Per iniziare, ispeziona i muscoli di interesse sezionati dal topo sacrificato per l'assenza di schegge ossee o bordi frastagliati e tagliali via con forbici affilate, se necessario. Pesare i muscoli puliti utilizzando una bilancia analitica e registrare il loro peso. Dopo aver posizionato il muscolo in almeno 0,1 millilitri di SDS all'1% per milligrammo di peso, posizionare la piastra del pozzetto su uno shaker a dondolo impostato a 50-80 Hertz.
Ispezionare visivamente periodicamente la soluzione SDS. Quando la soluzione diventa torbida, rimuovere la soluzione con una pipetta senza aspirare i muscoli e sostituirla con un volume uguale di SDS fresca all'1%. Quando la soluzione rimane limpida per 24 ore, rimuovere la soluzione SDS finale dai muscoli decellularizzati e sostituirla con un volume uguale di PBS.
Ispezionare i muscoli decellularizzati con uno stereomicroscopio e rimuovere con cura eventuali peli o detriti attaccati al muscolo utilizzando una pinza. Rimuovere con cautela il PBS e sostituirlo con un volume uguale di formaldeide al 3,7% prima di rimettere la piastra nello scuotitore a dondolo per 24 ore.