Analisi dell'espressione di TMOD3 in pazienti resistenti e sensibili alla chemioterapia a base di platino e analisi dell'mRNA-miRNA

Per iniziare, vai al plotter ROC e fai clic su Plotter ROC per il cancro ovarico. Inserire TMOD3 nella casella del simbolo del gene. Nella casella di risposta, scegli Sopravvivenza libera da recidiva a 6 mesi.

Nella casella di trattamento, selezionare Platino. Quindi fare clic su Calcola per ottenere i risultati. Vai su TargetScan e inserisci TMOD3 nella casella Inserisci un simbolo del gene umano.

Allora vai a vedere cBIOPortal. Ora scegli Cistoadenocarcinoma sieroso ovarico, set di dati TCGA Nature 2011. Inserire i simboli TMOD3 e miRNA nella casella Enter Genes.

Fare clic su Invia query per ottenere i dati di correlazione di TMOD3 con i miRNA nel set di dati sul carcinoma ovarico TCGA. Successivamente, visualizza il risultato con Avanti, vai su LinkedOmics e seleziona la coorte di campioni TCGA OV. Scegliere quindi Clinico nella casella Seleziona set di dati di ricerca.

Selezionare Platinum_status nella casella Seleziona attributo set di dati di ricerca. Quindi, scegli il sequenziamento dei miRNA nella casella Seleziona set di dati di destinazione. Scegli T-test in Seleziona metodo statistico e fai clic su Invia query per ottenere i risultati.

L'espressione di TMOD3 è risultata significativamente ridotta dopo chemioterapia a base di platino in pazienti con carcinoma ovarico altamente sensibile rispetto a quelle non trattate. L'espressione di TMOD3 era significativamente più alta nelle pazienti con carcinoma ovarico con resistenza al platino rispetto a quelle con sensibilità al platino, e la curva ROC ha mostrato TMOD3 come marcatore per determinare la resistenza al platino. Sono stati identificati 21 microRNA che hanno come bersaglio TMOD3, la maggior parte dei quali associati alla resistenza al cisplatino nel carcinoma ovarico, e has-miR-133a-3p è significativamente correlato negativamente con l'espressione di TMOD3 e scarsamente espresso nei tumori resistenti al cisplatino.