מערכת הקלטה נוירופיזיולוגית סטנדרטית זו יכולה לשמש לביצוע גירוי לולאה סגורה אשר שימושי לחקר אינטראקציות סיבתיות במוח. פרוטוקול זה מאפשר למדעני מוח בעלי מומחיות מוגבלת בלבד במדעי המחשב ליישם במהירות מגוון ניסויים בלולאה סגורה בעלות מועטה. ניסויים בלולאה סגורה יש becaming חשוב יותר ויותר עבור מדע בסיסי ומחקר.
לדוגמה, מחקרים רבים באפילפסיה הראו כי גירוי נוירון טריגר על הופעת התקפים היא גישה יעילה כדי להפחית את חומרת ההתקפים. כדי להקל על אימוץ ניסויים בלולאה סגורה במחקר מדעי המוח, פרוטוקול זה מספק קוד MATLAB להמרת מערכת הקלטה אלקטרופיזיולוגית לולאה פתוחה למערכת לולאה סגורה. יישום זה של גירוי לולאה סגורה מוכח בחולדה ערה.
כדי להתקין את מערכת רכישת הנתונים Cheetah 6.4, פתח את דף האינטרנט עבור התוכנה הכוללת ספריות לאינטראקציה עם מערכת רכישות הצ'יטה, והתקן את SpikeSort-3D. התקן את חבילת הפיתוח של NetCom. היכנס לחשבון MATLAB כדי לבחור את הרשיון, הגירסה ומערכת ההפעלה הנכונים.
לאחר מכן, הורד את הספריה עבור אירוע מקוון מפעיל כפי שצוין ולחלץ את הקבצים לתיקיה MATLAB מסמכים. לרכישת נתונים, פתח את תוכנת הצ'יטה והרשים נתוני spiking כדי לאכלס את צורות הגל של התבנית. לאחר מספר דקות, הפסק את רכישת הנתונים ובצע SpikeSort על הנתונים המוקלטים.
לאחר מכן, פתח את SpikeSort3-D ולחץ על תפריט קובץ וטען קובץ דקר כדי לבחור קובץ דקר מהתיקייה עם הנתונים המוקלטים. לאחר מכן, לחץ על תפריט אשכול, תסגור אוטומטית באמצעות KlustaKwik והפעל. כדי לבצע ניסוי בלולאה סגורה, חדש את רכישת הנתונים בצ'יטה ופתח את MATLAB.
פתח את סגורלופ. M ולחץ על הפעל. לחלופין, בצע לולאה סגורה בחלון הפקודה.
אתר את תיקיית ההקלטה ובחר אחד מקבצי הנתונים המהדקים כדי לטעון את מידע העלייה המוגדר בהקלטה הראשונית. לחץ על תיבות הסימון המתאימות תחת צורות הגל מותווים כדי לבחור נוירון אחד או יותר שיפעילו גירוי. הגדר את המספר המינימלי של נוירונים שיפעילו גירוי על-ידי הזנת מספר שלם בתיבת הטקסט min matches ולהגדיר את חלון הזמן שבו הקוצים התואמים לתוספי הגל השונים נחשבים לפעילים על-ידי הזנת מספר בתיבת הטקסט של החלון.
לאחר מכן, לחץ על שלח כדי להתחיל את ההפעלה המקוונת של אירועים המבוססים על פעילות spiking של הנוירונים שנבחרו. בניסוי מייצג זה, החולדה נחה על סיר פרחים שהיה מקום מנוחה מוכר בהפסקות בניסויים ההתנהגותיים. כאן, פועל בו זמנית נציג של תוכנת ההקלטה ואת תוכנית MATLAB אשר מציג צורות גל ספייק שנרכשו בזמן אמת ניתן לראות.
כאשר מתגלים קוצים מאשכולות מפעילים מוגדרים מראש, צורות הגל מוצגות עם קו מקף מודגש בחלון איור MATLAB המפעיל צליל ומספק מערכת לולאה סגורה. בנתון זה, היסטוגרמה מייצגת הממחישה את העיכובים בין זמן יצירת ספייק מלאכותי לבין זמן גרימת אות מופעל מוצגים. לאחר הכנת בעל חיים והתקנת התוכנה, הניסוי בלולאה סגורה מורכב משני שלבים עיקריים, רכישת הנתונים הראשונית והגירוי בלולאה סגורה שבמהלכם קוצים מפעילים גירויים חיצוניים.
פרוטוקול זה מאפשר גם טיפול בגירויים המבוססים על פעילות של נוירונים מרובים אשר חשוב לטיפול בשאלות על עיבוד מידע במוח. היתרונות של פתרון MATLAB זה הם העלות הנמוכה שלה ואת הגמישות בהגדרת דפוסי הפעילות כדי לעורר גירויים אשר יכול לעזור בחקירת מגוון רחב של שאלות מדעיות.
