Inizia creando un'immagine composita utilizzando le quattro immagini ottenute da ciascun mouse. Utilizzare un editor grafico per allineare tutti i vasi sanguigni, utilizzare la testa del nervo ottico e i modelli dei vasi sanguigni come punti di riferimento per l'allineamento del grammo di fibre composite sovrapporre le immagini composite e le immagini confocali della stessa retina colorata con ICAM2, per ottenere l'allineamento in vivo ed ex vivo. Il grammo di fibra vis-oct composito viene confrontato con la corrispondente immagine confocale della retina montata piatta.
Immunocolorazione con TUJ1 per assoni RGC. I vasi sanguigni presentano strutture ramificate distinguibili che possono essere abbinate ai vasi sanguigni marcati ICAM2 sull'immagine confocale. Il confronto fianco a fianco tra microscopia confocale ex vivo e vis-oct in vivo ha rivelato reti di fasci assonali RGC identiche e vascolarizzazione retinica circostante.
