Una volta raccolto un set di dati TIMS TOF MS/MS in modalità passiva di acquisizione dipendente dai dati, o DDA, eseguire l'acquisizione indipendente dai dati, o DIA, sull'applicazione software di mobilità ionica. A tale scopo, caricare prima il metodo DDA salvato in precedenza. Cambia la spettrometria di massa in frammentazione passiva DIA.
Lasciare invariate tutte le altre impostazioni. Nella scheda MS/MS, selezionare modifica finestre, quindi utilizzare il pulsante Apri analisi situato nella parte superiore della finestra pop-up DIA e caricare il set di dati DDA salvato in precedenza. Quando in basso a sinistra viene visualizzata una mappa termica che mostra un poligono di finestre che attraversano diagonalmente il grafico, fare clic e trascinare per ridimensionare il poligono in modo che si adatti ai dati nella mappa termica.
Impostare il numero di finestre di mobilità in base alla larghezza di massa e la sovrapposizione. Fai clic su Calcola finestre in basso a destra del pop-up per vedere le finestre visualizzate con le nuove impostazioni. Una volta adatto, fare clic su Applica.
