Per iniziare, apri MATLAB, quindi vai alla cartella in cui sono salvati i file raw e irs. Seleziona e apri la cartella. Digita Homer3 nella finestra di comando di MATLAB per avviare la GUI di Homer3.
Homer3 rileverà i file nirs e chiederà di convertirli in formato snirf per procedere con la pre-elaborazione dei dati. Dopo aver convertito i file, fare clic sull'opzione Strumenti e selezionare Modifica flusso di elaborazione. Nella GUI di modifica del flusso di processo, selezionare i passaggi di pre-elaborazione dalla colonna della funzione del Registro di sistema alla colonna del flusso di elaborazione corrente facendo clic su Aggiungi.
Fare clic sull'opzione Salva per salvare il flusso di elaborazione corrente, quindi uscire dalla GUI di modifica del flusso di processo. Fare clic sull'opzione RUN per eseguire il flusso di pre-elaborazione nella GUI principale di Homer3. Al termine dell'esecuzione del flusso di elaborazione selezionato, Homer3 salverà le serie temporali pre-elaborate per ciascun partecipante in un formato di file mat contenente HBO, HBR e HBT per tutti i canali e gli eventi.
Una cartella denominata derivati verrà creata da Homer3 nella cartella selezionata per memorizzare questi file. Selezionare la cartella homer che si trova nella cartella delle derivate. Scegli il file mat per ogni cervello ed esporta HBO, HBR, HBT.