כדי להתחיל, לרכוש תמונות מרובות תצוגה של עוברים דגי זברה בשלב מוקדם באמצעות מיקרוסקופ גיליון אור. לאחר זיהוי נקודות עניין, בחר את כל התצוגות, לחץ לחיצה ימנית ובחר הירשם באמצעות נקודות עניין. כדי לבדוק כיצד בדיוק פעל הרישום, בחר שתי תצוגות רצופות.
עבור לאזור החופף ועבור בין שתי התצוגות כדי לבחון אם החרוזים המצולמים מזוויות שונות מונחים על גבי מונחים. לאחר ההרשמה בהצלחה, לחץ על שמור בחלון Explorer מרובה תצוגות כדי לשמור את קובץ ה- XML המעודכן. עכשיו לפתוח את החרוז.
קובץ XML בעורך טקסט לפי בחירה והעתק את כל הבלוק תחת רישומי תצוגה. פתח את העובר. קובץ XML והחלף את בלוק רישומי התצוגה בבלוק שהועתק מקובץ החרוזים.
לאחר מכן פתח את העובר. קובץ XML ב- Big Stitcher ובדוק היטב אם הרישום עבד בהצלחה עבור העובר. חזור על אותו הדבר עבור החרוזים על ידי בדיקת החפיפה של מבנים מעניינים בכל שתי תצוגות עוקבות.
לביצוע דה-קונבולוציה מרובת תצוגות, בחרו בכל התצוגות בקובץ החרוזים, לחצו לחיצה ימנית ובחרו פונקציות כפולת נקודות ואפשרויות חילוץ. המשך עם גודל ברירת המחדל של פונקציית פריסת הנקודות ולחץ על אישור. לאחר מכן שמור מחדש את קובץ ה- XML. לאחר מכן, פתח את העובר.
קובץ XML והקצאת פונקציית כפולת הנקודות לכל תצוגה בנפרד. לחץ לחיצה ימנית על תצוגה, לחץ על פונקציות התפשטות נקודתיות, בחר הקצאה ובחר מתקדם, ולאחר מכן הקצה PSF חדש לכל התצוגות שנבחרו. לחץ על עיון, עבור אל נתיב קובץ XML ופתח את תיקיית PSF.
בתצוגה שנבחרה, בחר את פונקציית כפולת הנקודות התואמת עם המזהה המתאים ולחץ על אישור. לאחר הקצאת פונקציית התפשטות הנקודות לכל התצוגות, לחץ באמצעות לחצן העכבר הימני ובחר deconvolution מרובה תצוגות. בחר בתיבה התוחמת בתצוגות הנוכחיות שנבחרו. ב-70% אפיבולי, העוברים הניחו אוריינטציות אופקיות, אנכיות או אלכסוניות בתוך צינור הפולימר, כאשר האופקי היה הכי פחות מיוצג, בעוד שהתנוחות האנכיות והאלכסוניות נצפו באותה מידה.
כאשר הדגימות הוכנו לפני הגסטרולציה, כ-25% מהעוברים הציגו כיוון אופקי. שאר העוברים הציגו אוריינטציות שונות אחרות בשלב הניצן. עם זאת, רבים מהם כיוונו מחדש למצב אופקי במהלך היווצרות סומיט מוקדם.
השוואה של תמונות חדורות מידע בקנה מידה תאי לא הראתה הבדל משמעותי במידע גרעינים, אך גבולות התא נפתרו טוב יותר בקבוצת 30 המעלות. בהשוואה לתמונות הקלט המקוריות, התמונות המקוטעות הכילו שגיאות. התוכנה נכשלה בזיהוי גבול תא או שרטט גבולות תא שאינם קיימים.
מספר השגיאות הגדיל באופן דרסטי את התמונות המתקבלות מההדמיה במרווחים זוויתיים של 45 ו-60 מעלות בהשוואה ל-30 מעלות.
