כדי להתחיל, פתח את יישום התוכנה על ידי לחיצה כפולה על הסמל של קובץ הפעלה. הזן את רצפי השרשרת הכבדה והשרשרת הקלה בתיבות הטקסט מתחת לעמודה 1 ללא רווחים. עבור נוגדנים דו-ספציפיים, הוסף שרשראות כבדות או קלות נוספות בקבוצה השנייה של תיבות הטקסט מתחת לעמודה 2.
השאירו קופסאות אלה ריקות עבור נוגדנים חד שבטיים עם שרשראות כבדות זהות ושרשראות קלות. בדוק את תיבות הסימון מחזוריות מסוף קצה וחיתוך מסוף C אם גרסאות מסוף שרשרת כבדות אלה ישימות. הוסף שינויים כימיים כולל מקשר ומטען עבור תרופות נוגדנים מצומדות לתיבות שינוי כימיות כבדות וקלות שרשרת באמצעות הרכבי יסודות כגון סידן כלורי.
שינויים אלה יתווספו לתת-היחידה או לשרשרת החלבונים המתאימים. ציין את מספר הקשרים הדיסולפידים במולקולות החלבון, בתיבת הטקסט המסומנת כמספר הכולל של דיסולפידים. הזן את מספר הקשרים דיסולפידים של שרשרת כבדה לא מופחתת בתיבת הטקסט דיסולפידים של שרשרת כבדה לא מופחתת ואת מספר הקשרים דיסולפידים של שרשרת קלה לא מופחתת בתיבת הטקסט דיסולפידים של שרשרת קלה לא מופחתת, בהתאם למידת ההפחתה.
אם גליקוזילציה קיימת בשרשרת האור של נוגדנים חד-שבטיים (monoclonal antibodies), סמן את תיבת הסימון light chain is glycosylated. לחץ על לדפדף כפתור לבחירת תיקיית פלט עבור תיבת הטקסט של תיקיית הפלט והזן את שם קובץ הפלט ללא סיומת קובץ לתיבת הטקסט קובץ Excel ללא סיומת. לאחר מכן לחץ על שלח לחצן.
הודעה שנוצרה דוח חישוב המוני תופיע על המסך וניתן למצוא את קובץ הפלט בתיקייה המיועדת למשתמש. האפליקציה תיסגר באופן אוטומטי. ההרכבים הכימיים, המסות מחושבות, המסות הנמדדות וטעויות המסה של נוגדנים חד שבטיים שונים מסוכמים בטבלה זו.
תקן נוגדנים חד-שבטיים זמין מסחרית נבחר כדי לייצג נוגדן חד-שבטי קונבנציונלי עם שרשראות כבדות זהות, שרשראות קלות זהות ואתר גליקוזילציה N-linked אחד באזור FC. כמו כן נבחרו נוגדן חד שבטי עם גליקוזילציה N-linked נוספת בשרשרת קלה, נוגדן חד-שבטי דו-ספציפי ונוגדן נוגדן מצומד נוגדן חד-שבטי להרחבת השימוש ביישום. טעויות המסה הקטנות בין המסות המחושבות למסות הנמדדות היו בתוך הקריטריונים הרגילים לקבלת שגיאות מסה, דבר המצביע על כך שהמסות המחושבות היו מדויקות.
