Per iniziare, aggiungi 150 millilitri di perline di vetro pulite da cinque millimetri al barattolo pulito e chiudi il coperchio. Coprire il barattolo chiuso con un foglio di alluminio sufficiente a nascondere il coperchio-giunzione del barattolo e sterilizzare in autoclave a 121 gradi Celsius per 20 minuti. Quando le piantine sono pronte per essere trasferite nel barattolo sul banco sterile, rimuovere il foglio di alluminio e il coperchio del barattolo.
Aggiungere 35 millilitri di terreno Murashige e Skoog a mezza forza con pH compreso tra 5,7 e 5,9 nel barattolo e mescolare le perline per ricoprire uniformemente il terreno. Introduci da tre a cinque piantine nel barattolo, assicurandoti che gli apparati radicali siano posizionati tra le perle di vetro. Regolare le perline con pinze sterili o cucchiai per coprire le radici e sollevare le foglie dal substrato.
Fissare due strisce di nastro microporoso da 1,25 centimetri sulla parte superiore del barattolo e posizionare delicatamente il coperchio sopra. Sigillare lo spazio tra il coperchio e il barattolo con nastro microporoso da 2,5 centimetri per mantenere la sterilità consentendo il ricambio d'aria e posizionare il barattolo in una camera di crescita. Quando le piante raggiungono l'età desiderata, rimuovi il nastro microporoso e il coperchio dal barattolo.
Aliquotare 20 microlitri di terreno di coltura su piastra LB Agar per il test di sterilità. Utilizzando una pipetta volumetrica da 25 millilitri, rimuovere quanto più terreno di coltura possibile senza danneggiare le radici. Aggiungere 50 millilitri di terreno di raccolta lungo la parete del barattolo per evitare di bagnare le foglie.
Chiudere il barattolo con un coperchio e incubare in condizioni sterili per due ore. Dopo l'incubazione, rimuovere la quantità desiderata di terreno di raccolta nelle provette. Misura il peso della radice e del germoglio della pianta in un barattolo per normalizzare gli essudati radicali in base al peso della pianta.
Le piante di Arabidopsis thaliana sembravano sane in due diversi laboratori. Il sistema dei barattoli di vetro si è dimostrato adattabile a varie specie vegetali e fasi di sviluppo. Il frumento ha avuto il peso più elevato, seguito dal sorgo e dal pomodoro.
Mentre il sorgo ha avuto il peso radicale più elevato, seguito dal frumento e dalla Medicago truncatula. L'inoculazione di Arabidopsis thaliana con batteri commensali non ha alterato il fenotipo della pianta e i batteri inoculati sono persistiti nel sistema per almeno 12 giorni con un leggero aumento delle unità formanti colonie.
