Method Article
このプロトコルでは、発展途上の人間の脳のジカ ウイルス感染症をモデルに使用されるテクニックについて説明します。野生型または設計の幹細胞ラインを使用して、研究者は、様々 なメカニズムや初期の脳の感染症やジカ ウイルス感染胚の結果小頭症影響を与える治療法を明らかにするのにこの方法を使用可能性があります。
影響を受けやすい集団でジカ ウイルス (ZIKV) の最近の出現は、小頭症の急激な増加と新生児の神経発達等につながっています。蚊がウイルス感染の主なルートが、それはまた、性的接触と垂直の母-胎児感染を広めるため示されています。伝送、ZIKV の独自のウイルス親和性のための後者の場合、ウイルスでは、発展途上の脳の神経前駆細胞 (Npc) を主にターゲットと考えられます。
ここで ZIKV 感染、および結果の小頭症のモデリング手法、発生した人間脳オルガノイドを公開するとき説明されて ZIKV のライブです。オルガノイドの神経前駆細胞集団内でウイルスの高レベルを表示、時間をかけて深刻な細胞死と小頭症を展示します。この三次元脳におけるモデルでは、観察し、発展途上の人間の脳の ZIKV 感染症潜在的介入種照合実験を行う研究者をことができます。モデルは、標準的な二次元方法上関連性の向上を提供し、ひと特異細胞アーキテクチャと動物モデルでは不可能な蛋白質の表現が含まれています。
ジカ (ZIKV) アメリカ、フランス領ポリネシア、ミクロネシアに急速に広がっているし、最近の十字このような神経疾患につながる発展途上の胎児の脳に感染する胎盤バリア1,2に示されています。小頭症3,4,5,6 。これらの患者の生活と治療の現在の不足に長期的な影響は、研究者や臨床医は、ZIKV の感染および複製の背後にあるメカニズムの理解を深めるためにスクランブルをかけることにつながっています。以前の調査された各種生理学的に関連する細胞の種類7,8,9、10と生体内での in vitroシステムの ZIKV 感染症免疫と免疫不全マウス11,12,13ヒト以外の霊長類14,,1516。これらの従来の技術に加えて、いくつかのグループは発展途上の人間の脳の ZIKV 感染症についての詳細を理解する幹細胞由来脳オルガノイドを実装しています。これらのグループは、小頭症の表現型17,18を確認、ウイルス エントリ19にリンクされている受容体を調査、感染症20生理学的反応を調べる人間の脳オルガノイドを利用して,21、および可能性のある薬物候補22の画面。ここで19、発展途上の人間の脳の ZIKV 感染症の理解を深めるために示したように、急速に生産と幹細胞由来脳オルガノイドを感染させるためのテクニックが記載されています。
Organoids は標準的な多能性幹細胞 (PSC) の培養から形成される、のでこの技法は発展途上の脳のウイルス感染について答えられる様々 な科学的な質問のできます。たとえば、CRISPR 工学はほとんど生体内で遺伝的研究19よりも速い速度で organoid 感染する前にこれらの PSC のラインを変更する使えます。さらに、標準の 2 次元 (2 D) 分化文化で違っても内因、にとって重要な複雑な細胞アーキテクチャ organoids 展示し、最近の研究は、このアーキテクチャが感染時に中断されることが示されています。21。最後に、オルガノイドを生成する比較的低コストにより高いスループット実験・検診体内モデルと比較した場合。その一方で、ZIKV を勉強するオルガノイドの使用率にいくつかの欠点があります。Organoids は 2D の文化よりもはるかに多く生体関連、オルガノイドの三次元 (3 D) 性質の評価において新たな課題があります。イメージングとオルガノイドの解離より多くの機器と標準的な 2 D の文化よりも資源の大規模な投資を伴う傾向があります。さらに、血管およびウイルス感染のさまざまな側面に興味がある研究者は、代替のプロトコルを追求する助言されるので生体内でモデルに存在している免疫のコンポーネント オルガノイドを欠いています。
人間オルガノイド培養、細胞の形成技術の数があり、彼らは通常パターンまたはというカテゴリに分類します。パターン化されたメソッドは、特定の系統23へ分化をプッシュする wnt シグナル、BMP、TGFβ、および他のシグナル伝達経路を調節する因子を実装します。ここで、説明などという方法を誘導多能性幹細胞 (Ips) のための傾向の活用しヒト胚性幹細胞 (hESCs) で神経系統に区別するために既定の24。分化の約 3 週間後、結果 organoids は初期の脳の発達で観察されるいくつかの細胞の種類を含む大規模なバイオミメティック上皮細胞内構造体で構成されます。
標準、無料のフィーダーの PSC 文化からオルガノイドの生産および ZIKV のこれらのオルガノイドを感染手法が完全に表示されます。フィーダー無料 Psc に必要な培養方法については、前の方法出版物25,26を参照してください。さらに、一貫性のある複数の実験のためにウイルス量を適用するために、事前に慣性モーメントを計算することが重要です。これは、オーバーレイ媒体、インキュベーション、免疫染色と治療が続きます、Vero 細胞への感染を行うことにより行われます。説明、このテクニックの方法は、前述の19,27をされています。
PSC 文化 50%-70% のターゲット合流点に達すると、細胞は、解離、超低添付ファイル 96 ウェル プレートに集約。セルは、xeno 無料幹細胞維持培地 (SCMM) で 3 日間維持して、文化の残りの部分の神経誘導メディアに変換されます。3 週間、オルガノイドを設けて、一度感染症が実施できます。日常的に感染症を次の週の間に撮影し、研究者は進歩的な細胞死と、organoid の混乱を確認します。研究者は可能性がありますもこの転写を行う時間やプロテオームのプロファイリングで、オルガノイドを切り離して考えます。イメージング、セクショニングおよび lightsheet メソッドが推奨され、研究者が感染症やウイルスの複製、オルガノイドの神経前駆細胞 (NPC) 集団の内で特に高いレベルを見ると期待できます。最終的には、このテクニックは、急速に低コストと限られた機器と人間の脳のウイルス感染のメカニズムを解明する研究者をことができます。
1。 iPSC から脳オルガノイドの作成/hESC 2D 文化 (0 日)
注: このプロトコル幹細胞 (SC) メンテナンスはビトロネクチンまたは Geltrex と SCMM 培地で行われている前提としています。基板。代替、高蛋白質の幹細胞を培養メディアを使用している場合は organoid 形成を開始する前に移行 SC 文化 SCMM が少なくとも 2 つの通路のことをお勧めします。プロトコルはフィーダー ベース SC 文化方法でテストされていません
。2。脳におけるメンテナンス (日 2)
50 mL コニカル チューブ 50 mm Y-276433。脳におけるメンテナンス (日 3)
4。脳におけるメンテナンス (日 4 +)
注: 感染まで毎日この定期的なメンテナンスを実施します
。5。ZIKV Organoid 感染 (〜 24 日)
注: 分化、そこの wi の約 3 週間後ll が大規模な上皮細胞内構造とロゼット ZIKV に高い感受性となる organoid 内に表示します
。Organoid 成立の日、SC 文化する必要があります図 1(A ~ C)に示すように 50%-70% の合流を彼らログ成長期であります。文化は、明確なエッジを持つ丸みを帯びたコロニーを形作るべきである、井戸は図 1(D E)の分化の明確なはずです。差別化が発生している場合は、オルガノイドを作成する前に、少なくとも 1 日プレート内で影響を受ける領域をきれいにする - 削除する選択を実施することをお勧めします。文化の大部分は区別される場合は、余分な通路を実施、新しいバイアルを解凍または幹細胞の培養技術、organoids が純粋な幹細胞の培養によって形成されていることを確認するを変更する必要があります。
無料の酵素、酵素分離試薬処理の組み合わせによる解離は、カウント時に観測された細胞の小さな集合体がまだかもしれないけれどもほとんど単一のセルにつながるはずです。カウント精度に影響を与える可能性がありますが小さな集合体の存在は organoid 形成を妨害する表示をされません。複数のカウントは、1 サンプルあたりの作られています、さらに細胞を複数形に解離時間を増やす必要がありますカウント 20% 以上異なる場合は、それをお勧めします。
一度セルをシードして ULA U 下 96年ウェル プレート (図 2A) でスピンダウン、各井戸の底で細胞のフラット、高密度シートとして表示されます。セルは、次の 2 日にわたってゆっくりと集計されます。機械力が緩く形成された骨材を混乱させるようにこれらの 48 時間の間にプレートを邪魔しないようにお勧めします。最初の 10 日間、organoid 球状、大抵し、600 800 μ m (図 2B) に ~ 300 μ m からなります。10 日目と 20 日目 organoid に表示し始めるより多くの観察可能な構造 (図 2C E)。24 日までに、研究者が明視野顕微鏡 (図 2F) 経由でロゼットのような構造を観察するはずです。文化を続けながらこれらの上皮細胞内構造が数日間 (図 2G) 量およびサイズの増加します。フィードの中に研究者は特に文化の最初の 2 週間の間に各井戸の底に収集破片のかなりの量を注意してください。手順 2.2 で説明した分散技術は、複数のフィード (図 3A) 上の蓄積からアポトーシスの破片を防ぐためにこの細胞の破片のほとんどを削除します。この残骸は、イメージングを妨げることができることそれを観察し、感染で誘導される細胞死を定量化するが難しい、分化に影響を与えることができる近隣 organoid に非対称シグナリングを提供したり。分散技術が正しく行われている場合、これはする必要があります (図 3B C, 3 D 電子) を削減します。
凍結切片又は lightsheet イメージング、organoids 内に形成する皮質構造を検査することをお勧めします。日 25 オルガノイドのロゼット構造と心室のゾーンは DAPI (図 4A) とリン酸化ビメンチン (図 4B) 染色で明確に表示されます。TBR2 の存在 (図 4C) 外側の移行を示唆する形態と中間体の前駆を形成することを示します。MAP2 + (図 4D) ニューロンはそれぞれのロゼットの外側の領域を設定します。これらのタンパク質から 1 つは心室ゾーン (VZ) や脳室下帯 (SVZ)、中間帯 (IZ) 内各ロゼット皮質板 (CP) を可視化できる (図 4E、4 e ')。1 つは、開発の後の段階を観察するためにこれらのオルガノイドを文化を継続できます。皮質の階層化は organoid のこのタイプのように顕著ではない、これは生体内では同じよう gliogenesis に自然のスイッチは多く発生は。これは日 108 organoids、セルの大部分が MAP2 または GFAP を表現で観察できる (図 4F-私)。
ユーザーが organoids (図 5A B) に適用されるウイルスの慣性モーメントによって、ZIKV 感染後約 3 日間におけるサイズの違いを参照してくださいに望む可能性があります。これらの 3 日後があります増加細胞の残骸のモックの井戸に比較して感染した井戸。Organoid サイズのこの違いは、次の週、感染した organoids 開始を離れて (図 5C D) を破るまでに増加します。様々 なアッセイは、ウイルスの RNA の抽出およびセクショニング (材料のテーブルで報告された抗体を推奨) などの感染メカニズムを調査するためこの時点で使用可能性があります。セクショニング、時にユーザーは、上皮細胞内構造の根尖部におけるウイルスの大規模な存在観察し、神経前駆細胞 (Npc) の ZIKV 感染症 (図 6) の感受性を示唆しています。断面オルガノイドの蛍光も感染 organoids (図 7) 切断カスパーゼ 3 発現増加が表示されます。
図 1: Organoid 形成前に幹細胞コロニーの形態。
植民地は、一貫性のあるオルガノイドの数が多いを生成する解離の時に 50%-70% の合流をする必要があります。(A)スパース、最近シード文化に到達していないログ成長フェーズ、多く organoids は生成されません。(B)細胞が適切な合流点に達すれば、それらは、解離の準備ができて。これらの植民地が分化のクリアされることを確認する検査が重要です。(C)余りにずっと取られるコロニー上空の合流点に達するし、organoid 形成には推奨されません。この状態で文化はより細胞を含む可能性があります。(D)コロニー エッジは付けるべきである、中心部の丸い細胞の一貫した細胞の形態と若干延長端に向かって細胞。(E)最小限の分化は文化に存在する必要があります。大きく、平らにされた細胞の中心または植民地 (白い矢印) の枠で観察される文化の 1 割以上を占めて、ピックアップを削除または追加の通路が制服の幹細胞集団を形成するため行われているをお勧めします。 この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。
図 2: 時間の経過と共に脳における成長します。
(A) 2 D から脳オルガノイドの生産のための図の Psc xeno フリー、フィーダー フリー培地で維持されます。(B)最初の 8 日間、organoids 残りますほとんどいくつかの検出機能を備えた球状。(C ・ E)は、500 μ m に 10 日目で約 300 μ m から、organoid の直径の範囲が、明確な地域、オルガノイドの周囲を検出が開始されます、球形の形を失います。彼らは、オルガノイドを生成する細胞ラインに大きく依存し、直径約 1 mm のサイズに増加していきます。(F)分化の約 20 日後ユーザーは、ほとんどオルガノイドの明確な周辺地域における上皮細胞内構造 (黒矢印) の形成を観察するが。これらは模倣して大脳皮質の樹状突起と基底構造を持つリングのような形態があります。(G)これらの上皮細胞内の構造は成長し、約 20-30 日間のサイズが増加していきます。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。
図 3: 分散による細胞の残骸の清算フィード技術。
Organoid 成長中に大量の細胞死が予想される、organoid 基礎を取り巻く細胞の残骸の蓄積につながることができます。(A)描かれた分散技術は、各フィードの中にこの破片のほとんどを削除する研究者をことができます。マルチ チャンネル P200 ピペットを使用してこれを行うに使用される媒体をゆっくり引くし、急速に懸濁液に organoid や細胞の破片を持ち上げるそれを追放します。その時点で通常のフィードを行うことができる、井戸の底、organoid すぐにドロップします。(B)前に、とかなりゴミ削減を示しています(C)分散摂食後 6 日目 organoid の例です。日 18 organoid 前(D)に、と(E)分散供給後で示すように、これは数週間続きます。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。
図 4: 免疫組織化学による脳オルガノイドのキャラクタリゼーション。
脳オルガノイドの Lightsheet 画像を形成する細胞アーキテクチャの例を提供するために表示されます。日 25、DAPI (A)蛍光体, (B)はそれぞれ個々 のロゼットと心室のゾーンを示すと。(C) TBR2 ラベルを外側に移行する中間の前駆細胞と MAP2 (D)ラベル ニューロン皮質板を形成しています。(E, E')これらのタンパク質の組み合わせは明らかに脳におけるモデルの皮質発達の反復を示します。(F-私)日ごとに 108, GFAP + と MAP2 +、organoid の多くを作成する細胞の混合物、gliogenesis が発生しました。VZ SVZ 心室ゾーンを = = 脳室下帯、IZ = 中間ゾーン、CP = 皮質板。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。
図 5: 感染したオルガノイドの劣化します。
(A)明るいフィールド画像の嘲笑および MOI で ZIKV に感染した脳 organoids = 0.1 と 10。後に撮影されたすぐに感染 (0 日目) で、同様に 3 と 6 日感染後。(B ・ C)周囲のモック(B)と(C) MOI で ZIKV に感染した細胞の残骸の明視野画像 10 脳 organoids 3 日後感染を =。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。
図 6: Cryosection との感染 organoids 。
日 24 オルガノイドの MOI で ZIKV にさらされた = 0.1、および cryosectioned の 6 日後。この段階では、神経前駆細胞と放射状グリアが存在する、organoid の心室、脳室下帯、および中間ゾーンでウイルスの明確な存在です。(A)これらの上皮細胞内領域の染色性が核を経由で (白い矢印) により明確に表示が頂端表面のまわりのリングのような構造を形成する核の高密度。(B)ウイルスの封筒の染色に、1 つはこれらのロゼット構造 (白い矢印) ウイルスの比較的高いプレゼンスを観察できます。さまざまな正体不明の末梢細胞に存在するウイルスの少量があることに注意してください。(C ・ D)MAP2 または他のニューロン固有汚れを神経細胞に感染するウイルス ウイルスの汚れである場合に表示されない文化存在があること。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。
図 7: 感染した organoid のカスパーゼ 3 を蛍光抗体法を切断します。
感染後 1 つは、organoids 内に発生する細胞死のメカニズム解明のためアポトーシス指標を使用可能性があります。この例では、1 日 24 organoids MOI で ZIKV にさらされた = 0.1、および cryosectioned の 6 日後。感染していないオルガノイドを示さない(A)ウイルスの封筒 (4 2 蛋白質)、および組織で発生する恒常性のアポトーシスによる切断カスパーゼ 3 の最小量。(B)感染のロゼットは、アポトーシスの増加されたレベルを表示し始めます。(C) 4 2 また染色による重症感染症を示しているロゼットは、これらの地域に裂かれたカスパーゼ 3 の高レベルを示す傾向があります。感染症の重症度と感染したロゼット内切断カスパーゼ 3 式の直接的な相関関係があります。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。
ZIKV 感染症を調査する人間の脳オルガノイドを利用する場合を考慮するいくつかの注意事項があります。1 つの重要な考慮事項は、における形成と構造は形成する幹細胞ラインに大きく依存。同質遺伝子組み換え系統; を含む細胞間を比較するときの世話します。結論は複数のサブクローンと理想的な複数の幹細胞ラインを使用してお勧めします。さらにこの細胞の違い、ため、オルガノイドの適切な分化が発生していることを確認するためのパイロット実験が推奨されます。上皮細胞内構造が明視野顕微鏡による目に見える中、PAX6 やリン酸化ビメンチンなど神経分化マーカーを参照する qRT PCR またはセクショニングの実験を行うことも勧めします。
1 つはまた同じセル行内オルガノイドの間でかなり変動を予測する必要があります。プロトコルの性質という数と上皮細胞内構造体のサイズは、個々 organoids によって異なります。通常、1 つは少なくとも 2 つが大きく期待できる (> D24 による直径 200 μ m) あたり器官毛細神経ロゼット。このため、感染時におけるサイズの変化の観察などの縦方向の研究が特に啓発的です。バッチ間変動も生じる、この最も可能性の高い原因と不正確なセルをカウントまたは播種します。複数のカウントを実施する、細胞懸濁液は ULA U 下 96年-ウェル プレートに播種する前によく混合されていることを確認することをお勧めします。
オルガノイド ウーラ U 下 96年-ウェル プレートで培養、プレートの縁の周りのかなりの蒸散効果を見る予定です。PBS でこれらの井戸を埋めるし、センター 60 井戸でのみ動作に最適です。蒸発のため外側井戸オルガノイドを中心、彼らの成長と分化に影響を及ぼす可能性が高いものよりも異なる条件に公開されます。実験に必要となるオルガノイドの数を計画するときは、これにご検討ください。また、オルガノイド培養培地の変色のため表示されます約 30 日後 96 ウェル フォーマットにはびこるに始まります。過去 30 日間オルガノイドを取ることを計画する場合は、ウーラ 24 ウェル プレートに、オルガノイドを転送することをお勧めします。転送を実施するしには、開口部は organoids 自身よりもはるかに大きいので P1000 先端をカットするはさみを使用して、ピペッティングにより、オルガノイドを転送します。
人間の脳 organoids フィールドの神経発達や病気の理解を進める上で大きな可能性を保持します。研究者が必要に応じてプロトコルを変更することをお勧めします。たとえば、特定の解剖学的領域のウイルスの影響を探索する特定の細胞型への分化効率を改善するためにパターン形成要因を実装する 1 つ。ZIKV の神経発達の効果はまだよく理解されていない、しかし、この新しいアプローチは研究者に感染のメカニズムの調査の迅速なアクセス可能な高スループット方法を与えます。
著者は、彼らは競合する金銭的な利益があることを宣言します。
著者は、プリシラ ・ l ・ ヤンとハーバード大学医学部のドミニク ・ j. Burri を初期進展と ZIKV の定量化の助けに感謝します。我々 はまたナサニエル ・ d. カークパ トリックをイメージングのサポートに感謝したいと思います。けは、精神医学の研究とハーバード大学幹細胞研究所のスタンリー ・ センターによって支えられました。
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Enzyme-Free Detachment Reagent, ReLeSR | StemCell Technologies | 5873 | |
Dimethyl Sulfoxide (DMSO) | Sigma-Aldrich | D2650-100ML | |
Glutamate-supplemented DMEM/F12 (1X) | Gibco | 10565-018 | (+)2.438 g/L sodium bicarbonate, (+)sodium pyruvate |
N-2 Supplement (100X) | Gibco | 17502-048 | |
MEM Non-Essential Amino Acids (MEM-NEAA) | Gibco | 11140-050 | |
Earle's Balanced Salt Solution (EBSS) | GE Healthcare Life Sciences | SH30029.02 | |
Stericup Filter (500mL) | Millipore | 220009-140 | |
Costar Ultra-Low Attachment Plate, 96-Well, Round Bottom | Corning | 7007 | |
Low Residual Volume Reagent Reservoir (25mL) | Integra | 4312 | |
Pipet-Lite Multi Pipette L12-200XLS+ | Rainin | 17013810 | |
Large Centrifuge, Culture Plate-Compatible | Thermo Scientific | 75007210 | |
Culture Plate Centrifuge Rotor | Thermo Scientific | 75005706 | |
Vero Cells | ATCC | CCL-81 | For virus expansion, if necessary |
Zika Virus (Uganda Strain) | ATCC | VR-1838 | Other strains may be used |
Zika Virus (Puerto Rico Strain) | ATCC | VR-1843 | Other strains may be used |
phospho-vimentin | MBL | D076-3 | mouse polyclonal, 1:250 dilution |
TBR2 | Abcam | ab23345 | rabbit polyclonal, 1:300 dilution |
MAP2 | Novus | NB300-213 | chicken polyclonal, 1:1500 dilution |
GFAP | Cell Signaling Technologies | CST12389S | rabbit polyclonal, 1:200 dilution |
D1-4G2 flavivirus envelope protein | EMD Millipore | MAB10216 | mouse monoclonal, 1:500 dilution |
cleaved caspase-3 | Cell Signaling Technologies | 9661 | rabbit polyclonal, 1:200 dilution |
488 anti-mouse IgG | Thermo Fisher | A-11001 | goat polyclonal, 1:1000 |
594 anti-rabbit IgG | Thermo Fisher | A-11037 | goat polyclonal, 1:1000 dilution |
647 anti-chicken IgY | Thermo Fisher | A-21449 | goat polyclonal, 1:1000 dilution |
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