Per acquisire una coltura anaerobica mista al suolo, spingere lo strumento di carotaggio nel sedimento del campo fino a quando la parte superiore del cilindro di raccolta del campione non viene lavata con la superficie del sedimento. Ruotare il carotiere a 90 gradi per liberare il nucleo e tirare verso l'alto fino a quando il campione non viene estratto dall'ambiente. Per i sedimenti sciolti, coprire la base del carotiere con una nuova mano guantata di nitrile per evitare che il campione cada o si disperda nell'acqua durante l'estrazione.
Approssimare rapidamente a occhio sei o sette centimetri dalla base del torsolo e affettarlo per separare il fondo. Trasferire immediatamente il fondo del nucleo in un flacone di coltura, riducendo al minimo l'esposizione all'atmosfera aerobica. Dopo il trasferimento, riposizionare immediatamente il tappo e tenerlo in posizione con il tappo a vite.
Conservare il campione al fresco e refrigerare il flacone di raccolta a quattro gradi Celsius al ritorno in laboratorio.
