ"ג / ק"ג) ו dexmedetomidine ב 20 - 80 מיקרוגרם / ק"ג.
   הערה: Dexmedetomidine הואn אגוניסט אלפא-אדרנרגיים שיכול להיות הפוך עם atipamezole (1: נפח 1: נפח) כדי להקל על התאוששות מהירה יותר; עם זאת, רמה זו של הרגעה לא יכולה להיות מתאימה החיה לסבול רחבה ללא סיכון מיותר של פגיעה בבעלי החיים או מפעיליו. אם זה המקרה, לנהל הרדמה כללית ידי אספקת isoflurane באמצעות אוורור המסכה הבאה אינדוקציה קטמין / acepromazine.
2. צרף שתי רולטות גמישות מפלסטיק אל העור של החיה באמצעות פלסטר. מניחים את רולטות בין רשתות בצידי הימני והשמאלי.
3. מניח את החיה בצד אחד לרכוש 30 תמונות של הזירה מזוויות שונות רבות ככל האפשר.
   הערה: המטרה היא ללכוד את הגיאומטריה של שתי הרשתות הגלויות כאשר החיה היא בהנחה בצד אחד.
   1. ראשית, למקם את המצלמה מעל החיה ואת נוטה לצד הזנב, כדי ללכוד צילום שבו הרשתות המקועקעות תהיינה גלויות במלוא ולמלא את המסגרת.
   2. Mאובה בתבנית עגולה סביב החיה בתוך קשת מן הזנב לכיוון המקורי, לצלם לאורך הדרך, להבטיח, לכל תצלום, הרשתות המקועקעות הנראות להופיע לחלוטין את המסגרת.
      1. במקביל, מנסה למקסם את החלל כי הרשתות לכבוש את המסגרת. ירה אידיאלי היה ללכוד את הגב של החיה עם הרשתות המקועקעות ואזורים קטנים בלבד של רקע.
   3. שנית, מיקום המצלמה כלפי הצד הגחון ללכוד זווית הירייה הוא כ במקביל לקרקע ולצלם ב קשת מן הגחון לאזור הגב.
      הערה: כמות הצילומים אינה ערך קבוע. עבור שחזור טוב, כל נקודה על הרשת המקועקעת צריכה להיות 3 תמונות לפחות; 30 תמונות בסך הכל היא כמות מספקת עבור שיקום גיאומטריה מוצלח.
4. מניחים את החיה בצד הנגדי ולקחת 30 תמונות של השנייםרשתות הנותרות ביצוע הפעולות שמפורטות לעיל.
5. בצע את צעד האינפלציה על ידי מציאת הנמל מרחוק המילוי והזריק את הכמות הנדרשת של תמיסת המלח המתאימה הפרוטוקול הרחב של עניין. השתמשו מלוחים בזריקות 0.9% סטרילי.
   1. אתר את היציאות ו prep על העור של החיה עם מגבוני אלכוהול איזופרופיל. גש היציאה עם מחט פרפר 25-מד סטרילית מצורף מזרק מלא מלוח להזרקה סטרילית.
      הערה: כפי שתואר לעיל, יציאות מנהרה תת-עורית למיקום על dorsum קו האמצע הקדמי במהלך השמת הרחבה.
   2. להזריק את הכמות הרצויה של תמיסת מלח. עיין בהערה בתחילת סעיף זה, בשל כרכי האינפלציה מוזרקים בכל שלב של תהליך ההתרחבות.
6. חזור על שלבי רכישת תמונה לאחר אינפלציה.
7. לאחר פרוטוקול האינפלציה יושלם, להרדים את החיות.
   1. נהל כלליהרדמה על ידי מתן isoflurane באמצעות אוורור המסכה הבאה אינדוקציה קטמין / acepromazine. הערכת עומק ההרדמה על ידי ניטור רפלקס palpebral. כמו כן, לפקח סימנים חיוניים (דופק, חום גוף, קצב נשימה, ו / או בתגובה לצבוט עם מלקחי רקמות).
   2. להרדימו על ידי מנת יתר תוך ורידי של פנטוברביטול 90 - 100 מ"ג / ק"ג. בעקבות מנת יתר פנטוברביטול להמתת חסד, לאשר למוות על ידי בהעדר הדופק לגילוי באמצעות oximeter דופק ומישוש דופק כמו גם היעדר נשימה ספונטנית.

3. שחזור סטריאו Multi-נוף

1. השתמש זמינה מסחרי תוכנה להעלות את קובצי תמונה לשחזר את הדגמים הגיאומטריים.
   1. הפעל את תוכנת MVS על הדפדפן ולהתחברות.
   2. בחר תמונה כדי 3D על הפינה השמאלית העליונה.
   3. לחץ להוסיף תמונות, דפדף אל המיקום של imגילים יכולים לבחור ידני את 30 הצילומים מתאימים מודל יחיד.
   4. שם הדגם ולחץ ליצור
   5. חכו המודל להיווצר. זה יכול להימשך מספר דקות. לחץ מחוונים על הזכות לחזור לדף הנחיתה המקורי של התוכנה.
      הערה: מרכז השליטה מציג תמונות מייצגות של מודלים גיאומטריים אשר נוצרו על ידי המשתמש.
   6. מניח את הסמן על המודל פשוט נוצר. מניחים את הסמן על הפינה הימנית התחתונה של התמונה מודל. לחץ הורדות ובחר obj.

4. Fit Surface שגם

1. לשימוש בתוכנות קוד פתוח לעבד מודלים גיאומטריים.
2. לחץ על File-> ייבוא> obj לייבא את הקובץ שנוצר מהתוכנה MVS. על החלק התחתון של תצוגת 3D לחץ על הצללת viewport ו Sele גודלCT מרקם. חפש כרטיסייה על זכותו של צפה 3D עם תפריטי משנה: Transform, גריז עיפרון, נוף, 3D עיפרון, וכו 'לחץ על הצללה ובחר לא מוצלת.
3. קליק ימני על הגיאומטריה כדי לבחור בו. על החלק התחתון של תצוגת 3D לבחור מצב עריכה כדי להמחיש את הרשת המשולשת.
4. בחר אחד אחד הצמתים 1 הסימונים ס"מ של סרט מדידה.
   1. כדי לבחור נקודה, קליק ימני על זה, וכן להדגיש את הנקודה. הקואורדינטות של נקודת להופיע על הלשונית בצד הימני של צפה 3D. לבחור ולהעתיק את הקואורדינטות של הנקודה הנבחרת לקובץ טקסט.
   2. חזור על פעולה זו עבור כל הנקודות על 1 סימוני הסנטימטר של סרט המדידה.
   3. האם זה עבור שני צעדי הקלטת. דוגמאות לתאם קבצי טקסט הם מספקיםד: tape1.txt, tape2.txt.
      הערה: אם אין צמתים של הרשת על נקודת העניין, לחלק את הרשת עד שלא תהיה צומת על נקודת העניין. על מנת לפצל את רשת לבחור את שלושת הקודקודים של משולש ידי לחיצה על מקש Shift ועל לחיצה ימנית על הקודקודים. ואז ללחוץ על כפתור חלוקת משנה בכרטיסייה המופיע בצידו השמאלי של צפה 3D. פעולה זו מוסיפה שלושה צמתים יותר בתוך משולש שנבחרו.
5. בחר את 11 x 11 נקודות של הרשת ולשמור את הקואורדינטות של 121 נקודות לקובץ טקסט בדפוס שמוצג באיור 1.
   1. בדומה לכך למה שנעשה עבור הרולטות, כדי לבחור נקודת הרשת, קליק ימני על זה, הנקודה תודגש. קואורדינטות של הנקודה תופיע על הלשונית בצד הימני של צפה 3D. לבחור ולהעתיק את הקואורדינטות של הנקודה הנבחרת לקובץ טקסט
      הערה: מספור נקודות הרשת הוא alwזנב ays כדי מקורי ואת קו האמצע גב לכיוון אזור הגחון. סידור זה מבטיח כי מרחב הפרמטר עולה בקנה אחד עבור כל שני טלאים. כדוגמה, את gridReference.txt קובץ המכיל את הקואורדינטות של 121 נקודות של תיקון העור מסופק.
6. הורדה, לקמפל ולהתקין ספריות שגם ++ C. הקובץ מכיל splineLibraryInstallation.txt הקישור לקוד המקור של ספריות שגם והוראות התקנה.
7. לקמפל את קוד המקור generateCurve.cpp כדי ליצור את generateCurve ההפעלה
   הערה: התוכנית generateCurve רק צריך להיות הידור פעם. כדי לקמפל זה C ++ קוד המקור וליצור הפעלה ובצע את ההוראות בחלק העליון של קובץ קוד המקור generateCurve.cpp.
8. השתמש בתכנית generateCurve כדי להתאים splines לצעדי הקלטת לנקודות הרשת. כדי להפעיל את קובץ ההפעלה בתוך Bפגז אפר, סוג
   ספריית $ ./generateCurve
   1. לאחר הפעלת התוכנית, הוא יבקש מהמשתמש להקליד את הנתיב לקובץ המכיל את הקואורדינטות של סרט מדידה. אז התכנית תבקש שם עבור קובץ הפלט. מוסיפים את סיום .g2 לשם הקובץ.
      הערה: סיום .g2 מייצג כלים כדי תנועה, והיא קשורה אל ספריות שגם. שתי דוגמאות של קבצים שגם מתאימים רולטות זמינות עם פרוטוקול זה (tape1.g2, tape2.g2).
9. השתמש scalePoints.py סקריפט פייתון להרחיב את נקודות הרשת. הפעל את התוכנית שורת פגז Bash עם שלושה טיעונים: הקובץ של נקודות הרשת ואת שמות הקבצים של splines המתאים רולטות
   הספרייה Python $ scalePoints.py gridReference.txt tape1.g2 tape2.g2
   הערה: התסריט scalePoints.py מייבאת את הסקריפטים B_spline.py ו NURBS_Curv e.py, ולכן כל שלושת התסריטים חייבים להיות באותה התיקייה.
10. לקמפל את generateSurface.cpp קוד המקור כדי ליצור את generateSurface ההפעלה.
    הערה: שלב זה רק צריך להיעשות פעם. הוראות מפורטות יותר זמינות בתחילת קובץ קוד המקור generateSurface.cpp.
11. השתמש בתוכנית generateSurface כדי להתאים משטח שגם לנקודות רשת. הפעל את generateSurface ההפעלה על Bash הפגז
    ספריית $ ./generateSurface
    1. הפעלת התכנית במעטפת תבקש את שם הקובץ המכיל את הנקודות המדורגות. ואז הוא יבקש את שם קובץ הפלט. מוסיף את הסיום .g2 לשם קובץ הפלט.
       הערה: .g2 הסיום מוצע על ידי הספריות שגם ודוגל כלים בדרכים. הקבצים gridReference.g2 ו gridDeformed.g2 ניתנים כדוגמאות.

itle "> 5. כימות דפורמציה מושרה רחבה

1. התחל פיתון בשורת פגז Bash
   פיתון ספריית $
   הערה: Python מאתחל את המתורגמן, המהווה ממשק דומה הקליפה כי תראה בסביבת שורת הפקודה חדשה >>>
2. ייבא את התסריט expansionIGA.py המכיל פונקציה בשם evaluateMembraneIGA
   >>> מ evaluateMembraneIGA יבוא expansionIGA
3. קרא לפונקציה evaluateMembraneIGA לחשב את המפות עיוות.
   הערה: פונקציה זו לוקחת כמו טיעונים:
   שם קובץ של משטח ההפניה
   שם קובץ של המשטח המעווה
   החלטה של ​​ההערכה (כמה נקודות מוערכות לכל כיוון)
   שווי מזערי של מתיחה באזור המשמש להרחיב את העלילה קונטור
   ערך מקסימאלי של מתיחה באזור המשמש להרחיב את עלילת קונטור
   שווי מזערי של מתיחה בכיוון אורכי לנואד להרחיב את קווי המתאר
   ערך מקסימאלי של מתיחה בכיוון אורכים נהג לטפס על קווי המתאר
   שווי מזערי של מתיחה בכיוון רוחבי נהג לטפס על קווי המתאר
   ערך מקסימאלי של מתיחה בכיוון רוחבי נהג לטפס על קווי המתאר
   ריווח בין קווי רשת בעלילת קונטור
   שם קובץ פלט
   1. לדוגמה, לרוץ
      >>> evaluateMembraneIGA ( 'gridReference.g2', 'gridDeformed.g2', 250, 3, 0.5, 2, 0.5, 2, 0.5, 25, 'עיוות')
      הערה: פקודה זו תפיק ולשמור שישה קבצי פלט. הערה שהטיעון האחרון בדוגמה לעיל הוא עיוות filename פלט, ובכך, הקבצים יופק הם:
      deformation_theta.png: העלילה קונטור של מתיחה באזור
      deformation_theta.txt: טבלת ערכים התואמים את העלילה קונטור של מתיחה באזור
      deformation_G1.png: העלילה קונטור של אלון מתיחהg לציר האורך של החיה
      deformation_G1.txt: טבלת ערכים התואמים את העלילה קונטור של מתיחות לאורך ציר האורך של החיה
      deformation_G2.png: עלילה קונטור של רכיב מתיחת הציר הרוחבי של החיה
      deformation_G2.txt: טבלת ערכים התואמים את העלילה קונטור של מרכיב את מתיחת הציר הרוחבי של החיה
      הערה: אל תבלבל את סיום קבצים שגם, .g2, עם G2 וקטור. הקבצים שגם יש וכלה .g2 בהתאם למוסכמות מתן שמות של הספרייה שגם. מצד השני, ה- G1 הווקטורים G2 לציין את הכיוונים האורכים רוחביים ביחס החיה.
      הערה: הקבצים קונטור נוצרים עם תכונות שונות בארבע הפינות כדי להקל פרשנות של מרחב הפרמטרים: פיקסל השחור: רוב הזנב, נקודת הגבי ביותר; בפינת פיקסל אדומה: mosמקורי t, נקודת הגבי ביותר; בפינת פיקסל ירוקה: רוב הזנב, ברוב נקודת גחון; בפינת פיקסל כחולה: הכי מקורית, הכי גחון נקודה.

תוצאות

מתודולוגיה זו הועסקה בהצלחה ללמוד את העיוות נגרמת גיאומטריות הרחבה שונות: מלבן, כדור ו מרחיבי סהר ^{31, 32.} התוצאות המתאימות המרחיבים בתחום וסהר נדונים הבאים. איור 2 מדגים את שלושת השלבים של שחזור מודל MVS. נקודת המ...

Discussion

כאן הצגנו פרוטוקול לאפיין את דפורמציות המושרה במהלך הליך הרחבת רקמות במודל חזירי באמצעות סטריאו רב-נוף (MVS) ו קינמטיקה isogeometric (קינמטיקה IGA). במהלך הרחבת רקמות, עור עובר עיוותים גדולות יוצא מתוך משטח חלק יחסית שטוח לצורת 3D דמוי כיפה. עור, כמו ממברנות ביולוגיות אחרות

Materials

Name	Company	Catalog Number	Comments
Yucatan miniature swine	Sinclair Bioresources, Windham, ME	N/A
Antibiotics	Santa Cruz Animal Health, Paso Robles, CA	sc-362931Rx	Ceftiofur, dosage 5 mg/kg intramuscular
Chlorhexidine-based surgical soap	Cardinal Health, Dublin, OH	AS-4CHGL(4-32)	4% chlorhexidine gluconate surgical hand scrub
Tattoo transfer medium	Hildbrandt Tattoo Supply, Point Roberts, WA	TRANSF	Stencil thermal tattoo transfer paper
Lidocaine with epinephrine	ACE Surgical Supply Co, Brockton, MA	001-1423	Lidocaine Hcl 1% (Xylocaine) - Epinephrine 1:100,000, 20 mL
Buprenorphine	ZooPharm, Windsor, CO		1 mg/mL sustained release, dosage 0.01 mg/kg intramuscular
Digital camera	Sony	Alpha33	Standard digital camera with 18 - 35 mm lens, 3.5 - 5.6 aperture. Used in automatic mode, no flash
Tape measure	Medline, Mundelein, Illinois	NON171330	Retractable tape measure, cloth, plastic case, 72 inches
Tissue expanders	PMT, Chanhassen, MN	03610-06-02	4 cm x 6 cm, rectangular, 120 cc, 3610 series 2 stage tissue expander with standard port
ReCap360	Autodesk	N/A	MVS Software, Web application: recap360.autodesk.com
Blender	Blender Foundation	N/A	Computer Graphics Software, open source: blender.org
SISL	SINTEF	N/A	C++ spline libraries, open source: https://www.sintef.no/projectweb/geometry-toolkits/sisl/