Dopo aver eseguito la risonanza magnetica ad alta risoluzione, converti i file di scansione DICOM pesati in T1, pesati in T2 e con eco a tempo zero da DICOM al formato NIfTI utilizzando lo strumento dcm2niix. Utilizzando lo strumento SimNIBS Charm, eseguire la co-registrazione e l'estrazione della maschera tissutale. Quindi, apri Brainsight.
Fare clic su Nuovo progetto vuoto e caricare l'immagine NIfTI pesata T1 del partecipante. Fare clic sulla scheda Ricostruzioni e quindi sul menu a discesa Nuova ricostruzione. Fare clic su Skin, seguito da Compute Skin nella nuova finestra.
Una volta completato, fai clic sul pulsante Chiudi nell'angolo in alto a sinistra della finestra. All'interno della scheda Ricostruzioni, fai clic sul menu a discesa Nuova Ricostruzione, seguito da Full Brain Curvilinear. Ora regola la posizione della casella verde sui piani sagittale, coronale e trasversale trascinando i suoi bordi per circondare strettamente il cervello.
Scorrere tutte le fette per assicurarsi che i bordi del tessuto non si sovrappongano. Fare clic su Calcola curvilineo e regolare la profondità di pelatura a quattro millimetri. Quindi fare clic sulla scheda Punti di riferimento su Brainsight, quindi su Configura punti di riferimento.
Posiziona il mirino sulla punta del naso e, nel campo del nome, etichetta il punto di riferimento Naso. Quindi posiziona il mirino tra gli occhi sopra il ponte del naso ed etichetta il punto di riferimento Nasion. Quindi, posiziona il mirino sull'orecchio sinistro ed etichetta il punto di riferimento L Ear.
Quindi posiziona il mirino sull'orecchio destro ed etichetta il punto di riferimento R Ear. Successivamente, fai clic sulla scheda Destinazioni, quindi su Configura destinazioni. Posiziona il mirino sulla posizione del bersaglio desiderato e usa gli interruttori angolari sul lato destro dello schermo per impostare l'angolo di traiettoria.
Una volta selezionati l'obiettivo e la traiettoria desiderati, fare clic sul nuovo menu a discesa e scegliere Traiettoria. Per assegnare un nome alla destinazione, digitare nella casella di testo accanto a nome. Fare clic su Esporta per esportare la destinazione e salvarla nella cartella dell'oggetto appropriata.
Apri BabelBrain e seleziona i file necessari per le simulazioni acustiche e termiche. Per selezionare il file di testo precedentemente esportato da Brainsite, fare clic su Seleziona Traiettoria e scegliere il file partecipante appropriato. Fare clic su seleziona SimNIBS, per scegliere il file SimNIBS creato in precedenza.
Fare clic su Seleziona T1W e scegliere l'immagine pesata T1 prodotta e utilizzata in precedenza per la mappatura di target e traiettorie. Ora scegli CT reale per le scansioni TC, CTE per le scansioni CTE o no per utilizzare una maschera semplificata generata dallo strumento Charm. Quando si utilizza un'immagine CT o CTE, fare clic sul menu a discesa Coreg, seguito da CT a RM. Fare clic su Seleziona e scegliere l'immagine corrispondente dal file del partecipante appropriato.
Fare clic su Seleziona profilo termico e scegliere il file del profilo termico che descrive i parametri di sonicazione dell'esperimento in termini di durata, durata e ciclo di lavoro. Quindi fare clic sul menu a discesa accanto a Trasduttore e selezionare il trasduttore utilizzato per la sperimentazione. Fare clic sul menu a discesa accanto al backend di calcolo e scegliere il backend di calcolo del computer che esegue le simulazioni.
Una volta inserite tutte le informazioni, fai clic su Continua per completare il resto delle simulazioni. Ora seleziona la frequenza degli ultrasuoni del trasduttore e i punti appropriati per lunghezza d'onda. Fare clic su Calcola maschera di pianificazione.
Ispeziona l'immagine per assicurarti che i limiti della pelle, del cranio e del cervello siano stati riconosciuti con precisione. Per la simulazione acustica, fare clic sulla scheda Passaggio 2 AC Sim per aprire. Regola la distanza dal cono alla macchia focale digitando la distanza appropriata.
Per eseguire la simulazione, fare clic sul pulsante Calcola campi. Regolare il valore ZSteering in modo che il puntatore a croce si trovi al centro del punto focale. Premere le frecce su o giù o inserire manualmente il valore desiderato.
Quindi fare clic su Calcola campi. Per la simulazione termica, fare clic sulla scheda Passaggio 3 Simulazione termica, quindi fare clic su Calcola campi termici.
