生殖クローニングとは、生物全体を遺伝的に同一のコピー（クローン）を作り出すプロセスのことです。一卵性双生児のように初期胚を分割してクローンを作ることもできますが、成体動物のクローンは通常、体細胞核移植(SCNT)と呼ばれるプロセスで行われます。

体細胞核移植

SCNTでは、動物から卵細胞を採取し、その核を除去して無核卵を作ります。次に、クローンを作ろうとする動物から体細胞（性細胞以外の細胞）を採取します。体細胞の核は、直接注入するか、電流を流して体細胞を卵子に融合させるかして、無核卵に移植されます。

卵の中には、クローンを作る動物の染色体DNAを持つ核が入っています。

この卵子には、クローンを作る動物の染色体DNAを持つ核が含まれており、この核を刺激して分裂させて胚を作り、代理母の子宮に移植します。うまくいけば、正常に成長し、クローンが誕生します。

この方法で羊、牛、ラバ、ウサギ、犬など様々な動物のクローンを作ることに成功していますが、成功率は低く、生まれてくるまで生き延びることができるのはごくわずかです。出生までこぎつけたクローン動物は、老化して早死にするようです。これは、通常の老化現象であるテロメア短縮（細胞分裂のたびに染色体の保護末端の一部が失われること）を起こした成体細胞のDNAを使用しているためです。

クローンの染色体DNAは核提供者のものと同じですが、ミトコンドリアDNAは異なる動物の卵細胞の細胞質から来ているので、クローンは異なるミトコンドリアDNAを持つ可能性があります。また、環境やエピジェネティックな要因により、クローンと元の動物の間に表現型の違いが生じることもあります。例えば、最初のクローン猫であるCcは、元の猫とは全く異なる姿をしていました。これは、毛並みのパターンが、異なる細胞におけるランダムなX染色体の不活性化によるものだからです。

技術的な課題はありますが、生殖クローニングは、遺伝的に同一の研究用動物、希望する形質を持った家畜、絶滅危惧種の子孫の生産など、多くの用途が考えられます。また、人間の不妊症や病気にも応用できる可能性がありますが、人間のクローン作成はまだ行われておらず、倫理的な問題もあります。