התחל בהפעלת תוכנת ההפעלה של המיקרוסקופ. תחת הכרטיסיה הגדרה, בחר את סוג הצלחת הנכון שהוגדר מראש. לחץ על הוצא כדי לגשת לשלב הצלחת כדי למקם את הצלחת ולאחר מכן לחץ על עומס כדי לטעון את הצלחת במיקרוסקופ.
לאחר מכן, בחר את היעד האוויר 20 פעמים עם צמצם מספרי של 0.4. התאם את צווארון התיקון של מטרת האוויר 20x לעובי הצלחת של סוג הצלחת שנבחר. קבעו את בחירת הערוץ על Hoechst 33342 והתאימו את פרמטרי ההדמיה לערוץ Hoechst.
בדוק את ההגדרות שנבחרו על ידי בחירת נציג היטב בתוך הצלחת. בפריסה מוגדרת, בחר את כל בארות הלוחות ועבור השדות. לאחר מכן בחר את התיקיה המתאימה תחת משימות מקוונות כדי להעביר את הנתונים לתוכנת הניתוח המקוונת.
הגדרות הניסוי נשמרות. תחת הכרטיסיה ניסוי הפעלה, הלוח שעומד להיות מצולם מקבל שם, ותהליך ההדמיה מתחיל. כדי להתחיל בניתוח תמונות, תחילה הפעל את התוכנה, בחר את התמונות לניתוח ולאחר מכן לחץ על הכרטיסייה ניתוח תמונות כדי להתחיל בפילוח תמונות.
לאחר מכן, לחץ על סימן החיבור בכרטיסייה תמונת קלט כדי להוסיף אבן בניין חדשה. מהרשימה, לחץ על מצא גרעינים. בחרו בשיטת הפילוח המתאימה ביותר לאחר בדיקת העצמים המפולחים בתמונה.
התאם את פרמטרי הזיהוי בשיטת הסגמנטציה. לחץ על הגדר תוצאות ובחר פלט סטנדרטי כשיטה. לחץ על שמור ניתוח במסד נתונים כדי לשמור את צינור הניתוח.
תחת הכרטיסייה ניתוח אצווה, לחץ על הצינור השמור שיופיע תחת אפשרות השיטה. לאחר מכן בחר את הנתונים לניתוח. התחל את הניתוח על ידי לחיצה על התחל ניתוח כדי ליצור את ערכת הנתונים עבור מספרי תאים.
הבדיקה מבוססת התאים המתוארת מסתמכת על קריאת כתב המשקפת בעקיפין שינויים בפעילות ATG4B, ומאפשרת זיהוי הן של מעכבים והן של מפעילים של פעילות ATG4B. היחס בין פעילות ATG4B של כל תרכובת לכדאיות התא שלה משמש כערך חיתוך לזיהוי מעכבי ATG4B. יחסים גדולים מאחד מציינים מפעילי ATG4B אפשריים ויחסים קטנים מאחד מציינים מעכבי ATG4B אפשריים.
