Per iniziare, ottenere la pianta di Nicotiana benthamiana infiltrata con le cellule dell'Agrobacterium tumefaciens che ospitano i vettori desiderati. Per gli studi di localizzazione delle proteine, raccogliere due foglie da due piante in momenti diversi dopo l'infiltrazione. Con l'aiuto di una lama tagliare la zona di infiltrazione a fette lontano dalla vena.
Posizionare il campione di tessuto con il lato aassiale rivolto verso l'alto su una goccia di acqua sterile al centro di un vetrino da microscopio. Coprire il vetrino con un vetro di copertura assicurandosi che non rimangano intrappolate bolle. Visualizzare il segnale fluorescente dei tag autofluorescenti nell'area infiltrata con un microscopio confocale a scansione laser.
Raccogli 20 immagini per ogni condizione utilizzando almeno due repliche biologiche indipendenti. Punteggio della localizzazione plasmodesmale della proteina testata in base all'aspetto diagnostico puntato del segnale alla periferia della cellula. Le proteine TVCV, MP-EGFP e PDL5-EGFP hanno dimostrato una chiara localizzazione del puntato nei plasmodesmi.
Mentre PDCB1-EGFP ha mostrato localizzazione sia ai plasmodesmi che al reticolo endoplasmatico il primo giorno, dopo l'infiltrazione. Sia MP che PDLP5 hanno iniziato ad accumularsi nei plasmodesmi il primo giorno dopo l'infiltrazione, raggiungendo la massima intensità il secondo giorno e rimanendo stabili per cinque giorni. PDCB1 ha mostrato una forte localizzazione del reticolo endoplasmatico fino al terzo giorno, dopodiché la localizzazione plasmodesmale è diventata visibile in un minor numero di cellule.