Per iniziare, prepara un serbatoio semiesagonale, una piastra di base e uno stadio di testa. Posizionare il serbatoio semiesagonale sulla piattaforma sperimentale del microscopio. Puntare la luce infrarossa a 810 nanometri e la telecamera sul palco principale per la registrazione comportamentale.
Quindi, impostare un filtro passa-corto da 875 nanometri e un filtro passa-lungo da 700 nanometri davanti alla telecamera per evitare che il laser a due fotoni e lo stimolo visivo interferiscano con la registrazione comportamentale. Per presentare lo stimolo visivo, fissare delle pellicole di retroproiezione sul lato interno delle tre pareti del serbatoio semiesagonale. Puntare i tre proiettori verso le tre superfici del serbatoio.