הערכה כמותית של נשאות Bacillus velezensis על שורשי Arabidopsis thaliana

כדי להתחיל, לשקול שני צינורות מיליליטר ולרשום את המשקל ההתחלתי כמו w0. קצרו את רקמות שורש Arabidopsis thaliana בתרבית משותפת, ושטפו אותן שלוש פעמים במים סטריליים. הניחו את השורש על נייר סינון כדי להסיר את עודפי המים.

מעבירים את השורשים לצינור מיקרו צנטריפוגה שנשקל מראש. שקלו את השורשים עם הצינור ורשמו אותו כ-w1. לאחר מכן, להוסיף 1 מיליליטר של PBS לצינור וורטקס במשך שמונה דקות במהירות מקסימלית.

לדלל את התרחיפים המכילים את תאי החיידקים מושבת השורש מ 1 על 10 שלילי 1st ל 1 על ידי 10 שלילי 5th. מורחים את התרחיפים החיידקיים המדוללים על צלחות אגר לוריא-ברטאני, ודגרים ב 37 מעלות צלזיוס במשך 10 שעות. לאחר הדגירה, ספרו את מושבות החיידקים על צלחות אגר לוריא-ברטני.

חשב את יחידות יצירת המושבה על פי הדילול המתאים, ונרמל את הנתונים עם משקל טרי השורש כדי לקבל ספירה של תאי חיידקים מושבה לכל גרם של שורש. יומיים לאחר החיסון, הנשאות של Bacillus velezensis wild type SQR9 ומוטציה נגזרת, delta 8mcp, הדגימה הפחתה משמעותית של התיישבות שורשים של דלתא 8mcp, מה שמרמז על היעילות של מצב זה ושיטה זו במדידת התיישבות חיידקים.