כדי להתחיל, להשיג את הגידול שמקורו בחולה, אורגנואיד, או PDTO, Matrigel Dome ולמקם אותו במערכת הדמיה חיה. בתוכנת IncuCyte, בחר תזמון לרכישה. לחץ על סימן החיבור בפינה השמאלית העליונה, בחר סרוק לפי לוח זמנים ולחץ על הבא.
לאחר מכן בחר Create Vessel New, בחר Organoid, ואחריו QC ו- Phase plus Brightfield ערוצי תמונה. לאחר בחירת הצלחת המאומתת בתוכנה, בהתאם למספר הקטלוגי, בחר את מיקום הלוחית על המכשיר ואת הבארות בהתאם לפריסת הצלחת. כדי ליצור מפת לוחות, לחץ על סימן הפלוס בפינה השמאלית העליונה של פריסת הצלחת.
לאחר מכן, תחת המקטע תאים, לחץ על סמל הוסף או ערוך סוג תא וציין את סוג התא. בחר את הבארות המתאימות ולחץ על סמל הפלוס. כדי לציין את הטיפול, עבור לתנאי גידול ולחץ על צור מצב חדש.
החל על הבארות המתאימות עם סמל הפלוס. לחץ על אישור, ואחריו הבא. לאחר בדיקה אם האפשרות לדחות את הניתוח למועד מאוחר יותר נבחרה, לחץ על הבא.
בחר לסרוק פעמיים ביום ללא הגבלת זמן. לבסוף, בדוק את הסיכום ולחץ על הוסף ללוח זמנים. הקרנה של אחד מניתוחי ה-PTDO של סרטן השד במנה אחת של שני טיפולי קרינה אפורים עיכבה באופן משמעותי את הצמיחה המחודשת של PDTO, בעוד שמנות קרינה גבוהות יותר מנעו לחלוטין את ההתחדשות של PDTO הגדל.