Per iniziare, rimuovere il PBS dai cervelli di Drosophila sezionati con una breve centrifugazione. Quindi aggiungere 600 microlitri di tampone di lisi dell'RNA al campione e omogeneizzare 10 volte con un pestello di plastica. Ispezionare il tubo al microscopio stereoscopico per una lisi completa.
Centrifugare a 1000 g per 5 minuti a 4 gradi Celsius per rimuovere i detriti di tessuto. Trasferire il surnatante eliminato in una nuova provetta per microcentrifuga. Isolare l'RNA utilizzando un kit di micro preparazione dell'RNA seguendo le istruzioni del produttore.
Per le cellule S2, rimuovere il PBS e isolare l'RNA. Determina la purezza e la quantità dell'RNA misurando il rapporto di densità ottica a 260 e 280 nanometri. Per preparare il campione per l'elettroforesi, diluire il campione di RNA a 40 nanogrammi per microlitro e aggiungere il colorante di caricamento dell'RNA.
Riscaldare i campioni a 70 gradi Celsius per 5 minuti. In un gel di agarosio, caricare la scala dell'RNA e i campioni. Eseguire l'elettroforesi in tampone MOPS a 100 volt per 60 minuti e visualizzare il gel su un transilluminatore UV.
La visualizzazione di RNA isolati da cervelli larvali di Drosophila mediante elettroforesi di agarosio ha mostrato una singola banda di RNA a circa 600 nucleotidi, indicando una preparazione di RNA intatta.
