Per iniziare, avviare il software 3D Slicer. Per l'inserimento di immagini dei siti di erosione ossea identificati, fare clic sul pulsante Dati nella finestra 3D Slicer. Quindi premere Scegli file per aggiungere e individuare le singole immagini per aggiungere i file.
Per importare un'intera directory di immagini contemporaneamente, premere l'opzione Scegli directory da aggiungere, quindi cercare e inserire la directory preferita. Quindi, fai clic sul menu a discesa della barra degli strumenti di 3D Slicer. Passare il cursore sui moduli di analisi ossea e fare clic su Maschera automatica.
Nella scheda Passaggio 2 Maschera automatica, scegli un volume di ingresso dal menu a discesa del volume di ingresso. Seleziona Crea nuovo volume mappa etichette nel menu a discesa della segmentazione dell'output. Se si preferisce un'altra etichetta di output, fare clic su Crea nuova etichetta mappa volume come e fornire l'etichetta desiderata.
Inserisci il numero di ossa da mascherare nella casella di testo fornita, quindi seleziona ORMR o Doppia soglia dal menu a discesa dell'algoritmo. Fare clic su Ottieni maschera per eseguire l'algoritmo e visualizzare un risultato nella directory dell'immagine corrispondente. Se l'immagine contiene più ossa, verrà salvata una maschera separata per ciascuna di esse.
Per importare una maschera binaria in 3D Slicer, copiare i file della maschera nella directory di caricamento delle maschere che si trova nella cartella BAM. Tornare alla finestra 3D Slicer e fare clic sulla scheda Passaggio 3: Correzione manuale. Per caricare i file maschera e convertirli automaticamente in segmentazioni slicer, fare clic su Carica.
Per apportare modifiche alla maschera, utilizzare gli strumenti forniti nella scheda di correzione manuale. Per avviare l'analisi statistica, fare clic sul modulo del volume di erosione dal menu a discesa sulla barra degli strumenti. Carica un'immagine e la maschera corrispondente.
Selezionare l'immagine e la maschera di input, creare una segmentazione di output e posizionare i punti di partenza sull'erosione. Fare clic sul pulsante Ottieni erosioni per avviare l'algoritmo di misurazione dell'erosione. Se le dimensioni e la forma dei volumi di erosione rilevati automaticamente non sono soddisfacenti, modificarli manualmente nella scheda Passo 5 Correzione manuale.
Ora fai clic sulla scheda denominata Passaggio 6 Statistiche per esportare i dati del computer in un file di foglio di calcolo. Successivamente, inserisci il volume di erosione nel menu a discesa denominato Erosioni di input. Ora fornisci l'immagine in scala di grigi e la sua larghezza voxel in millimetri nella casella di testo sotto il menu del volume principale.
Fare clic su Ottieni statistiche per generare un file di foglio di calcolo nella directory dei dati di output di Erosions che si trova nella cartella BAM.
