ניתוח תמונה בתוכנת Gen5 לניתוח תגובה לתרופות באורגנואידים שמקורם במטופל באמצעות הדמיה מרובת תאים חיים

Please note that all translations are AI generated. Click here for the English version.

86 Views

•

02:40 min

•

January 5th, 2024

DOI :

10.3791/201046-v

January 5th, 2024

•

Kaitriana E. Colling*¹^,², Emily L. Symons*¹, Lorenzo Buroni*³, Hiruni K. Sumanasiri¹, Jessica Andrew-Udoh¹, Emily Witt¹^,⁴, Haley A. Losh¹, Abigail M. Morrison¹, Kimberly K. Leslie⁵, Christopher J. Dunnill⁶, Johann S. de Bono³, Kristina W. Thiel¹^,⁷

¹Department of Obstetrics and Gynecology, Carver College of Medicine, University of Iowa, ²Cancer Biology Graduate Program, Carver College of Medicine, University of Iowa, ³The Institute of Cancer Research: and the Royal Marsden NHS Foundation Trust, ⁴Department of Radiation Oncology, Carver College of Medicine, University of Iowa, ⁵Division of Molecular Medicine, Departments of Internal Medicine and Obstetrics and Gynecology, University of New Mexico Comprehensive Cancer Center, University of New Mexico Health Sciences Center, ⁶Agilent Technologies, ⁷Holden Comprehensive Cancer Center, University of Iowa

* These authors contributed equally

Transcript

כדי להתחיל, צלם את PDO המסומנים באופן פלואורסצנטי באמצעות מערכת ההדמיה של תאים חיים Cytation 5. לאחר מכן, הפעל את תוכנת Gen5. נווט אל ניסויים ולחץ על פתח במנהל המשימות.

פתח את הניסוי הרצוי ובחר Plate, ואחריו View בסרגל הכלים. לאחר מכן, העבר את התפריט הנפתח של הנתונים ל- Z Projection. לחץ פעמיים על באר שנבחרה.

בחר נתח. לחץ, אני רוצה להגדיר שלב חדש להפחתת נתוני ניתוח תמונה, ולחץ על הגדרות ניתוח OK.In, הגדר סוג לניתוח סלולרי וערוץ זיהוי ל- Z Projection הפך TSF Brightfield. לחץ על אפשרויות כדי לפתוח את המסיכה הראשית ואת עמוד הספירה.

סמן אוטומטי בתיבת הסף ולחץ על אישור כדי לסגור את החלון הקופץ. תחת בחירת אובייקטים, הגדר גדלים מינימליים ומרביים של אובייקטים כדי לסנן פסולת תאית או תאים בודדים, ובחר תכונות אחרות כרצונך. לאחר מכן, לחץ על החל והאובייקטים עם מסיכה יסומנו.

כדי להגדיר ניתוח תת-אוכלוסייה בסרגל הכלים של ניתוח תאים, לחץ על מדדים מחושבים. לאחר מכן, לחץ על בחר או צור מדדים מעניינים ברמת האובייקט בפינה השמאלית התחתונה. מתוך מדדי עצמים זמינים, בחרו במדדים רצויים, כגון 'מעגליות', ולחצו על 'הוסף'.

לחץ על אישור כדי לאשר. לאחר מכן, בחר Subpopulation Analysis בסרגל הכלים של ניתוח תאים ולחץ על Add כדי ליצור תת-אוכלוסייה חדשה. הזן שם עבור אוכלוסיית המשנה.

במדדי האובייקטים, לחצו על 'הוסף תנאי' כדי להוסיף מדד שנבחר. הזינו את הפרמטרים הרצויים בחלון 'עריכת תנאי' ולחצו על הלחצן 'אשר'. בחר בתוצאות הרצויות בטבלה שבתחתית החלון ולחץ על OK, ולאחר מכן על Apply. באזור 'פרטי אובייקט', בחרו בתת-האוכלוסייה שהוקצתה כדי להציג מסיכה.

אם אתה מרוצה, לחץ על אישור בחלון ניתוח סלולרי ולחץ על הוסף שלב כדי להחיל את הניתוח על כל הבארות.

Explore More Videos

Image Analysis

Gen5 Software

Drug Response

Patient derived Organoids

Multiplexed Live cell Imaging

Subpopulation Analysis