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堆積物中のバイオ マーカーの抽出溶媒抽出を加速

概要

ソース: ジェフ Salacup - マサチューセッツ大学アマースト校講座

グリセロール ジアルキル グリセロール tetraethers (GDGTs)、古細菌と細菌のスイート プロデュースと呼ばれる有機バイオ マーカーのグループの分布は、空気への応答で予測可能な方法で変更または水の温度1, 2現世堆積物で発見されました。したがって、知られている時代の堆積物のシーケンスでこれらのバイオ マーカーの分布は、千年に十年スケール (図 1) の空気や水の温度の進化を再構築する使用できます。古気候学と呼ばれる、過去の気候の長い高解像度記録の生産は、何百、何千ものサンプルの迅速分析に依存します。古い手法を超音波やソックスレーなどが遅いです。ただし、新しい溶媒抽出の高速化手法は効率を考慮して設計されました。

Figure 1
図 1。過去の間に東地中海の海面水温 (SST) の変化を示す古レコードの例 〜 27,000 年3.このレコード 〜 115 サンプルと isoprenoidal gdgt かかわらずベース TEX86 SST プロキシに基づいています。

手順

1. 必要な資料の収集

  1. サンプルを抽出します。(この場合は堆積物) のサンプルは凍結、凍結乾燥、粉砕と抽出、前に均質化、効率を最大にするグループで抽出します。
  2. サンプルのサイズ、に応じて 40 または 60 mL のボリューム コレクション バイアルを使用します。この実験では、ホウケイ酸ガラスの瓶 (40 mL) と溶剤の安全キャップを使用します。燃焼バイアル、ホウケイ酸ガラス ピペットおよび 550 ° C、6 h 可能な有機汚染物質の除去を確実に事前に計量缶。
  3. ほとんどの有機地球化学研究室では、ジクロロ メタン (DCM) とメタノールを共通です。それらを個別に使用して、(メタノール最初、DCM が続く) 実験室のツールと使用前にガラスを洗浄します。多くのラボでメタノール (メタノール; 9:1) ジクロロ メタンの混合物を使用することで、効率的に極性の広い範囲でバイオ マーカーを抽出します。溶剤は、有機汚染物質の無料する必要があります。
  4. この実験に使用する加速の溶媒抽出を取得します。

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結果

抽出の最後には、各サンプルの総脂質抽出 (TLE) があります。各バイアルには、底質、土壌、または植物組織から抽出される有機物が含まれています。これら TLEs を分析してその成分を識別して定量化します。

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申請書と概要

抽出したサンプルの TLEs には古代温度を再構築に使用する GDGTs を含む別の有機化合物の広い範囲が含まれます。グリセロール ジアルキル グリセロール-tetraethers は、成長温度への感受性を示すバイオ マーカーの広いスイートです。GDGTs、分岐し、イソプレノイド、コア アルキル基(図 3に分岐パターンの特徴の異なる 2 つのグループがある)。海では、タウムアーキオ...

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参考文献

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  2. Weijers, J. W. H. et al. Environmental controls on bacterial tetraether membrane lipid distribution in soils, Geochimica et Cosmochimica Acta71(3), 703-713 (2007).
  3. Castaneda, I. S. et al. Millennial-scale sea surface temperature changes in the eastern Mediterranean (Nile River Delta region) over the last 27,000 years, Paleoceanography, 25, 13 (2010).
  4. Damste, J. S. S. et al. Crenarchaeol: the characteristic core glycerol dibiphytanyl glycerol tetraether membrane lipid of cosmopolitan pelagic crenarchaeota, J Lipid Res, 43(10), 1641-1651 (2002).
  5. Hopmans, E. C. et al. A novel proxy for terrestrial organic matter in sediments based on branched and isoprenoid tetraether lipids, Earth and Planetary Science Letters224(1-2), 107-116 (2004).
  6. Tierney, J. E., Russell J. M. Distributions of branched GDGTs in a tropical lake system: Implications for lacustrine application of the MBT/CBT paleoproxy, Organic Geochemistry40(9), 1032-1036 (2009).
  7. Damste, J. S. S. et al. 13,16-Dimethyl Octacosanedioic Acid (iso-Diabolic Acid), a Common Membrane-Spanning Lipid of Acidobacteria Subdivisions 1 and 3, Appl Environ Microb, 77(12), 4147-4154 (2011).

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Overview

1:05

Principles of Accelerated Solvent Extraction

2:23

Collection of Sample Materials and Preparation of ASE Cells

3:48

Preparation of Collection Vials and Extraction

4:49

Applications

6:18

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