* Questi autori hanno contribuito in egual misura
Questo studio presenta un metodo per analizzare la morfologia dei mitocondri basato sull'immunocolorazione e l'analisi delle immagini nel tessuto cerebrale di topo in situ. Descrive anche come questo consenta di rilevare i cambiamenti nella morfologia mitocondriale indotti dall'aggregazione proteica nei modelli di malattia di Parkinson.
I mitocondri svolgono un ruolo centrale nel metabolismo energetico delle cellule e la loro funzione è particolarmente importante per i neuroni a causa della loro elevata richiesta di energia. Pertanto, la disfunzione mitocondriale è un segno distintivo patologico di vari disturbi neurologici, tra cui il morbo di Parkinson. La forma e l'organizzazione della rete mitocondriale sono altamente plastiche, il che consente alla cellula di rispondere a segnali e bisogni ambientali, e anche la struttura dei mitocondri è strettamente legata alla loro salute. Qui, presentiamo un protocollo per studiare la morfologia mitocondriale in situ basato sull'immunocolorazione della proteina mitocondriale VDAC1 e successiva analisi delle immagini. Questo strumento potrebbe essere particolarmente utile per lo studio delle malattie neurodegenerative perché è in grado di rilevare sottili differenze nella conta mitocondriale e nella forma indotte da aggregati di α-sinucleina, una proteina soggetta ad aggregazione fortemente coinvolta nella patologia della malattia di Parkinson. Questo metodo permette di riferire che i neuroni dopaminergici che ospitano lesioni pS129 mostrano una frammentazione mitocondriale (come suggerito dal loro rapporto d'aspetto ridotto, AR) rispetto ai loro neuroni vicini sani in un modello di Parkinson con iniezione intracranica di fibrille preformate.
Il sistema nervoso centrale ha un'intensa richiesta di ATP: i neuroni utilizzano l'ATP per supportare i gradienti ionici, la sintesi dei neurotrasmettitori, la mobilizzazione, il rilascio e il riciclaggio delle vescicole sinaptiche e per consentire la traduzione e la degradazione locale delle proteine. Più del 95% dell'ATP utilizzato dal cervello è prodotto dai mitocondri1. Pertanto, non sorprende che la disfunzione mitocondriale sia particolarmente dannosa per i neuroni. Infatti, le compromissioni della funzione mitocondriale svolgono un ruolo importante in diverse malattie neurologiche, comprese le condizioni neurodegenerative, come il morbo di Parkinson (PD) e il morbo di Alzheimer (AD)2,3.
Diversi geni sono inequivocabilmente legati a proteine codificanti per PD che sono rilevanti per la funzione mitocondriale e l'omeostasi, come Parkin 4,5,6, la chinasi 1 indotta da PTEN (PINK1)7,8 e DJ-19. Un'ulteriore evidenza di un ruolo della disfunzione mitocondriale nella malattia di Parkinson è che i trattamenti con inibitori del Complesso I della catena di trasporto degli elettroni mitocondriali (come il Rotenone e l'MPTP) ricapitolano diversi aspetti della malattia di Parkinson in vitro e in vivo10. Tuttavia, è importante affermare che molti processi patologici possono guidare la perdita neuronale nella malattia di Parkinson, insieme ai deficit mitocondriali: lo stress ossidativo, l'alterata omeostasi del calcio, il fallimento dell'ubiquitina-proteasoma e dei sistemi autofagia-lisosomiale e l'aggregazione proteica sono tra i più studiati (esaminati in 11,12,13 e).
I mitocondri hanno una forma eterogenea: oltre alle singole unità, si trovano comunemente come reti reticolari e tubulari estese. La struttura e la posizione cellulare dei mitocondri sono fondamentali per la loro funzione14; Infatti, le reti mitocondriali sono estremamente dinamiche, subendo frequenti processi di fissione, fusione e mitofagia al fine di soddisfare le esigenze delle cellule e di rispondere a segnali ambientali15,16. Inoltre, la morfologia dei mitocondri è intimamente legata al loro stato di salute. Ad esempio, nell'atrofia ottica umana, le mutazioni genetiche che riducono l'attività mitocondriale portano a mitocondri anormali, sottili e iperfusi17. D'altra parte, una varietà di malattie umane presenta una morfologia mitocondriale aberrante, tra cui la frammentazione mitocondriale o l'eccessiva fusione mitocondriale, che hanno effetti dannosi sulla funzione mitocondriale (esaminata in18). Nel contesto della malattia di Parkinson, noi e altri abbiamo precedentemente dimostrato che la forma mitocondriale anomala è correlata con la disfunzione in risposta agli aggregati di α-sinucleina19. Mentre la morfologia mitocondriale è stata ampiamente studiata in vitro sia nel contesto della malattia di Parkinson che di altre malattie 20,21,22, mancano protocolli per la valutazione della morfologia mitocondriale da sezioni in vivo. Ciò rende lo studio in vivo dei mitocondri nel contesto di malattie come la malattia di Parkinson altamente dipendente da animali transgenici23 o la valutazione di estratti del mesencefalo che non possono fornire la risoluzione cellulare.
Qui, viene presentato un protocollo per studiare la morfologia mitocondriale in situ come indicatore del loro stato funzionale e di salute, basato sull'immunocolorazione della proteina mitocondriale VDAC124 seguita dall'analisi delle immagini in sezioni di tessuto incluse in paraffina. Mostriamo anche i risultati di questo protocollo in modelli di PD in vitro e in vivo : cellule di neuroblastoma che sovraesprimono SNCA (sinucleina alfa) e tessuto cerebrale di topi sottoposti a iniezione intracranica di fibrille preformate di α-sinucleina (PFF). La co-immunocolorazione con un anticorpo contro la α-sinucleina (nelle cellule) o la fosfoSer129- α-sinucleina pS129 (nel cervello di topo) ci ha permesso di identificare le cellule con patologia proteica aggregata (fibrille di α-sinucleina e α-sinucleina sovraespresse, rispettivamente) nei campioni, mentre le cellule negative sono servite come controllo non patologico all'interno degli stessi campioni. Attraverso questa analisi e i dati qui descritti, è stato osservato un rapporto d'aspetto ridotto, indicando la frammentazione dei mitocondri nelle cellule che sovraesprimono SNCA o che presentano lesioni pS129.
Tutte le procedure descritte in questa sezione sono state eseguite secondo il quadro etico fornito dall'Università dei Paesi Baschi Riferimento M20/2022/212, dal Governo dei Paesi Baschi, dal Governo spagnolo e dall'Unione Europea.
1. Analisi della morfologia mitocondriale in cellule SH-SY5Y sovraesprimenti SNCA
NOTA: Qui viene fornita una breve descrizione della generazione del materiale in vitro per lo studio, che servirà come confronto per i risultati ottenuti in situ . Si raccomanda di eseguire questo tipo di analisi prima di avviare un esperimento in vivo per la morfologia mitocondriale, in quanto garantirà che siano in atto tutte le impostazioni di imaging e analisi appropriate.
2. La generazione di PFF e le iniezioni intracraniche di PFF nei topi
NOTA: La generazione del materiale di iniezione e il processo di iniezione intracranica sono presentati qui. Questo protocollo è adattato da Luk et al.25.
3. Analisi della morfologia mitocondriale mediante immunoistochimica su fette di cervello incluse in paraffina da topi iniettati con PFF
Al fine di garantire che siano in atto le condizioni appropriate per l'imaging e l'analisi per la valutazione in situ della morfologia mitocondriale nei tessuti, si raccomanda un'esplorazione in vitro della morfologia mitocondriale in risposta a un modulatore noto della morfologia mitocondriale (Sezione 1). Ad esempio, SNCA è stato geneticamente sovraespresso nelle cellule SH-SY5Y per indurre cambiamenti nella morfologia mitocondriale come descrittoin precedenza 26. Altri insulti che potrebbero essere usati come controllo per peggiorare la morfologia mitocondriale sarebbero la fame o l'uso di inibitori dell'attività mitocondriale come MPP+. Le cellule sono state trasfettate e colorate per la α-sinucleina (AS) per separare le cellule SNCA+ (AS+) e SNCA- (AS-). Sono stati anche colorati con TOMM2027 per visualizzare la rete mitocondriale di cellule. Per rendere questa analisi il più simile possibile a quella di una sezione di tessuto di 5 μm, è stato analizzato un piano confocale invece di una proiezione massima di più piani. L'analisi morfologica di un piano confocale di TOMM20 ha rivelato che sia il numero totale di mitocondri che il loro rapporto d'aspetto o AR (che è correlato all'allungamento dell'organello) sono stati ridotti in risposta alla sovraespressione di SNCA (Figura 1).
L'immunocolorazione è stata eseguita per la proteina mitocondriale VDAC1 in sezioni cerebrali di topo incluse in paraffina da 5 μm di animali iniettati con PFF, come descritto nella sezione del protocollo sopra. I neuroni dopaminergici della substantia nigra pars compacta (SNc), che subiscono una degenerazione nella malattia di Parkinson, sono stati rivelati attraverso la co-immunocolorazione con l'anti-tirosina idrossilasi (TH) e sono stati separati a livello regionale dall'area tegmentale ventrale e dalla substantia nigra pars lateralis. D'altra parte, la colorazione anti-fosfoSer129-α-sinucleina (pS129) ci ha permesso di discriminare le cellule che ospitavano lesioni pS129 dalle cellule sane (pS129+ rispetto a pS129-). Sono state acquisite immagini SNc di tre diversi animali e la successiva analisi delle immagini della colorazione VDAC1 dei neuroni TH-positivi ha rivelato una riduzione sia del numero mitocondriale che del rapporto d'aspetto tra i neuroni portatori di lesioni pS129 e i neuroni privi di queste (Figura 2). Questi risultati indicano che la morfologia mitocondriale dei neuroni che ospitano lesioni pS129 è compromessa rispetto a quella delle cellule prive di lesioni pS129.
Mentre questo particolare esperimento mostra una riduzione dell'AR, evidenziando così una riduzione dell'allungamento dei mitocondri insieme a una riduzione della conta globale, che indica un peggioramento della morfologia mitocondriale, l'interpretazione dei dati dovrebbe dipendere dall'esperimento. Ad esempio, una riduzione dell'AR e della conta può indicare una riduzione globale del contenuto mitocondriale e della frammentazione, mentre una riduzione dell'AR ma un aumento della conta globale indicherebbe un fenotipo di frammentazione mitocondriale. Pertanto, è importante interpretare i dati nel contesto di entrambe le misure.
Figura 1: Morfologia mitocondriale in un modello in vitro con sovraespressione di SNCA. Co-immunocolorazione per TOMM20 (verde), α-sinucleina (AS, rosso) e DAPI (blu) su cellule sovraesprimenti e non sovraesprimenti SNCA (AS+ e AS-, rispettivamente) (A). Dettaglio di una cella AS- (B) e di una cella AS+ (C). Le immagini in bianco e nero nei pannelli (B) e (C) rappresentano le maschere del segnale TOMM20 dopo l'applicazione della funzione Fiji descritta nella sezione Protocollo. Questa maschera consente di quantificare la forma delle strutture risultanti. La conta mitocondriale e i valori di Aspect Ratio (AR) delle cellule AS- e AS+ (N = 25 cellule per condizione) sono stati quantificati e rappresentati come valori individuali e ± SEM medi; **Valore p < 0,05 t-test (D). La normalità è stata valutata attraverso i test di normalità di D'Agostino e Pearson. Barre graduate: A, 30 μm; B,C, 5 μm. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Figura 2: La morfologia mitocondriale è influenzata dai neuroni che ospitano lesioni pS129. Co-immunocolorazione per TH (verde), VDAC1 (rosso), fosfoS129-α-sinucleina (magenta) e DAPI (blu) del SNc di topi iniettati con PFF (A). Il dettaglio di un neurone dopaminergico fosfoS129-α-sinucleina-negativo (pS129-) e di un neurone dopaminergico (C) fosfoS129-α-sinucleina-positivo (pS129+). Le immagini in bianco e nero nei pannelli (B) e (C) rappresentano le maschere del segnale TOMM20 dopo l'applicazione della funzione Fiji descritta nella sezione Protocollo. Questa maschera consente di quantificare la forma delle strutture risultanti. Le cellule negative e positive sono state contate in campioni di tre diversi animali, come illustrato dai diversi colori dei singoli valori grafici (blu, verde e arancione). La conta mitocondriale e la quantificazione AR di pS129- (N = 29) rispetto a pS129+ (N = 22) nei neuroni dopaminergici sono stati rappresentati come valori medi ± SEM e delle singole cellule; **Valore p < 0,05 t-test (D). La normalità è stata valutata attraverso i test di normalità di D'Agostino e Pearson. Barre graduate: A, 30 μm; B,C, 5 μm. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Nel complesso, questo studio dimostra che l'immunocolorazione combinata con l'analisi delle immagini è un metodo affidabile per analizzare la morfologia mitocondriale. Permette infatti di quantificare il numero di mitocondri e alcuni parametri morfologici come l'aspect ratio sia in coltura cellulare che in tessuto. Il numero di mitocondri è direttamente collegato allo stato funzionale dei meccanismi di fissione e fusione dei campioni, mentre il valore AR si basa sull'allungamento dell'organello. Questo metodo può essere particolarmente utile per la valutazione rapida delle anomalie mitocondriali in modelli di PD in cui l'alterazione della morfologia, della dinamica e delle funzioni mitocondriali sono meccanismi patologici ben noti28,29. Anche la α-sinucleina svolge un ruolo rilevante nella malattia di Parkinson: la α-sinucleina è infatti uno dei componenti dei Corpi di Lewy, gli aggregati fibrillari citoplasmatici che vengono utilizzati per la diagnosi post-mortem dei pazienti affetti da malattia di Parkinson30. Inoltre, mutazioni nel gene SNCA sono state trovate in pazienti con PD sia familiare che sporadica (esaminata in31). È stato ampiamente dimostrato che la fosforilazione della α-sinucleina a Ser129 etichetta la patologia simile al corpo di Lewy, che emerge dopo l'insulto PFF e suscita vari effetti tossici32,26.
Utilizzando lo strumento qui presentato, siamo stati in grado di rilevare una riduzione del numero mitocondriale e dei valori di AR in presenza di α-sinucleina sia sovraespressa che aggregata (cellule con colorazione α-sinucleina e neuroni portatori rispettivamente di lesioni positive alla fosfoSer129α-sinucleina) rispetto alle cellule prive di tali lesioni (cellule negative alla α-sinucleina e fosfoS129α-sinucleina). Questi risultati concordano con i precedenti rapporti che mostrano come le interazioni dirette α-sinucleina-mitocondri producano effetti tossici sulla funzione mitocondriale e sull'omeostasi nel PD26,33, 34. In effetti, è stato riportato che i topi con mutazioni di α-sinucleina mostrano un aumento del danno al DNA mitocondriale35 e alla mitofagia 36,37. Inoltre, è stato descritto che l'aumento dei livelli di α-sinucleina promuove la fissione/frammentazione mitocondriale, induce specie reattive dell'ossigeno all'interno dei mitocondri e disregola l'espressione proteica mitocondriale in linee cellulari e modelli murini che sovraesprimono α-sinucleina 26,38,39.
È importante sottolineare che questo strumento dipende molto dagli anticorpi utilizzati per lo studio; Un'attenta valutazione morfologica del colorante anticorpale utilizzato è indispensabile per individuare il compartimento subcellulare appropriato. Poiché questa tecnica si basa su sezioni di 5 μm e quindi richiede singoli piani focali per l'analisi delle strutture mitocondriali, l'assenza di un fenotipo non escluderà l'esistenza di un fenotipo, in quanto è possibile che sottili differenze nella morfologia mitocondriale non possano essere rilevate con questo metodo.
Mentre questo lavoro e altri hanno precedentemente utilizzato approcci simili per valutare la morfologia mitocondriale in vivo40, è necessario rendere accessibile alla comunità di ricerca un protocollo dettagliato per questa valutazione. L'importanza di questo studio è che è possibile applicare questo metodo a vari modelli di malattia in vivo per valutare le anomalie morfologiche mitocondriali e identificare potenziali patologie, che possono eventualmente facilitare lo screening dei composti guida per il trattamento di tali disturbi. Sebbene questa analisi sia attualmente limitata al tessuto incluso in paraffina, il vantaggio del metodo è che può essere applicato a qualsiasi modello di malattia dopo la raccolta di tessuto terminale, rendendolo uno strumento molto versatile.
Desideriamo segnalare l'assenza di conflitti di interesse.
Desideriamo ringraziare i finanziatori di questo studio, in particolare Ikerbasque, il Ministero spagnolo per la Scienza e l'Innovazione, la Michael J Fox Foundation, l'IBRO e l'Achucarro Basque Center for Neuroscience.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
32 G Hamilton syringe | Hamilton | 7632-01 | |
4',6-diamidino-2-fenilindol, dihidrocloruro (DAPI) | Invitrogen | D1306 | |
4/0 USP 45 cm suture | SSa90 pga | 32345n-36u | |
Alexa fluor 488/594-Donkey anti-Mouse | Invitrogen | A21202; A21203 | green/red dye-Donkey anti-Mouse |
Alexa fluor 594/647-Donkey anti-Rabbit | Invitrogen | A21207 A31573 | red/far red dye-Donkey anti-Rabbit |
AlexaFluor 488-Donkey anti-Chicken | Jackson ImmunoResearch | 703-545-155 | green dye-Donkey anti-Chicken |
Anti-PSer129 α-synuclein EP1536Y (Rabbit) antibody | Abcam | ab51253 | |
Anti-TOM 20 (Mouse) antibody | Santa Cruz | sc-17764 | |
Anti-Tyrosine Hydroxylase (Chicken) antibody | Abcam | ab76442 | |
Anti-VDAC1 (Mouse) antibody | Santa Cruz | sc-390996 | |
Anti-α-synuclein antibody MJFR1 (Rabbit) | Abcam | ab138501 | |
Citrate buffer 100X stock: 120mM citrate buffer, 5% Tween in water (pH 6) | Home-made | ||
Disposable base mold for tissue embedding | Fisher | 22-363-553 | Plastic embedding boxes |
D-MEM F12 | Gibco | A321331020 | |
EVOS M7000 Imaging System | ThermoFisher Scientific | High-content automated fluorescence microscope | |
Fetal Bovine Serum | Gibco | 10270106 | |
Flat optical bottom 96 well plates | Greiner | 675090 | |
FluorSave Reagent | Millipore | 345789-20ML | Mounting reagent |
Glutamine 200 mM | Gibco | 25030-024 | |
ImmEdge Hydrophobic Barrier Pen | Vector Laboratories | H-4000 | PAP-pen |
Lipofectamine and Plus Reagent | Invitrogen | 11668-019; 11514-015 | Transfection reagent and transfection adjuvant |
Matrigel | Corning | 354230 | Coating matrix |
Microtome | ThermoFisher Scientific | ||
Normal Donkey Serum | Gibco | PCN5000 | |
Opti-MEM | Gibco | 31985070 | Transfection medium |
PCDNA4 plasmid (backbone) | Addgene | 41036 | |
Penicillin/Streptomycin solution | Gibco | 15140-122 | |
SH-SY5Y cells/well | ATCC | HTB-11 | |
Xylene substitute | Labbox | 22L36504 | |
Zeiss Axio Imager Apotome 2 | Carl Zeiss | Structured illumination fluorescence imaging system | |
α-synuclein peptide | rpeptide | S-1010-2 |
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